Protein Alignment Amfr and Amfr

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001414073.1
• Gene: Amfr / 361367
• RGDID: 1311551
• Length: 643
• Species: Rattus norvegicus
• Sequence 2: NP_035917.2
• Gene: Amfr / 23802
• MGIID: 1345634
• Length: 639
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 643
• Identity: 630/643 - (97%)
• Similarity: 632/643 - (98%)
• Gaps: 4/643 - (0%)

  Rat     1 MPLLFLERFPWPSLRTYTGLSGLALLGTIVSAYRALSQPEDGSGEPEPLTAPLQPEALAPARLTP 65
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||    ||||.
Mouse     1 MPLLFLERFPWPSLRTYTGLSGLALLGTIVSAYRALSQPEDGSGEPEPLTAPLQPE----ARLTA 61

  Rat    66 GGPRVRDVAQYLLSDSLFVWVLVNTACCVLMLVAKLIQCIVFGPLRVSERQHLKDKFWNFIFYKF 130
            ||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse    62 GGPRARDVAQYLLSDSLFVWVLVNTACCVLMLVAKLIQCIVFGPLRVSERQHLKDKFWNFIFYKF 126

  Rat   131 IFIFGVLNVQTVEEVVMWCLWFAGLVFLHLMVQLCKDRFEYLSFSPTTPMSSHGRVLSLLIAMLL 195
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   127 IFIFGVLNVQTVEEVVMWCLWFAGLVFLHLMVQLCKDRFEYLSFSPTTPMSSHGRVLSLLIAMLL 191

  Rat   196 SCCGLAVVCCVTGYTHGMHTLAFMAAESLLVTVRTAHVILRYVIHLWDLNHEGTWEGKGTYVYYT 260
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   192 SCCGLAVVCCVTGYTHGMHTLAFMAAESLLVTVRTAHVILRYVIHLWDLNHEGTWEGKGTYVYYT 256

  Rat   261 DFVMELMLLSLDLMHHIHMLLFGNIWLSMASLVIFMQLRYLFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEAR 325
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   257 DFVMELALLSLDLMHHIHMLLFGNIWLSMASLVIFMQLRYLFHEVQRRIRRHKNYLRVVGNMEAR 321

  Rat   326 FAVATAEELAVNNDDCAICWDSMQAARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADGSRA 390
            |||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   322 FAVATPEELAVNNDDCAICWDSMQAARKLPCGHLFHNSCLRSWLEQDTSCPTCRMSLNIADGSRA 386

  Rat   391 REDHQGENLDENLVPVAAAEGRPRLNQHNHFFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGITQASNS 455
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   387 REDHQGENLDENLVPVAAAEGRPRLNQHNHFFHFDGSRIASWLPSFSVEVMHTTNILGITQASNS 451

  Rat   456 QLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQMTRSVEITTDNILEGRIQVPFPVQRSDSLRPALNSPVER 520
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Mouse   452 QLNAMAHQIQEMFPQVPYHLVLQDLQMTRSVEITTDNILEGRIQVPFPTQRSDSLRPALNSPVER 516

  Rat   521 PGTDLEEGEASVQTERVPLDLSPRLEETLDFSEVELEPVEVEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQR 585
            |..|||||||||||||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||||
Mouse   517 PSPDLEEGEASVQTERVPLDLSPRLEETLDFSEVELEPIEVEDFEARGSRFSKSADERQRMLVQR 581

  Rat   586 KDDLLQQARKRFLNKSSEDDGASERLLPSEGTSSDPVTLRRRMLAAAAERRLQRQQTT 643
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:||
Mouse   582 KDDLLQQARKRFLNKSSEDDGASERLLPSEGTSSDPVTLRRRMLAAAAERRLQRQRTT 639

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Amfr	NP_001414073.1	None
Amfr	NP_035917.2	HRD1	82..>378	CDD:227568	293/295 (99%)
		RING-H2_AMFR	335..378	CDD:438119	42/42 (100%)
		CUE_AMFR	454..494	CDD:270604	39/39 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	500..531		27/30 (90%)
		G2BR	571..596	CDD:375868	24/24 (100%)
		Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite	594..620		25/25 (100%)
		VCP/p97-interacting motif (VIM). /evidence=ECO:0000250|UniProtKB:Q9UKV5	618..636		17/17 (100%)