Protein Alignment Cul1 and cul4a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_523655.1
• Gene: Cul1 / 35742
• FlyBaseID: FBgn0015509
• Length: 774
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_957321.2
• Gene: cul4a / 394002
• ZFINID: ZDB-GENE-040426-1357
• Length: 745
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 795
• Identity: 234/795 - (29%)
• Similarity: 392/795 - (49%)
• Gaps: 87/795 - (10%)

  Fly     1 MNRSGNSQTTQKLV-------------NLDDIWSELVEGIMQVFEHEKSLTRSQY--MRFYTHVY 50
            :::|..:..::|||             ..:|.|.:|.:.:..:    ::.|..||  ...|..|.
Zfish    17 LSKSAKAGASKKLVIKNFKDRPKLTDSYTEDTWLKLRDAVSAI----QNSTSIQYNLEELYQAVE 77

  Fly    51 DYCTSVSAAPSGRSSGKTGGAQLVGKKLYDRLEQFLKSYLSELLTKFKAISGEEV-LLSRYTKQW 114
            :.| |...:|                .||.:|.|..:.::...:.:|:..|.:.: .|.|..:.|
Zfish    78 NLC-SYKVSP----------------MLYKQLRQVCEEHVQAQIHQFREESLDSLSFLKRMNRCW 125

  Fly   115 KSYQFSSTVLDGICNYLNRNWVKRECEEGQKGIYKIYRLALVAWKGHLFQ--VLNEPVTKAVLKS 177
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Zfish   126 QDHCRQTIMIRSIFLFLDRTYVLQ-----NSLLPSIWDTGLELFRTHIVSDAAVQSRTVQGILEQ 185

  Fly   178 IEEERQGKLINRSLVRDVIECYVELSFNEEDTDAEQQKLSVYKQNFENKFIADTSAFYEKESDAF 242
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Zfish   186 VERERSGETVDRSLLRSLLGMLSD--------------LQVYKDSFEQRFLSETTRLYAAEGQRL 236

  Fly   243 LSTNTVTEYLKHVENRLEEETQRVRGFNSKNGLSYLHETTADVLKSTCEEVLIEKHL-KIFHTEF 306
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Zfish   237 MQERDVPEYLHHVARRLEEENDRV--------ISYLDQSTQKPLIATVEKQLLGEHMTTILQKGL 293

  Fly   307 QNLLNADRNDDLKRMYSLVALSSKNLTDLKSILENHILHQGTEAIAKCCTTDAANDPKTYVQTIL 371
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Zfish   294 RTLLDENRVCELTLLYELFSKVKGGLTALLQSWREYIKSVGAETV---CSPER---DREMVQELL 352

  Fly   372 DVHKKYNALVLTAFNNDNGFVAALDKACGKFINSNVVTIANSASKSPELLAKYCDLLLKKSSKNP 436
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Zfish   353 DFKDQMDSVTQSCFQRNESFINAMKEAFENFINQR-------PNKPAELIAKYVDSKLRAGNKEA 410

  Fly   437 EDKELEDNLNQVMVVFKYIEDKDVFQKYYSKMLAKRLVNHTSASDDAEAMMISKLKQTCGYEYTV 501
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Zfish   411 TEEELERILDKIMIIFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTS 475

  Fly   502 KLQRMFQDIGVSKDLNSYFKQYLAEKNLTMEIDFGIEVLSSGSWPFQLSNNFLLPSELERSVRQF 566
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Zfish   476 KLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQTEPSNIELTVNILTMGYWPSYTPMDVHLPAEMVKLQEVF 540

  Fly   567 NEFYAARHSGRKLNWLYQMCKGELIMNVNRNNSSTYTLQASTFQMSVLLQFNDQLSFTVQQLQDN 631
            ..||..:||||||.|  |...|..::......... .||.|.||..|||.||:....:|::::..
Zfish   541 KLFYLGKHSGRKLQW--QPTLGHAVLKTEFKEGKK-ELQVSLFQTLVLLMFNESDECSVEEIRVA 602

  Fly   632 TQTQQENLIQVLQILL--KAKVLTSSDNENSLTPESTVELFLDYKNKKRRININQPLKTELKVEQ 694
            |..::..|.:.||.|.  ||:||..:.....:..........|:::|..||.|||....|...||
Zfish   603 TGIEEGELKRTLQSLACGKARVLNKTPRGKEVEDGDRFHFNSDFRHKLFRIKINQIQMKETVEEQ 667

  Fly   695 ETVHKHIEEDRKLLIQAAIVRIMKMRKRLNHTNLISEVLNQLSTRFKPKVPVIKKCIDILIEKEY 759
            .:..:.:.:||:..|.||:||||||||.|:|..|:||:.|||  :|..|...:||.|:.||:::|
Zfish   668 VSTTERVFQDRQYQIDAAVVRIMKMRKTLSHNLLVSELYNQL--KFPVKPADLKKRIESLIDRDY 730

  Fly   760 LERMEGHKDTYSYLA 774
            :||.:.:.:.|.|:|
Zfish   731 MERDKENSNQYHYVA 745

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul1	NP_523655.1	Cullin	20..673	CDD:459983	185/660 (28%)
		Cullin_Nedd8	704..765	CDD:463146	31/60 (52%)
cul4a	NP_957321.2	Cullin	49..646	CDD:459983	185/660 (28%)
		Cullin_Nedd8	677..737	CDD:463146	31/61 (51%)