Protein Alignment Cul1 and cul3b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523655.1
• Gene: Cul1 / 35742
• FlyBaseID: FBgn0015509
• Length: 774
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001177414.1
• Gene: cul3b / 572370
• ZFINID: ZDB-GENE-081007-1
• Length: 766
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 833
• Identity: 230/833 - (27%)
• Similarity: 402/833 - (48%)
• Gaps: 129/833 - (15%)

  Fly     1 MNRSGNSQTT------------QKLVNLDDIWSELVEGIMQVFEHEKS------LTRSQY-MRFY 46
            :::.|..:.|            :|.||  :||..|...|.::.....|      |.|:.| |..:
Zfish     4 LSKGGTKKDTKMRIRAFPMTMDEKYVN--NIWDLLKNAIQEIQRKNNSGLSFEELYRNAYTMVLH 66

  Fly    47 THVYDYCTSVSAAPSGRSSGKTGGAQLVGKKLYDRLEQFLKSYLSELLTKFKAISGEEVL----- 106
            .|                          |:|||..|.:.:..:   |:.|.:    |:||
Zfish    67 KH--------------------------GEKLYTGLREVVTEH---LINKVR----EDVLNSLNN 98

  Fly   107 --LSRYTKQWKSYQFSSTVLDGICNYLNRNWVKRECEEGQKGIYKIYRLALVAWKGHL--FQVLN 167
              |....:.|..:|.:..::..|..|::|.:|:      |..:..:|.|.|:.::..:  :..:.
Zfish    99 NFLQTLNQAWNDHQTAMVMIRDILMYMDRVYVQ------QNNVENVYNLGLIIFRDQVVRYGCIR 157

  Fly   168 EPVTKAVLKSIEEERQGKLINRSLVRDVIECYVELSFNEEDTDAEQQKLSVYKQNFENKFIADTS 232
            :.:.:.:|..|..||:|::::|..:|:..:..:.|..         :..|||:::||..|:..::
Zfish   158 DHLRQTLLDMIARERKGEVVDRGAIRNACQMLMILGL---------EGRSVYEEDFEAPFLEMSA 213

  Fly   233 AFYEKESDAFLSTNTVTEYLKHVENRLEEETQRVRGFNSKNGLSYLHETTADVLKSTCEEVLIEK 297
            .|::.||..||:.|:.:.|:|.||.|:.||.:||        :..|.::|.:.:....|..||.|
Zfish   214 EFFQMESQKFLAENSASVYIKKVEARINEEIERV--------IHCLDKSTEEPIVKVVERELISK 270

  Fly   298 HLKIFHTEFQN-----LLNADRNDDLKRMYSLVALSSKNLTDLKSILENHILHQGTEAIAKCCTT 357
            |:|.. .|.:|     :|...:.:||..||.|.:.....|..:...:.:::..||...:::   .
Zfish   271 HMKTI-VEMENSGLVHMLKNGKTEDLACMYKLFSRVPNGLKTMCECMSSYLREQGKALVSE---E 331

  Fly   358 DAANDPKTYVQTILDVHKKYNALVLTAFNNDNGFVAALDKACGKFINSNVVTIANSASKSPELLA 422
            ....:|..|:|.:||:..:::..:..:||||..|...:......|:|.|        |:|||.|:
Zfish   332 GEGKNPVDYIQGLLDLKSRFDRFLQESFNNDRLFKQTIAGDFEYFLNLN--------SRSPEYLS 388

  Fly   423 KYCDLLLKKSSKNPEDKELEDNLNQVMVVFKYIEDKDVFQKYYSKMLAKRLVNHTSASDDAEAMM 487
            .:.|..|||..|...::|:|..|::.||:|:::::||||::||.:.||:||:.:.|.|||:|..|
Zfish   389 LFIDDKLKKGVKGLTEQEVESILDKAMVLFRFMQEKDVFERYYKQHLARRLLTNKSVSDDSEKNM 453

  Fly   488 ISKLKQTCGYEYTVKLQRMFQDIGVSKDLNSYFKQYLAEKNLTM-EIDFGIEVLSSGSWPFQLSN 551
            |||||..||.::|.||:.||:|:.:|......|:|:|....::: .:|..:.||::|.||.|.:.
Zfish   454 ISKLKTECGCQFTSKLEGMFRDMSISNTTMDEFRQHLTSTGVSLGGVDLIVRVLTTGYWPTQSAT 518

  Fly   552 -NFLLPSELERSVRQFNEFYAARHSGRKLNWLYQMCKGELI------------------MNVNRN 597
             ...:|.....:...|..||.|:||||:|...:.|...:|.                  ..|..:
Zfish   519 PKCNIPPSPRHAFEVFRRFYLAKHSGRQLTLQHHMGSADLNATFYGPIKKEDGSDMVGGAQVTGS 583

  Fly   598 NSSTYTLQASTFQMSVLLQFNDQLSFTVQQLQDNTQTQQENLIQVLQILLKAK----VLTSSDNE 658
            |:..:.||.|||||::|:.||::...|.:::|..|...:..|::.||.|...|    |||.....
Zfish   584 NTRKHILQVSTFQMTILMLFNNREKSTFEEIQQETDIPERELVRALQSLACGKPTQRVLTKEPKS 648

  Fly   659 NSLTPESTVELFLDYKNKKRRININ--QPLKTELKVEQETVHKHIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRK 721
            ..:.......:...:.::..|:.|.  ...:.|...|::...:.:::|||..|:||||||||.||
Zfish   649 KEIENGHVFTVNDQFTSRLHRVKIQTVAAKQGESDPERKETRQKVDDDRKHEIEAAIVRIMKSRK 713

  Fly   722 RLNHTNLISEVLNQLSTRFKPKVPVIKKCIDILIEKEYLERMEGHKDTYSYLA 774
            ::.|..|::||..||..||.|...||||.|:.|||:|||.|....:..|:|:|
Zfish   714 KMQHNVLVAEVTQQLRARFLPSPVVIKKRIEGLIEREYLARTPEDRKVYTYVA 766

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul1	NP_523655.1	Cullin	20..673	CDD:459983	182/697 (26%)
		Cullin_Nedd8	704..765	CDD:463146	35/60 (58%)
cul3b	NP_001177414.1	Cullin	33..663	CDD:459983	182/697 (26%)
		Cullin_Nedd8	696..758	CDD:463146	35/61 (57%)