DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Hectd1 and hectd1

DIOPT Version :9

Sequence 1:XP_006240148.1 Gene:Hectd1 / 362736 RGDID:1561653 Length:2610 Species:Rattus norvegicus
Sequence 2:XP_012823549.1 Gene:hectd1 / 100192372 XenbaseID:XB-GENE-1010869 Length:2580 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2646 Identity:2315/2646 - (87%)
Similarity:2444/2646 - (92%) Gaps:102/2646 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Rat     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65

  Rat    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130
            ||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVEGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130

  Rat   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||||||||
 Frog   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDASLETCVESLSSLL 195

  Rat   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||.||.|
 Frog   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAQHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKTGRGT 260

  Rat   261 TGAPSAAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325
            :|.||.:.|||:|||||||||||||||||||:|||||||:||.||:|||||||||||||||||||
 Frog   261 SGGPSTSGDSKISNQVSTIVSLLSTLCRGSPVVTHDLLRAELLDSMESALQGDERCVLDTMRLVD 325

  Rat   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390

  Rat   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455

  Rat   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPVY 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||:|::|||||||||||||||:|
 Frog   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDEKKKKDSNREEEECNEPKGDPEMAPIY 520

  Rat   521 LKRLLPVFAQTFQHTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDAGHNLPTALVEITATVLD 585
            |||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.||||||||||
 Frog   521 LKRLLPVFAQTFQQTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCHSDAGHNLPTVLVEITATVLD 585

  Rat   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSALAGPSSDDENEEESKPE------- 643
            ||||||||||||||||||||||.|:|||||||||||||||.||||:|||||||:||||       
 Frog   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGDDLFLDQLARLGVISKVSTLAGPTSDDENEEDSKPEKVRIHLF 650

  Rat   644 ----------------KEDEPQEDAKELQQGKPYHWRDWSVIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNG 692
                            |||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   651 PLYSAHKGTQAAASQLKEDEPQEDAKELQQGRPYHWRDWSVIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNG 715

  Rat   693 WFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGN 757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||.|||.||||||
 Frog   716 WFRFILDGKLATMYSSGSPEGGSDSSESRSEFLEKLQRARSQVKPSTSSQPILSTPGPGKLTVGN 780

  Rat   758 WSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATILKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKL 822
            |||||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   781 WSLTCLKDGEIAIHNSDGQQATILKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKL 845

  Rat   823 KSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHFKAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRD 887
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||
 Frog   846 KSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHFKAVESMPRGVVVTLRNIATQLESAWELHTNRQCIEGENTWRD 910

  Rat   888 LMKTALENLIVLLKDESTISPYEMCSSGLVQALLTVLNSSIDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSE 952
            ||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||::.|.|:||||.|||||:|||||||||
 Frog   911 LMKTALENLIVLLKDENTISPYEMCSSGLVQALLTVLNNNEDCDIKQDCGQLVERLNVFKTAFSE 975

  Rat   953 SEDDESRPAVALIRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTG 1017
            :|||||||||||:|||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||:||||||
 Frog   976 NEDDESRPAVALVRKLIAVLESIERLPLHLYDTPGSSYNLQILTRRLRFRLERAPGETSLIDRTG 1040

  Rat  1018 RMLKMEPLATVESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGT 1082
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:.:||||||||:|||:|||||
 Frog  1041 RMLKMEPLATVESLEQYLLKMVAKQWYDFDRSSFVFVRKLREGQSCVFRHQHDFDDNGIMYWIGT 1105

  Rat  1083 NAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGVWVIP 1147
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||:||||:||||||||:||:|
 Frog  1106 NAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSEGRNLPYGRLEDILSRDSSALNCHTNDDKSAWFAIDLGLWVVP 1170

  Rat  1148 SAYTLRHARGYGRSALRNWVFQVSKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPAKDEKQGWRH 1212
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||::|||||||
 Frog  1171 SAYTLRHARGYGRSALRNWVFQVSKDGQNWTTLYTHMDDCSLNEPGSTATWPLDPAREEKQGWRH 1235

  Rat  1213 VRLKQMGKNASGQTHYLSLSGFELYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPG 1277
            ||:||.||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1236 VRIKQTGKNASGQTHYLSLSGFELYGNVTGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPG 1300

  Rat  1278 ARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGTVTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDT 1342
            ||||||:||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||::
 Frog  1301 ARVIRGIDWKWRDQDGSAQGEGTVTGELHNGWIDVIWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPES 1365

  Rat  1343 VASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVKNNCPDK-----------TSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSD 1396
            ..|||||||||:||..|||||||||||||           ..:.|||.|||||||||||||||||
 Frog  1366 AVSPKPVSSTVAGTPPSWSSLVKNNCPDKAPPSSSSSCVVVGSVAGSGSRKGSSSSVCSVASSSD 1430

  Rat  1397 ISLGSTKTERRSEIVMEHSIVSGADV-HEPIVVLSSAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENA 1460
            :||...|||||:|..:       :|: |:||::|||.:        ::|.:||.....||..|..
 Frog  1431 VSLSCAKTERRAEEQV-------SDIHHDPILLLSSNQ--------AASGSSTCPPGGETVGEGG 1480

  Rat  1461 ERKLGPDSSVRAPGESSAISMGIVSVSSPDVSSVSELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAG 1525
            :||         .||:.|||||:||:|||||||||||:|||.|..|||.||||||||||||||||
 Frog  1481 DRK---------AGEAPAISMGMVSISSPDVSSVSELSNKEVAVPRPLGSSASNRLSVSSLLAAG 1536

  Rat  1526 APMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPL 1590
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.:|:|||||
 Frog  1537 APMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRRVANIARTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNAVSSATSPL 1601

  Rat  1591 MGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVTSSSNVATATTVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEA 1655
            |||||||||||.|||||||||||||| |||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1602 MGAQSFPNLTTTGTTSTVTMSTSSVT-SSNVATATTGLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEA 1665

  Rat  1656 EYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDENEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRS 1720
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||               
 Frog  1666 EYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDLPEPDEEDDENEDDNQEEQEYEEVM--------------- 1715

  Rat  1721 DVTHHAVTSQLPQVPSGAGSRPIGEQEEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRT 1785
                                      |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  1716 --------------------------EEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRT 1754

  Rat  1786 NVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVECTPSPRLALTLKVTGLGTTREVELPLSNFRSTIFYYVQKL 1850
            |||||||||||.||||||||||||||.|:|||||||||||||:.|||||||:|||||||:|||:|
 Frog  1755 NVQQTTDLEIPAPGTPHSELLEEVECAPAPRLALTLKVTGLGSGREVELPLNNFRSTIFFYVQRL 1819

  Rat  1851 LQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKEKENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLIT 1915
            |||||||.:|:|||||||||||||||||||||||:||.|::||||:|||||.||||.||||||||
 Frog  1820 LQLSCNGAIKTDKLRRIWEPTYTIMYREMKDSDKQKECGRLGCWSVEHVEQSLGTDALPKNDLIT 1884

  Rat  1916 YLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCEHGTRSGLNQGASSSLQSSDILNLT 1980
            |||:|||..|||.||||||||||||||||||||||||||||:|.:|.....|.::|||:|||:.:
 Frog  1885 YLQRNADPGFLRRWKLTGTNKSIRKNRNCSQLIAAYKDFCENGCKSLSMPAALATLQSADILSHS 1949

  Rat  1981 KEQPQAKAGNGQNPCGVEDVLQLLRILYIVASDPYS-RISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTK 2044
            :||.|||||:.||.|||||||||||||:|||||||| |..||||::...|:.||:||||||||||
 Frog  1950 REQAQAKAGSSQNSCGVEDVLQLLRILFIVASDPYSARTPQEDGEDMLLFSVPPEEFTSKKITTK 2014

  Rat  2045 ILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERT 2109
            |:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:
 Frog  2015 IVQQIEEPLALASGALPDWCEQLTSKCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERS 2079

  Rat  2110 RTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPT 2174
            ||.|:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2080 RTASAVRRDDPGEFRVGRLKHERVKVPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPT 2144

  Rat  2175 LEFYALVAAEFQRTDLGTWLCDDNFPDDESRHVDLGGGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELE 2239
            ||||||||||||:||||.|||||:|||||||.|||||||||||||||||||||.||:||||:||:
 Frog  2145 LEFYALVAAEFQKTDLGIWLCDDDFPDDESRQVDLGGGLKPPGYYVQRSCGLFIAPYPQDSEELD 2209

  Rat  2240 RITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSE 2304
            |:|:|.||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||:...||||||||
 Frog  2210 RVTRLCHFLGVFLAKCIQDNRLVDLPISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLLYASRGEESEHCTESQSE 2274

  Rat  2305 ASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFILDPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIK 2369
            ||||:|||:|||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||:||||||||::|::||:|
 Frog  2275 ASTEDGHDALSVGSFEEDCKSEFILDPPKPKPPAWFQGILTWEDFELINPHRARFLRDIRELAVK 2339

  Rat  2370 RRQILGNKSLSEDEKNTKLQELVLKNPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGED 2434
            |||||||:.||||||||:||||:||||||||||:||||||||||||||||:|||:||||:|:|||
 Frog  2340 RRQILGNRCLSEDEKNTQLQELMLKNPSGSGPPVSIEDLGLNFQFCPSSRVYGFSAVDLRPNGED 2404

  Rat  2435 EMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQKQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWA 2499
            ||:|:|||||||||||||||.||:||||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||||:
 Frog  2405 EMVTIDNAEEYVDLMFDFCMQTGVQKQMEAFRSGFNKVFPMEKLGSFSPEEVQMILCGNQSPSWS 2469

  Rat  2500 AEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVR 2564
            ||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog  2470 AEDIINYTEPKLGYTRESPGFLRFVRVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVR 2534

  Rat  2565 KVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRERLLAATMEKGFHLN 2610
            |||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||
 Frog  2535 KVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYSSEEIMRDRLLAATMEKGFHLN 2580

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Hectd1XP_006240148.1 Ank_2 366..457 CDD:289560 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
ANK 369..479 CDD:238125 109/109 (100%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
F5_F8_type_C 1107..1240 CDD:304887 121/132 (92%)
MIB_HERC2 1277..1335 CDD:284184 54/57 (95%)
HECTc 2131..2608 CDD:238033 429/476 (90%)
HECTc 2155..2607 CDD:214523 404/451 (90%)
hectd1XP_012823549.1 Ank_2 366..457 CDD:372319 90/90 (100%)
ANK repeat 366..393 CDD:293786 26/26 (100%)
PLN03192 <386..612 CDD:215625 215/225 (96%)
ANK repeat 396..426 CDD:293786 29/29 (100%)
ANK repeat 428..457 CDD:293786 28/28 (100%)
F5_F8_type_C 1130..1263 CDD:390053 121/132 (92%)
MIB_HERC2 1300..1358 CDD:369043 54/57 (95%)
BTHB 1861..1927 CDD:375836 58/65 (89%)
HECTc 2101..2578 CDD:238033 429/476 (90%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 1220 1.000 Domainoid score I337
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 00.000 Not matched by this tool.
Homologene 1 1.000 - - H9115
Inparanoid 1 1.050 4574 1.000 Inparanoid score I68
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 1 1.010 - - D10145at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0006411
OrthoInspector 1 1.000 - - oto212361
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X4675
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
88.060

Return to query results.
Submit another query.