Protein Alignment Cul4 and cul5a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610352.2
• Gene: Cul4 / 35780
• FlyBaseID: FBgn0033260
• Length: 821
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001314988.1
• Gene: cul5a / 327215
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-5426
• Length: 780
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 835
• Identity: 214/835 - (25%)
• Similarity: 378/835 - (45%)
• Gaps: 151/835 - (18%)

  Fly    81 TSNLLNRMGAIHNSKPGD-VKKIVIKNFKDKPTLP----DNYSKDTYVKLEEAVIAIQLSKPIKY 140
            |||||...|::......| ::.||:|..:.:....    |.:|....|.|.:.....::.:.:|.
Zfish     3 TSNLLKNKGSLQFEDKWDLMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDQFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKE 67

  Fly   141 S-LEELYQAVVNMCSHKMDAQLYAKLKELTEQHVKRNIKLKELTGGSMDKLILLEKINHWWLSFC 204
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Zfish    68 DILDFIKQAQARVLSHQDDTALL--------------------------KAYIVE-----WRKFF 101

  Fly   205 QQMIMIRSIFLYMDRTYV----------LQNSTVHSIWDMGLDLFRIHFAQNSVVQKRTVDGLLT 259
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Zfish   102 TQCDILPKPFCQLEITLMGKQGSSKKSNVEDSIVRKLM---LDTWNESIFSN--IKNRLQDSAMK 161

  Fly   260 LIEKERQGSTVDR----GLLKSLVRMLCD-----LQIYTSSFEEKFLDATNQLYKAESQRKMQEL 315
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Zfish   162 LVHAERLGEAFDSQLVIGVRESYVN-LCSNPEDKLQIYRDNFEKSYLDSTERFYRTQAPSYLQQN 225

  Fly   316 EVPEYLQHVNKRLAEENERLRHYLDSSTK------------HPLIYNVEKELLAEHLTSILQKGL 368
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Zfish   226 GVQNYMKYADAKLREEEKRALRYLETRRECNSVQALMECCVNALVTSFKETILAE---------C 281

  Fly   369 DSLLEDNRLSDLTLLYGLLSRVKNGTSELCGNFNGFIKKKG--------RTIVIDPEKDKSMVQD 425
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Zfish   282 PGMIKRNETDKLHLMFSLMDKVPNGIEPMLKDLEEHIISAGLADMVAAAETITTDSEK---YVEQ 343

  Fly   426 LLDFKDKMDVIVRTCFEHNEKFTNSLREAFEFFIN--------------------QRANKPAELI 470
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Zfish   344 LLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDKAYKAVVNDATIFKLELPMKQKGVGLKTQPESKCPELL 408

  Fly   471 AKYVDMKLRSG--NKGTTDEELEKTLDKIMVLFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDSE 533
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Zfish   409 ANYCDMLLRKTPLSKKLTSEDIELKLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIE 473

  Fly   534 KSMLSKLKQECG--GGFTSKLEGMFKDMELSRDINIAFRGHALSNNRDVHNLDLCVSILTMGYWP 596
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Zfish   474 ENMVEWLR-EVGMPADYVNKLARMFQDIKVSEDLNQVFKEMHKHNKLALPADSVNIKILNAGAWS 537

  Fly   597 TYA-------PTEVTMPPQFINPQQIFNKFYLEKHSGRKLQWQPTLGNCMLRAQFDAGPKELLVS 654
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Zfish   538 RSSEKVFVSLPTEL----EDLIPE--VEDFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVT 596

  Fly   655 LFQALVLLLFNDKP--VLSYEEILAATLIEDGELRRTLQSLACG---RARVITKTPK---GREIL 711
            .||..||..:|.:|  .:|:|.:..||.:.|.||||||.||...   :.:|:...|:   .::..
Zfish   597 TFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATELPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVSSPKDFT 661

  Fly   712 DGDQFDFNNEF-----TNKLFRIKINQI-QMKETNEEQKATE-ERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMR 769
            |...|..|.||     :....|.|||.| :::.|.|..:..| |.:.|.|..:...||::|||||
Zfish   662 DSTLFFVNQEFSLIKNSKAQKRGKINLIGRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMR 726

  Fly   770 KTLSHNLLITEL---FNQLTFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKDNQNQYNYVA 821
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Zfish   727 KKITNAQLQTELVEILKNMFLPQKKM-IKEQIEWLIEHKYIKRDETDINTFIYMA 780

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul4	NP_610352.2	Cullin	124..722	CDD:459983	163/676 (24%)
		Cullin_Nedd8	753..813	CDD:463146	23/62 (37%)
cul5a	NP_001314988.1	Cullin	19..672	CDD:459983	170/708 (24%)
		Cullin_Nedd8	711..772	CDD:463146	23/61 (38%)