DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Prp8 and prp-8

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610735.1 Gene:Prp8 / 36304 FlyBaseID:FBgn0033688 Length:2396 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_498785.1 Gene:prp-8 / 176153 WormBaseID:WBGene00004187 Length:2329 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2347 Identity:1999/2347 - (85%)
Similarity:2187/2347 - (93%) Gaps:29/2347 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    57 GGHTNGIPIPVGGQGPGLGQIPTPKPDILTEEKLQEKALKWQHLQSKRFAEKRKFGFVDTQKEDM 121
            |||                  |..:|..:.:..|:||:.||:.||.||::||:|||..|||||:|
 Worm     5 GGH------------------PQTEPHAIPDSILEEKSRKWKQLQGKRYSEKKKFGMSDTQKEEM 51

  Fly   122 PPEHIRKIIRDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITGAI 186
            ||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
 Worm    52 PPEHVRKVIRDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVKVLYHITGAI 116

  Fly   187 TFVNEIPWVIEPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAI 251
            ||||:||.||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||.|
 Worm   117 TFVNDIPRVIEPVYMAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEPI 181

  Fly   252 QIELDNDEDNAVYKWFYDHRPLVDTQFVNGTTYRKWNLSLPQLATLYRLANQLLTDLVDNNFFYL 316
            |:|||.:||.||.:|||||:||..|:||||.|||||..|:||::|||||||||||||||:|:|||
 Worm   182 QMELDPEEDGAVAEWFYDHKPLATTRFVNGPTYRKWAFSIPQMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYL 246

  Fly   317 FDPKSFFTAKALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVGDEDWNEFNDINKVIIRQPIRTEYRIAFPYLYNN 381
            ||.||||||||||:|||||||||||:||.:. ||||||||||||||||.|||||||||||::|||
 Worm   247 FDMKSFFTAKALNVAIPGGPKFEPLVKDLHT-DEDWNEFNDINKVIIRAPIRTEYRIAFPFMYNN 310

  Fly   382 ----MPHFVHLSWYHTPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNANSKIQEPLP--DDDEDFTL 440
                :|  |.:||||||:||:||||||||||||:|||||||...|..: .:|.||  ::::::.|
 Worm   311 LISSLP--VQVSWYHTPSVVFIKTEDPDLPAFYYDPLINPIVLSNLKA-TEENLPEGEEEDEWEL 372

  Fly   441 PDDVQPFLQDTPLYTDNTANGIALLWAPRPFNMRSGRSRRAIDVPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRV 505
            |:||:|..:|.||||||||||:||||||||||:||||:|||:||||||.||:||||.|.||||||
 Worm   373 PEDVRPIFEDVPLYTDNTANGLALLWAPRPFNLRSGRTRRAVDVPLVKSWYREHCPAGMPVKVRV 437

  Fly   506 SYQKLLKYYVLNALKHRKPKPQKKRYLFRSFKATKFFQTTTLDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHR 570
            |||||||.:||||||||.|||||:|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
 Worm   438 SYQKLLKVFVLNALKHRPPKPQKRRYLFRSFKATKFFQTTTLDWVEAGLQVLRQGYNMLNLLIHR 502

  Fly   571 KNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLA 635
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::|:|||||||||||:|||
 Worm   503 KNLNYLHLDYNFNLKPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLVVDAHVQYRLNNVDAYQLA 567

  Fly   636 DGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFF 700
            ||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm   568 DGLQYIFAHVGQLTGMYRYKYKLMRQVRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFF 632

  Fly   701 MRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNK 765
            :||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:||||:||||||
 Worm   633 LRGITPLLERWLGNLLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPDGIKQNK 697

  Fly   766 ARTILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPIPIENMILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKT 830
            ||.||||||||||||||||||||||||.|:|||||||||.|||||||:|||||||:|||||||||
 Worm   698 ARVILQHLSEAWRCWKANIPWKVPGLPTPVENMILRYVKAKADWWTNSAHYNRERVRRGATVDKT 762

  Fly   831 VCKKNLGRLTRLYLKAEQERQHNYLKDGPYISPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHD 895
            |||||||||||||||:||||||||||||||||.|||||||||||||||||||:||||||||||||
 Worm   763 VCKKNLGRLTRLYLKSEQERQHNYLKDGPYISAEEAVAIYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHD 827

  Fly   896 TKLLILALERLKEAYSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMD 960
            |||||||||||||:||||:||||||||||.|||||||||||||||||||:|||||||||||||||
 Worm   828 TKLLILALERLKESYSVKNRLNQSQREELALIEQAYDNPHEALSRIKRHMLTQRAFKEVGIEFMD 892

  Fly   961 LYSHLIPVYEVEPLEKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPSDTEPPPLLAYKWCQGINNLQDV 1025
            ||:||||||::|||||:||||||||||||||||||||.|:||.||||||||.||||||:||||||
 Worm   893 LYTHLIPVYDIEPLEKVTDAYLDQYLWYEADKRRLFPAWVKPGDTEPPPLLTYKWCQGLNNLQDV 957

  Fly  1026 WDVGEGECNVLLESRFEKLYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGI 1090
            |:..||||||::|::.||:.||:||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||:||
 Worm   958 WETSEGECNVIMETKLEKIAEKMDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTSKNNVLINYKDMNHTNSFGI 1022

  Fly  1091 IRGLQFSSFITQYYGLVLDLLVLGLHRSSEMAGPPQMPNDFLTFQDTVTETAHPIRLYCRYVDRI 1155
            ||||||:|||.|:||||||||||||.|:||:|||||.||:||.|||..||..|||||||||:||:
 Worm  1023 IRGLQFASFIVQFYGLVLDLLVLGLRRASEIAGPPQCPNEFLQFQDVATEIGHPIRLYCRYIDRV 1087

  Fly  1156 HLFFRFSAEEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNR 1220
            .:.|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm  1088 WIMFRFSADEARDLIQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNR 1152

  Fly  1221 LPRSVTTIGWESTFVSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERT 1285
            ||||:||:.||::|||||||||||:||:||||||||||||||.||||.|||||||||||:|||||
 Worm  1153 LPRSITTVEWENSFVSVYSKDNPNMLFDMSGFECRILPKCRTANEEFVHRDGVWNLQNEVTKERT 1217

  Fly  1286 AQCFLRVDDESLGRFHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVK 1350
            |||||:||:|||.:||||:|||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm  1218 AQCFLKVDEESLSKFHNRIRQILMSSGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVK 1282

  Fly  1351 CENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDV-GITHFR 1414
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||.:||:. |:||||
 Worm  1283 CENKIQTRIKIGLNSKMPSRFPPVVFYTPKEIGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWMQQTEAGGVTHFR 1347

  Fly  1415 SGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEANAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRI 1479
            ||||||||||||||||||||||:||:||.|||||||||||||||||||||||||:||||||||||
 Worm  1348 SGMSHDEDQLIPNLYRYIQPWEAEFVDSVRVWAEYALKRQEANAQNRRLTLEDLDDSWDRGIPRI 1412

  Fly  1480 NTLFQKDRHTLAYDKGWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGI 1544
            ||||||||||||||||||:|||||.||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm  1413 NTLFQKDRHTLAYDKGWRVRTEFKAYQILKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGI 1477

  Fly  1545 LEHTLFKGTYFPTWEGLFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYV 1609
            ||||||:|||||||||||||:|||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm  1478 LEHTLFRGTYFPTWEGLFWERASGFEESMKFKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYV 1542

  Fly  1610 GFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETI 1674
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||:|||||||
 Worm  1543 GFQVQLDLTGIFMHGKIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESVVMDLCQVFDQELDALEIQTVQKETI 1607

  Fly  1675 HPRKSYKMNSSCADILLFPAYKWNVSRPSLLADTKDTMDNTTTQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERY 1739
            ||||||||||||||:|||..||||||||||:||:||.||||||||||||:|||||||||||||||
 Worm  1608 HPRKSYKMNSSCADVLLFAQYKWNVSRPSLMADSKDVMDNTTTQKYWLDVQLRWGDYDSHDVERY 1672

  Fly  1740 ARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGCKTLIQQAMAKIMKANPALYVLR 1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||.|.||:||||||:|||||.||||
 Worm  1673 ARAKFLDYTTDNMSIYPSPTGVLIAIDLAYNLYSAYGNWFPGMKPLIRQAMAKIIKANPAFYVLR 1737

  Fly  1805 ERIRKALQLYSSEPTEPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFI 1869
            |||||.|||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Worm  1738 ERIRKGLQLYSSEPTEPYLTSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFI 1802

  Fly  1870 FNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEV 1934
            ||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||:|||||||.|||||||
 Worm  1803 FNPRTGQLFLKIIHTSVWAGQKRLSQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPRQIIVTRKAMLDPLEV 1867

  Fly  1935 HLLDFPNIVIKGSELQLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILI 1999
            |||||||||||||||.|||||.:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||::||
 Worm  1868 HLLDFPNIVIKGSELMLPFQAIMKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRVVLI 1932

  Fly  2000 LRALHVNTERTKIILKPDKTTITEAHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQ 2064
            :|.:|:|.::||:|||||||||||.|||||||:|::|||||:.|||:||||||||||||||||||
 Worm  1933 MRGMHINPDKTKVILKPDKTTITEPHHIWPTLSDDDWIKVELALKDMILADYGKKNNVNVASLTQ 1997

  Fly  2065 SEIRDIILGMEISAPSAQRQQIAEIEKQTKEQNQLTATTTRTTNKHGDEIITSTTSNYETQTFSS 2129
            ||:|||||||||||||.||||||:||||||||:|:|||||||.|||||||||:|||||||.:|:|
 Worm  1998 SEVRDIILGMEISAPSQQRQQIADIEKQTKEQSQVTATTTRTVNKHGDEIITATTSNYETASFAS 2062

  Fly  2130 KTEWRVRAISATNLHLRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNILKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPP 2194
            :|||||||||:|||||||.||||:|||:|:|||||||||||||||:||||||.||||::||||||
 Worm  2063 RTEWRVRAISSTNLHLRTQHIYVNSDDVKDTGYTYILPKNILKKFITISDLRTQIAGFMYGVSPP 2127

  Fly  2195 DNPQVKEIRCIVMPPQWGTHQTINLPNTLPTHQYLKDMEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKI 2259
            ||||||||||||:.||.|:||.:|||..||.|:.|:|.|||||:||||||||||||||:|||||:
 Worm  2128 DNPQVKEIRCIVLVPQTGSHQQVNLPTQLPDHELLRDFEPLGWMHTQPNELPQLSPQDVTTHAKL 2192

  Fly  2260 MQENSNWDGEKTIVITCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFEWGSKNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLS 2324
            :.:|.:||||||::|||||||||.|||||||||||:|||..|||||||||||:|:|||:||||||
 Worm  2193 LTDNISWDGEKTVMITCSFTPGSVSLTAYKLTPSGYEWGKANTDKGNNPKGYMPTHYEKVQMLLS 2257

  Fly  2325 NKFLGFFMVPAQSSWNYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGA 2389
            ::|||:||||:...|||||.|.|..|.||:::.|:||||:|||.||..||..|...:|......|
 Worm  2258 DRFLGYFMVPSNGVWNYNFQGQRWSPAMKFDVCLSNPKEYYHEDHRPVHFHNFKAFDDPLGTGSA 2322

  Fly  2390 DREDVYA 2396
            ||||.:|
 Worm  2323 DREDAFA 2329

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Prp8NP_610735.1 PRP8 64..2396 CDD:227505 1995/2338 (85%)
prp-8NP_498785.1 PRP8 5..2329 CDD:227505 1998/2345 (85%)

Return to query results.
Submit another query.