DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hectd1 and HECTD1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_006240148.1 Gene:Hectd1 / 362736 RGDID:1561653 Length:2610 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_056197.3 Gene:HECTD1 / 25831 HGNCID:20157 Length:2610 Species:Homo sapiens


Alignment Length:2610 Identity:2583/2610 - (98%)
Similarity:2596/2610 - (99%) Gaps:0/2610 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65

  Rat    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130

  Rat   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195

  Rat   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260

  Rat   261 TGAPSAAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325
            |||||..||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   261 TGAPSTTADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPVVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325

  Rat   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390

  Rat   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455

  Rat   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPVY 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|
Human   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPIY 520

  Rat   521 LKRLLPVFAQTFQHTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDAGHNLPTALVEITATVLD 585
            |||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Human   521 LKRLLPVFAQTFQQTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDVGHNLPTILVEITATVLD 585

  Rat   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSALAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQE 650
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||
Human   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSTLAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQE 650

  Rat   651 DAKELQQGKPYHWRDWSVIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   651 DAKELQQGKPYHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715

  Rat   716 DSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   716 DSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780

  Rat   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHF 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHF 845

  Rat   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVLLKDESTISPYE 910
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||:||||||
Human   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIESENTWRDLMKTALENLIVLLKDENTISPYE 910

  Rat   911 MCSSGLVQALLTVLNSSIDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSESEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975
            |||||||||||||||:|:||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Human   911 MCSSGLVQALLTVLNNSMDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSENEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975

  Rat   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040

  Rat  1041 KQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1041 KQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105

  Rat  1106 GRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGVWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
Human  1106 GRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGLWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170

  Rat  1171 SKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPAKDEKQGWRHVRLKQMGKNASGQTHYLSLSGFE 1235
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||:||||||||||||||||||||
Human  1171 SKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPPKDEKQGWRHVRIKQMGKNASGQTHYLSLSGFE 1235

  Rat  1236 LYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGT 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1236 LYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGT 1300

  Rat  1301 VTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVK 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1301 VTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVK 1365

  Rat  1366 NNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLS 1430
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1366 NNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLS 1430

  Rat  1431 SAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRAPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVS 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Human  1431 SAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRTPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVS 1495

  Rat  1496 ELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1496 ELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA 1560

  Rat  1561 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATAT 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1561 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATAT 1625

  Rat  1626 TVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDE 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1626 TVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDE 1690

  Rat  1691 NEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPSGAGSRPIGEQEEEEYETKG 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
Human  1691 NEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPAGAGSRPIGEQEEEEYETKG 1755

  Rat  1756 GRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALT 1820
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1756 GRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALT 1820

  Rat  1821 LKVTGLGTTREVELPLSNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKE 1885
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1821 LKVTGLGTTREVELPLTNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKE 1885

  Rat  1886 KENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAA 1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  1886 KENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAA 1950

  Rat  1951 YKDFCEHGTRSGLNQGASSSLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNPCGVEDVLQLLRILYIVASDPY 2015
            |||||||||:|||||||.|:|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Human  1951 YKDFCEHGTKSGLNQGAISTLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNSCGVEDVLQLLRILYIVASDPY 2015

  Rat  2016 SRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETR 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2016 SRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETR 2080

  Rat  2081 QLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWA 2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2081 QLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWA 2145

  Rat  2146 ENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGTWLCDDNFPDDESRHVDLG 2210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Human  2146 ENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGAWLCDDNFPDDESRHVDLG 2210

  Rat  2211 GGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMC 2275
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2211 GGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMC 2275

  Rat  2276 MGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF 2340
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2276 MGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF 2340

  Rat  2341 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILGNKSLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSI 2405
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||
Human  2341 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILSNKGLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSI 2405

  Rat  2406 EDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFN 2470
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2406 EDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFN 2470

  Rat  2471 KVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDER 2535
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2471 KVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDER 2535

  Rat  2536 KAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLA 2600
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Human  2536 KAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLA 2600

  Rat  2601 ATMEKGFHLN 2610
            ||||||||||
Human  2601 ATMEKGFHLN 2610

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hectd1XP_006240148.1 Ank_2 366..457 CDD:289560 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK 369..479 CDD:238125 109/109 (100%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
F5_F8_type_C 1107..1240 CDD:304887 129/132 (98%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:284184 57/57 (100%)
HECTc 2131..2608 CDD:238033 473/476 (99%)
HECTc 2155..2607 CDD:214523 448/451 (99%)
HECTD1NP_056197.3 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 246..269 20/22 (91%)
Ank_2 366..457 CDD:403870 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK 1 395..424 28/28 (100%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK 2 426..455 28/28 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
ANK 3 459..491 31/31 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 489..513 23/23 (100%)
ANK 4 579..612 32/32 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 627..657 29/29 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 707..748 40/40 (100%)
Sad1_UNC 1107..1240 CDD:400199 129/132 (98%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:399589 57/57 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1343..1406 62/62 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1433..1483 48/49 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1496..1515 18/18 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1592..1611 18/18 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1674..1757 81/82 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1777..1797 19/19 (100%)
BTHB 1892..1965 CDD:408209 71/72 (99%)
K-box 2029..2103 73/73 (100%)
HECTc 2131..2608 CDD:238033 473/476 (99%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2297..2318 20/20 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C83687980
Domainoid 1 1.000 1272 1.000 Domainoid score I883
eggNOG 1 0.900 - - E1_COG5021
HGNC 1 1.500 - -
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9115
Inparanoid 1 1.050 5165 1.000 Inparanoid score I103
NCBI 1 1.000 - -
OMA 1 1.010 - - QHG52632
OrthoDB 1 1.010 - - D10145at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006411
OrthoInspector 1 1.000 - - oto130401
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_107049
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45670
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4675
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 1 0.960 - -
1818.270

Return to query results.
Submit another query.