DRSC - DRSC Integrative Ortholog Prediction Tool

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Protein Alignment Hectd1 and hectd1

DIOPT Version :9

Sequence 1:	XP_006240148.1	Gene:	Hectd1 / 362736	RGDID:	1561653	Length:	2610	Species:	Rattus norvegicus
Sequence 2:	XP_009291386.1	Gene:	hectd1 / 100002034	ZFINID:	ZDB-GENE-030616-153	Length:	2585	Species:	Danio rerio

Alignment Length:	2621	Identity:	2303/2621 - (87%)
Similarity:	2450/2621 - (93%)	Gaps:	47/2621 - (1%)

- Green bases have known domain annotations that are detailed below.

  Rat     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65
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Zfish     1 MADVDPDTLLEWLQMGQGDERDMQLIALEQLCMLLLMSDNVDRCFETCPPRTFLPALCKIFLDES 65

  Rat    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 APDNVLEVTARAITYYLDVSAECTRRIVGVDGAIKALCNRLVVVELNNRTSRDLAEQCVKVLELI 130

  Rat   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLTFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCGKMEPQDSSLEICVESLSSLL 195
            ||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||.||||||||||.|||||||||
Zfish   131 CTRESGAVFEAGGLNCVLSFIRDSGHLVHKDTLHSAMAVVSRLCSKMEPQDSSLETCVESLSSLL 195

  Rat   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTVSGPSSACKPGRST 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||::
Zfish   196 KHEDHQVSDGALRCFASLADRFTRRGVDPAPLAKHGLTEELLSRMAAAGGTASGPSSTCKPGRTS 260

  Rat   261 TGAPSAAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSIESALQGDERCVLDTMRLVD 325
            :||..:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||
Zfish   261 SGAAPSAADSKLSNQVSTIVSLLSTLCRGSPLVTHDLLRSELPDSMESALQGDERCVLDTMRLVD 325

  Rat   326 LLLVLLFEGRKALPKSSAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390
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Zfish   326 LLLVLLFEGRKALPKSTAGSTGRIPGLRRLDSSGERSHRQLIDCIRSKDTDALIDAIDTGAFEVN 390

  Rat   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455
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Zfish   391 FMDDVGQTLLNWASAFGTQEMVEFLCERGADVNRGQRSSSLHYAACFGRPQVAKTLLRHGANPDL 455

  Rat   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDTNKDEEECNEPKGDPEMAPVY 520
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Zfish   456 RDEDGKTPLDKARERGHSEVVAILQSPGDWMCPVNKGDDKKKKDVNKEEEEGSEPKGDPEMAPIY 520

  Rat   521 LKRLLPVFAQTFQHTMLPSIRKASLALIRKMIHFCSEALLKEVCDSDAGHNLPTALVEITATVLD 585
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Zfish   521 LKRLLPVFAQTFQQTMLPSIRKASLALIRKMVHYSSEVLLKEVCDSDAGHNLPTVLVEITATVLD 585

  Rat   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDIFLDQLARLGVISKVSALAGPSSDDENEEESKPEKEDEPQE 650
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Zfish   586 QEDDDDGHLLALQIIRDLVDKGGDVFLDQLARLGVINKVSTLAGPTSDDENEEEAKPEKDDEPQE 650

  Rat   651 DAKELQQGKPYHWRDWSVIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715
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Zfish   651 DAKEIQQGKPYHWRDWSIIRGRDCLYIWSDAAALELSNGSNGWFRFILDGKLATMYSSGSPEGGS 715

  Rat   716 DSSESRSEFLEKLQRARGQVKPSTSSQPILSAPGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780
            |||||||||||||||||.||||.|:||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   716 DSSESRSEFLEKLQRARSQVKPVTASQPILSTQGPTKLTVGNWSLTCLKEGEIAIHNSDGQQATI 780

  Rat   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVRTMARDLYDDHF 845
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Zfish   781 LKEDLPGFVFESNRGTKHSFTAETSLGSEFVTGWTGKRGRKLKSKLEKTKQKVKTMARDLYDDHF 845

  Rat   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESSWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVLLKDESTISPYE 910
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Zfish   846 KAVESMPRGVVVTLRNIATQLESAWELHTNRQCIEGENTWRDLMKTALENLIVVLKDENTISPYE 910

  Rat   911 MCSSGLVQALLTVLNSSIDLDMKQDCSQLVERINVFKTAFSESEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975
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Zfish   911 MCSSGLVQALFTVLSNSVELDIKHDCKPLMERINVFKTAFTENEDDESRPAVALIRKLIAVLESI 975

  Rat   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040
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Zfish   976 ERLPLHLYDTPGSTYNLQILTRRLRFRLERAPGETALIDRTGRMLKMEPLATVESLEQYLLKMVA 1040

  Rat  1041 KQWYDFDRSSFVFVRKLREGQNFIFRHQHDFDENGIIYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105
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Zfish  1041 KQWYDFDRSSFIFVRKLREGQNFTFRHQHDFDENGIVYWIGTNAKTAYEWVNPAAYGLVVVTSSE 1105

  Rat  1106 GRNLPYGRLEDILSRDNSALNCHSNDDKNAWFAIDLGVWVIPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170
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Zfish  1106 GRNLPYGRLEDILSRDSSALNCHTNDDKNAWFAIDLGLWFVPSAYTLRHARGYGRSALRNWVFQV 1170

  Rat  1171 SKDGQNWTSLYTHVDDCSLNEPGSTATWPLDPAKDEKQGWRHVRLKQMGKNASGQTHYLSLSGFE 1235
            |||||||.:|||||||.|||||||||||||||:|||||||||:|:||||||||||||||||||.|
Zfish  1171 SKDGQNWMTLYTHVDDSSLNEPGSTATWPLDPSKDEKQGWRHIRIKQMGKNASGQTHYLSLSGLE 1235

  Rat  1236 LYGTVNGVCEDQLGKAAKEAEANLRRQRRLVRSQVLKYMVPGARVIRGLDWKWRDQDGSPQGEGT 1300
            :||||.||||||||||.|||||||||||||.||||:||:||||||:||:|||||||||:|.||||
Zfish  1236 IYGTVTGVCEDQLGKAVKEAEANLRRQRRLFRSQVMKYIVPGARVVRGIDWKWRDQDGNPAGEGT 1300

  Rat  1301 VTGELHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPDTVASPKPVSSTVSGTTQSWSSLVK 1365
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||::..|||||||||:||.||||||||
Zfish  1301 VTGEAHNGWIDVTWDAGGSNSYRMGAEGKFDLKLAPGYDPESAPSPKPVSSTVAGTPQSWSSLVK 1365

  Rat  1366 NNCPDK----TSAAAGSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLGSTKTERRSEIVMEHSI-----VSGAD 1421
            ||||||    ::|.|.||||||||||||||||||||||.||:.|||.|.:.|..:     ..||:
Zfish  1366 NNCPDKGGSSSTAGASSSSRKGSSSSVCSVASSSDISLSSTRVERRVESLFEQGVGVIGGPPGAE 1430

  Rat  1422 VHEPIVVLSSAENVPQTEVGSSSSASTSTLTAETGSENAERKLGPDSSVRAPGESSAISMGIVSV 1486
            ..||||||||||        :.|::|||||||:||||:..:..|||.: |...||:|||||||||
Zfish  1431 GQEPIVVLSSAE--------AGSASSTSTLTADTGSESERKTPGPDGT-RQSAESTAISMGIVSV 1486

  Rat  1487 SSPDVSSVSELTNKEAASQRPLSSSASNRLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSRETSSLESFVRR 1551
            ||||||||||.::|:|||||||.|:.|.|||||||||||||||||||||||||||.|.:||||||
Zfish  1487 SSPDVSSVSESSSKDAASQRPLCSATSARLSVSSLLAAGAPMSSSASVPNLSSREASLMESFVRR 1551

  Rat  1552 VANIARTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTPGTTSTVTMSTSSVT 1616
            ..|::|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||
Zfish  1552 APNMSRTNATNNMNLSRSSSDNNTNTLGRNVMSTATSPLMGAQSFPNLTTTGTTSTVTMSTSIVT 1616

  Rat  1617 SSSNVATATTVLSVGQSLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEYSLYDFLDSCRASTLLAELDDDEDL 1681
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Zfish  1617 SSNNVATATTGLSVGQLLSNTLTTSLTSTSSESDTGQEAEFSLYDFLDSCRANTLLAELDDEEDL 1681

  Rat  1682 PEPDEEDDENEDDNQEDQEYEEVMILRRPSLQRRAGSRSDVTHHAVTSQLPQVPSGAGSRPIGEQ 1746
            ||||::||||||||||:||||||::          .||.::.:|...                .:
Zfish  1682 PEPDDDDDENEDDNQEEQEYEEVLV----------RSRVNLGYHVHI----------------HR 1720

  Rat  1747 EEEEYETKGGRRRTWDDDYVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPHSELLEEVEC 1811
            ||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||:.|||||
Zfish  1721 EEEEYETKGGRRRTWDDDFVLKRQFSALVPAFDPRPGRTNVQQTTDLEIPPPGTPRSEVQEEVEC 1785

  Rat  1812 TPSPRLALTLKVTGLGTTREVELPLSNFRSTIFYYVQKLLQLSCNGNVKSDKLRRIWEPTYTIMY 1876
            .|||||||.|||.||||||||||||:|::|||||||||||||||||.:|.|||||||||||||||
Zfish  1786 APSPRLALILKVAGLGTTREVELPLTNYKSTIFYYVQKLLQLSCNGAIKPDKLRRIWEPTYTIMY 1850

  Rat  1877 REMKDSDKEKENGKMGCWSIEHVEQYLGTDELPKNDLITYLQKNADAAFLRHWKLTGTNKSIRKN 1941
            ||:||||||:|:|||||||:||||||||||||||||||||:|||||:.|||||||||:|||||||
Zfish  1851 RELKDSDKERESGKMGCWSVEHVEQYLGTDELPKNDLITYMQKNADSTFLRHWKLTGSNKSIRKN 1915

  Rat  1942 RNCSQLIAAYKDFCEHGTR-SGLNQGASSSLQSSDILNLTKEQPQAKAGNGQNPCGVEDVLQLLR 2005
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Zfish  1916 RNCSQLIAAYKDFCERGCRSSGLSSGTLSTTQSCDILSAAREQAQAKAGSGQSACSVEDVLQLLR 1980

  Rat  2006 ILYIVASDPYS-RISQEDGDEQPQFTFPPDEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTS 2069
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Zfish  1981 ILFTIGGEPTSGRTLQEDVEEL-QFNASPEEFTSKKITTKILQQIEEPLALASGALPDWCEQLTS 2044

  Rat  2070 KCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATVERTRTTSSVRRDDPGEFRVGRLKHERVK 2134
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||:|.:::||||||||||||||||||||
Zfish  2045 KCPFLIPFETRQLYFTCTAFGASRAIVWLQNRREATMERSRPSTTVRRDDPGEFRVGRLKHERVK 2109

  Rat  2135 VPRGESLMEWAENVMQIHADRKSVLEVEFLGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTDLGTWLCDDNF 2199
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Zfish  2110 VPRGESMMEWAESVMQIHADRKSVLEVEFQGEEGTGLGPTLEFYALVAAEFQRTSLGIWLCDDDF 2174

  Rat  2200 PDDESRHVDLGGGLKPPGYYVQRSCGLFTAPFPQDSDELERITKLFHFLGIFLAKCIQDNRLVDL 2264
            ||||||.|||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Zfish  2175 PDDESRQVDLGGGLKPPGYYVQRSCGLFPAPFPQDSDELERITKLFLFLGIFLAKCIQDNRLVDL 2239

  Rat  2265 PISKPFFKLMCMGDIKSNMSKLIYESRGDRDLHCTESQSEASTEEGHDSLSVGSFEEDSKSEFIL 2329
            |||:|||||:||||||||||||:|::||:.|.|.:|.|||||||||.|:.|||||:|||||||||
Zfish  2240 PISQPFFKLLCMGDIKSNMSKLLYQTRGESDCHFSEIQSEASTEEGQDTYSVGSFDEDSKSEFIL 2304

  Rat  2330 DPPKPKPPAWFNGILTWEDFELVNPHRARFLKEIKDLAIKRRQILGNKSLSEDEKNTKLQELVLK 2394
            ||||||||||::||||||||||||||||.||||:|.|::||||||||||||||||||:||:|:||
Zfish  2305 DPPKPKPPAWYHGILTWEDFELVNPHRALFLKELKALSVKRRQILGNKSLSEDEKNTRLQDLMLK 2369

  Rat  2395 NPSGSGPPLSIEDLGLNFQFCPSSRIYGFTAVDLKPSGEDEMITMDNAEEYVDLMFDFCMHTGIQ 2459
            ||.||||||.:|||||||||||||:::||::|||||:|||||:|||||||||:||||||||||||
Zfish  2370 NPMGSGPPLCVEDLGLNFQFCPSSKVHGFSSVDLKPNGEDEMVTMDNAEEYVELMFDFCMHTGIQ 2434

  Rat  2460 KQMEAFRDGFNKVFPMEKLSSFSHEEVQMILCGNQSPSWAAEDIINYTEPKLGYTRDSPGFLRFV 2524
            |||||||:||||||||||||||||:||||||||||||||.||||:||||||||||||||||||||
Zfish  2435 KQMEAFREGFNKVFPMEKLSSFSHKEVQMILCGNQSPSWTAEDIVNYTEPKLGYTRDSPGFLRFV 2499

  Rat  2525 RVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTVVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYS 2589
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||||||||||||||||||
Zfish  2500 RVLCGMSSDERKAFLQFTTGCSTLPPGGLANLHPRLTIVRKVDATDASYPSVNTCVHYLKLPEYS 2564

  Rat  2590 SEEIMRERLLAATMEKGFHLN 2610
            |||||||||||||||||||||
Zfish  2565 SEEIMRERLLAATMEKGFHLN 2585

Known Domains:

Indicated by green bases in alignment.

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Hectd1	XP_006240148.1	Ank_2	366..457	CDD:289560	90/90 (100%)
		ANK repeat	366..393	CDD:293786	26/26 (100%)
		ANK	369..479	CDD:238125	109/109 (100%)
		ANK repeat	396..426	CDD:293786	29/29 (100%)
		ANK repeat	428..457	CDD:293786	28/28 (100%)
		F5_F8_type_C	1107..1240	CDD:304887	119/132 (90%)
		MIB_HERC2	1277..1335	CDD:284184	52/57 (91%)
		HECTc	2131..2608	CDD:238033	426/476 (89%)
		HECTc	2155..2607	CDD:214523	403/451 (89%)
hectd1	XP_009291386.1	Ank_2	366..457	CDD:289560	90/90 (100%)
		ANK repeat	366..393	CDD:293786	26/26 (100%)
		ANK	369..479	CDD:238125	109/109 (100%)
		ANK repeat	396..426	CDD:293786	29/29 (100%)
		ANK repeat	428..457	CDD:293786	28/28 (100%)
		F5_F8_type_C	1107..1240	CDD:304887	119/132 (90%)
		MIB_HERC2	1277..1335	CDD:284184	52/57 (91%)
		HECTc	2106..2583	CDD:238033	426/476 (89%)
		HECTc	2130..2582	CDD:214523	403/451 (89%)

Information from Original Tools:

Tool	Simple Score	Weighted Score	Original Tool Information
Tool	Simple Score	Weighted Score	BLAST Result	Score	Score Type	Cluster ID
Compara	1	0.930	-	-		C194896972
Domainoid	1	1.000	1222	1.000	Domainoid score	I202
eggNOG	0	0.000	Not matched by this tool.
Hieranoid	1	1.000	-	-
Homologene	1	1.000	-	-		H9115
Inparanoid	1	1.050	4574	1.000	Inparanoid score	I41
OMA	1	1.010	-	-		QHG52632
OrthoDB	1	1.010	-	-		D10145at33208
OrthoFinder	1	1.000	-	-		FOG0006411
OrthoInspector	1	1.000	-	-		oto68174
orthoMCL	1	0.900	-	-		OOG6_107049
Panther	1	1.100	-	-	LDO	PTHR45670
Phylome	1	0.910	-	-
SonicParanoid	1	1.000	-	-		X4675
SwiftOrtho	1	1.000	-	-
TreeFam	0	0.000	Not matched by this tool.
	14	13.910