DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment wde and Atf7ip

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610608.1 Gene:wde / 36133 FlyBaseID:FBgn0027499 Length:1420 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_063142223.1 Gene:Atf7ip / 312800 RGDID:1306030 Length:1317 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:1582 Identity:331/1582 - (20%)
Similarity:517/1582 - (32%) Gaps:544/1582 - (34%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 MGVNQTMELKELSTEEALMRTLSTELGNEV--EPLS-TPAILNESSQTSVDEVDLCELTNGVDSS 63
            :||....|  :|:: |||..:::::|.::|  ||.| |||..|....|...:...|:..    :|
  Rat   105 VGVKNKQE--DLNS-EALSPSITSDLASKVTTEPASGTPASDNPGCDTLASDNPGCDTL----AS 162

  Fly    64 DNVKVIDKPKKISDRERNPGS-DLDA--LLDKISSI-------VDCSPRNSDDIDSLDR--DEEC 116
            || ...|.|...:....|||| ||.|  |..::.:.       :..|..:|.|..|.|.  .:.|
  Rat   163 DN-PASDNPASDNPASDNPGSGDLAAGELTTRVPTAGESACEELPSSHPSSSDPSSSDPTFSDPC 226

  Fly   117 DSASAKKRTAAD--TDENLKEQREKPEEEEEGEEVLSSLEGEECIDP-DSELKTEEKLDETEEHA 178
            .|......||::  |.:.|........:...||.|..        :| .||..:||::  |...|
  Rat   227 CSDPVSGDTASEEPTSDALASGDSASGDSASGEPVSH--------EPASSEPASEERV--TGAVA 281

  Fly   179 SAKESTQKTEDLADSDEILKSKEEDEVPANTADNIEKDRKNTSTDDVFMYALDCISSADEFDAFA 243
            |.        |||..:..|.                                ||::|.|      
  Rat   282 SC--------DLASGESALD--------------------------------DCVTSGD------ 300

  Fly   244 SQDSKKAKPSKKLNTENNSSVNDLEDISSDDDDIIKETEKPNTEVIDLDSSSECVP--------- 299
                                        |..||:....|...|.|....:|.|.:|         
  Rat   301 ----------------------------SPSDDLPSSEESLRTSVCSRLASGELIPGELTVESAT 337

  Fly   300 ----------CEAESEVEETEANT----------EDTEVLTHGKVSTKKSLN----LQNNISEKS 340
                      ||...:.::||.|:          :|.|.|  .::.:|.:.:    :.:|::||.
  Rat   338 DSFKPSSVPVCEPGPDTDKTEQNSKNNDDCPDRNDDDEDL--AQIQSKDAFDEGNKVNSNVAEKE 400

  Fly   341 ASAAEYESVKADQHLTEGKEPMLVGDEVTEKSKESIPIQSEESIQVDEPEESKESEELEEHKEKE 405
            .:...:.::....||.......:..|.|.|.:.|...|.|  |::||:.|:              
  Rat   401 GTLETHSAIIHSDHLPPENTKKVEEDAVAEPALEEEAISS--SMEVDQSEK-------------- 449

  Fly   406 EPDYCKETKDSEEATEKEKSEIKIIKASKVAQILGDTKEEEDPSPTQEVEDVKETEEPENKKEIE 470
                           ::.||.::::.|:           .|||           |||.:.....:
  Rat   450 ---------------DRHKSPVELVDAA-----------SEDP-----------TEEGKKNTVSD 477

  Fly   471 DTEELEEPVVIEGEETEDPQKKVQKEFDVRTADHEMNYTTIDDKLDEAVKDVVEIEEKKA-AEDE 534
            :|:.:|                                          ..:::.|.||.| .|||
  Rat   478 NTDSME------------------------------------------TDEIIPILEKLAPTEDE 500

  Fly   535 LGVIPKGDKEPTTNGACEISTDGNLKDLESNESTVVEEETKETESDDEVIFFEPLDKTENVGTTA 599
            |....|....|.                             ||..|.|       ||.|  |:..
  Rat   501 LSCFSKTSLLPV-----------------------------ETSQDLE-------DKME--GSFG 527

  Fly   600 NPTNENSVKPQAKDDEVVLVSEDEDETPQNGISEKEVQTIQKETALKGLPNESTTESVEAKNLQI 664
            :|:.:.|.:...|  |..||..||::. ..|..|.||....|.::.:|..:|..:::.|.|.:..
  Rat   528 SPSKQESSENLPK--EAFLVLSDEEDI-SCGKDESEVLAQNKTSSPEGERSEKDSKAEEEKRVPD 589

  Fly   665 DNSDNACDQFEKLKTHDMVKQTTTEDGNSNSSNLLRPAEYAEESVPKRLRLSTDEKNEFEAETNQ 729
            :......::|.:.      |::.:||.:|..|...|   |.||              |:|||   
  Rat   590 EERPPGRNEFSRR------KRSKSEDMDSVQSKRRR---YMEE--------------EYEAE--- 628

  Fly   730 ESLPILSRAEGGLKDVTKRSHEHLDSSPQEE------------IPNKKAKTEDSDSNSSHEGT-- 780
              ..:...|:|   |:.::..:.:....:|:            :...|.:.|..:.|..|:..  
  Rat   629 --FQVKITAKG---DINQKLQKVIQWLLEEKLCALQCAVFDKTLAELKTRVEKIECNKRHKAVLT 688

  Fly   781 -LQIDMGGQEDKEESPKKDTQKKLDFDLNPVPEIKQNVKPLRLEFFKTFRRSFDTMTRDDLEELV 844
             ||..:.....:..:.|.|.:|:.:..  |.|.|... ||..                       
  Rat   689 ELQAKIARLTKRFGAAKDDLKKRQESP--PNPPISPG-KPAN----------------------- 727

  Fly   845 LQKVVEAMMVKSDFAEIRMQLDKCESTLANYRRKIAEVSKQFLDLETVHKRVLKDLEAKNSHFTA 909
                                 |...:....||.  |...:|.|:    .||.:.  |.....|..
  Rat   728 ---------------------DVNSNNNVTYRN--AGTVRQLLE----SKRNIS--EGPPPSFQT 763

  Fly   910 PVRI---------TRAVGLQVGIPFKAIKPTV-AAP----ESTHAAGSVLAPPSGTP-PKASTSP 959
            ||..         :.||..|..:...|...:: |||    .||....:....|||.| |..|..|
  Rat   764 PVNTVSSASHGPSSAAVSSQPKVQPSATSGSLPAAPLLPVPSTATVVATTQVPSGNPQPTISLQP 828

  Fly   960 TRATVRPRPPPPTFGPSTSSSETGAGVSVTPNSNHQ----QQQPAARSSQSLTTASVT-PPVRRG 1019
            ....:.. |...|..|....|..|..|:..|:.|.:    |.||..   ..||...|: ||:   
  Rat   829 LPVILHV-PVAVTSQPQLLQSHPGTLVTNQPSGNVEFISVQSQPTV---SGLTKTPVSLPPL--- 886

  Fly  1020 CLQKVTPHRP-VPTNLQPAPMLMNQSS-----------VQRLQSSPPIAQRTMHASKHTGTPG-- 1070
                ..|.:| :|:  .|:|.:...||           ||.:.::..|.|.|..:....|..|  
  Rat   887 ----PNPTKPNIPS--VPSPSIQRNSSATAAPLGTTLAVQAVPTAHSIVQATRTSLPPVGPSGLY 945

  Fly  1071 ------------------STPSS----------VANAINKTVMRARNSEAAFLAQKQQQKQHQQQ 1107
                              ||.||          ..|..||||..|.|.:||....:..:......
  Rat   946 SSSSSRGSIQMKIPIPAFSTSSSAEQSSSATPRAENQTNKTVDSAVNKKAADSTSQSGKASSNDS 1010

  Fly  1108 -------QQQQQQHLQQQQKQ--------------QQAQQQFLLPRP--SPGPTPGSSPAKQ--- 1146
                   ...:.....|..|:              .....|.:||.|  .|...|.|.|::.   
  Rat  1011 SGVIDLTMDDEDSGTTQDPKKLNPPSASTVSTSQPMSRPLQPILPAPPLQPSGVPTSGPSQATIH 1075

  Fly  1147 -VPKCTTKVRAKQPPLSGATVSVPISSSSSGSELGSYGQQQESSLAPAKPKEKAVIDLTDEDDAA 1210
             :|...|.|.....|::..|..:|:..:.:       ..|...:..|| |..:|.:..|    ..
  Rat  1076 VLPTAPTTVNVTHRPVTQVTTRLPVPRAPA-------NHQVVYTTLPA-PTTQAPLRGT----VM 1128

  Fly  1211 AAAAARAAQAQNA-RLRMEMLKRNAQTAAATRGGRGGGNVVRASPMQLPRVNARQIVHNNGGGQQ 1274
            .|.|.|....||: .:|:............|.|..|....|...|.|         |||.     
  Rat  1129 QAPAVRQVNPQNSVTVRVPQTTTYVVNNGLTLGSAGPQLTVHHRPPQ---------VHNE----- 1179

  Fly  1275 SPLGSNVTMQIRSENTPPPASRLRYSHPAPLPTS------PPQPFNPSWKVPPSRPVIRISLLDT 1333
                             ||    |..||||||.:      ||:..|.|.   |.:|.::::.:.:
  Rat  1180 -----------------PP----RPLHPAPLPEAPQPQRLPPEAANTSL---PQKPHLKLARVQS 1220

  Fly  1334 --GIVISWTLEDSSPRFAECVMYQIYAYQETINEPSTDSWRHVGDVSAMLLPMAVTLNQFQENQR 1396
              |||:||::.:.....|....|.:|||.|..:..:...|:.:|:|.|:.||||.||.||....:
  Rat  1221 QNGIVLSWSVLEVDRSCATVDSYHLYAYHEEPSATAPSQWKKIGEVKALPLPMACTLTQFVSGSK 1285

  Fly  1397 YYFAVRGVDSHERFGPFSVPKT 1418
            ||||||..|.:.|||||..|::
  Rat  1286 YYFAVRAKDIYGRFGPFCDPQS 1307

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
wdeNP_610608.1 PTZ00121 <154..818 CDD:173412 125/713 (18%)
DUF5585 <927..>1074 CDD:465521 45/189 (24%)
fn3_4 1320..1418 CDD:465273 38/99 (38%)
Atf7ipXP_063142223.1 None

Return to query results.
Submit another query.