DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

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Protein Alignment Prp8 and prpf8

DIOPT Version :9

Sequence 1:	NP_610735.1	Gene:	Prp8 / 36304	FlyBaseID:	FBgn0033688	Length:	2396	Species:	Drosophila melanogaster
Sequence 2:	XP_002936105.2	Gene:	prpf8 / 100380187	XenbaseID:	XB-GENE-966799	Length:	2335	Species:	Xenopus tropicalis

Alignment Length:	2332	Identity:	2132/2332 - (91%)
Similarity:	2244/2332 - (96%)	Gaps:	3/2332 - (0%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

  Fly    66 PVGGQGPGLGQIPTPKPDILTEEKLQEKALKWQHLQSKRFAEKRKFGFVDTQKEDMPPEHIRKII 130
            |...|.|.:...|...||.::||||||||.|||.||:||::|||||||||.|||||||||:||||
Frog     6 PYRPQAPPMPGPPGGTPDYMSEEKLQEKARKWQQLQAKRYSEKRKFGFVDAQKEDMPPEHVRKII 70

  Fly   131 RDHGDMTSRKYRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVQVLYHITGAITFVNEIPWV 195
            |||||||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||:||||||||
Frog    71 RDHGDMTNRKFRHDKRVYLGALKYMPHAVLKLLENMPMPWEQIRDVPVLYHITGAISFVNEIPWV 135

  Fly   196 IEPVYIAQWGTMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNVLDVEPLEAIQIELDNDED 260
            ||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||:|||.:||
Frog   136 IEPVYIAQWGSMWIMMRREKRDRRHFKRMRFPPFDDEEPPLDYADNILDVEPLEAIQLELDPEED 200

  Fly   261 NAVYKWFYDHRPLVDT-QFVNGTTYRKWNLSLPQLATLYRLANQLLTDLVDNNFFYLFDPKSFFT 324
            ..|..|||||:||.|. ::||||||::|..:||.::|||||||||||||||:|:|||||.|:|||
Frog   201 APVTDWFYDHQPLRDNRKYVNGTTYQRWQFTLPMMSTLYRLANQLLTDLVDDNYFYLFDLKAFFT 265

  Fly   325 AKALNMAIPGGPKFEPLIKDHNVGDEDWNEFNDINKVIIRQPIRTEYRIAFPYLYNNMPHFVHLS 389
            :||||||||||||||||::|.|:.||||||||||||:||||||||||:|||||||||:||.|||:
Frog   266 SKALNMAIPGGPKFEPLVRDINLQDEDWNEFNDINKIIIRQPIRTEYKIAFPYLYNNLPHHVHLT 330

  Fly   390 WYHTPNVVYIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRNANSKIQEPLPDDDEDFTLPDDVQPFLQDTPLY 454
            ||||||||:|||||||||||||||||||||||: :.|.|||||||||:|.||:.|:|||:|||||
Frog   331 WYHTPNVVFIKTEDPDLPAFYFDPLINPISHRH-SVKSQEPLPDDDEEFELPEYVEPFLKDTPLY 394

  Fly   455 TDNTANGIALLWAPRPFNMRSGRSRRAIDVPLVKCWYKEHCPPGHPVKVRVSYQKLLKYYVLNAL 519
            :|||||||||||||||||:||||:|||||:||||.||:||||.|.||||||||||||||||||||
Frog   395 SDNTANGIALLWAPRPFNLRSGRTRRAIDIPLVKNWYREHCPAGQPVKVRVSYQKLLKYYVLNAL 459

  Fly   520 KHRKPKPQKKRYLFRSFKATKFFQTTTLDWVEAGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNL 584
            |||.||.|||||||||||||||||:|.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog   460 KHRPPKAQKKRYLFRSFKATKFFQSTKLDWVEVGLQVCRQGYNMLNLLIHRKNLNYLHLDYNFNL 524

  Fly   585 KPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREILRLTKLIIDSHVQYRLNNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLT 649
            |||||||||||||||||||||||||:||||||::||||||||.||||||||||||||||||||||
Frog   525 KPVKTLTTKERKKSRFGNAFHLCREVLRLTKLVVDSHVQYRLGNVDAFQLADGLQYIFAHVGQLT 589

  Fly   650 GMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAPGWRVWLFFMRGITPLLERWLGN 714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||
Frog   590 GMYRYKYKLMRQIRMCKDLKHLIYYRFNTGPVGKGPGCGFWAAGWRVWLFFMRGITPLLERWLGN 654

  Fly   715 LLSRQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRASVMHDIVDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRC 779
            ||:||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|||||||||||||||||||||||||
Frog   655 LLARQFEGRHSKGVAKTVTKQRVESHFDLELRAAVMHDILDMMPEGIKQNKARTILQHLSEAWRC 719

  Fly   780 WKANIPWKVPGLPIPIENMILRYVKMKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYL 844
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog   720 WKANIPWKVPGLPTPIENMILRYVKAKADWWTNTAHYNRERIRRGATVDKTVCKKNLGRLTRLYL 784

  Fly   845 KAEQERQHNYLKDGPYISPEEAVAIYTTTVHWLESRRFAPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEA 909
            |||||||||||||||||:.|||||:|||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
Frog   785 KAEQERQHNYLKDGPYITAEEAVAVYTTTVHWLESRRFSPIPFPPLSYKHDTKLLILALERLKEA 849

  Fly   910 YSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLIPVYEVEPL 974
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||:||||
Frog   850 YSVKSRLNQSQREELGLIEQAYDNPHEALSRIKRHLLTQRAFKEVGIEFMDLYSHLVPVYDVEPL 914

  Fly   975 EKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPSDTEPPPLLAYKWCQGINNLQDVWDVGEGECNVLLES 1039
            ||||||||||||||||||||||||||||:||||||||.|||||||||||||||..||||||:|||
Frog   915 EKITDAYLDQYLWYEADKRRLFPPWIKPADTEPPPLLVYKWCQGINNLQDVWDTTEGECNVMLES 979

  Fly  1040 RFEKLYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFSSFITQYY 1104
            ||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||
Frog   980 RFEKMYEKIDLTLLNRLLRLIVDHNIADYMTAKNNVVINYKDMNHTNSYGIIRGLQFASFIVQYY 1044

  Fly  1105 GLVLDLLVLGLHRSSEMAGPPQMPNDFLTFQDTVTETAHPIRLYCRYVDRIHLFFRFSAEEARDL 1169
            |||:|||||||||:||||||||||||||:|||..||:||||||:|||:||||:||||||:|||||
Frog  1045 GLVMDLLVLGLHRASEMAGPPQMPNDFLSFQDVATESAHPIRLFCRYIDRIHIFFRFSADEARDL 1109

  Fly  1170 IQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTIGWESTF 1234
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.||::|
Frog  1110 IQRYLTEHPDPNNENIVGYNNKKCWPRDARMRLMKHDVNLGRAVFWDIKNRLPRSVTTVQWENSF 1174

  Fly  1235 VSVYSKDNPNLLFNMSGFECRILPKCRTQNEEFTHRDGVWNLQNEITKERTAQCFLRVDDESLGR 1299
            |||||||||||||||.||||||||||||..|||||:|||||||||:||||||||||||||||:.|
Frog  1175 VSVYSKDNPNLLFNMCGFECRILPKCRTSYEEFTHKDGVWNLQNEVTKERTAQCFLRVDDESMQR 1239

  Fly  1300 FHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLN 1364
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog  1240 FHNRVRQILMASGSTTFTKIVNKWNTALIGLMTYFREAVVNTQELLDLLVKCENKIQTRIKIGLN 1304

  Fly  1365 SKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHDEDQLIPNLY 1429
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||
Frog  1305 SKMPSRFPPVVFYTPKELGGLGMLSMGHVLIPQSDLRWSKQTDVGITHFRSGMSHEEDQLIPNLY 1369

  Fly  1430 RYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEANAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDK 1494
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog  1370 RYIQPWESEFIDSQRVWAEYALKRQEAIAQNRRLTLEDLEDSWDRGIPRINTLFQKDRHTLAYDK 1434

  Fly  1495 GWRIRTEFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWE 1559
            |||:||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog  1435 GWRVRTDFKQYQVLKQNPFWWTHQRHDGKLWNLNNYRTDMIQALGGVEGILEHTLFKGTYFPTWE 1499

  Fly  1560 GLFWEKASGFEESMKYKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHG 1624
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Frog  1500 GLFWEKASGFEESMKWKKLTNAQRSGLNQIPNRRFTLWWSPTINRANVYVGFQVQLDLTGIFMHG 1564

  Fly  1625 KIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADI 1689
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Frog  1565 KIPTLKISLIQIFRAHLWQKIHESIVMDLCQVFDQELDALEIETVQKETIHPRKSYKMNSSCADI 1629

  Fly  1690 LLFPAYKWNVSRPSLLADTKDTMDNTTTQKYWLDIQLRWGDYDSHDVERYARAKFLDYTTDNMSI 1754
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Frog  1630 LLFASYKWNVSRPSLLADSKDVMDSTTTQKYWIDIQLRWGDYDSHDIERYARAKFLDYTTDNMSI 1694

  Fly  1755 YPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGCKTLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKALQLYSSEPT 1819
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Frog  1695 YPSPTGVLIAIDLAYNLHSAYGNWFPGGKPLIQQAMAKIMKANPALYVLRERIRKGLQLYSSEPT 1759

  Fly  1820 EPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHT 1884
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Frog  1760 EPYLSSQNYGELFSNQIIWFVDDTNVYRVTIHKTFEGNLTTKPINGAIFIFNPRTGQLFLKIIHT 1824

  Fly  1885 SVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSEL 1949
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Frog  1825 SVWAGQKRLGQLAKWKTAEEVAALIRSLPVEEQPKQIIVTRKGMLDPLEVHLLDFPNIVIKGSEL 1889

  Fly  1950 QLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNTERTKIIL 2014
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Frog  1890 QLPFQACLKVEKFGDLILKATEPQMVLFNLYDDWLKTISSYTAFSRLILILRALHVNNDRAKVIL 1954

  Fly  2015 KPDKTTITEAHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAP 2079
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Frog  1955 KPDKTTVTEPHHIWPTLTDEEWIKVEVQLKDLILADYGKKNNVNVASLTQSEIRDIILGMEISAP 2019

  Fly  2080 SAQRQQIAEIEKQTKEQNQLTATTTRTTNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISATNLH 2144
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Frog  2020 SQQRQQIAEIEKQTKEQSQLTATQTRTVNKHGDEIITSTTSNYETQTFSSKTEWRVRAISAANLH 2084

  Fly  2145 LRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNILKKFVTISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMPP 2209
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Frog  2085 LRTNHIYVSSDDIKETGYTYILPKNVLKKFICISDLRAQIAGYLYGVSPPDNPQVKEIRCIVMVP 2149

  Fly  2210 QWGTHQTINLPNTLPTHQYLKDMEPLGWIHTQPNELPQLSPQDITTHAKIMQENSNWDGEKTIVI 2274
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Frog  2150 QWGTHQTVHLPSQLPQHEYLKEMEPLGWVHTQPNESPQLSPQDVTTHAKVMADNPAWDGEKTIII 2214

  Fly  2275 TCSFTPGSCSLTAYKLTPSGFEWGSKNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSNKFLGFFMVPAQSSW 2339
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Frog  2215 TCSFTPGSCTLTAYKLTPSGYEWGRQNTDKGNNPKGYLPSHYERVQMLLSDRFLGFFMVPAQASW 2279

  Fly  2340 NYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHELHRTSHFLLFSNLEDGGDGAGADREDVYA 2396
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Frog  2280 NYNFMGVRHDPNMKYELQLANPKEFYHEVHRPSHFLNFALLQE-GEVYSADREDLYA 2335

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Prp8	NP_610735.1	PRP8	64..2396	CDD:227505	2130/2330 (91%)
		PRO8NT	118..268	CDD:285342	135/149 (91%)
		PROCN	456..856	CDD:285343	377/399 (94%)
		RRM_4	1046..1137	CDD:287556	85/90 (94%)
		U5_2-snRNA_bdg	1270..1402	CDD:287555	127/131 (97%)
		U6-snRNA_bdg	1502..1660	CDD:287554	156/157 (99%)
		RNase_H_like_Prp8_IV	1826..2076	CDD:260013	243/249 (98%)
		MPN_PRP8	2127..2377	CDD:163687	219/249 (88%)
prpf8	XP_002936105.2	PRP8	27..2335	CDD:227505	2124/2309 (92%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	0	0.000	Not matched by this tool.
Domainoid	1	1.000	816	1.000	Domainoid score	I70
eggNOG	0	0.000	Not matched by this tool.
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H4706
Inparanoid	1	1.050	4439	1.000	Inparanoid score	I4
OMA	1	1.010	-	-		QHG53611
OrthoDB	1	1.010	-	-		D156083at2759
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0004087
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto103821
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR11140
Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	1	1.030	-	avgDist	Average_Evolutionary_Distance	R1384
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X2835
SwiftOrtho	0	0.000	Not matched by this tool.
TreeFam	0	0.000	Not matched by this tool.
	12	12.110