Protein Alignment Vps13 and Vps13D

DIOPT Version :9

• Sequence 1: NP_001260781.1
• Gene: Vps13 / 35693
• FlyBaseID: FBgn0033194
• Length: 3321
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_729825.2
• Gene: Vps13D / 39448
• FlyBaseID: FBgn0052113
• Length: 3919
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 4289
• Identity: 823/4289 - (19%)
• Similarity: 1463/4289 - (34%)
• Gaps: 1430/4289 - (33%)

  Fly    10 VLNKVLGDYIENLDRNQLKIGIWGGDVVLQNLKIRENALDELDLPVQLIYGYLGKLVLKIPWKNL 74
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  Fly     9 VLNTYLGKYLENLNSAQLSVALLSGEVELENIPIRKDALRSFNLPVEVTAGSIRKIKLQIPVRQF 73

  Fly    75 YSQPVIVNIEDLYVLVSPNNNVQYNAEKEAKYEMDLKKAALDALEAARKKE--LEMDQPKADA-- 135
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  Fly    74 RTSPWCISIEGLFCIICPKNLDNWDYEKEKLQDLEYKLAVLDTAEAGWRSEKGKQMESYYFSSYN 138

  Fly   136 ---GFAEKLTAQIVNNLQVQITNVHLRYEDTTTTG-SPFSFGISLHELELYTTDCDWEK-CYMAQ 195
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  Fly   139 NWLKYGTNMATNIIDNIELKISDVHFRFEDIVDTGKSKICTGIKIGSLTAQSCDCDWTNGSYKMN 203

  Fly   196 QASQVFKIANLSCLSAY-------LNCGGQLYANNKSDLSQQF--KTNIACKETKPNYNYVLGPI 251
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  Fly   204 NNEMNYKLVELKELSVYWDLLHEDIKC--QSYSN------QEILEKMHSTCE--LRSHNFIIKPI 258

  Fly   252 SCNAKLKLNMNPELDDPPFEKPKIDLTLEMEKLNVGLTNTQ----FDNLMKLGDAMNRQQLGIPY 312
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  Fly   259 CATARWKRDKCQQVIRTK-DKPRVSCELLVPEVVIDISKVQRLQMLDKLSEIRQVKEVRQ----Y 318

  Fly   313 RKYRPYNIPYKGHARDWWHFAITSILEEEVRKPRESWTWGHIKTHRERCNTYAQKYKEQCL--SK 375
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  Fly   319 RLKRP-TCTVESNPIAWWKYA-TICHGFDFKKNEEKWLM--LKENLR----YMLLYKSIILNPNE 375

  Fly   376 KPSAVLTETCRLLETELDVFNLLLIRQRVNIE--------IAKQREAVPEQKSGWFSGW-GW--- 428
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  Fly   376 NLSAADKEFKAYIESDRKISDLTIMR-RICFEKVFTKGFAFESQNEQGKNMLFHWFPNWMGWYAN 439

  Fly   429 GGGAKKDDQTTSQKLVE-----------------KFEAA--------------MTSEEK------ 456
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  Fly   440 SPSTPNNEQDESLKHLEDDILVALENSLQNSSDLKSDAVFGHFSIKLLKGLVILQTEDKLNDGRN 504

  Fly   457 ---EKMYR-----------------AIGYQE-----------------------NAKPTDLPES- 477
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  Fly   505 KSMEMQFNNFSAYLQLSPQLTSYTVGISLQEVYLIDKTSSDTMHNYLIKPQTGNTATPNQLVKNA 569

  Fly   478 -----------YE-----AIRMNFKLIALEVGLYKDE-------------------RNSSAATKD 507
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  Fly   570 ALQEDILFQLQYENCNHLRFQLNIKSKGLDL-IYNEDAIQWLLDFLADSNSFKYSPRNRVAKKTD 633

  Fly   508 F----HEL-------------------PSLVLL-NFSMATALIT----------QRPAAEAISII 538
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  Fly   634 FMKNWNEMFSGNEVNRKIWMFEIEIFAPRIIFLENYKVSNSLMVLLDFGKLEMRKMEVKRVIPVI 698

  Fly   539 AGMREIKVTGLTRND-------------------YTPLLVESKITDEF---NL-LEVFFETNPLD 580
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  Fly   699 ----ESAVTENTSDDDETYLTPCSTPPASEKSGSESPTLLENPKTESFLNKNVQLEYVLHNKIYD 759

  Fly   581 K-----------LC--DQRVKVVARP-----------LQITYD-------------------APT 602
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  Fly   760 KYLINFTNLQVLVCKYEERWQACLKTSSNFHLIDKFNINLTLEQRNIFTVDPEYPSFMLFGTCPT 824

  Fly   603 IL-----ALIN---AFQTPGDVTLSKFEDA--------ASTKISNFKE--RSATGMQYMID---- 645
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  Fly   825 ILIHGNEELINNCCNIMKPIIKASKEMENIYRGGNTIYASERIKNLAEDDRSRVVIEFVMDQLVI 889

  Fly   646 -----KKAVLDVDIL-LMPNILVVPHKG----------VYDA-----GNVSLLVVSMGQVHLSSQ 689
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  Fly   890 EMQSTERSIAELQIIGARAGLTKEPHETNISMSVHGLLLVDAIQSFGPDFELLVASHRHVGMDSL 954

  Fly   690 PRRESNKLQH-------------LFSAGEDKDEILKTVME-NAYDRFTVAVDD--------VQML 732
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  Fly   955 ----SGSLKHSAIVSPTSPGSPNFFDRATSPHMITKAVQNIKMGDRSTEFCDDEDSTALISVDIK 1015

  Fly   733 VVRAGEPWQNALAEANSTEMHVL------------------------------------RPVSLK 761
            :|...        |:||.::|..                                    .|.|.|
  Fly  1016 IVPPN--------ESNSMQLHTTSITFNSLDIIANQDTIIEILNFAKRTLLAQNIFPSESPESPK 1072

  Fly   762 --VTAALCVVDNDPRLPNIKVDIDL----PAILVNVSEDRIFLAIKVATSIPLPEQKEPASRLTQ 820
              ..|.:.|||......:.::..|.    ..:|..:..|:..:..||.| :.|.|.|..||
  Fly  1073 EATEAPVDVVDQVDHKSHNEIFFDFFRLNILLLYTIKRDKFNVGRKVGT-VTLTEAKINAS---- 1132

  Fly   821 TNSRSSMSI--------------SNFINKEVKKIGPS--ASGSSASKDPLLDEI---IQYTSLDV 866
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  Fly  1133 --FQSDLSIIGSLGGIQVIDITSEAFCHPRILSVGRDQILRASDTNKQTVLSQLSNEIYSNNYNE 1195

  Fly   867 NFSLGEINFVLFQSSRKCETS-------------------PDVSI----------EFLTPDGDVL 902
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  Fly  1196 ETKSDESDAISFQSHWSDKTTCTFQMRMASASYTHCPRFLRDVNACITYFKRSLREFATSIGNKA 1260

  Fly   903 PSQLTENIQE--PIEELPPTPPQQ---------ILSIDIRRLEAHFVSKTYESVATVKLGDINLR 956
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  Fly  1261 TDMAKEFVQQVRAVEQIGPVYPQRNRQDNWLDIIISSPIIILP---ISNTSTNVLIANLGKIS-- 1320

  Fly   957 QYDCQDS---DMDVLDVIYTPKQENS---------SNYLFTV---------------SCTI---- 990
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  Fly  1321 ---CSNAVKCDSDEFNESYTIEIKNTYVYSLNIDEGEYSFNVHPAKNKDAIPILHDTAITLQLYA 1382

  Fly   991 -------ADKSSPEFSTKYNSTEQLVVA-----------------NFE----------------- 1014
                   .||....||.|.:..|.|.|:                 ||.
  Fly  1383 GYSDDNDEDKQLNRFSIKGSMVEALKVSLNRKQYELLLESIRYATNFSNEVLNESDELDQNGDIE 1447

  Fly  1015 --------------------VLQIVL----HQECLQ------RIMEVVNNFQRNLDLVLSS---- 1045
                                |.||.|    |.:.:.      .:..:...|.:::::||.|
  Fly  1448 PTANIDAESIISTTIQFSVPVFQINLQNEYHNDLINLTFKNFNVKHISKGFDKDVEVVLKSVLME 1512

  Fly  1046 ------TRP----------------------------------RDRMGSIG------------GG 1058
                  |.|                                  ::|..|:.            ||
  Fly  1513 DLKSDLTSPFRNMVTSVDLEQKIKKNEMTSSSCPDLPSYCNSLKNRSSSVPSCFYNHMQVKVFGG 1577

  Fly  1059 D-----------GIKR---TL------------NVILEDTEEI---------------------- 1075
            |           |.|:   ||            |..||.|..|
  Fly  1578 DQKYTSSNKNELGKKKESQTLVIYKSHTGRSAQNGKLEQTSSIQFNCLNLAICVERWYTIFDFFG 1642

  Fly  1076 -MTTDQMKRR----KKTRRTHVVETVKVRVIANLDQVGLVLTGRKRPIAEMNVKKFVSSLIIKSS 1135
             ::.|.:..:    .|....| ::.|..::..::......|...:..::.:||...| .:|::..
  Fly  1643 LVSVDNVNEKYPEEMKLVEKH-IDKVCSKLKVSIRSFNFTLIRNESLLSRVNVSNAV-FMILQDP 1705

  Fly  1136 YTEVNIG-LKDIQVLDLNPY-TIHKNILSIVGKDAFNCQIVIYNKE----ETQDYNSDDMKITVD 1194
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  Fly  1706 YSKIVEGCLGSVSVNDLTKYGNIYKQKFLTSGTEALN---FVYKKKLVDLEALNTLDTDSTLRIN 1767

  Fly  1195 IGCMKIIFLNWFVAGVMNFLNNFTAAQATISQAGAAAAESARQKAMDAYETATRMKLNIRIKAPI 1259
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  Fly  1768 MSAVHYIHTKRFSTELHVFVKDLLQLQTPV-------IRKLKKHGSEQNMRPSKMKLVIQADSPV 1825

  Fly  1260 IIVPIGSQDRNALLLD-LGLLEL--------TNNTVEVAVAEEERLAVIDEIKLQICDVKISKIV 1315
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  Fly  1826 IVLP-SSYNRNEVIIAYLGQFSLKNSFHFASDNNIISKMSATPSKDEILDVMRIDLVNIN----- 1884

  Fly  1316 LLDGNESTV-----DEVD----AEVGFLSKFNMMNPMSC--TLSITRNLSYTWYRDVPELNLSGR 1369
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  Fly  1885 LFSGERSSMKAKADQEKDRIIIADMNFLRLGQPFFNESCFLHLQLERNLSADAHRVCPDISVQGT 1949

  Fly  1370 LKSIELTLFADDYALVMLVLNRNLNEGLEEFPPSEEAPQEAQVRPERRNSRAGRLSR--TVQVSP 1432
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  Fly  1950 FSKLSGIINIQQYKLIRSFLNNNIGE------------QTDDIYMNYHNNSCTSIERLSTINLMP 2002

  Fly  1433 IRE-----KIHESIKFNFQFDGVVINLMEGEGAGLARFG-IYFLSVKGT-KLD---NGTLSTSVV 1487
            ..|     .|..||:...:...:::.|...:.|.:.... |:||  |.| ::|   :|:....::
  Fly  2003 KNEVSKIVSILISIRILLEDVSLLLALNTSQSAAIEPLACIHFL--KSTLEIDLFSDGSQDIDLI 2065

  Fly  1488 LCNIQMDDMRSNS-KSQIRQYLSRKDWVQPKLDTDEIIDACYNERNFMVDVTAIIKEDDTFAE-- 1549
            ..||.:.|.|:.| ||....:   |:.::|......|      |.:..|:|..  ::..||::
  Fly  2066 SSNILIVDERNESDKSNENVF---KNILEPSKKEVRI------ENSVQVEVHC--RKKATFSKYT 2119

  Fly  1550 VRVRGFDLIVCIDFLLKLTTFLTLPPEENPRESVYIKPAPVSETARDTKHSIRSSAILAAQELVP 1614
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  Fly  2120 IMLNNMRVFALLSFLDQLKSYL----QED-------SPAPVVNNAANQ---------IAQKPQID 2164

  Fly  1615 VESSSHEVPNRKMNLILHIDEPDIILVENLEDLNTSCIIFNAQVHLNYRSINDKQIVNGQIDALK 1679
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  Fly  2165 TSISTEYVVN--------ITDSEIIFAEECSRLDSNAIILKSTTVICYKPNSNIVPLSLDINHLE 2221

  Fly  1680 MYMCAFLPERREMTRHYILHP----------CV-ISLQGSTPEEEGMHISLKLSDIIIN------ 1727
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  Fly  2222 IFSCTL--DAEEESALSIIDPFTLIIELRSNCLNILIQ--------KHLNIRLSYVDVKLFSRMA 2276

  Fly  1728 -------------VSPATIELLNKAMLSVSSGTMTKCAIAEESRNY----SNLWHQHHFHSRTYW 1775
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  Fly  2277 RLLPTQTSRPKNVISKADSDLEKAAPLVAMGFEISDCLYAMQINNWRINDAAIWLSQQ-KQNTYR 2340

  Fly  1776 FTKVEQGVDALEAEQRSVSTDNEKQKTEKCVIEIPSITLVI------------ESGVGYYTKPLI 1828
            ...:|.....::|...||...::....:..::|:.....::            |:.:.:|:  |.
  Fly  2341 NPALEMKTAVVDASLISVFIIDDCMDADVPLLEVSLSKFLLNFTFQTQDPNPKETNIRHYS--LG 2403

  Fly  1829 SLDTRITAVFNNWSRSLTAHGSLTLNMNYYNQALAEWEPIIELNEVIGRNGVREYTPWEL----K 1889
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  Fly  2404 NIDTEV-------------------SVNYYNRRLSGWEPVAETWE---SNLNWKYTKGHLDNKKR 2446

  Fly  1890 FEMGMEKVQSELEDDAEQQAMHMNIHSAETLEITLSKTCLGLLSELAEAFSQAIDQNGL-----T 1949
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  Fly  2447 FEIG--------------------ISSKQMLKLNVTSTFIELFHMVLKNWTNDFNDNGAKNFRQR 2491

  Fly  1950 KPDIVAPYVLENDTGFDVNLNLRKGIFTLHEVHRGGTPVG--ANSTLLMVAQSE---EVDPSVIK 2009
            .|.|  |:.|:|.:|..:   |.|.|:         .|:|  ..|.|..|...:   .|.|:..|
  Fly  2492 SPFI--PFALQNLSGTPL---LFKPIY---------APLGDLTRSDLQQVELIKNWYSVQPNETK 2542

  Fly  2010 TCTISTGGRAYLQTKDLSTLSEEDSEDYTLYV------TIGDINKE---IALPVSKSDTRFFNLM 2065
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  Fly  2543 TFDFS-------QKSKLRHVHSHQLNLHQIFVQIHGWTLIGPISVDKVGMFFRTTKLDSQFLTKS 2600

  Fly  2066 RSTSHEPWGIISEVKQEYGTTK-VNIHGVVSVHNHFTTGLNIYRRNPAPTAQCFEDIFVGRVRPG 2129
            |        |:.::.......| :.:...:.|.|.....:.:........:.....|.|  ::|.
  Fly  2601 R--------IVFDISLIGSAQKLIKVKSSLGVINKLDRNVFLKMTLKGTHSDGLSSISV--IKPN 2655

  Fly  2130 EVFHVPLHAIYAE-------SKDLFFSMRGYRRSVQGISWASNPSDLNYSHQLHCDPTNTFEPLI 2187
            :...|||..|.|.       |:...:...|:  |.:.|.|.:            |...:| ..|:
  Fly  2656 DELSVPLKFIDASLYVAHNTSESDAYEDTGF--SNEEILWKA------------CGKDDT-RQLL 2705

  Fly  2188 MNARRSKSEVY-FENT--------------NKYTLLSAFYTIHLRPPLYLRNSLPINIQVSV--- 2234
            .....:||.:| |.|.              :|.|||         |||.:.|.|..::...:
  Fly  2706 AGYDTNKSILYTFVNISREIYHCKEQNLPGHKITLL---------PPLKINNMLCCDLMFKIHEH 2761

  Fly  2235 AGCSVRKEDGLDAQSSQ--RFVDRGYRKEDFLDYGEK--PVNSGDVLHLPTVRLASKGKESKSFL 2295
            |...:...:.::..:..  :.::.....::|...|:.  ||:...|:. |.::|....|..   |
  Fly  2762 ATGRINSSESVNIYNVNICQPLNLSITLDNFQLSGQLKIPVSHRGVIE-PKLKLIDIQKRE---L 2822

  Fly  2296 VVRLVQYLEKDWSCATEIWDYTDDVITWTFSSYDSEMKVDMDLYVKTENRHGSLMLTLFSPFWMI 2360
            .||:                           |..|.....|:||:.             :|.|:|
  Fly  2823 HVRV---------------------------SIQSVPGKGMELYIS-------------APVWII 2847

  Fly  2361 NKTGMMLTYKSETTSVEVLYHPPEYS-----GPILFTFRDK-------LFFDKKKASIRIDNGQW 2413
            ||||:.|.||.|.||........|:.     .|::|:|.|:       |...|...|    |..|
  Fly  2848 NKTGLPLIYKQEGTSHTAAGQFEEHETARQVAPLMFSFSDQEGSPALVLRLGKAYGS----NNMW 2908

  Fly  2414 SEKIPL--DVAGSVGEVICFANNQK--YPVGVHNHLTQN--SLTKQITFIPFYIVCNKCHFDIEL 2472
            .:....  |:|    :....|.|.|  |.:|:.....:.  :.|..:|..|.:.:.|:..:.:|.
  Fly  2909 CKSFSTHKDLA----DRDLRAENTKGSYAIGISVRRGRGLYACTTFVTLSPRFHLHNRSGYKLEF 2969

  Fly  2473 QE------QSRPADPWLHLEPNEM--EPL-------WPRNDTKNNLVVRVDGKITPAFDFTEVIC 2522
            .:      ..||       :|.::  .|:       ||..|.:..:.||:          .|:.|
  Fly  2970 MQLCDIVNYDRP-------DPRKIISAPVDCNFAFHWPNWDQEQIICVRI----------PEIEC 3017

  Fly  2523 TL----LKLEDSKYGGINV------------DVQTTEGGVYITFTDYKPADAPGLLINHTGKQIV 2571
            ..    :.::|.:...|||            ::.:.:....:.|||.:....|..:.|.:...|.
  Fly  3018 CCWSKGIPIKDVQSLYINVRNEWGEMFFLRLEIISKDATFILLFTDARTLPPPIRIDNCSEVVIN 3082

  Fly  2572 YHEKGTKNEHI--LNAKSTIMYAWDDPTGPKMLVF------------------------------ 2604
            :.:..:|...|  :..:|::.|..|||.|.::|:.
  Fly  3083 FSQLRSKPVWITPVRPQSSLSYVMDDPLGQQILLMEAPGGNMIEFPINNKNNIKKTLTYTNFIYI 3147

  Fly  2605 ---GT----NKEETDLKRDGIG------EVIMQDGG--KVLWVSFLDG----------------- 2637
               ||    |:||...::..:|      .::.::.|  ..||:...:|
  Fly  3148 AFQGTFERSNEEENTHRQLVLGVRGKKVVIVEKNSGDRSQLWLMNSNGQLEHEGSTPPIQTNDAN 3212

  Fly  2638 --------------------------LQRVLLFT---EN------------------------ES 2649
                                      .|||...|   ||                        |:
  Fly  3213 AVRLVLDLEKAPNPMEFTNLVVRTPNKQRVTTQTWRFENGRLMCHANMCVQSRFGESGLKPNYEA 3277

  Fly  2650 IANRTESTASLQSITQSIDLRIH--------GIGLSVINNE-----TGLDILYLGVTSSGI---- 2697
            :..|||:.|   |.::.|.:..|        |.|...::.:     :.::|..:.:..:.:
  Fly  3278 VVGRTENRA---SSSKQIPIGQHIVAQKLRPGSGQLELSTKMDGPISTIEICDIKIKQNSVFLTP 3339

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  Fly  3798 -----KNFSEKIISYEPNLWSDKEA-RLRLLVSTEYVRIFSL-------SDANP---TIMFECH 3845

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
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		VPS13	140..370	CDD:318996	57/244 (23%)
		VPS13_mid_rpt	574..807	CDD:318998	64/382 (17%)
		SHR-BD	2349..2600	CDD:310922	64/301 (21%)
		VPS13	<2701..3232	CDD:330393	133/545 (24%)
		VPS13_C	2904..3074	CDD:318997	42/170 (25%)
Vps13D	NP_729825.2	Chorein_N	4..112	CDD:315323	37/102 (36%)
		VPS13	147..368	CDD:318996	57/243 (23%)
		VPS13_mid_rpt	<656..837	CDD:318998	31/184 (17%)
		VPS13	<2039..>2694	CDD:330393	146/783 (19%)
		SHR-BD	2836..3113	CDD:310922	67/314 (21%)
		VPS13	<3346..3802	CDD:330393	137/587 (23%)

Information from Original Tools

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eggNOG	0	0.000	Not matched by this tool.
Homologene	0	0.000	Not matched by this tool.
Inparanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
Isobase	0	0.000	Not matched by this tool.
OMA	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoDB	1	1.010	-	-		D4159at2759
OrthoFinder	0	0.000	Not matched by this tool.
OrthoInspector	0	0.000	Not matched by this tool.
orthoMCL	0	0.000	Not matched by this tool.
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Phylome	1	0.910	-	-
RoundUp	1	1.030	-	avgDist	Average_Evolutionary_Distance	R1642
SonicParanoid	0	0.000	Not matched by this tool.
	5	4.980