DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp8 and spp42

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610735.1 Gene:Prp8 / 36304 FlyBaseID:FBgn0033688 Length:2396 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_593861.1 Gene:spp42 / 2543413 PomBaseID:SPAC4F8.12C Length:2363 Species:Schizosaccharomyces pombe


Alignment Length:2376 Identity:1737/2376 - (73%)
Similarity:1994/2376 - (83%) Gaps:44/2376 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    48 PPGAPLPPAGGHTNGIPIPVGGQGPGLGQIPTPKPDILT--------------EEKLQEKALKWQ 98
            |||.|.||        |.|.|.:.|  .|.|.|.|....              |::|.|:|.||:
pombe     5 PPGNPPPP--------PPPPGFEPP--SQPPPPPPPGYVKKRKNKTPAQSGNLEKQLNERARKWR 59

  Fly    99 HLQSKRFAEKRKFGFVDTQKEDMPPEHIRKIIRDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLL 163
            ..|..:|..|||.|:|.|:|.|:||||:|||::|.|||:|||:|.|||.|||||||:||||||||
pombe    60 ASQKSKFGVKRKQGYVQTEKADLPPEHLRKIMKDRGDMSSRKFRADKRSYLGALKYLPHAVLKLL 124

  Fly   164 ENMPMPWEQIRDVQVLYHITGAITFVNEIPWVIEPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPP 228
            ||||||||:.|:|:||||:|||||||||.|.||||.:||||||||:|||||||||::|||:||||
pombe   125 ENMPMPWEEYREVKVLYHVTGAITFVNESPRVIEPHFIAQWGTMWMMMRREKRDRKNFKRLRFPP 189

  Fly   229 FDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIELDNDEDNAVYKWFYDHRPLVDTQFVNGTTYRKWNLSLPQ 293
            |||||||.. .|.:||:||||||:::||.::|..|..|||:::.|.||..|||.|||:|.|:|||
pombe   190 FDDEEPPFS-IDQLLDLEPLEAIRMDLDEEDDAPVMDWFYENKALEDTPHVNGPTYRRWKLNLPQ 253

  Fly   294 LATLYRLANQLLTDLVDNNFFYLFDPKSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVGDEDWNEFNDI 358
            :|.|:||..|||:||.|:|:||||:..|||||||||:|||||||||||.||.....|||||||||
pombe   254 MANLHRLGYQLLSDLRDDNYFYLFNDNSFFTAKALNVAIPGGPKFEPLYKDEAPEMEDWNEFNDI 318

  Fly   359 NKVIIRQPIRTEYRIAFPYLYNNMPHFVHLSWYHTPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNA 423
            .|:|||.||:||||||||||||:....|.||.||.|:.|::..||||||||::||:||||:.|..
pombe   319 YKLIIRHPIKTEYRIAFPYLYNSRARSVALSEYHQPSNVFVPPEDPDLPAFFWDPIINPITSRQL 383

  Fly   424 NSKIQEPLPDD-----DEDFTLPDDVQPFLQDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNMRSGRSRRAID 483
            .....:..|:|     |.:|.:|.|  ||.....:..::||:.:.|||||.|||.|||.::||.|
pombe   384 TLHELDTSPEDSAIEEDPNFEIPFD--PFFHSEDIEFEHTASALILLWAPHPFNKRSGATKRAQD 446

  Fly   484 VPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRVSYQKLLKYYVLNALKHRKPKPQKKRYLFRSFKATKFFQTTTLD 548
            |||:|.||.|||||..|||||||||||||.:|:|.|....||....|.|.|..|.|||||:|::|
pombe   447 VPLIKHWYLEHCPPNQPVKVRVSYQKLLKSHVMNKLHMAHPKSHTNRSLLRQLKNTKFFQSTSID 511

  Fly   549 WVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRL 613
            ||||||||||||||||.||||||.|.|||||||.||||.|||||||||||||||||||.||||||
pombe   512 WVEAGLQVCRQGYNMLQLLIHRKGLTYLHLDYNCNLKPTKTLTTKERKKSRFGNAFHLMREILRL 576

  Fly   614 TKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNT 678
            ||||:||||||||.|:||:||||||.|||.|||||||||||||:||||||.|||.||||||||||
pombe   577 TKLIVDSHVQYRLGNIDAYQLADGLHYIFNHVGQLTGMYRYKYRLMRQIRACKDFKHLIYYRFNT 641

  Fly   679 GPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDL 743
            ||||||||||||||.|||||||:|||.|||||||||||:||||||||.||||.:|||||:||.||
pombe   642 GPVGKGPGCGFWAPSWRVWLFFLRGIVPLLERWLGNLLARQFEGRHSTGVAKQITKQRVDSHQDL 706

  Fly   744 ELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPIPIENMILRYVKMKAD 808
            ||||:||:||:||:||||:|.|::|||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
pombe   707 ELRAAVMNDILDMIPEGIRQGKSKTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPAPIENMILRYVKSKAD 771

  Fly   809 WWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYISPEEAVAIYTTT 873
            |||:.||:|||||||||||||||.||||||||||:|||||||||||||||||::.:||||||||.
pombe   772 WWTSVAHFNRERIRRGATVDKTVAKKNLGRLTRLWLKAEQERQHNYLKDGPYVTADEAVAIYTTF 836

  Fly   874 VHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEAL 938
            |||||||||.||||||||||||||||:|||||||||||||.||||||||||.|:|||||||||.|
pombe   837 VHWLESRRFQPIPFPPLSYKHDTKLLVLALERLKEAYSVKGRLNQSQREELALVEQAYDNPHEML 901

  Fly   939 SRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLIPVYEVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPS 1003
            |:|||.|||.|.||||||||||:||||||||.|:|:|||.|||||||||:|||:|.|||.|:|||
pombe   902 SQIKRRLLTMRTFKEVGIEFMDMYSHLIPVYSVDPMEKICDAYLDQYLWFEADRRHLFPSWVKPS 966

  Fly  1004 DTEPPPLLAYKWCQGINNLQDVWDVGEGECNVLLESRFEKLYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADY 1068
            |:||||||.||||||||||.|||:...||||||:|:|..|::||:||||||||:.|::|.|:|.|
pombe   967 DSEPPPLLVYKWCQGINNLTDVWETSNGECNVLMETRLSKVFEKVDLTLLNRLMSLLMDTNLASY 1031

  Fly  1069 MTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFSSFITQYYGLVLDLLVLGLHRSSEMAGPPQMPNDFLT 1133
            .:||||||::||||:||||||::|||||||||.|:||||||||:|||.|::|:|||...|||||.
pombe  1032 ASAKNNVVLSYKDMSHTNSYGLVRGLQFSSFIWQFYGLVLDLLILGLQRATEIAGPADAPNDFLH 1096

  Fly  1134 FQDTVTETAHPIRLYCRYVDRIHLFFRFSAEEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYN--NKKCWPR 1196
            |:|..|||:||||||.||:|::::.|||:.||:||||||:|.|:|||.|.|:|.|:  .|.||||
pombe  1097 FKDQATETSHPIRLYTRYIDKVYIMFRFTDEESRDLIQRFLNENPDPTNSNVVNYSKGKKNCWPR 1161

  Fly  1197 DARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTIGWESTFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCR 1261
            |||||||||||||||||||:|:||||||:||:.||.||.||||||||||||:|:|||.|||||.|
pombe  1162 DARMRLMKHDVNLGRAVFWEIRNRLPRSLTTLEWEDTFPSVYSKDNPNLLFSMTGFEVRILPKIR 1226

  Fly  1262 TQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERTAQCFLRVDDESLGRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTA 1326
             |||||:.:||||||.:..||:||||.|:||.::.:.:|.||:|||||:|||||||||.||||||
pombe  1227 -QNEEFSLKDGVWNLTDNRTKQRTAQAFIRVTEDGINQFGNRIRQILMSSGSTTFTKIANKWNTA 1290

  Fly  1327 LIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMG 1391
            ||.||||:|||.::|.||||||||||:|||||:||.|||||||||||.|||:|||||||||||||
pombe  1291 LIALMTYYREAAISTPELLDLLVKCESKIQTRVKISLNSKMPSRFPPAVFYSPKELGGLGMLSMG 1355

  Fly  1392 HVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEA 1456
            ||||||||||||||||.|||||||||:.:.:.|||||||||||||||||||||||||||:|||||
pombe  1356 HVLIPQSDLRWSKQTDTGITHFRSGMTTNGEHLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYAMKRQEA 1420

  Fly  1457 NAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHD 1521
            ..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:||.||||||.||||
pombe  1421 LQQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTEFKQYQLLKNNPFWWTSQRHD 1485

  Fly  1522 GKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGL 1586
            ||||.|||||.|:||||||||||||||:||.|.||:|||||||||||||||||:|||||||||||
pombe  1486 GKLWQLNNYRVDVIQALGGVEGILEHTMFKATGFPSWEGLFWEKASGFEESMKFKKLTNAQRSGL 1550

  Fly  1587 NQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVM 1651
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||:|||||||||:|.
pombe  1551 NQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIMMHGKIPTLKISLIQIFRSHLWQKIHESVVW 1615

  Fly  1652 DLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLFPAYKWNVSRPSLLADTKDTMDNTT 1716
            |||||.||||::|:||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||.|.:|.:||||
pombe  1616 DLCQVLDQELESLQIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADILLLAAYKWNVSRPSLLNDNRDVLDNTT 1680

  Fly  1717 TQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERYARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPG 1781
            |.|||:|:|||:|||||||:|||.|||||||:||..|:|||||||||.|||.||:|||||||.||
pombe  1681 TNKYWIDVQLRFGDYDSHDIERYTRAKFLDYSTDAQSMYPSPTGVLIGIDLCYNMHSAYGNWIPG 1745

  Fly  1782 CKTLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVY 1846
            .|.||||:|.||||||||||||||||||.||||:|||.|.||||.||.|||||||..||||||||
pombe  1746 MKPLIQQSMNKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYASEPQEQYLSSSNYAELFSNQIQLFVDDTNVY 1810

  Fly  1847 RVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRS 1911
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||
pombe  1811 RVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKVIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRS 1875

  Fly  1912 LPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVL 1976
            |||||||:|||||||||||||||||||||||.||||||||||||.:|::|..||||:||||||||
pombe  1876 LPVEEQPRQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNITIKGSELQLPFQAIIKLDKINDLILRATEPQMVL 1940

  Fly  1977 FNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNTERTKIILKPDKTTITEAHHIWPTLTDEEWIKVEV 2041
            ||||||||:::||||||||||||||||:||||:||:||:|||:.||:.:|:||.|.|::|:.||.
pombe  1941 FNLYDDWLQSVSSYTAFSRLILILRALNVNTEKTKLILRPDKSIITKENHVWPNLDDQQWLDVEP 2005

  Fly  2042 QLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQNQLTATTTRT 2106
            :|:|||||||.||||:||||||.||:|||||||.|:|||.|||||||||||.:|..|:||.||:|
pombe  2006 KLRDLILADYAKKNNINVASLTNSEVRDIILGMTITAPSLQRQQIAEIEKQGRENAQVTAVTTKT 2070

  Fly  2107 TNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIKET-GYTYILPKNI 2170
            ||.||||::.:|||.||.:.||||||||.||||:.:|.|||.:|||:||:|.|| .||||||:|:
pombe  2071 TNVHGDEMVVTTTSAYENEKFSSKTEWRNRAISSISLPLRTKNIYVNSDNISETFPYTYILPQNL 2135

  Fly  2171 LKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMPPQWGTHQTINLPNTLPTH----QYLKD 2231
            |:|||||||||.|:|||:||.||.||||:||||||.:.||.|:.:.:.||:.|| |    ..|:|
pombe  2136 LRKFVTISDLRTQVAGYMYGKSPSDNPQIKEIRCIALVPQLGSIRNVQLPSKLP-HDLQPSILED 2199

  Fly  2232 MEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKIMQENSNWDGEKTIVITCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFE 2296
            :|||||||||.:|||.||..|:||||||:..:..|| .|.:.:|.|:.|||.||.||.::..|.|
pombe  2200 LEPLGWIHTQSSELPYLSSVDVTTHAKILSSHPEWD-TKAVTLTVSYIPGSISLAAYTVSKEGIE 2263

  Fly  2297 WGSKNTD-KGNNPKGYLPSHYERVQMLLSNKFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLAN 2360
            |||||.| ..:...||.||..|:.|:|||::..|||:||.:..|||||.|....|.|.|.|:|..
pombe  2264 WGSKNMDINSDEAIGYEPSMAEKCQLLLSDRIQGFFLVPEEGVWNYNFNGASFSPKMTYSLKLDV 2328

  Fly  2361 PKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGADREDVYA 2396
            |..|:...||.:|.:.::.||. .|....|..|.:|
pombe  2329 PLPFFALEHRPTHVISYTELET-NDRLEEDMPDAFA 2363

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp8NP_610735.1 PRP8 64..2396 CDD:227505 1730/2358 (73%)
spp42NP_593861.1 PRP8 33..2363 CDD:227505 1722/2336 (74%)

Return to query results.
Submit another query.