DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TER94 and VCP

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097249.1 Gene:TER94 / 36040 FlyBaseID:FBgn0286784 Length:826 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_009057.1 Gene:VCP / 7415 HGNCID:12666 Length:806 Species:Homo sapiens


Alignment Length:800 Identity:664/800 - (83%)
Similarity:736/800 - (92%) Gaps:6/800 - (0%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    30 KREDLATAILKRKDRPNRLIVEEAQNDDNSVVSLSQAKMDELQLFRGDTVILKGKRRKETVCIVL 94
            |.:||:|||||:|:|||||||:||.|:|||||||||.|||||||||||||:||||:|:|.|||||
Human     8 KGDDLSTAILKQKNRPNRLIVDEAINEDNSVVSLSQPKMDELQLFRGDTVLLKGKKRREAVCIVL 72

  Fly    95 SDDTCPDEKIRMNRVVRNNLCVHLSDVVSVQSCPDVKYGKRVRILPIDESTEGVTGNLFEIYLKP 159
            |||||.||||||||||||||.|.|.||:|:|.|||||||||:.:||||::.||:||||||:||||
Human    73 SDDTCSDEKIRMNRVVRNNLRVRLGDVISIQPCPDVKYGKRIHVLPIDDTVEGITGNLFEVYLKP 137

  Fly   160 YFLEAYRPIHMGDNFIVRAAMRPIEFKVVLTDPEPYCIVAPETVIFCDGDPIKREEEEESLNAVG 224
            |||||||||..||.|:||..||.:|||||.|||.|||||||:|||.|:|:|||||:||||||.||
Human   138 YFLEAYRPIRKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPSPYCIVAPDTVIHCEGEPIKREDEEESLNEVG 202

  Fly   225 YDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPSLFKAIGVKPPRGILMYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFF 289
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:||||||||||||||||||||||||
Human   203 YDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFF 267

  Fly   290 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNSPAIIFIDEIDAIAPKRDKTHGEVERRIVSQLLTLM 354
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||:||||||||||||||||||
Human   268 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLM 332

  Fly   355 DGMKKSSHLIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREIDIGIPDATGRLEVLRIHTKNMKLHDDVDLE 419
            ||:|:.:|:|||||||||||||||||||||||||:||||||||||||:|:||||||||.||||||
Human   333 DGLKQRAHVIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREVDIGIPDATGRLEILQIHTKNMKLADDVDLE 397

  Fly   420 QIAAESHGHVGADLASLCSEAALQQIREKMDLIDLEDDKIDAEVLASLAVTMENFRYAMTKSSPS 484
            |:|.|:|||||||||:||||||||.||:|||||||||:.|||||:.||||||::||:|:::|:||
Human   398 QVANETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMDLIDLEDETIDAEVMNSLAVTMDDFRWALSQSNPS 462

  Fly   485 ALRETVVEVPNTTWTDIGGLESVKKELQELVQYPVEHPDKFLKFGMQPSRGVLFYGPPGCGKTLL 549
            ||||||||||..||.||||||.||:|||||||||||||||||||||.||:|||||||||||||||
Human   463 ALRETVVEVPQVTWEDIGGLEDVKRELQELVQYPVEHPDKFLKFGMTPSKGVLFYGPPGCGKTLL 527

  Fly   550 AKAIANECQANFISVKGPELLTMWFGESEANVRDIFDKARSAAPCVLFFDELDSIAKARGGNVGD 614
            ||||||||||||||:||||||||||||||||||:||||||.|||||||||||||||||||||:||
Human   528 AKAIANECQANFISIKGPELLTMWFGESEANVREIFDKARQAAPCVLFFDELDSIAKARGGNIGD 592

  Fly   615 AGGAADRVINQILTEMDGMGAKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDDKSREAIL 679
            .||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||.|||
Human   593 GGGAADRVINQILTEMDGMSTKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDEKSRVAIL 657

  Fly   680 KANLRKSPLAKEVDLTYIAKVTQGFSGADLTEICQRACKLAIRQAIEAEIRREKERAENQNSAMD 744
            ||||||||:||:|||.::||:|.||||||||||||||||||||::||:|||||:||..|. |||:
Human   658 KANLRKSPVAKDVDLEFLAKMTNGFSGADLTEICQRACKLAIRESIESEIRRERERQTNP-SAME 721

  Fly   745 MDEDDPVPEITSAHFEEAMKFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGQNFRFP----GQTGNTS 805
            ::||||||||...||||||:|||||||||||||||||||||||||||| :||||    |..|.:.
Human   722 VEEDDPVPEIRRDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFG-SFRFPSGNQGGAGPSQ 785

  Fly   806 GSGNNLPVNSPGDNGDDDLY 825
            |||.....:...::.|||||
Human   786 GSGGGTGGSVYTEDNDDDLY 805

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TER94NP_001097249.1 CDC48 47..787 CDD:273521 631/739 (85%)
VCPNP_009057.1 CDC48 25..764 CDD:273521 631/739 (85%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 708..727 11/19 (58%)
Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 768..806 15/38 (39%)
Interaction with UBXN6. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18656546 797..806 4/8 (50%)
PIM motif. /evidence=ECO:0000269|PubMed:24726327 802..806 3/3 (100%)

Return to query results.
Submit another query.