Protein Alignment Cul4 and Cul2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610352.2
• Gene: Cul4 / 35780
• FlyBaseID: FBgn0033260
• Length: 821
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 754
• Identity: 209/754 - (27%)
• Similarity: 378/754 - (50%)
• Gaps: 77/754 - (10%)

  Fly   125 LEEAVIAIQLSKPIKYSLEELYQAVVNMC---SHKMDAQLYAKLKELTEQHVKRNIKLKEL---- 182
            :.|:||.  |:|..:......:..|..:|   ...|..:||.:.|...||||:..:..|.|
  Fly    20 IAESVIT--LTKVERSVWNTSFSDVYTLCVAQPEPMADRLYGETKHFLEQHVQEMLAKKVLIEGE 82

  Fly   183 ---TGGSMDKLILLEKINHWWLSFCQQMIMIRSIFLYMDRTYVLQNSTVHS-------------- 230
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  Fly    83 CSHSNGGPD---LLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKITDTESFYGNLSSDAAEQ 144

  Fly   231 --IWDMGLDLFRIHFAQ--NSVVQKRTVDGLLTLIEKERQGSTVD-------RGLLKSLV----- 279
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  Fly   145 MEIGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRHILEGIAA--DRASNG-TLDHHRVQIINGVIHSFVEVQDY 206

  Fly   280 RMLCDLQIYTSSFEEKFLDATNQLYKAESQRKMQELEVPEYLQHVNKRLAEENERLRHYLDSSTK 344
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  Fly   207 KKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEVIRILEYESRRAQKFLHVSSL 271

  Fly   345 HPLIYNVEKELLAEHLTSILQKGLDSLLEDNRLSDLTLLYGLLSRV-KNGTSELCGNFNGFIKKK 408
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  Fly   272 PKLRKECEEKFINDRLGFIYSECREMVSEERR-QDLRNMYVVLKPIPDNLKSELITTFLDHIKSE 335

  Fly   409 GRTIVIDPEKDK---SMVQDLLDFKDKMDVIVRTCFEHNEKFTNSLREAFEFFINQRAN-----K 465
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  Fly   336 GLQTVSALKGENIHIAFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDKACASVINRRPTERQPCR 400

  Fly   466 PAELIAKYVDMKLRSGNKGTTDEELEKTLDKIMVLFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASV 530
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  Fly   401 SAEYVAKYCDTLLKKSK--TCEAEIDQKLTNNITIFKYIEDKDVYQKFYSRLLAKRLIHEQSQSM 463

  Fly   531 DSEKSMLSKLKQECGGGFTSKLEGMFKDMELSRDINIAFRGHALSNNRDVHNLDLCVSILTMGYW 595
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  Fly   464 DAEEGMINRLKQACGYEFTNKLHRMFTDISVSVDLNNKFNTHLKDSNVDL-GINLAIKVLQAGAW 527

  Fly   596 PTYAPTEV---TMPPQFINPQQIFNKFYLEKHSGRKLQWQPTLGNCMLRAQFDAGPKELLVSL-- 655
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  Fly   528 P-LGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFEDYYHKLFSGRKLTWLHHM--CHGELKLSHLKKSYIVTMQT 589

  Fly   656 FQALVLLLFNDKPVLSYEEILAATLIEDGELRRTLQSLACGRARVITKTPKGREILDGD-QFDFN 719
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  Fly   590 YQMAIILLFETCDSLSCREIQNTLQLNDETFQKHMQPII--ESKLLNAS---SENLAGETRIELN 649

  Fly   720 NEFTNKLFRIKINQIQMKETNEEQKATEERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLITEL--F 782
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  Fly   650 LDYTNKRTKFKISSALQKETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNALIQEVLSL 714

  Fly   783 NQLTFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKDNQNQYNYVA 821
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  Fly   715 SKVSFTPNIAMIKKCVESLIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul4	NP_610352.2	Cullin	124..722	CDD:459983	165/651 (25%)
		Cullin_Nedd8	753..813	CDD:463146	30/61 (49%)
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	165/651 (25%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	30/61 (49%)