DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACC and Acaca

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_610342.1 Gene:ACC / 35761 FlyBaseID:FBgn0033246 Length:2482 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038942680.1 Gene:Acaca / 60581 RGDID:621248 Length:2384 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2384 Identity:1447/2384 - (60%)
Similarity:1797/2384 - (75%) Gaps:107/2384 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   141 SINKNQNNNSIDISISISKMSETNESNDTAAQSAEGERPSFLVGDEIDERAAEAGEACDEFPLKM 205
            ::..||::..|     |..:||.|..::.          |.||..:::|:.....      |..:
  Rat    49 TLELNQHSRFI-----IGSVSEDNSEDEI----------SNLVKLDLEEKEGSLS------PASV 92

  Fly   206 QNDVRQNGDISERRK----RLRPSMSRGTGL-----GQDRHQ---DRDFHIATTEEFVKRFGGTR 258
            .:|...:..||..:.    .:|.|||   ||     |:||.:   .|||.:|:..|||.||||.:
  Rat    93 SSDTLSDLGISALQDGLAFHMRSSMS---GLHLVKQGRDRKKIDSQRDFTVASPAEFVTRFGGNK 154

  Fly   259 VINKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWAYEMFKNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGG 323
            ||.|||||||||||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat   155 VIEKVLIANNGIAAVKCMRSIRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGG 219

  Fly   324 SNNNNYANVELIVDIALRTQVQAVWAGWGHASENPKLPELLHKEGLVFLGPPERAMWALGDKVAS 388
            :|||||||||||:|||.|..|||||||||||||||||||||.|.|:.|:|||.:||||||||:||
  Rat   220 ANNNNYANVELILDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNGIAFMGPPSQAMWALGDKIAS 284

  Fly   389 SIVAQTAEIPTLPWSGSDLKA-----QYSGKKIKISSELFARGCVTNVEQGLAAVNKIGFPVMIK 448
            |||||||.|||||||||.|:.     .:|.:.:.:..:|:.:|.|.:|:.||.|..::|:|||||
  Rat   285 SIVAQTAGIPTLPWSGSGLRVDWQENDFSKRILNVPQDLYEKGYVKDVDDGLKAAEEVGYPVMIK 349

  Fly   449 ASEGGGGKGIRRVDTTEEFPGLFRQVQAEVPGSPIFVMKLARGARHLEVQLLADQYGNAISLFGR 513
            |||||||||||:|:..::||.|||||||||||||||||:||:.:||||||:||||||||||||||
  Rat   350 ASEGGGGKGIRKVNNADDFPNLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILADQYGNAISLFGR 414

  Fly   514 DCSIQRRHQKIIEEAPAIVAQPEVFEDMEKAAVRLAKMVGYVSAGTVEYLYDPEGRYFFLELNPR 578
            |||:|||||||||||||.:|.|.|||.||:.||:|||||||||||||||||..:|.::|||||||
  Rat   415 DCSVQRRHQKIIEEAPAAIATPAVFEHMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGSFYFLELNPR 479

  Fly   579 LQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIGMGIPLYRLKDIRLLYGESPWGSSVIDFENPPNKPRPSGHVI 643
            |||||||||||||||||||||||.|||||:|:||||::||.||||.:.|||||..:.|.|.||||
  Rat   480 LQVEHPCTEMVADVNLPAAQLQIAMGIPLFRIKDIRMMYGVSPWGDAPIDFENSAHVPCPRGHVI 544

  Fly   644 AARITSENPDEGFKPSSGTVQELNFRSSKNVWGYFSVAASGGLHEFADSQFGHCFSWGENRQQAR 708
            |||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||||||::|.
  Rat   545 AARITSENPDEGFKPSSGTVQELNFRSNKNVWGYFSVAAAGGLHEFADSQFGHCFSWGENREEAI 609

  Fly   709 ENLVIALKELSIRGDFRTTVEYLITLLETNRFLDNSIDTAWLDALIAERVQSEKPDILLGVMCGS 773
            .|:|:|||||||||||||||||||.||||..|..|.|||.|||.||||:||:|:||.:|||:||:
  Rat   610 SNMVVALKELSIRGDFRTTVEYLIKLLETESFQLNRIDTGWLDRLIAEKVQAERPDTMLGVVCGA 674

  Fly   774 LHIADRQITESFSSFQTSLEKGQIQAANTLTNVVDVELINDGIRYKVQAAKSGANSYFLLMNSSF 838
            ||:||..:..|.|:|..|||:||:..|:||.|.||||||.:||:|.::..:...|||.::||.|.
  Rat   675 LHVADVNLRNSISNFLHSLERGQVLPAHTLLNTVDVELIYEGIKYVLKVTRQSPNSYVVIMNGSC 739

  Fly   839 KEIEVHRLSDGGLLISLEGASYTTYMKEEVDRYRIVIGNQTCVFEKENDPSLLRSPSAGKLINMI 903
            .|::||||||||||:|.:|:|||||||||||||||.|||:|||||||||||::|||||||||..|
  Rat   740 VEVDVHRLSDGGLLLSYDGSSYTTYMKEEVDRYRITIGNKTCVFEKENDPSVMRSPSAGKLIQYI 804

  Fly   904 VEDGAHVSKGQAYAEIEVMKMVMTLTSQEAGTVTFVRRPGAVLDAGSLLGHLELDDPSLVTKAQP 968
            ||||.||..||.||||||||||||||:.|:|.:.:|:||||.||.|.::..::||:||.|.:|:.
  Rat   805 VEDGGHVFAGQCYAEIEVMKMVMTLTAVESGCIHYVKRPGAALDPGCVIAKMQLDNPSKVQQAEL 869

  Fly   969 FKGQFLQPENAPV-PEKLNRVHNTYKSILENTLAGYCLPEPFNAQRLRDIIEKFMQSLRDPSLPL 1032
            ..|...|.::..: .|||:||.:.....|.|.:.|||||:||.:.:::|.:|:.|::||||||||
  Rat   870 HTGSLPQIQSTALRGEKLHRVFHYVLDNLVNVMNGYCLPDPFFSSKVKDWVERLMKTLRDPSLPL 934

  Fly  1033 LELQEVIASISGRIPISVEKKIRKLMTLYERNITSVLAQFPSQQIASVIDSHAATLQKRADRDVF 1097
            ||||:::.|:|||||::|||.|:|.|..|..||||||.||||||||:::|||||||.::::|:||
  Rat   935 LELQDIMTSVSGRIPLNVEKSIKKEMAQYASNITSVLCQFPSQQIANILDSHAATLNRKSEREVF 999

  Fly  1098 FLTTQSIVQLVQRYRNGIRGRMKAAVHELLRQYYDVESQFQYGHYDKCVGLVREHNKDDMQTVVN 1162
            |:.||||||||||||:||||.|||.|.:|||||..||:|||.|||||||..:||.||.||.||:|
  Rat  1000 FMNTQSIVQLVQRYRSGIRGHMKAVVMDLLRQYLRVETQFQNGHYDKCVFALREENKSDMNTVLN 1064

  Fly  1163 TIFSHSQVAKKNLLVTLLIDHLWANEPGLTDELANTLSELTSLNRAEHSRVALRSRQVLIAAHQP 1227
            .||||:||.|||||||:|||.|...:|.|||||.|.|:|||.|::..:::||||:||||||:|.|
  Rat  1065 YIFSHAQVTKKNLLVTMLIDQLCGRDPTLTDELLNILTELTQLSKTTNAKVALRARQVLIASHLP 1129

  Fly  1228 AYELRHNQMESIFLSAVDMYGHDFHPENLQRLILSETSIFDILHDFFYHSNRAVCNAALEVYVRR 1292
            :|||||||:|||||||:|||||.|..||||:||||||||||:|.:||||||:.|..|||||||||
  Rat  1130 SYELRHNQVESIFLSAIDMYGHQFCIENLQKLILSETSIFDVLPNFFYHSNQVVRMAALEVYVRR 1194

  Fly  1293 AYTSYELTCLQHLELSGGLPLVHFQFLLPTAHPNR----LFSRMSSPD-----GLDQAAAES--- 1345
            ||.:|||..:||.:|.....:|.|||:|||:||||    ..:|||...     |:...|:.|   
  Rat  1195 AYIAYELNSVQHRQLKDNTCVVEFQFMLPTSHPNRGNIPTLNRMSFASNLNHYGMTHVASVSDVL 1259

  Fly  1346 LGNSFV----RTGAIAAFDSFEHFEMYSDEILDLLEDFVSPAMVNAKVLEAVEAADSISDSRHST 1406
            |.|:|.    |.|.:.:|.:||.|....||::....|  ||..           :.:..:|.|: 
  Rat  1260 LDNAFTPPCQRMGGMVSFRTFEDFVRIFDEVMGCFCD--SPPQ-----------SPTFPESGHT- 1310

  Fly  1407 SINVSLSDPVTRANAAEEAKSTEPIHIVSVAVRETGELDDLQMAQIFGNYCQEHNEELFQRRIRR 1471
                ||.|       .::....|||||::||::..|:::|.::|.:|..:.|::...|.:..|||
  Rat  1311 ----SLYD-------EDKVPRDEPIHILNVAIKTDGDIEDDRLAAMFREFTQQNKATLVEHGIRR 1364

  Fly  1472 ITFAALKK---------------RQFPKFFTFRARDKFTEDRIYRHLEPASAFHLELNRMKTYDL 1521
            :||...:|               |:|||||||||||||.|||||||||||.||.||||||:.:||
  Rat  1365 LTFLVAQKDFRKQVNCEVDQRFHREFPKFFTFRARDKFEEDRIYRHLEPALAFQLELNRMRNFDL 1429

  Fly  1522 EALPTANQKMHLYLGKAKVSKGQEVTDYRFFIRSIIRHSDLITKEASFEYLQNEGERVLLEAMDE 1586
            .|:|.||.|||||||.|||..|.||||||||:|:|||||||:|||||||||||||||:|||||||
  Rat  1430 TAIPCANHKMHLYLGAAKVEVGTEVTDYRFFVRAIIRHSDLVTKEASFEYLQNEGERLLLEAMDE 1494

  Fly  1587 LEVAFSHPHAKRTDCNHIFLNFVPTVIMDPAKIEESVTKMIMRYGPRLWKLRVLQAELKMVIRQS 1651
            |||||::.:. |||||||||||||||||||:||||||..|:||||.|||||||||||||:.||.:
  Rat  1495 LEVAFNNTNV-RTDCNHIFLNFVPTVIMDPSKIEESVRSMVMRYGSRLWKLRVLQAELKINIRLT 1558

  Fly  1652 PQSPTQAVRLCIANDSGYFLDISMYTEQTEPETGIIKFKAYGEKQGSLHGHPISTPYMTKDFLQQ 1716
            .......:||.:.|:|||:||||:|.|.|:..|..|.|:|||:|||.|||..|:|||:|||.||.
  Rat  1559 TTGKAIPIRLFLTNESGYYLDISLYKEVTDSRTAQIMFQAYGDKQGPLHGMLINTPYVTKDLLQS 1623

  Fly  1717 KRFQAQSNGTTYVYDVPDMFRQMTERHWREFSKARPTVDIRTPDKILIECKELVLEGD-NLVEMQ 1780
            |||||||.||||:||:|:||||...:.|...|..........|..|| ...||||:.. .||.|.
  Rat  1624 KRFQAQSLGTTYIYDIPEMFRQSLIKLWESMSTQAFLPSPPLPSDIL-TYTELVLDDQGQLVHMN 1687

  Fly  1781 RLPGENNCGMVAWRIVLATPEYPNGREIIVIANDLTYLIGSFGIKEDVLFAKASQLARQLKVPRI 1845
            ||||.|..|||||::.|.:||||:||::|||.||:||.|||||.:||:||.:||:|||...:|||
  Rat  1688 RLPGGNEIGMVAWKMSLKSPEYPDGRDVIVIGNDITYRIGSFGPQEDLLFLRASELARAEGIPRI 1752

  Fly  1846 YISVNSGARIGLAEEVKAMFKIAWEDPEEPDKGFKYLYLSTEDYAQVANLNSVRAILIEDEGEQR 1910
            |::.|||||||||||::.||.:||.|.|:|.||:|||||:.:||.:|:.||||....:|||||.|
  Rat  1753 YVAANSGARIGLAEEIRHMFHVAWVDSEDPYKGYKYLYLTPQDYKRVSALNSVHCEHVEDEGESR 1817

  Fly  1911 YKITDIIGKDDGLGVENLRYAGLIAGETSQAYEEIVTIAMVTCRTIGIGSYVVRLGQRVIQIDNS 1975
            |||||||||::|||.||||.:|:||||:|.||:||:||::||||.||||:|:||||||.||::||
  Rat  1818 YKITDIIGKEEGLGAENLRGSGMIAGESSLAYDEIITISLVTCRAIGIGAYLVRLGQRTIQVENS 1882

  Fly  1976 HIILTGYAALNKLLGRKVYASNNQLGGTQIMFNNGVTHKTEAIDLDGVYTILDWLSYIPAYIGCD 2040
            |:||||..||||:|||:||.|||||||.|||.||||||.|...|.:||:|:|.||||:|..:...
  Rat  1883 HLILTGAGALNKVLGREVYTSNNQLGGIQIMHNNGVTHCTVCDDFEGVFTVLHWLSYMPKNVHSS 1947

  Fly  2041 LPIVLPNDRIERPVDFMPTKSPYDPRWMLGGRVNPVNANDWENGFFDRDSWSEIMASWAKTVVTG 2105
            :|::...|.|:|.::|:|||:||||||||.||.:|.....|.:||||..|:||||..||:|||.|
  Rat  1948 VPLLNSKDPIDRIIEFVPTKAPYDPRWMLAGRPHPTQKGQWLSGFFDYGSFSEIMQPWAQTVVVG 2012

  Fly  2106 RARLGGVPVGVIAVETRTVEVEMPADPANLDSEAKTLQQAGQVWYPDSSYKTAQAIKDFGREELP 2170
            ||||||:||||:||||||||:.:||||||||||||.:|||||||:|||::||.||||||.||.||
  Rat  2013 RARLGGIPVGVVAVETRTVELSVPADPANLDSEAKIIQQAGQVWFPDSAFKTYQAIKDFNREGLP 2077

  Fly  2171 LIVFANWRGFSGGMKDMYEQIVKFGAYIVDGLREYKKPVLIYLPPNAELRGGAWAVLDSLINPRY 2235
            |:||||||||||||||||:|::||||||||||||..:||::|:||.||||||:|.|:|..||||:
  Rat  2078 LMVFANWRGFSGGMKDMYDQVLKFGAYIVDGLRECSQPVMVYIPPQAELRGGSWVVIDPTINPRH 2142

  Fly  2236 METYADPEARGGVLEPEGIVEIKYKEKDLVKTIHRLDPTTIALKKELDEANASGDKVRAAQVDEK 2300
            ||.|||.|:||.||||||.||||:::||||||:.|:||..|.|.:.|.....|  .....:::.|
  Rat  2143 MEMYADRESRGSVLEPEGTVEIKFRKKDLVKTMRRVDPVYIRLAERLGTPELS--PTERKELESK 2205

  Fly  2301 IKARIAVLMHVYHTVAVHFADLHDTPERMLEKECISEIVPWRDSRRWLYWRLRRLLLEDAYIKKI 2365
            :|.|...|:.:||.|||.||||||||.||.||..|::|:.|:.||.:.|||||||||||...|||
  Rat  2206 LKEREEFLIPIYHQVAVQFADLHDTPGRMQEKGVINDILDWKTSRTFFYWRLRRLLLEDLVKKKI 2270

  Fly  2366 LRAQDNLSVGQAKQMLRRWLVEEKGATEAYLWDKNEEMVSWYEEQINAE----SIVSRNVNSVRR 2426
            ..|...|:.||.:.|||||.||.:|..:||:||.|:::|.|.|:|:..|    |::..|:..:.|
  Rat  2271 HSANPELTDGQIQAMLRRWFVEVEGTVKAYVWDNNKDLVEWLEKQLTEEDGVRSVIEENIKYISR 2335

  Fly  2427 DAIISTISKMLEDCPDVALDAVVGLCQGLTPVNRGVVVRTLAQM 2470
            |.::..|..:::..|:||:|::|.:.|.::|..|..|||.|:.|
  Rat  2336 DYVLKQIRSLVQANPEVAMDSIVHMTQHISPTQRAEVVRILSTM 2379

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACCNP_610342.1 AccC 260..757 CDD:223516 393/501 (78%)
CPSase_L_chain 260..379 CDD:278706 103/118 (87%)
ATP-grasp_4 384..607 CDD:302634 164/227 (72%)
Biotin_carb_C 644..751 CDD:280880 91/106 (86%)
biotinyl_domain 891..952 CDD:133459 42/60 (70%)
ACC_central 956..1700 CDD:285519 436/775 (56%)
Carboxyl_trans 1800..2344 CDD:279390 347/543 (64%)
AcacaXP_038942680.1 AccC 156..658 CDD:223516 393/501 (78%)
AccB 709..856 CDD:223585 98/146 (67%)
Biotin_lipoyl 791..856 CDD:395290 42/64 (66%)
ACC_central 858..1607 CDD:400565 436/774 (56%)
Carboxyl_trans 1707..2255 CDD:395825 349/549 (64%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 812 1.000 Domainoid score I68
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H31015
Inparanoid 1 1.050 2819 1.000 Inparanoid score I20
OMA 1 1.010 - - QHG53830
OrthoDB 1 1.010 - - D10336at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001818
OrthoInspector 1 1.000 - - otm46318
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101052
Panther 1 1.100 - - O PTHR45728
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X1180
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1312.980

Return to query results.
Submit another query.