DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Rme-8 and Dnajc13

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610467.1 Gene:Rme-8 / 35939 FlyBaseID:FBgn0015477 Length:2408 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038937706.1 Gene:Dnajc13 / 363127 RGDID:1308046 Length:2251 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2449 Identity:1123/2449 - (45%)
Similarity:1564/2449 - (63%) Gaps:264/2449 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 KENVDLECFLVTKHSWKGRYKRILSIGTAGISTYNPDKLDLTNRWSYSDIVAAAP---SKTTNIP 66
            :||.||.||..|||||:|:|||:.|:||..::||||:.|::||:|.|.||.:.:|   .:.|   
  Rat     5 RENKDLACFYTTKHSWRGKYKRVFSVGTHAVTTYNPNTLEVTNQWPYGDICSISPVGKGQGT--- 66

  Fly    67 HDFVITIKK--DKKLDTIKLSSEYRNDILSSILKYYKEFADKPKNAQRFSAYKYHWSGISLPTVL 129
             :|.:|.:|  .||.:|:|.|:|:|.::|:..|::..:||:.....:|::.||:|||....|.:|
  Rat    67 -EFNLTFRKGSGKKSETLKFSTEHRTELLTEALRFRTDFAEGKITGRRYNCYKHHWSDTRRPVIL 130

  Fly   130 EVTPCSLDQLDPTTNDVLASYMYKDIEGIIAGISDYEGGIVMAYGGFSRLHLFKALNHHEIVQNI 194
            ||||...||::|.||.||.||.|::|||.: .:|||:||..:.||||||||||.:....||:::.
  Rat   131 EVTPGGFDQINPVTNRVLCSYDYRNIEGFV-DLSDYQGGFCILYGGFSRLHLFASEQREEIIKSA 194

  Fly   195 AQRSAQFLGIETKILKSQITLEQFERQRFGKFSGDQFQTSSTEFSVHKITPRHPDPVKRILCLTE 259
            .:.:..::|:..:..|..:..||:...||||:|.|:..||..||.|.||:|||.:||||:|.:||
  Rat   195 VEHAGTYIGVSLRTRKEPLEFEQYLSLRFGKYSTDESITSLAEFVVQKISPRHSEPVKRVLAVTE 259

  Fly   260 VTLLERDPQTYSVCTLRPLTDVFALVRDKDNLQRFSIEYKNGIVRNYSTNDRDSLLATVLDAVRS 324
            ..|:||||.||::.||:||.:|||||.|.:|.|.|:||:..|.||.||:.:||||||::||.||:
  Rat   260 TCLVERDPATYNIATLKPLGEVFALVCDSENPQVFTIEFIKGQVRKYSSTERDSLLASLLDGVRA 324

  Fly   325 SGNQDVHVRIGNTPRGKRYVPLNSSVDEETEANLMRLVI----NNFQNPSKRYEILERFNANVPH 385
            |||:||.|::..|.:|:|:..|:..:|||.|:..:|.:.    .||.      :.:.|||||:.:
  Rat   325 SGNRDVCVKMTPTHKGQRWGLLSMPIDEEVESLHLRFLAAPPNGNFA------DAVFRFNANISY 383

  Fly   386 SGLNYSVTQDSLFAENKDKLILSALQALAQKELDSPTAQLSNLELEAIFHALTRLLASKVGYAAF 450
            ||:.::||||.||:|||:|||.:|:.||..:|.|   ...||.|||:.|.|:.||:|||.|:.||
  Rat   384 SGVLHAVTQDGLFSENKEKLINNAITALLAQEGD---VVASNAELESQFQAVRRLVASKAGFLAF 445

  Fly   451 TNLPGFREIIGTKVVAALRRKDLAVTYSAIDMINSLMHSVNSDHDLKQEQLNKSSILSSKSFLET 515
            |.||.|||.:|.|||.||:|.:..|.::|:||:.:||..::.|:||:||||||:|:||||.|||.
  Rat   446 TQLPKFRERLGMKVVKALKRSNNGVIHAAVDMLCALMCPMHDDYDLRQEQLNKASLLSSKKFLEN 510

  Fly   516 LLNMWTTHVSHGSGALVLSAMLDFMTFALCVPYSETTDGKQFDTLLELVADRGRYLYKLFQHPSL 580
            ||..:.:||.||:||||:|::|||:|||||.||||||:|:|||.|||:||..||.|:|||||||:
  Rat   511 LLEKFNSHVDHGTGALVISSLLDFLTFALCAPYSETTEGQQFDMLLEMVASNGRTLFKLFQHPSM 575

  Fly   581 AIVKGAGLVLRAIIEEGELQVAQQMQALALDEAALCRHLLVALYTPSNDPTQTTQRQLSRHLIGL 645
            |||||||||::||||||:.::|.:||.|||.|.||.|||..|::|.|:|....|.|||||||:||
  Rat   576 AIVKGAGLVMKAIIEEGDREIATKMQDLALSEGALPRHLHTAMFTISSDQRMLTNRQLSRHLVGL 640

  Fly   646 WLTDSEEAMELFKRIFPAGLLTFLESEETVPESDVEEDKLNFRDNLKFAIQHSNKTRKNVIEKHL 710
            |..|:..|..|.:||.|.|||.:|:|.:.|||.|.  |:::.|||:|.|:....|..|....:.|
  Rat   641 WTADNTTATNLLRRILPPGLLAYLDSSDPVPEKDA--DRMHVRDNVKIAMDQYGKFNKVPEWQRL 703

  Fly   711 QG-----------------IKHW--GMNLIEKQDGAAQALKNRPVVLRNRRQKKKTSDVVVNLPF 756
            .|                 :.||  .|.:.:|::     :..:|||||.|||:.|   :..|...
  Rat   704 AGKAAKEVEKFAKEKVDLVLMHWRDRMGIAQKEN-----INQKPVVLRKRRQRIK---IEANWDL 760

  Fly   757 FFYS--------FAKDHSLPNLIWNHKTREELRMCLENELRQFLNDRDLAGQMIVAWNYQEFEVA 813
            |:||        |::||:..|||||.||||||:..||:|:|.|..||:|....:::||:.||||.
  Rat   761 FYYSFLIACVFRFSQDHARSNLIWNFKTREELKDTLESEMRTFNIDRELGSASVISWNHHEFEVK 825

  Fly   814 YQCLADEIKIGDYYIRLILEKDDWPQN-LVKDPIELFNALYRRVLCRQRVNDDQMTVFSLQALAK 877
            |:|||:||||||||:||:||:|:..:: .:|...|.||.||.|.|...:||   |....|||||.
  Rat   826 YECLAEEIKIGDYYLRLLLEEDENEESGSIKRSYEFFNELYHRFLLTPKVN---MKCLCLQALAI 887

  Fly   878 VYRRYHAEIGKFNDMSYILQLSDRCLSPSMRDALINLISCLVLEKSNSRALIDH--VQCLVDLIT 940
            ||.|.|.:||.|.|..||:.:.:||.....||.||..::.|:|.|.|.:.|:|.  ::.||||:|
  Rat   888 VYGRCHEDIGPFTDTRYIIGMLERCTDKLERDRLILFLNKLILNKKNVKDLMDSNGIRILVDLLT 952

  Fly   941 LAHLHKGRAQLNTKTNVIEAGPNMGTYEEKDWYY-NIEKDGQKPERQGPITYSELKELWQKGLIT 1004
            |||||..||.:..::|||||.|:|....||:||: |.:|     ||.||..:.|::|||.||::.
  Rat   953 LAHLHVSRATVPLQSNVIEASPDMKRESEKEWYFGNADK-----ERSGPYGFHEMQELWAKGMLN 1012

  Fly  1005 PKTRCWAIGMDGWRSLQQIPQLKWCLIAKGTPLYDETELSSKILDILIKCTSFFPSRTQNGVAVL 1069
            .||||||.||||||.||.||||||||:|.|..:.:||:|::.||::||....:||||.|:. |::
  Rat  1013 AKTRCWAQGMDGWRPLQAIPQLKWCLLASGQAVLNETDLATLILNMLITMCGYFPSRDQDN-AII 1076

  Fly  1070 IPGPKLSRKLSEFICLPHVVQVCLTHDPGLLERVATLLYQIMEDNPEMPKVYLTGVFYFMLMYTG 1134
            .|.|::.|.||:..||||::|:.||.||.|:|:||.||:.||:|||::|::||:|||:|::||||
  Rat  1077 RPLPRVKRLLSDSTCLPHLIQLLLTFDPILVEKVAILLHHIMQDNPQLPRLYLSGVFFFIMMYTG 1141

  Fly  1135 SNILPITRFLKMTHMKQGFRSEETSQSGIMHRSILGQLLPEAMVCFLENYSAEKFAEIFLGEFDT 1199
            ||:||:.||||.||.||.|:|||:....|..|||||.:|||||||:||||..|||:|||||||||
  Rat  1142 SNVLPVARFLKYTHTKQAFKSEESKGQDIFQRSILGHILPEAMVCYLENYEPEKFSEIFLGEFDT 1206

  Fly  1200 PEVIWSSEMRRLLIEKIAAHIADFTPRLRGHTMARYPYLAIPVISYPQLENELFCHIYYLRHLCD 1264
            ||.|||||||||:|||||||:|||||||:.:|.|.|.|..||||:||||||||||:||||:.|||
  Rat  1207 PEAIWSSEMRRLMIEKIAAHLADFTPRLQSNTRALYQYCPIPVINYPQLENELFCNIYYLKQLCD 1271

  Fly  1265 TQKFPNWPISDPVQLLKHTLDAWRKEVEKKPPQMTIQQAYQDLGIDLTKTPKPDESMIRKSYYKL 1329
            |.:||:|||.|||:|||.:||||:||||||||.|:|..||:.|.:.:.: ...|||.|||:|::|
  Rat  1272 TLRFPDWPIKDPVKLLKDSLDAWKKEVEKKPPMMSIDDAYEVLNLPVGQ-GLHDESKIRKAYFRL 1335

  Fly  1330 AQMYHPDKNPNGREIFEKVNQAYEFLCSRNVWSSGGPDPNNIVLILRTQSILFERYPDVLRPYKY 1394
            ||.|||||||.||::|||||:||||||:::.....||||.||:|||:||||||.|:.:.|:||||
  Rat  1336 AQKYHPDKNPEGRDMFEKVNKAYEFLCTKSTKIVDGPDPENIILILKTQSILFNRHKEELQPYKY 1400

  Fly  1395 AGYPQLIKTIRLETRDDELFSKEAQLLTAASELCYHTVHCSALNAEELRREEGIEALLEAYTRCV 1459
            ||||.||:||.:||.||.|||||:.||.||:||.:|||:||||||||||||.|:|.|.||::|||
  Rat  1401 AGYPMLIRTITMETSDDLLFSKESPLLPAAAELAFHTVNCSALNAEELRRENGLEVLQEAFSRCV 1465

  Fly  1460 SILGVDSKPDSLHYQVISNVTRCFEVACNFEKCKQKIIQLPQLLSDVCRVVYFKH------TLSV 1518
            ::|...|||..:..||..:::||:.||..||:|::||.::|.::.|:|||:||..      .|:|
  Rat  1466 AVLSRSSKPSDMSVQVCGHISRCYSVAAQFEECREKITEMPGIIKDLCRVLYFGKCIPRVAALAV 1530

  Fly  1519 SLVTSLAANNYDLQCQLSRNGVLWSLLLFIFEYDYTLDESGVDVSDKSNQQQLANNLAKMAVLGC 1583
            ..|:|.|. ::.||..|.:.|:||.||:::|.|||||:|||:..::::|||::||:|||::|...
  Rat  1531 DCVSSFAV-DFWLQTHLFQAGILWYLLVYLFNYDYTLEESGIQKNEETNQQEVANSLAKLSVHAL 1594

  Fly  1584 IALAGYSMELRQKPVTGSETNSPAAKAPPVIKPKPSVSAASSSTYTQNAHNPLQSKQLAITSGKE 1648
            ..|.||               .|..:|.|                    .||...|.||      
  Rat  1595 SRLGGY---------------LPEDQATP--------------------ENPTVRKSLA------ 1618

  Fly  1649 KESDTSSGSSDTASSTPTESEQQQQLTKTRTSAIQQKYIVTGEAKNSLIKQVLDRLLTRYISNQL 1713
                                                                  .:||.||:.:|
  Rat  1619 ------------------------------------------------------GMLTPYIARKL 1629

  Fly  1714 ATVRDSDVLKLLTANTRNPYLIWDNGTRAQLKDFLEQQRTASAKETHEDIAQVSELVSSFEFDAH 1778
            |.|..:::||:|.:||.||||:|:|.|||:|.:|||.|:....|:...|....:|    |.:..|
  Rat  1630 AVVSATEILKMLNSNTENPYLMWNNSTRAELLEFLESQQENMIKKGDCDKTYGAE----FVYSEH 1690

  Fly  1779 KDELQIGGIFIRIYNDMPTHPIAQPKLFIMDLLEYLKHAYQFLQYKKNPASTAAPVNATPKMGND 1843
            ..||.:|.||:|:||::||..:..||.|...||:|:....|:|.                     
  Rat  1691 AKELIVGEIFVRVYNEVPTFQLEVPKEFAASLLDYIGSQAQYLH--------------------- 1734

  Fly  1844 GILTPTLAPNHPQLQQASTGKSGTTFDEVLTAYNRSKSRKKLETDALTEQQLALQQSKYDFSSDG 1908
                                    ||..:..|                        :|.:....|
  Rat  1735 ------------------------TFMAITHA------------------------AKVESEQHG 1751

  Fly  1909 KIELHITMVLKALIAVIKANAEVEIQCIGNFDMIFGFLASNIFPDNSTVKAVALEVVSLVSRNKE 1973
            .....:.|.|:||..|||.|...|.:|||:|.:||..|..:   ....|:.:|||||::|:.|::
  Rat  1752 DRLPRVEMALEALRNVIKYNPGSESECIGHFKLIFSLLRVH---GAGQVQQLALEVVNIVTSNQD 1813

  Fly  1974 CVSEVAACEILGNYLVALKDPELRASQVKVLETLSGLMNVQEMIKEAQAKGATIYLLDMFCNSRN 2038
            ||:.:|...:|.|.|..|.  .|.:|:..|||||..|.:..::||||.||||.||||||||||.:
  Rat  1814 CVNNIAESLVLSNLLALLH--SLPSSRQLVLETLYALASNTKIIKEAMAKGALIYLLDMFCNSTH 1876

  Fly  2039 PQIREMCAGILAKMTADRLSGPKVRITVSKFLPALFIDAMVESPATSVQLFESIHEHPELIWNDT 2103
            ||:|...|.:.||||||:|.|||||||:.||||::|:|||.::|..:|.:||..||:|||||||:
  Rat  1877 PQVRSQTAELFAKMTADKLIGPKVRITLMKFLPSVFMDAMRDNPEAAVHIFEGTHENPELIWNDS 1941

  Fly  2104 TRSNVCDAVADTCQRFYQLQKANSRHVWKDPE---ILKDIVSNEIVVAGVYLRLFVSNPAWTLRK 2165
            :|..|...|.:.....::.|:.|....||.||   ::......|:.|.||:||:|::.|||.|||
  Rat  1942 SRDKVSTTVREMMLEHFKNQRDNPDMNWKLPEDFAVVFGEAEGELAVGGVFLRIFIAQPAWVLRK 2006

  Fly  2166 PKQFLSDLLDFVVEQIGKSSSEQDVLDLSTTALVELLRSQPNLADDIPVLGHIPKLFNLLSVQ-- 2228
            |::||..||:.:.|.:.|::...:.|:..|.|.|.|..:||.|||.:|.|||:||:...::.:  
  Rat  2007 PREFLIALLEKLTELLEKNNPHGETLETLTMATVCLFSAQPQLADQVPPLGHLPKVIQAMNHRNN 2071

  Fly  2229 --PKNTLSVLHQLSLSEFCVSAISQTECVAPLKKCMEHNRDCIEKACEALSRLFKHQHDSLISQS 2291
              ||:.:.|:|.||.:|.||.|::..|.:.||...|....|.:..||||::|:|:.:...|::|:
  Rat  2072 AIPKSAIRVIHVLSDNELCVRAMASLETIGPLMNGMRKRADTVGLACEAINRMFQKEQSELVAQA 2136

  Fly  2292 LEVGLIPFLLGLLDS-RLEFVDNPSAVKAQIVAALKGMTHNLNYGDRVTQILLKHPVWAEFKDQR 2355
            |:..|:|:||.||:. .||.:|:|:|.|||||.|||.||.:|.||::|.:||.:..||:.||||:
  Rat  2137 LKAELVPYLLKLLEGIGLESLDSPAATKAQIVKALKAMTRSLQYGEQVNEILSRSSVWSAFKDQK 2201

  Fly  2356 HDLFIADTTIRGYLTGVNPTAGYLTAGPAQSVEVLTSPPPIDRD 2399
            |||||:|:...|||||.. .||||||| |.|..:...|||:|.:
  Rat  2202 HDLFISDSQTAGYLTGPG-VAGYLTAG-ASSSAMSNLPPPVDHE 2243

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Rme-8NP_610467.1 RME-8_N 12..835 CDD:466078 411/858 (48%)
GYF_2 972..1026 CDD:464112 30/54 (56%)
DnaJ 1304..1356 CDD:395170 30/51 (59%)
HEAT repeat 2174..2200 CDD:293787 6/25 (24%)
HEAT repeat 2212..2243 CDD:293787 12/34 (35%)
HEAT repeat 2253..2282 CDD:293787 11/28 (39%)
HEAT repeat 2291..2327 CDD:293787 19/36 (53%)
Dnajc13XP_038937706.1 RME-8_N 12..839 CDD:466078 405/850 (48%)
GYF_2 984..1034 CDD:464112 30/54 (56%)
DnaJ 1309..1362 CDD:395170 31/53 (58%)

Return to query results.
Submit another query.