DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment ACC and acaca

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_610342.1 Gene:ACC / 35761 FlyBaseID:FBgn0033246 Length:2482 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_004911956.2 Gene:acaca / 100495654 XenbaseID:XB-GENE-1013637 Length:2347 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:2383 Identity:1451/2383 - (60%)
Similarity:1785/2383 - (74%) Gaps:129/2383 - (5%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   157 ISKMSETNESNDTAAQSAEGERPSFLVGDEIDER---------AAEAGEACDEFPLKMQNDVRQN 212
            |..:||.|..::.          |.:|..:::::         |:.|.:...:..|....|    
 Frog    19 IGSVSEDNSEDEF----------SSMVRVDLEDKERSSSPASIASTASDTLSDMGLSNYQD---- 69

  Fly   213 GDISERRKRLRPSMSRGTGL-----GQDRHQ---DRDFHIATTEEFVKRFGGTRVINKVLIANNG 269
                ....::|||||   ||     |:||.:   .|||.:|:..|||.||||.:||.||||||||
 Frog    70 ----NLALQMRPSMS---GLHLVKQGRDRKKIDLQRDFTVASPAEFVTRFGGNKVIEKVLIANNG 127

  Fly   270 IAAVKCMRSIRRWAYEMFKNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGSNNNNYANVEL 334
            |||||||||||||:||||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
 Frog   128 IAAVKCMRSIRRWSYEMFRNERAIRFVVMVTPEDLKANAEYIKMADHYVPVPGGPNNNNYANVEL 192

  Fly   335 IVDIALRTQVQAVWAGWGHASENPKLPELLHKEGLVFLGPPERAMWALGDKVASSIVAQTAEIPT 399
            |:|||.|..|||||||||||||||||||||.|.|:.|:|||.:||||||||:|||||||||.|||
 Frog   193 ILDIAKRIPVQAVWAGWGHASENPKLPELLLKNGIAFMGPPSQAMWALGDKIASSIVAQTAGIPT 257

  Fly   400 LPWSGSDLKAQYSGKKIKISS-----ELFARGCVTNVEQGLAAVNKIGFPVMIKASEGGGGKGIR 459
            ||||||.||..:....:|.|:     |::.:|.|.:|:.||.|...:|:||||||||||||||||
 Frog   258 LPWSGSGLKVDWQESDLKKSTLIVPPEVYGKGYVKDVDDGLKAAEVVGYPVMIKASEGGGGKGIR 322

  Fly   460 RVDTTEEFPGLFRQVQAEVPGSPIFVMKLARGARHLEVQLLADQYGNAISLFGRDCSIQRRHQKI 524
            :|:..|:||.|||||||||||||||||:||:.:||||||:|:|||||||||||||||:|||||||
 Frog   323 KVNNAEDFPNLFRQVQAEVPGSPIFVMRLAKQSRHLEVQILSDQYGNAISLFGRDCSVQRRHQKI 387

  Fly   525 IEEAPAIVAQPEVFEDMEKAAVRLAKMVGYVSAGTVEYLYDPEGRYFFLELNPRLQVEHPCTEMV 589
            ||||||.:|...:||.||:.||:|||||||||||||||||..:|.::||||||||||||||||||
 Frog   388 IEEAPASIATATIFEQMEQCAVKLAKMVGYVSAGTVEYLYSQDGSFYFLELNPRLQVEHPCTEMV 452

  Fly   590 ADVNLPAAQLQIGMGIPLYRLKDIRLLYGESPWGSSVIDFENPPNKPRPSGHVIAARITSENPDE 654
            ||||||||||||.||:||:|:||||:|||...||.|.|||:|..|.|.|.|||||||||||||||
 Frog   453 ADVNLPAAQLQIAMGVPLHRIKDIRMLYGLPAWGDSPIDFDNSLNAPCPRGHVIAARITSENPDE 517

  Fly   655 GFKPSSGTVQELNFRSSKNVWGYFSVAASGGLHEFADSQFGHCFSWGENRQQARENLVIALKELS 719
            ||||||||||||||||:|||||||||||:|||||||||||||||||||||::|..|:|:||||||
 Frog   518 GFKPSSGTVQELNFRSNKNVWGYFSVAAAGGLHEFADSQFGHCFSWGENREEAISNMVVALKELS 582

  Fly   720 IRGDFRTTVEYLITLLETNRFLDNSIDTAWLDALIAERVQSEKPDILLGVMCGSLHIADRQITES 784
            |||||||||||||.||||..|.:|.|||.|||.||:|:||:|:||.:|||:||:||:||.....|
 Frog   583 IRGDFRTTVEYLIKLLETESFQNNRIDTGWLDRLISEKVQAERPDAMLGVVCGALHVADVTFRNS 647

  Fly   785 FSSFQTSLEKGQIQAANTLTNVVDVELINDGIRYKVQAAKSGANSYFLLMNSSFKEIEVHRLSDG 849
            .|:|..|||:||:..|:||.|.||||||.:|.:|.::..:...|||.::||:|..|::|||||||
 Frog   648 VSNFLHSLERGQVLPAHTLLNTVDVELIYEGEKYVLKVTRQSPNSYVVIMNNSCVEVDVHRLSDG 712

  Fly   850 GLLISLEGASYTTYMKEEVDRYRIVIGNQTCVFEKENDPSLLRSPSAGKLINMIVEDGAHVSKGQ 914
            |||:|.:|:|||||||||||||||.|||:|||||||||||:||||||||||..:||||.||..||
 Frog   713 GLLLSYDGSSYTTYMKEEVDRYRITIGNKTCVFEKENDPSILRSPSAGKLIQYVVEDGGHVFAGQ 777

  Fly   915 AYAEIEVMKMVMTLTSQEAGTVTFVRRPGAVLDAGSLLGHLELDDPSLVTKAQPFKGQFLQPENA 979
            .||||||||||||||:.|:|.:.:|:||||.|:.|.::..|:|||||.|.:|:..:|        
 Frog   778 CYAEIEVMKMVMTLTAVESGCIHYVKRPGAALEPGCVIAKLQLDDPSRVQQAELHRG-------- 834

  Fly   980 PVP---------EKLNRVHNTYKSILENTLAGYCLPEPFNAQRLRDIIEKFMQSLRDPSLPLLEL 1035
            |:|         |||:||.:.....|.|.:.|||||||:.:.:|:|.:|:.|::|||||||||||
 Frog   835 PLPLIHSTALRGEKLHRVFHCVLDNLVNVMNGYCLPEPYFSSKLKDWVERLMKTLRDPSLPLLEL 899

  Fly  1036 QEVIASISGRIPISVEKKIRKLMTLYERNITSVLAQFPSQQIASVIDSHAATLQKRADRDVFFLT 1100
            |:::.|:|||||.:|||.|:|.|..|..||||||.||||||||:::|||||||.:::||:|||:.
 Frog   900 QDIMTSVSGRIPPNVEKSIKKEMAQYASNITSVLCQFPSQQIANILDSHAATLNRKSDREVFFMN 964

  Fly  1101 TQSIVQLVQRYRNGIRGRMKAAVHELLRQYYDVESQFQYGHYDKCVGLVREHNKDDMQTVVNTIF 1165
            ||||||||||||:||||.|||.|.:|||||..||:|||:|||||||..:||.||.|:..|:|:||
 Frog   965 TQSIVQLVQRYRSGIRGHMKAVVMDLLRQYLKVETQFQHGHYDKCVFALREENKSDLTMVLNSIF 1029

  Fly  1166 SHSQVAKKNLLVTLLIDHLWANEPGLTDELANTLSELTSLNRAEHSRVALRSRQVLIAAHQPAYE 1230
            ||:||.|||||:|:|||.|...:|.|||||.|.|.|||.|::..:::||||:||||||:|.|:||
 Frog  1030 SHAQVTKKNLLITMLIDQLCGRDPTLTDELLNILMELTQLSKTTNAKVALRARQVLIASHLPSYE 1094

  Fly  1231 LRHNQMESIFLSAVDMYGHDFHPENLQRLILSETSIFDILHDFFYHSNRAVCNAALEVYVRRAYT 1295
            |||||:|||||||:|||||.|..||||:||||||||||:|.:||||||:.|..|||||||||||.
 Frog  1095 LRHNQVESIFLSAIDMYGHQFCIENLQKLILSETSIFDVLPNFFYHSNQVVRMAALEVYVRRAYI 1159

  Fly  1296 SYELTCLQHLELSGGLPLVHFQFLLPTAHPNR----LFSRMSSPDGLDQ------AAAESLGNSF 1350
            :|||..:||.:|.....:|.|||:|||:||||    ..:|||....|:.      .:...|..||
 Frog  1160 AYELNSVQHRQLKDNTCVVEFQFMLPTSHPNRGNIPTLNRMSFSSNLNHYGMVHVVSDVLLDTSF 1224

  Fly  1351 V----RTGAIAAFDSFEHFEMYSDEILDLLEDFVSPAMVNAKVLEAVEAADSISDSRHSTSINVS 1411
            .    |.|.:.||.:||.|....|:::....|  ||..           :....::.|.     |
 Frog  1225 TPPCQRMGGMVAFRTFEDFVRLFDDVMSCFSD--SPPQ-----------SPVFPEAGHP-----S 1271

  Fly  1412 LSDPVTRANAAEEAKST--EPIHIVSVAVRETGELDDLQMAQIFGNYCQEHNEELFQRRIRRITF 1474
            |.|       .::.||:  |||||::||::...::||..:|.:|..:.|.....|....|||:||
 Frog  1272 LYD-------EDDNKSSRDEPIHILNVAIKTDCDIDDDGLAAMFREFTQSKKAVLMDHGIRRLTF 1329

  Fly  1475 AALKK---------------RQFPKFFTFRARDKFTEDRIYRHLEPASAFHLELNRMKTYDLEAL 1524
            ...:|               |:||||||||||:||.|||||||||||.||.||||||:.:||.|:
 Frog  1330 LVAQKDFRKQVNCEVDQRFQREFPKFFTFRARNKFEEDRIYRHLEPALAFQLELNRMRNFDLTAI 1394

  Fly  1525 PTANQKMHLYLGKAKVSKGQEVTDYRFFIRSIIRHSDLITKEASFEYLQNEGERVLLEAMDELEV 1589
            |.||.|||||||.|||..|.||||||||:|:|||||||:|||||||||||||||:||||||||||
 Frog  1395 PCANHKMHLYLGAAKVEVGTEVTDYRFFVRAIIRHSDLVTKEASFEYLQNEGERLLLEAMDELEV 1459

  Fly  1590 AFSHPHAKRTDCNHIFLNFVPTVIMDPAKIEESVTKMIMRYGPRLWKLRVLQAELKMVIRQSPQS 1654
            ||::.:. |||||||||||||||||||:||||||..|:||||.|||||||||||||:.||.:|..
 Frog  1460 AFNNTNV-RTDCNHIFLNFVPTVIMDPSKIEESVRSMVMRYGSRLWKLRVLQAELKINIRLTPTG 1523

  Fly  1655 PTQAVRLCIANDSGYFLDISMYTEQTEPETGIIKFKAYGEKQGSLHGHPISTPYMTKDFLQQKRF 1719
            ....:||.:.|:|||:||||:|.|.|:..|..|.|:|||:|||.|||..|:|||:|||.||.|||
 Frog  1524 KQIPIRLFLTNESGYYLDISLYKEVTDSRTAQIMFQAYGDKQGPLHGMLINTPYVTKDLLQSKRF 1588

  Fly  1720 QAQSNGTTYVYDVPDMFRQMTERHWREFSKARPTVDIRTPDKILIECKELVLEGD-NLVEMQRLP 1783
            ||||.|||||||:|:||||...:.|..............|..:| ...||||:.. .||.|.|||
 Frog  1589 QAQSLGTTYVYDIPEMFRQALIKLWESMEAHAFLPKSPLPSDVL-TYTELVLDDQGQLVHMNRLP 1652

  Fly  1784 GENNCGMVAWRIVLATPEYPNGREIIVIANDLTYLIGSFGIKEDVLFAKASQLARQLKVPRIYIS 1848
            |.|..|||||::.|.:||||:||:||||.||:||.|||||.:||:|:.:||:|:|...:||||::
 Frog  1653 GGNEIGMVAWKMTLKSPEYPDGRDIIVIGNDITYKIGSFGPQEDLLYLRASELSRSEGIPRIYVA 1717

  Fly  1849 VNSGARIGLAEEVKAMFKIAWEDPEEPDKGFKYLYLSTEDYAQVANLNSVRAILIEDEGEQRYKI 1913
            .|||||||||||::.||.:|||||.:|.||||||||:.:||.:|:.||||....:|||||.||||
 Frog  1718 ANSGARIGLAEEIRHMFHVAWEDPADPYKGFKYLYLTPQDYKKVSALNSVHCEHVEDEGESRYKI 1782

  Fly  1914 TDIIGKDDGLGVENLRYAGLIAGETSQAYEEIVTIAMVTCRTIGIGSYVVRLGQRVIQIDNSHII 1978
            ||||||::||||||||.:|:||||:|.|||||:||.:||||.||||:|:||||||.||::|||||
 Frog  1783 TDIIGKEEGLGVENLRGSGMIAGESSLAYEEIITINLVTCRAIGIGAYLVRLGQRTIQVENSHII 1847

  Fly  1979 LTGYAALNKLLGRKVYASNNQLGGTQIMFNNGVTHKTEAIDLDGVYTILDWLSYIPAYIGCDLPI 2043
            |||..||||:|||:||.|||||||.|||.||||||.|...|.:||||||.||||:|..:...:||
 Frog  1848 LTGAGALNKVLGREVYTSNNQLGGIQIMHNNGVTHSTVYDDFEGVYTILQWLSYMPKCVASPVPI 1912

  Fly  2044 VLPNDRIERPVDFMPTKSPYDPRWMLGGRVNPVNANDWENGFFDRDSWSEIMASWAKTVVTGRAR 2108
            :.|.|.|||.::|..||:||||||||.||.:|.....|.:||||..|:.|||..||:|||.||||
 Frog  1913 LTPKDSIERLIEFTHTKAPYDPRWMLAGRPHPTQKGQWLSGFFDYGSFMEIMQPWAQTVVVGRAR 1977

  Fly  2109 LGGVPVGVIAVETRTVEVEMPADPANLDSEAKTLQQAGQVWYPDSSYKTAQAIKDFGREELPLIV 2173
            |||:||||:||||||||:.:||||||||||||.:|||||||:|||::|||||||||.||.|||:|
 Frog  1978 LGGIPVGVVAVETRTVELSVPADPANLDSEAKIIQQAGQVWFPDSAFKTAQAIKDFNREGLPLMV 2042

  Fly  2174 FANWRGFSGGMKDMYEQIVKFGAYIVDGLREYKKPVLIYLPPNAELRGGAWAVLDSLINPRYMET 2238
            |||||||||||||||:|::|||||||||||||::|||:|:||.||||||:|.|:|..||||:||.
 Frog  2043 FANWRGFSGGMKDMYDQVLKFGAYIVDGLREYRQPVLVYIPPQAELRGGSWVVIDPTINPRHMEM 2107

  Fly  2239 YADPEARGGVLEPEGIVEIKYKEKDLVKTIHRLDPTTIALKKEL--DEANASGDKVRAAQVDEKI 2301
            |||.|:|||||||||.||||::.|||:||:.|:||..|.|.::|  .|..|:..|    :::.|:
 Frog  2108 YADKESRGGVLEPEGTVEIKFRRKDLIKTMRRVDPVYIHLAEKLGTPELGAADCK----ELETKL 2168

  Fly  2302 KARIAVLMHVYHTVAVHFADLHDTPERMLEKECISEIVPWRDSRRWLYWRLRRLLLEDAYIKKIL 2366
            |.|...|:.:||.|||.||||||||.||.||..|::::.|:.||.:.||||||||||:...|||.
 Frog  2169 KEREEFLLPIYHQVAVQFADLHDTPGRMQEKGVITDVIEWKTSRTFFYWRLRRLLLENVAKKKIH 2233

  Fly  2367 RAQDNLSVGQAKQMLRRWLVEEKGATEAYLWDKNEEMVSWYEEQINAE----SIVSRNVNSVRRD 2427
            .|...|:.||.:.|||||.||.:|..:|||||.|:::|.|.|:|:..|    |:|..|:..:.||
 Frog  2234 SANPELTDGQIQAMLRRWFVEVEGTVKAYLWDNNKDVVEWLEKQMAEEEGTRSVVDENIKYISRD 2298

  Fly  2428 AIISTISKMLEDCPDVALDAVVGLCQGLTPVNRGVVVRTLAQM 2470
            .|:..|..::::.|:||:|::|.:.|.::|..|..:||.|:.|
 Frog  2299 YILKQIRSLVQENPEVAMDSIVHMTQHISPTQRAEIVRILSTM 2341

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
ACCNP_610342.1 AccC 260..757 CDD:223516 391/501 (78%)
CPSase_L_chain 260..379 CDD:278706 103/118 (87%)
ATP-grasp_4 384..607 CDD:302634 163/227 (72%)
Biotin_carb_C 644..751 CDD:280880 91/106 (86%)
biotinyl_domain 891..952 CDD:133459 41/60 (68%)
ACC_central 956..1700 CDD:285519 436/783 (56%)
Carboxyl_trans 1800..2344 CDD:279390 358/545 (66%)
acacaXP_004911956.2 AccC 118..620 CDD:223516 391/501 (78%)
AccB 671..818 CDD:223585 96/146 (66%)
Biotin_lipoyl 754..818 CDD:366053 41/63 (65%)
ACC_central 820..1569 CDD:369816 436/782 (56%)
Carboxyl_trans 1669..2223 CDD:366432 366/557 (66%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 819 1.000 Domainoid score I68
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H31015
Inparanoid 1 1.050 2788 1.000 Inparanoid score I25
OMA 1 1.010 - - QHG53830
OrthoDB 1 1.010 - - D10336at33208
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001818
OrthoInspector 1 1.000 - - otm49394
Panther 1 1.100 - - O PTHR45728
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X1180
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1111.080

Return to query results.
Submit another query.