DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hectd1 and Hectd1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_006240148.1 Gene:Hectd1 / 362736 RGDID:1561653 Length:2610 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:NP_659037.2 Gene:Hectd1 / 207304 MGIID:2384768 Length:2610 Species:Mus musculus


Alignment Length:2610 Identity:2593/2610 - (99%)
Similarity:2604/2610 - (99%) Gaps:0/2610 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65

  Rat    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130

  Rat   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195

  Rat   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260

  Rat   261 TGAPSAAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   261 TGAPSAAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325

  Rat   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390

  Rat   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455

  Rat   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPVY 520
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||:|
Mouse   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPRGDPEMAPLY 520

  Rat   521 LKRLLPVFAQTFQHTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDAGHNLPTALVEITATVLD 585
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||.||||||||||
Mouse   521 LKRLLPVFAQTFQHTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDVGHNLPTTLVEITATVLD 585

  Rat   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSALAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQE 650
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSALAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQE 650

  Rat   651 DAKELQQGKPYHWRDWSVIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715
            |||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   651 DAKELQQGKPYHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715

  Rat   716 DSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   716 DSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780

  Rat   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHF 845
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHF 845

  Rat   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVLLKDESTISPYE 910
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||
Mouse   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVLLKDENTISPYE 910

  Rat   911 MCSSGLVQALLTVLNSSIDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSESEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975
            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   911 MCSSGLVQALLTVLNNSIDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSESEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975

  Rat   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETSLIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040

  Rat  1041 KQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1041 KQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105

  Rat  1106 GRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGVWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1106 GRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGVWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170

  Rat  1171 SKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPAKDEKQGWRHVRLKQMGKNASGQTHYLSLSGFE 1235
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1171 SKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPAKDEKQGWRHVRLKQMGKNASGQTHYLSLSGFE 1235

  Rat  1236 LYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGT 1300
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1236 LYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGT 1300

  Rat  1301 VTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVK 1365
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1301 VTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVK 1365

  Rat  1366 NNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLS 1430
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1366 NNCPDKTSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLASTKTERRSEIVMEHSIVSGADVHEPIVVLS 1430

  Rat  1431 SAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRAPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVS 1495
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1431 SAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRAPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVS 1495

  Rat  1496 ELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA 1560
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1496 ELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNA 1560

  Rat  1561 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATAT 1625
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1561 TNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATAT 1625

  Rat  1626 TVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDE 1690
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1626 TVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDE 1690

  Rat  1691 NEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPSGAGSRPIGEQEEEEYETKG 1755
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||:||||||||||||
Mouse  1691 NEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHVVTSQLPQVPSGAGSRPVGEQEEEEYETKG 1755

  Rat  1756 GRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALT 1820
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1756 GRRRAWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALT 1820

  Rat  1821 LKVTGLGTTREVELPLSNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKE 1885
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1821 LKVTGLGTTREVELPLTNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKE 1885

  Rat  1886 KENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAA 1950
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  1886 KENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAA 1950

  Rat  1951 YKDFCEHGTRSGLNQGASSSLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNPCGVEDVLQLLRILYIVASDPY 2015
            |||||||||:|||||||.||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||
Mouse  1951 YKDFCEHGTKSGLNQGAISSLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQSPCGVEDVLQLLRILYIVASDPY 2015

  Rat  2016 SRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETR 2080
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2016 SRISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETR 2080

  Rat  2081 QLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWA 2145
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2081 QLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWA 2145

  Rat  2146 ENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGTWLCDDNFPDDESRHVDLG 2210
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2146 ENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGTWLCDDNFPDDESRHVDLG 2210

  Rat  2211 GGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMC 2275
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2211 GGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMC 2275

  Rat  2276 MGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF 2340
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2276 MGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWF 2340

  Rat  2341 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILGNKSLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSI 2405
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse  2341 NGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILGNKSLSEDEKNTKLQELVLRNPSGSGPPLSI 2405

  Rat  2406 EDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFN 2470
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2406 EDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFN 2470

  Rat  2471 KVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDER 2535
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2471 KVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDER 2535

  Rat  2536 KAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLA 2600
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse  2536 KAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLA 2600

  Rat  2601 ATMEKGFHLN 2610
            ||||||||||
Mouse  2601 ATMEKGFHLN 2610

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hectd1XP_006240148.1 Ank_2 366..457 CDD:289560 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK 369..479 CDD:238125 109/109 (100%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
F5_F8_type_C 1107..1240 CDD:304887 132/132 (100%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:284184 57/57 (100%)
HECTc 2131..2608 CDD:238033 475/476 (100%)
HECTc 2155..2607 CDD:214523 450/451 (100%)
Hectd1NP_659037.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 247..268 20/20 (100%)
Ank_2 366..457 CDD:289560 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK 369..479 CDD:238125 109/109 (100%)
ANK 1. /evidence=ECO:0000255 395..424 28/28 (100%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK 2. /evidence=ECO:0000255 426..455 28/28 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 450..469 18/18 (100%)
ANK 3. /evidence=ECO:0000255 459..491 31/31 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 489..513 22/23 (96%)
ANK 4. /evidence=ECO:0000255 579..612 32/32 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 627..657 29/29 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 707..748 40/40 (100%)
F5_F8_type_C 1107..1240 CDD:304887 132/132 (100%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:284184 57/57 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1343..1389 45/45 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1433..1475 41/41 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1592..1611 18/18 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1674..1756 79/81 (98%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1777..1801 23/23 (100%)
K-box. /evidence=ECO:0000250 2029..2103 73/73 (100%)
HECTc 2131..2608 CDD:238033 475/476 (100%)
HECTc 2155..2607 CDD:214523 450/451 (100%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 2297..2318 20/20 (100%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C55125333
Domainoid 1 1.000 1218 1.000 Domainoid score I1288
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H9115
Inparanoid 1 1.050 5138 1.000 Inparanoid score I134
OMA 1 1.010 - - QHG52632
OrthoDB 1 1.010 - - D10145at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006411
OrthoInspector 1 1.000 - - oto179920
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_107049
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR45670
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X4675
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1413.910

Return to query results.
Submit another query.