DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Rme-8 and DNAJC13

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_610467.1 Gene:Rme-8 / 35939 FlyBaseID:FBgn0015477 Length:2408 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001316055.1 Gene:DNAJC13 / 23317 HGNCID:30343 Length:2248 Species:Homo sapiens


Alignment Length:2441 Identity:1127/2441 - (46%)
Similarity:1560/2441 - (63%) Gaps:251/2441 - (10%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     5 KENVDLECFLVTKHSWKGRYKRILSIGTAGISTYNPDKLDLTNRWSYSDIVAAAP---SKTTNIP 66
            :||.||.||..|||||:|:|||:.|:||..|:||||:.|::||:|.|.||.:.:|   .:.|   
Human     5 RENKDLACFYTTKHSWRGKYKRVFSVGTHAITTYNPNTLEVTNQWPYGDICSISPVGKGQGT--- 66

  Fly    67 HDFVITIKK--DKKLDTIKLSSEYRNDILSSILKYYKEFADKPKNAQRFSAYKYHWSGISLPTVL 129
             :|.:|.:|  .||.:|:|.|:|:|.::|:..|::..:|::.....:|::.||:|||....|.:|
Human    67 -EFNLTFRKGSGKKSETLKFSTEHRTELLTEALRFRTDFSEGKITGRRYNCYKHHWSDSRKPVIL 130

  Fly   130 EVTPCSLDQLDPTTNDVLASYMYKDIEGIIAGISDYEGGIVMAYGGFSRLHLFKALNHHEIVQNI 194
            ||||...||::|.||.||.||.|::|||.: .:|||:||..:.||||||||||.:....||:::.
Human   131 EVTPGGFDQINPATNRVLCSYDYRNIEGFV-DLSDYQGGFCILYGGFSRLHLFASEQREEIIKSA 194

  Fly   195 AQRSAQFLGIETKILKSQITLEQFERQRFGKFSGDQFQTSSTEFSVHKITPRHPDPVKRILCLTE 259
            ...:..::||..:|.|..:..||:...||||:|.|:..||..||.|.||:|||.:||||:|.|||
Human   195 IDHAGNYIGISLRIRKEPLEFEQYLNLRFGKYSTDESITSLAEFVVQKISPRHSEPVKRVLALTE 259

  Fly   260 VTLLERDPQTYSVCTLRPLTDVFALVRDKDNLQRFSIEYKNGIVRNYSTNDRDSLLATVLDAVRS 324
            ..|:||||.||::.||:||.:|||||.|.:|.|.|:||:..|.||.||:.:||||||::||.||:
Human   260 TCLVERDPATYNIATLKPLGEVFALVCDSENPQLFTIEFIKGQVRKYSSTERDSLLASLLDGVRA 324

  Fly   325 SGNQDVHVRIGNTPRGKRYVPLNSSVDEETEANLMRLVI----NNFQNPSKRYEILERFNANVPH 385
            |||:||.|::..|.:|:|:..|:..||||.|:..:|.:.    .||.      :.:.|||||:.:
Human   325 SGNRDVCVKMTPTHKGQRWGLLSMPVDEEVESLHLRFLATPPNGNFA------DAVFRFNANISY 383

  Fly   386 SGLNYSVTQDSLFAENKDKLILSALQALAQKELDSPTAQLSNLELEAIFHALTRLLASKVGYAAF 450
            ||:.::||||.||:|||:|||.:|:.||..:|.|   ...||.|||:.|.|:.||:|||.|:.||
Human   384 SGVLHAVTQDGLFSENKEKLINNAITALLSQEGD---VVASNAELESQFQAVRRLVASKAGFLAF 445

  Fly   451 TNLPGFREIIGTKVVAALRRKDLAVTYSAIDMINSLMHSVNSDHDLKQEQLNKSSILSSKSFLET 515
            |.||.|||.:|.|||.||:|.:..:.::|:||:.:||..::.|:||:||||||:|:||||.|||.
Human   446 TQLPKFRERLGVKVVKALKRSNNGIIHAAVDMLCALMCPMHDDYDLRQEQLNKASLLSSKKFLEN 510

  Fly   516 LLNMWTTHVSHGSGALVLSAMLDFMTFALCVPYSETTDGKQFDTLLELVADRGRYLYKLFQHPSL 580
            ||..:.:||.||:||||:|::|||:|||||.||||||:|:|||.|||:||..||.|:|||||||:
Human   511 LLEKFNSHVDHGTGALVISSLLDFLTFALCAPYSETTEGQQFDMLLEMVASNGRTLFKLFQHPSM 575

  Fly   581 AIVKGAGLVLRAIIEEGELQVAQQMQALALDEAALCRHLLVALYTPSNDPTQTTQRQLSRHLIGL 645
            ||:||||||::||||||:.::|.:||.|||.|.||.|||..|::|.|:|....|.|||||||:||
Human   576 AIIKGAGLVMKAIIEEGDKEIATKMQELALSEGALPRHLHTAMFTISSDQRMLTNRQLSRHLVGL 640

  Fly   646 WLTDSEEAMELFKRIFPAGLLTFLESEETVPESDVEEDKLNFRDNLKFAIQHSNKTRKNVIEKHL 710
            |..|:..|..|.|||.|.|||.:|||.:.|||.|.  |:::.|||:|.|:....|..|....:.|
Human   641 WTADNATATNLLKRILPPGLLAYLESSDLVPEKDA--DRMHVRDNVKIAMDQYGKFNKVPEWQRL 703

  Fly   711 QG-----------------IKHW--GMNLIEKQDGAAQALKNRPVVLRNRRQKKKTSDVVVNLPF 756
            .|                 :.||  .|.:.:|:|.....:..:|||||.|||:.|   :..|...
Human   704 AGKAAKEVEKFAKEKVDLVLMHWRDRMGIAQKEDKNNMNINQKPVVLRKRRQRIK---IEANWDL 765

  Fly   757 FFYSFAKDHSLPNLIWNHKTREELRMCLENELRQFLNDRDLAGQMIVAWNYQEFEVAYQCLADEI 821
            |:|.|.:||:..|||||.||||||:..||:|:|.|..||:|....:::||:.||||.|:|||:||
Human   766 FYYRFGQDHARSNLIWNFKTREELKDTLESEMRAFNIDRELGSANVISWNHHEFEVKYECLAEEI 830

  Fly   822 KIGDYYIRLILEKDDWPQN-LVKDPIELFNALYRRVLCRQRVNDDQMTVFSLQALAKVYRRYHAE 885
            ||||||:||:||:|:..:: .:|...|.||.||.|.|...:||   |....|||||.||.|.|.|
Human   831 KIGDYYLRLLLEEDENEESGSIKRSYEFFNELYHRFLLTPKVN---MKCLCLQALAIVYGRCHEE 892

  Fly   886 IGKFNDMSYILQLSDRCLSPSMRDALINLISCLVLEKSNSRALIDH--VQCLVDLITLAHLHKGR 948
            ||.|.|..||:.:.:||.....||.||..::.|:|.|.|.:.|:|.  ::.||||:||||||..|
Human   893 IGPFTDTRYIIGMLERCTDKLERDRLILFLNKLILNKKNVKDLMDSNGIRILVDLLTLAHLHVSR 957

  Fly   949 AQLNTKTNVIEAGPNMGTYEEKDWYY-NIEKDGQKPERQGPITYSELKELWQKGLITPKTRCWAI 1012
            |.:..::|||||.|:|....||:||: |.:|     ||.||..:.|::|||.||::..||||||.
Human   958 ATVPLQSNVIEAAPDMKRESEKEWYFGNADK-----ERSGPYGFHEMQELWTKGMLNAKTRCWAQ 1017

  Fly  1013 GMDGWRSLQQIPQLKWCLIAKGTPLYDETELSSKILDILIKCTSFFPSRTQNGVAVLIPGPKLSR 1077
            ||||||.||.||||||||:|.|..:.:||:|::.||::||....:||||.|:. |::.|.||:.|
Human  1018 GMDGWRPLQSIPQLKWCLLASGQAVLNETDLATLILNMLITMCGYFPSRDQDN-AIIRPLPKVKR 1081

  Fly  1078 KLSEFICLPHVVQVCLTHDPGLLERVATLLYQIMEDNPEMPKVYLTGVFYFMLMYTGSNILPITR 1142
            .||:..||||::|:.||.||.|:|:||.|||.||:|||::|::||:|||:|::||||||:||:.|
Human  1082 LLSDSTCLPHIIQLLLTFDPILVEKVAILLYHIMQDNPQLPRLYLSGVFFFIMMYTGSNVLPVAR 1146

  Fly  1143 FLKMTHMKQGFRSEETSQSGIMHRSILGQLLPEAMVCFLENYSAEKFAEIFLGEFDTPEVIWSSE 1207
            |||.||.||.|:||||....|..|||||.:|||||||:||||..|||:|||||||||||.|||||
Human  1147 FLKYTHTKQAFKSEETKGQDIFQRSILGHILPEAMVCYLENYEPEKFSEIFLGEFDTPEAIWSSE 1211

  Fly  1208 MRRLLIEKIAAHIADFTPRLRGHTMARYPYLAIPVISYPQLENELFCHIYYLRHLCDTQKFPNWP 1272
            ||||:|||||||:|||||||:.:|.|.|.|..||:|:||||||||||:||||:.||||.:||:||
Human  1212 MRRLMIEKIAAHLADFTPRLQSNTRALYQYCPIPIINYPQLENELFCNIYYLKQLCDTLRFPDWP 1276

  Fly  1273 ISDPVQLLKHTLDAWRKEVEKKPPQMTIQQAYQDLGIDLTKTPKPDESMIRKSYYKLAQMYHPDK 1337
            |.|||:|||.|||||:||||||||.|:|..||:.|.:...:.|. |||.|||:|::|||.|||||
Human  1277 IKDPVKLLKDTLDAWKKEVEKKPPMMSIDDAYEVLNLPQGQGPH-DESKIRKAYFRLAQKYHPDK 1340

  Fly  1338 NPNGREIFEKVNQAYEFLCSRNVWSSGGPDPNNIVLILRTQSILFERYPDVLRPYKYAGYPQLIK 1402
            ||.||::|||||:||||||:::.....||||.||:|||:||||||.|:.:.|:||||||||.||:
Human  1341 NPEGRDMFEKVNKAYEFLCTKSAKIVDGPDPENIILILKTQSILFNRHKEDLQPYKYAGYPMLIR 1405

  Fly  1403 TIRLETRDDELFSKEAQLLTAASELCYHTVHCSALNAEELRREEGIEALLEAYTRCVSILGVDSK 1467
            ||.:||.||.|||||:.||.||:||.:|||:||||||||||||.|:|.|.||::|||::|...||
Human  1406 TITMETSDDLLFSKESPLLPAATELAFHTVNCSALNAEELRRENGLEVLQEAFSRCVAVLTRASK 1470

  Fly  1468 PDSLHYQVISNVTRCFEVACNFEKCKQKIIQLPQLLSDVCRVVYFKHT------LSVSLVTSLAA 1526
            |..:..||...:::|:.||..||:|::||.::|.::.|:|||:||..:      |.|..|:|.|.
Human  1471 PSDMSVQVCGYISKCYSVAAQFEECREKITEMPSIIKDLCRVLYFGKSIPRVAALGVECVSSFAV 1535

  Fly  1527 NNYDLQCQLSRNGVLWSLLLFIFEYDYTLDESGVDVSDKSNQQQLANNLAKMAVLGCIALAGYSM 1591
             ::.||..|.:.|:||.||.|:|.|||||:|||:..|:::|||::||:|||::|.....|.||..
Human  1536 -DFWLQTHLFQAGILWYLLGFLFNYDYTLEESGIQKSEETNQQEVANSLAKLSVHALSRLGGYLA 1599

  Fly  1592 ELRQKPVTGSETNSPAAKAPPVIKPKPSVSAASSSTYTQNAHNPLQSKQLAITSGKEKESDTSSG 1656
            |.:..|                                                           
Human  1600 EEQATP----------------------------------------------------------- 1605

  Fly  1657 SSDTASSTPTESEQQQQLTKTRTSAIQQKYIVTGEAKNSLIKQVLDRLLTRYISNQLATVRDSDV 1721
                                                :|..|::.|..:||.|::.:||....:::
Human  1606 ------------------------------------ENPTIRKSLAGMLTPYVARKLAVASVTEI 1634

  Fly  1722 LKLLTANTRNPYLIWDNGTRAQLKDFLEQQRTASAKETHEDIAQVSELVSSFEFDAHKDELQIGG 1786
            ||:|.:||.:|||||:|.|||:|.:|||.|:....|:...|....||    |.:..|..||.:|.
Human  1635 LKMLNSNTESPYLIWNNSTRAELLEFLESQQENMIKKGDCDKTYGSE----FVYSDHAKELIVGE 1695

  Fly  1787 IFIRIYNDMPTHPIAQPKLFIMDLLEYLKHAYQFLQYKKNPASTAAPVNATPKMGNDGILTPTLA 1851
            ||:|:||::||..:..||.|...||:|:....|:|.                             
Human  1696 IFVRVYNEVPTFQLEVPKAFAASLLDYIGSQAQYLH----------------------------- 1731

  Fly  1852 PNHPQLQQASTGKSGTTFDEVLTAYNRSKSRKKLETDALTEQQLALQQSKYDFSSDGKIELHITM 1916
                            ||..:..|                        :|.:....|.....:.|
Human  1732 ----------------TFMAITHA------------------------AKVESEQHGDRLPRVEM 1756

  Fly  1917 VLKALIAVIKANAEVEIQCIGNFDMIFGFLASNIFPDNSTVKAVALEVVSLVSRNKECVSEVAAC 1981
            .|:||..|||.|...|.:|||:|.:||..|..:   ....|:.:|||||::|:.|::||:.:|..
Human  1757 ALEALRNVIKYNPGSESECIGHFKLIFSLLRVH---GAGQVQQLALEVVNIVTSNQDCVNNIAES 1818

  Fly  1982 EILGNYLVALKDPELRASQVKVLETLSGLMNVQEMIKEAQAKGATIYLLDMFCNSRNPQIREMCA 2046
            .:|.:.|..|.  .|.:|:..|||||..|.:..::||||.||||.||||||||||.:||:|...|
Human  1819 MVLSSLLALLH--SLPSSRQLVLETLYALTSSTKIIKEAMAKGALIYLLDMFCNSTHPQVRAQTA 1881

  Fly  2047 GILAKMTADRLSGPKVRITVSKFLPALFIDAMVESPATSVQLFESIHEHPELIWNDTTRSNVCDA 2111
            .:.||||||:|.|||||||:.||||::|:|||.::|..:|.:||..||:|||||||.:|..|...
Human  1882 ELFAKMTADKLIGPKVRITLMKFLPSVFMDAMRDNPEAAVHIFEGTHENPELIWNDNSRDKVSTT 1946

  Fly  2112 VADTCQRFYQLQKANSRHVWKDPE---ILKDIVSNEIVVAGVYLRLFVSNPAWTLRKPKQFLSDL 2173
            |.:.....::.|:.|....||.||   ::......|:.|.||:||:|::.|||.||||::||..|
Human  1947 VREMMLEHFKNQQDNPEANWKLPEDFAVVFGEAEGELAVGGVFLRIFIAQPAWVLRKPREFLIAL 2011

  Fly  2174 LDFVVEQIGKSSSEQDVLDLSTTALVELLRSQPNLADDIPVLGHIPKLFNLLSVQ----PKNTLS 2234
            |:.:.|.:.|::...:.|:..|.|.|.|..:||.|||.:|.|||:||:...::.:    ||:.:.
Human  2012 LEKLTELLEKNNPHGETLETLTMATVCLFSAQPQLADQVPPLGHLPKVIQAMNHRNNAIPKSAIR 2076

  Fly  2235 VLHQLSLSEFCVSAISQTECVAPLKKCMEHNRDCIEKACEALSRLFKHQHDSLISQSLEVGLIPF 2299
            |:|.||.:|.||.|::..|.:.||...|:...|.:..||||::|:|:.:...|::|:|:..|:|:
Human  2077 VIHALSENELCVRAMASLETIGPLMNGMKKRADTVGLACEAINRMFQKEQSELVAQALKADLVPY 2141

  Fly  2300 LLGLLDS-RLEFVDNPSAVKAQIVAALKGMTHNLNYGDRVTQILLKHPVWAEFKDQRHDLFIADT 2363
            ||.||:. .||.:|:|:|.|||||.|||.||.:|.||::|.:||.:..||:.||||:|||||:::
Human  2142 LLKLLEGIGLENLDSPAATKAQIVKALKAMTRSLQYGEQVNEILCRSSVWSAFKDQKHDLFISES 2206

  Fly  2364 TIRGYLTGVNPTAGYLTAGPAQSVEVLTSPPPIDRD 2399
            ...|||||.. .|||||||.:.|| :...|||:|.:
Human  2207 QTAGYLTGPG-VAGYLTAGTSTSV-MSNLPPPVDHE 2240

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Rme-8NP_610467.1 DUF4339 972..1020 CDD:290937 26/48 (54%)
DnaJ 1304..1356 CDD:278647 31/51 (61%)
HEAT repeat 2174..2200 CDD:293787 6/25 (24%)
HEAT repeat 2212..2243 CDD:293787 12/34 (35%)
HEAT repeat 2253..2282 CDD:293787 11/28 (39%)
HEAT repeat 2291..2327 CDD:293787 19/36 (53%)
DNAJC13NP_001316055.1 Involved in membrane association. /evidence=ECO:0000269|PubMed:18256511 1..453 215/461 (47%)
DUF4339 981..1025 CDD:290937 26/48 (54%)
DnaJ 1306..1359 CDD:278647 32/53 (60%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 1 0.930 - - C165141014
Domainoid 1 1.000 895 1.000 Domainoid score I51
eggNOG 1 0.900 - - E1_KOG1789
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H13574
Inparanoid 1 1.050 2059 1.000 Inparanoid score I49
Isobase 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG53869
OrthoDB 1 1.010 - - D11434at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0007583
OrthoInspector 1 1.000 - - oto89000
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103669
Panther 1 1.100 - - LDO PTHR36983
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R3172
SonicParanoid 1 1.000 - - X5690
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 1 0.960 - -
User_Submission 00.000 Not matched by this tool.
1615.800

Return to query results.
Submit another query.