DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment TER94 and zgc:136908

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_001097249.1 Gene:TER94 / 36040 FlyBaseID:FBgn0286784 Length:826 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001035017.1 Gene:zgc:136908 / 563679 ZFINID:ZDB-GENE-060312-22 Length:805 Species:Danio rerio


Alignment Length:802 Identity:637/802 - (79%)
Similarity:728/802 - (90%) Gaps:13/802 - (1%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly    30 KREDLATAILKRKDRPNRLIVEEAQNDDNSVVSLSQAKMDELQLFRGDTVILKGKRRKETVCIVL 94
            |.||.:|||||:|.|||||||:||.|:|||:|.|||.||:||||||||||:|:|::|::||||||
Zfish    10 KTEDFSTAILKQKIRPNRLIVDEATNEDNSIVCLSQVKMEELQLFRGDTVVLRGRKRRQTVCIVL 74

  Fly    95 SDDTCPDEKIRMNRVVRNNLCVHLSDVVSVQSCPDVKYGKRVRILPIDESTEGVTGNLFEIYLKP 159
            :||||.:|::|||||.||||.|.|.||:|:..|||||||||:.:||||::.||:|||||:::|||
Zfish    75 TDDTCGNERVRMNRVTRNNLRVRLGDVISIHPCPDVKYGKRIHVLPIDDTIEGLTGNLFDVFLKP 139

  Fly   160 YFLEAYRPIHMGDNFIVRAAMRPIEFKVVLTDPEPYCIVAPETVIFCDGDPIKREEEEESLNAVG 224
            ||||||||:|.||.|:||..||.:|||||.|||.|:|||||:|:|.|:|:|||||:||||||.:|
Zfish   140 YFLEAYRPVHKGDIFLVRGGMRAVEFKVVETDPTPHCIVAPDTIIHCEGEPIKREDEEESLNDIG 204

  Fly   225 YDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPSLFKAIGVKPPRGILMYGPPGTGKTLIARAVANETGAFFF 289
            |||||||||||||||||||||||||:||||||||||||||:||||||||||:|||||||||||||
Zfish   205 YDDIGGCRKQLAQIKEMVELPLRHPALFKAIGVKPPRGILLYGPPGTGKTLVARAVANETGAFFF 269

  Fly   290 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNSPAIIFIDEIDAIAPKRDKTHGEVERRIVSQLLTLM 354
            |||||||||||||||||||||||||||||:||||||||:|||||||:||||||||||||||||||
Zfish   270 LINGPEIMSKLAGESESNLRKAFEEAEKNAPAIIFIDELDAIAPKREKTHGEVERRIVSQLLTLM 334

  Fly   355 DGMKKSSHLIVMAATNRPNSIDPALRRFGRFDREIDIGIPDATGRLEVLRIHTKNMKLHDDVDLE 419
            ||:|:.:|::||||||||||:|.||||||||||||||||||:|||||:|:||||||||.:|||||
Zfish   335 DGLKQRAHVVVMAATNRPNSVDAALRRFGRFDREIDIGIPDSTGRLEILQIHTKNMKLSEDVDLE 399

  Fly   420 QIAAESHGHVGADLASLCSEAALQQIREKMDLIDLEDDKIDAEVLASLAVTMENFRYAMTKSSPS 484
            ||:||:|||||||||:||||||||.||:||.|||||||.|||::|.||||||::|::|:::|:||
Zfish   400 QISAETHGHVGADLAALCSEAALQAIRKKMTLIDLEDDSIDADLLNSLAVTMDDFKWALSQSNPS 464

  Fly   485 ALRETVVEVPNTTWTDIGGLESVKKELQELVQYPVEHPDKFLKFGMQPSRGVLFYGPPGCGKTLL 549
            ||||||||||:..|.|||||:.||:|||||||||||:|||||||||.||||||||||||||||||
Zfish   465 ALRETVVEVPHVNWEDIGGLDEVKRELQELVQYPVEYPDKFLKFGMTPSRGVLFYGPPGCGKTLL 529

  Fly   550 AKAIANECQANFISVKGPELLTMWFGESEANVRDIFDKARSAAPCVLFFDELDSIAKARGGNVGD 614
            ||||||||||||:|:|||||||||||||||||||:|||||.||||:|||||||||||||||..||
Zfish   530 AKAIANECQANFVSIKGPELLTMWFGESEANVRDVFDKARQAAPCILFFDELDSIAKARGGGAGD 594

  Fly   615 AGGAADRVINQILTEMDGMGAKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDDKSREAIL 679
            |||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||
Zfish   595 AGGAADRVINQILTEMDGMTNKKNVFIIGATNRPDIIDPAILRPGRLDQLIYIPLPDMPSRTAIL 659

  Fly   680 KANLRKSPLAKEVDLTYIAKVTQGFSGADLTEICQRACKLAIRQAIEAEIRREKERAENQNSAMD 744
            :|||||||:||:|||.|::|:|:||||||||||||||||||||:|||||||.|::|...:.:|||
Zfish   660 RANLRKSPVAKDVDLMYLSKITEGFSGADLTEICQRACKLAIREAIEAEIRAERQRQARKETAMD 724

  Fly   745 MDEDDPVPEITSAHFEEAMKFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFGQNFRFP------GQTGN 803
             |:.||||||...||||||:|||||||||||||||||||||||||||| |||||      |..|:
Zfish   725 -DDYDPVPEIRKDHFEEAMRFARRSVSDNDIRKYEMFAQTLQQSRGFG-NFRFPTAPKSGGGQGS 787

  Fly   804 TSGSGNNLPVNSPGDNGDDDLY 825
            :.|||.:.     .|.||||||
Zfish   788 SQGSGGHF-----RDEGDDDLY 804

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
TER94NP_001097249.1 CDC48 47..787 CDD:273521 601/739 (81%)
zgc:136908NP_001035017.1 CDC48 27..766 CDD:273521 601/739 (81%)

Return to query results.
Submit another query.