DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp8 and Prpf8

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_610735.1 Gene:Prp8 / 36304 FlyBaseID:FBgn0033688 Length:2396 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_619600.2 Gene:Prpf8 / 192159 MGIID:2179381 Length:2335 Species:Mus musculus


Alignment Length:2343 Identity:2134/2343 - (91%)
Similarity:2248/2343 - (95%) Gaps:14/2343 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    55 PAGGHTNGIPIPVGGQGPGLGQIPTPKPDILTEEKLQEKALKWQHLQSKRFAEKRKFGFVDTQKE 119
            |..|..|.:|.|:           .|.||.::||||||||.|||.||:||:||||||||||.|||
Mouse     6 PYRGPGNPVPGPL-----------APLPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYAEKRKFGFVDAQKE 59

  Fly   120 DMPPEHIRKIIRDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITG 184
            ||||||:|||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Mouse    60 DMPPEHVRKIIRDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITG 124

  Fly   185 AITFVNEIPWVIEPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLE 249
            ||:||||||||||||||:|||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||
Mouse   125 AISFVNEIPWVIEPVYISQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLE 189

  Fly   250 AIQIELDNDEDNAVYKWFYDHRPLVDT-QFVNGTTYRKWNLSLPQLATLYRLANQLLTDLVDNNF 313
            |||:|||.:||..|..|||||:||.|: ::|||:||::|..:||.::|||||||||||||||:|:
Mouse   190 AIQLELDPEEDAPVLDWFYDHQPLRDSRKYVNGSTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNY 254

  Fly   314 FYLFDPKSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVGDEDWNEFNDINKVIIRQPIRTEYRIAFPYL 378
            |||||.|:|||:||||||||||||||||::|.|:.||||||||||||:||||||||||:||||||
Mouse   255 FYLFDLKAFFTSKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYL 319

  Fly   379 YNNMPHFVHLSWYHTPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNANSKIQEPLPDDDEDFTLPDD 443
            |||:||.|||:||||||||:|||||||||||||||||||||||: :.|.|||||||||:|.||:.
Mouse   320 YNNLPHHVHLTWYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRH-SVKSQEPLPDDDEEFELPEF 383

  Fly   444 VQPFLQDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNMRSGRSRRAIDVPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRVSYQ 508
            |:|||:|||||||||||||||||||||||:||||:|||:|:||||.||:||||.|.|||||||||
Mouse   384 VEPFLKDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRALDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQ 448

  Fly   509 KLLKYYVLNALKHRKPKPQKKRYLFRSFKATKFFQTTTLDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNL 573
            ||||||||||||||.||.|||||||||||||||||:|.|||||.|||||||||||||||||||||
Mouse   449 KLLKYYVLNALKHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNL 513

  Fly   574 NYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLADGL 638
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||::||||||||.|||||||||||
Mouse   514 NYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGL 578

  Fly   639 QYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRG 703
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||
Mouse   579 QYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRG 643

  Fly   704 ITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKART 768
            |||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||||||||||||
Mouse   644 ITPLLERWLGNLLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKART 708

  Fly   769 ILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPIPIENMILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCK 833
            ||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   709 ILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCK 773

  Fly   834 KNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYISPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKL 898
            ||||||||||||||||||||||||||||:.|||||:|||||||||||||:|||||||||||||||
Mouse   774 KNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKL 838

  Fly   899 LILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYS 963
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   839 LILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYS 903

  Fly   964 HLIPVYEVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPSDTEPPPLLAYKWCQGINNLQDVWDV 1028
            ||:|||:||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.||||||||||||||:.
Mouse   904 HLVPVYDVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWET 968

  Fly  1029 GEGECNVLLESRFEKLYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRG 1093
            .||||||:|||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   969 SEGECNVMLESRFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRG 1033

  Fly  1094 LQFSSFITQYYGLVLDLLVLGLHRSSEMAGPPQMPNDFLTFQDTVTETAHPIRLYCRYVDRIHLF 1158
            |||:|||.||||||:|||||||||:||||||||||||||:|||..||.||||||:|||:||||:|
Mouse  1034 LQFASFIVQYYGLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDIATEAAHPIRLFCRYIDRIHIF 1098

  Fly  1159 FRFSAEEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPR 1223
            |||:|:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1099 FRFTADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPR 1163

  Fly  1224 SVTTIGWESTFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERTAQC 1288
            ||||:.||::||||||||||||||||.||||||||||||..|||||:|||||||||:||||||||
Mouse  1164 SVTTVQWENSFVSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQC 1228

  Fly  1289 FLRVDDESLGRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCEN 1353
            ||||||||:.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1229 FLRVDDESMQRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCEN 1293

  Fly  1354 KIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMS 1418
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1294 KIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMS 1358

  Fly  1419 HDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEANAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLF 1483
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1359 HEEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLF 1423

  Fly  1484 QKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHT 1548
            ||||||||||||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1424 QKDRHTLAYDKGWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHT 1488

  Fly  1549 LFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQV 1613
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1489 LFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQV 1553

  Fly  1614 QLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRK 1678
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1554 QLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRK 1618

  Fly  1679 SYKMNSSCADILLFPAYKWNVSRPSLLADTKDTMDNTTTQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERYARAK 1743
            ||||||||||||||.:|||||||||||||:||.||:|||||||:|||||||||||||:|||||||
Mouse  1619 SYKMNSSCADILLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAK 1683

  Fly  1744 FLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGCKTLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIR 1808
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||
Mouse  1684 FLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGSKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIR 1748

  Fly  1809 KALQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPR 1873
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1749 KGLQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPR 1813

  Fly  1874 TGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLD 1938
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1814 TGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLD 1878

  Fly  1939 FPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRAL 2003
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1879 FPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRAL 1943

  Fly  2004 HVNTERTKIILKPDKTTITEAHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIR 2068
            |||.:|.|:||||||||:||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1944 HVNNDRAKVILKPDKTTVTEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIR 2008

  Fly  2069 DIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQNQLTATTTRTTNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEW 2133
            ||||||||||||.|||||||||||||||:|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2009 DIILGMEISAPSQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEW 2073

  Fly  2134 RVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNILKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQ 2198
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||:||||:.||||||||||||||||||||||
Mouse  2074 RVRAISAANLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQ 2138

  Fly  2199 VKEIRCIVMPPQWGTHQTINLPNTLPTHQYLKDMEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKIMQEN 2263
            |||||||||.||||||||::||:.||.|:|||:|||||||||||||.|||||||:|||||||.:|
Mouse  2139 VKEIRCIVMVPQWGTHQTVHLPSQLPQHEYLKEMEPLGWIHTQPNESPQLSPQDVTTHAKIMADN 2203

  Fly  2264 SNWDGEKTIVITCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFEWGSKNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSNKFL 2328
            .:|||||||:||||||||||:||||||||||:|||.:||||||||||||||||||||||||::||
Mouse  2204 PSWDGEKTIIITCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFL 2268

  Fly  2329 GFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGADRED 2393
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||.||||.|:.|:: |:...|||||
Mouse  2269 GFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQE-GEVYSADRED 2332

  Fly  2394 VYA 2396
            :||
Mouse  2333 LYA 2335

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp8NP_610735.1 PRP8 64..2396 CDD:227505 2129/2332 (91%)
PRO8NT 118..268 CDD:285342 134/149 (90%)
PROCN 456..856 CDD:285343 376/399 (94%)
RRM_4 1046..1137 CDD:287556 85/90 (94%)
U5_2-snRNA_bdg 1270..1402 CDD:287555 127/131 (97%)
U6-snRNA_bdg 1502..1660 CDD:287554 156/157 (99%)
RNase_H_like_Prp8_IV 1826..2076 CDD:260013 243/249 (98%)
MPN_PRP8 2127..2377 CDD:163687 222/249 (89%)
Prpf8NP_619600.2 PRP8 1..2335 CDD:227505 2132/2341 (91%)
Reverse transcriptase homology domain 812..1303 456/490 (93%)
Linker 1304..1577 267/272 (98%)
Important for branch point selection. /evidence=ECO:0000250 1513..1526 11/12 (92%)
Restriction endonuclease homology domain 1581..1752 160/170 (94%)
Involved in interaction with pre-mRNA 5' splice site. /evidence=ECO:0000250 1669..2034 353/364 (97%)
RNase H homology domain 1767..2020 246/252 (98%)
Required for interaction with EFTUD2 and SNRNP200. /evidence=ECO:0000250 2301..2335 21/34 (62%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C167841570
Domainoid 1 1.000 816 1.000 Domainoid score I65
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5178
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H4706
Inparanoid 1 1.050 4447 1.000 Inparanoid score I4
Isobase 1 0.950 - 0 Normalized mean entropy S96
OMA 1 1.010 - - QHG53611
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0004087
OrthoInspector 1 1.000 - - oto93587
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101765
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR11140
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R1384
SonicParanoid 1 1.000 - - X2835
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
1615.740

Return to query results.
Submit another query.