DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Vps13 and Vps13a

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001260781.1 Gene:Vps13 / 35693 FlyBaseID:FBgn0033194 Length:3321 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001094445.2 Gene:Vps13a / 309243 RGDID:1311340 Length:3167 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:3466 Identity:1043/3466 - (30%)
Similarity:1731/3466 - (49%) Gaps:457/3466 - (13%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVFEAVVADVLNKVLGDYIENLDRNQLKIGIWGGDVVLQNLKIRENALDELDLPVQLIYGYLGKL 65
            ||||:||.||||:.||||:.|||::||.:|||.|.|||:||.|:||||.|||:|.::..|.:|.|
  Rat     1 MVFESVVVDVLNRFLGDYVVNLDQSQLSLGIWKGAVVLKNLVIKENALHELDVPFKVKVGRIGSL 65

  Fly    66 VLKIPWKNLYSQPVIVNIEDLYVLVSPNNNVQYNAEKEAKYEMDLKKAALDALEAARKKELEMDQ 130
            .|||||||||:|||...:|::|:|:.|::.:||:..||.|..|:.|:..|..:|.|::|.::.:.
  Rat    66 QLKIPWKNLYTQPVEAVLEEIYLLIVPSSRIQYDPIKEEKQLMEAKQQELKRIEEAKQKVVDQEN 130

  Fly   131 PKADA--GFAEKLTAQIVNNLQVQITNVHLRYE-DTTTTGSPFSFGISLHELELYTTDCDWEKCY 192
            |:.:.  .|||||..||:.||||||:::|:||| |.|....|.||||||..|.|.|||..|..|.
  Rat   131 PREEKQDTFAEKLVTQIIKNLQVQISSIHVRYEDDITNREKPLSFGISLQNLSLQTTDQYWIPCL 195

  Fly   193 MAQQASQVFKIANLSCLSAYLNCGGQL-YANNKSDLSQQFKTNIACKETKP-NYNYVLGPISCNA 255
            .......|.|:..|..|.||.|...:: |.|:..|..:..|..|..:...| .|::|..|||.||
  Rat   196 HDDTEKLVRKLIRLDNLFAYWNVNSEMFYLNDYDDALEALKNGIVNENIIPEGYDFVFRPISANA 260

  Fly   256 KLKLNMNPELDDPPFEKPKIDLTLEMEKLNVGLTNTQFDNLMKLGDAMNRQQLGIPYRKYRPYNI 320
            ||::|...:.|   |..|||:|.:|:..:.:.....|:.:||:|.::::.....:||||::| ::
  Rat   261 KLQMNRRSDFD---FSDPKINLDIELHTIVIEFNKPQYFSLMELLESIDMMTQNLPYRKFKP-SV 321

  Fly   321 PYKGHARDWWHFAITSILEEEVRKPRESWTWGHIKTHRERCNTYAQKYKEQCLSKKPSAVLTETC 385
            |...||.:||.:||..|||..|......|:|.|||.||.:...|.:.||::..:||||..:..:.
  Rat   322 PLHLHAEEWWAYAIHGILEVNVCPSLRMWSWEHIKNHRYKMKQYREFYKKKLTNKKPSPEILMSL 386

  Fly   386 RLLETELDVFNLLLIRQRVNIEIAK-----QREAV--PEQKSGWFSG-WGWGGGAKKDDQTTSQK 442
            ..||..|||||:.:.||:..:|:.|     .:|.:  ||..:||||. |.|........|.....
  Rat   387 EELEKTLDVFNITIARQQAEVEVKKAGYKIYKEGLKDPEDNAGWFSWMWSWSESNANQQQDVKPG 451

  Fly   443 LVEKFEAAMTSEEKEKMYRAIGYQENAKPTDLPESYEAIRMNFKLIALEVGLYKDERNSSAATKD 507
            ::.:.   :|.|||..:|.||||.|.|....||:::||::....|.::.:.|.::.:..      
  Rat   452 ILAEM---LTPEEKALLYEAIGYSETAVDPTLPKTFEALKFFVHLKSMSIVLRENRQKP------ 507

  Fly   508 FHELPSLVLLNFSMATALITQRPAAEAISIIAGMREIKVTGLTRNDYTPLLVESKITDEFNLLEV 572
              ||.::|:...|.:   |.|||.|:|:.....:....:|||..:...|.|:.|  .|:.:|..:
  Rat   508 --ELLNVVVEGLSTS---IVQRPGAQALKFETKIDSFHITGLPDDFKKPHLLSS--LDDMSLFRI 565

  Fly   573 FFETNPLDKLCDQRVKVVARPLQITYDAPTILALINAFQTPGDVTLSKFEDAASTKISNFKERSA 637
            .||.||||:...||..:.|.||::.|||.|:.:::..|:.|.||.|::...|..||:..|:|::|
  Rat   566 TFEINPLDETVSQRCTIEAEPLEMIYDARTVNSIVEFFRPPKDVRLAQLTTATLTKLEEFREKTA 630

  Fly   638 TGMQYMIDKKAVLDVDILLMPNILVVPHKGVYDAGNVSLLVVSMGQVHLSSQPRRESNKLQHLFS 702
            ||:.|:|:.:.|||:.|.:..:.::||..|.:...: :||::.:|  ||....:|.|. |..:..
  Rat   631 TGLLYIIETQKVLDLRINVKASYVIVPQYGNFSPTS-NLLLLDLG--HLKVTSKRRSG-LPDVKP 691

  Fly   703 AGEDKDEILKTVMENAYDRFTVAVDDVQMLVVRAGEPWQNALAEANSTEMHVLRPVSLKVTAALC 767
            :|..    |:.:|..|||.|.:.:..:|:|..|.|:.|:.| .:.|.:..|:|.|:.:.:..:..
  Rat   692 SGAS----LEDIMHRAYDSFDIQLSSIQLLYSRVGDNWKEA-RKLNVSTQHILIPMHVNIELSKA 751

  Fly   768 VVDNDPRLPNIKVDIDLPAILVNVSEDRIFLAIKVATSIPLPEQKEPAS---RLTQTNSRSSMSI 829
            :|..|.::|..|:...||.:.:.:|:.::...:::..|||.||.....|   |..|..: |:|.:
  Rat   752 MVFMDIKMPKFKIFGKLPLVSLRISDKKLQGIMELLESIPKPEPVTDVSAPARSFQIQA-STMPV 815

  Fly   830 SNFINKEVKKIGPSASGSSASK---DPLLDEIIQYTSLDVNFSL----------GEINFVLFQSS 881
            |:...|.:..:..||:...:.:   |.....:.:|..:......          |.:||:  |.|
  Rat   816 SHISQKLIPLLEQSATEDDSEEEFFDAPCSPLEEYPQVSCRVESTRRKKLQKKDGSMNFI--QLS 878

  Fly   882 RKCETSPDVSIEFLTPDGDVLPSQLTENIQEPIEELPPTPPQQILSIDIRRLEAHFVSKTYESVA 946
            .:.|.: :|.|:|....||.              |||      :|.:.:..|......:.::...
  Rat   879 MRFEVA-EVLIQFYHLVGDC--------------ELP------VLEMGVLGLGTEVEIRKFDLKG 922

  Fly   947 TVKLGDINLRQYDCQDSDMDVLDVIYTPKQENSSNYLFTVSCTIADKSSPEFSTKYNSTEQLVVA 1011
            ...|.::.|:.....|.....:.:|.|  .:|:...|.|:.....:|::|..::.||:..||:..
  Rat   923 NAFLKELWLKCPGYLDEHKKPVYLITT--LDNTMEDLLTLEFMRVEKNAPNLNSTYNNVLQLIKV 985

  Fly  1012 NFEVLQIVLHQECLQRIMEVVNNFQRNL---DLVLSSTRPRDRMGSIGGGDGIKRTLNVILEDTE 1073
            ||..|.|.||.|.|...|..:||....|   ...:|:..|.|:      ||.||: |.:.|...|
  Rat   986 NFSSLDIHLHTEALLNTMNYLNNILPELGETSASVSAAEPEDK------GDIIKK-LALKLPTNE 1043

  Fly  1074 EIMTTDQMKRRKKTRRTHVVETVKVRVIANLDQVGLVLTGRKRPIAEMNVKKFVSSLIIKSSYTE 1138
            :|:|                    ::::|.|..:.:.:..:|:.|:|:.::...|.:|:|...||
  Rat  1044 DIIT--------------------LQLLAELSCLRIFIQDQKQNISEIKIEGLDSEMIMKPLVTE 1088

  Fly  1139 VNIGLKDIQVLDLNPYTIHKNILSIVGKDAFNCQIVIYNKEETQDYNSDDM-----KITVDIGCM 1198
            :|..|::|.|||.:...::|..:.|.||:.|:.:::.| .:.|..|...||     ::.:.:||:
  Rat  1089 INAKLRNIIVLDSDKMAVYKKAVYITGKEVFSFKMISY-MDATAGYAYTDMSVVDARVYLTVGCI 1152

  Fly  1199 KIIFLNWFVAGVMNFLNNFTA-----AQATISQAGAAA---AESARQKAMDAYETATRMKLNIRI 1255
            :::|:..|:..::.|:|||.|     |:||:..||.||   .|.||:        ::|..|::.|
  Rat  1153 EVVFVTKFLYSILAFINNFQAVKNALAEATVQAAGMAADGVKELARK--------SSRFALDVNI 1209

  Fly  1256 KAPIIIVPIGSQDRNALLLDLGLLELTNNTVEVAVAEEERLAVIDEIKLQICDVKISKIVLLDGN 1320
            |||::::|.....||..:.|.||:.:.|..|.|...:.....|||.|.:::..:::.:...::  
  Rat  1210 KAPVVLIPQSPVSRNVFVADFGLITIKNIFVTVTETQSNIPPVIDLITIKLSKMRLYRSQFMN-- 1272

  Fly  1321 ESTVDEVDAEVGFLSKFNMMNPMSCTLSITRNLSYTWYRDVPELNLSGRLKSIELTLFADDYALV 1385
             :|..||         .:::.|::..:.:.||||:.||::||..|:..:||.:|..|..:|...|
  Rat  1273 -NTYQEV---------LDLLLPLNLEVIVERNLSWEWYKEVPCFNIKAQLKPMEFILSQEDLTTV 1327

  Fly  1386 MLVLNRNLNEGLEEFPPS--EEAPQ--EAQVRPERRNSRAGRL-SRTVQVSPIREKIHESIKFNF 1445
            ...|..|:..|.:...||  .:.|:  ..:|.....:|.|..: |..|:|.|.....:.::..:|
  Rat  1328 FQTLYGNIWYGRDVPAPSSVNKGPEIMTTEVTSTSYHSGATMVTSAVVEVHPQASPANTTLNVSF 1392

  Fly  1446 QFDGVVINLMEGEGAGLARFGIY---FLSVKGTKLDN----------GTLSTSVVLCNIQMDDMR 1497
            |.|.:::.|. ..|...|.|...   .|.:...||:|          .::..|..|.|..:||.|
  Rat  1393 QTDHLIMTLY-SPGPDQASFTDVRDPSLELAEFKLENIISDLKVYTDDSMVFSFSLKNCILDDKR 1456

  Fly  1498 SNSKSQIRQYLSRKDWVQPKLDTDEIIDACYNERN--FMVDVTAIIKEDDTFAEVRVRGFDLIVC 1560
            .:    :.:...|...:....|..:::|..|.:..  |:.||  :::|             :.||
  Rat  1457 PH----VMKATPRMIGLTVGFDKKDMVDVKYRQIRDVFVTDV--VVQE-------------MYVC 1502

  Fly  1561 --IDFLLKLT-----TFLTLPPEENPRESVYIKPAPVSETARDTKHSIRSSAILAAQELVPVESS 1618
              ::||:.:.     .::|....|...::...:.|||                   |||      
  Rat  1503 ASVEFLMTVARVFFDAYMTSTALETSVQTWTTREAPV-------------------QEL------ 1542

  Fly  1619 SHEVPNRKMNLILHIDEPDIILVENLEDLNTSCIIFNAQVHLNYRSINDKQIVNGQIDALKMYMC 1683
                  ||..:.:.|..|:|:.|.::...:...::...|..:..:...:...|...|...::..|
  Rat  1543 ------RKWEMNILIKNPEIVFVADMTRNDAPALVITTQCEICCKGEPESNTVTAAIKDFQVRAC 1601

  Fly  1684 AFLPERREMTRHYILHPCVISLQ----GSTPEEEGMHI---SLKLSDIIINVSPATIELLNKAML 1741
            .|||.:|:.....:|.||.:..|    |:.|:...:.:   :||:|.:|||    ||..:..|:.
  Rat  1602 PFLPVKRKGRVTTVLQPCDLFYQATQFGTDPQTIDISVKSLTLKVSPVIIN----TIITVTSALY 1662

  Fly  1742 SVSSGTMTKCAIAEES-RNYSNLWHQHHFHSRTYWFTKVEQGVDALEAEQRSVSTDNEKQKTEKC 1805
            :      ||..:.||| .|.::||.:....:...||.:     ::.|.| :.|.||......|..
  Rat  1663 T------TKETVPEESTSNVAHLWDKKDTKNLKMWFLE-----ESNETE-KVVPTDEVMPGGETL 1715

  Fly  1806 VIEIPSITLVIESGVGYYTKPLISLDTRITAVFNNWSRSLTAHGSLTLNMNYYNQALAEWEPIIE 1870
            .:.|.||.:|:|:|:|:.|.|::...:.......||...:..|..|.|.::|:|:....|||::|
  Rat  1716 NLNIDSIFIVLEAGIGHRTVPMLLAKSSFLGESKNWRTLINLHCQLELEVHYFNEMFGVWEPLLE 1780

  Fly  1871 LNEVIGRNGVREYTPWELKFEMGMEKVQSELEDDAEQQ-------AMHMNIHSAETLEITLSKTC 1928
            ..|:   :...::.||.|..:|..:..::.:|.|:|::       ...::..|.:.|.|||||..
  Rat  1781 PLEI---DQSDDFRPWNLGIKMKKKAKEAIVESDSEEENYKVPEYKTAISFFSRDQLNITLSKCG 1842

  Fly  1929 LGLLSELAEAFSQAIDQNGLTKPDIVAPYVLENDTGFDVNLNLRKGIFTLHEVHRGGTPVGANST 1993
            |.:||.|.|||::|...:.......:||:::.|..|..|:::.......|:      .|: |.|.
  Rat  1843 LVMLSNLVEAFTEAATGSSAVFLRDLAPFMILNSLGLTVSVSPSDSFHVLN------VPL-AKSY 1900

  Fly  1994 LLMVAQSEEVDPSVIKTCTISTGGRAYLQTKD------LSTLSEEDSEDYTLYVTIGDINKEIA- 2051
            .|...:|..:|               |::|||      :::||.:     ..::.:...|..:| 
  Rat  1901 ELKNEESLSMD---------------YVRTKDNDHFNAMTSLSSK-----LFFILLTPANHSVAD 1945

  Fly  2052 -LPVSKSDTRFFNLMRSTSHEPWGIISEVKQEYGTTKVNIHGVVSVHNHFTTGLNIYRRNPAPTA 2115
             :|::|...|.:.:....|.....||.::....|:.||.|...|.:.|||:..::::.       
  Rat  1946 KIPLTKVGRRLYTVRHRESGVERSIICQIDTVEGSKKVTIRSPVQIKNHFSIPISVFE------- 2003

  Fly  2116 QCFEDIFVGRVRPGEVFHVPLHAIYAESKDLFFSMRGYRRSVQGISWASNPSDLNYSHQLHCDPT 2180
               .|..:|...|...|::||              ..||.|:     :..|.|.:|  || |:..
  Rat  2004 ---GDTLLGIASPENEFNIPL--------------ASYRSSL-----SLKPEDEDY--QL-CEGI 2043

  Fly  2181 NTFEPLIMNARR---------SKSEVYF------ENTNKYTLLSAF--------YTIHLRPPLYL 2222
            : ||.:|.:..:         |.|:..|      |..| ...|||:        |.:||.||:.:
  Rat  2044 D-FEEIIKHDGQLLKKKCRSISPSKKSFVINIVPEKDN-LASLSAYSEDGWDLPYVMHLWPPILI 2106

  Fly  2223 RNSLPINIQVSVAG-----CSVRKEDGLDAQSSQRF-VDRGYRKEDFLDYGEKPVNSGDVLHLPT 2281
            ||.||..|...:.|     |::.     :..|||.: |:....|                |||  
  Rat  2107 RNLLPYKIAYYLEGIENTVCTLS-----EGHSSQIYNVEMDQAK----------------LHL-- 2148

  Fly  2282 VRLASKGKESKSFLVVRLVQYLEKDWSCATEIWDYTDDVITWTFSSYDSEMKVDMDLYVKTENRH 2346
                            :|:.||..||....:|.....|:....|:......|.|:|:.:......
  Rat  2149 ----------------KLLDYLNHDWKSEFQIDPNQQDINFINFTCLTEMEKSDLDIAIHMTYNT 2197

  Fly  2347 GSLMLTLFSPFWMINKTGMMLTYKSETTSVEVLYHPPEYSGPILFTFRDKLFFDKKKASIRIDNG 2411
            |..::...||:||:|||..||.||::....:   |||.|..|:||:|:...||:..|..:.:.:.
  Rat  2198 GQTVVAFHSPYWMVNKTNRMLQYKADGIHRK---HPPNYKKPVLFSFQPNHFFNNNKVQLMVTDS 2259

  Fly  2412 QWSEKIPLDVAGSVGEVICFANNQKYPVGVHNHLTQNSLTKQITFIPFYIVCNKCHFDIELQEQS 2476
            :.|::..:|..||.|.:.|.....:|.|||...|:..::|:.:||||||::.||..:.|.:.|:.
  Rat  2260 ELSDQFSIDTVGSHGAIKCKGLKMEYQVGVTIDLSSFNITRIVTFIPFYMIKNKSRYHISVTEEG 2324

  Fly  2477 RPADPWLHLEPNEMEPLWPRNDTKNNLVVRVDGKITP---AFDFTEVICTLLKLEDSKYGGINVD 2538
              :|.||.|:..:..|.||.| ..:.|:::|:....|   .:...:..|.||:| |::.||:..:
  Rat  2325 --SDKWLSLDLEQCIPFWPEN-ASDILLIQVERSEGPPKRIYFNKQDSCILLRL-DNELGGVIAE 2385

  Fly  2539 VQTTEGGVYITFTDYKPADAPGLLINHTGKQIVYHEKGTKN--EHILNAKSTIMYAWDDPTGPKM 2601
            |...|....|||:||....|..||||||....|.:.:.:.:  |..|.....:.|.|.||.|.:.
  Rat  2386 VNLAEHSTVITFSDYHEGAATFLLINHTKSDPVQYNQSSLSEIEDSLPPGKAVYYTWADPVGSRK 2450

  Fly  2602 LVFGTNKEETDLKRDGIGEVIMQD--------GGKVLW-VSFLDGLQRVLLFTENESIANRTEST 2657
            |.:...:        ..|||..:|        |.|.:: |||.:||||::||||:..:...|..:
  Rat  2451 LKWSCGQ--------SYGEVTHKDDMMTPISVGKKTIYLVSFFEGLQRIILFTEDPRVFKVTYES 2507

  Fly  2658 ASLQSITQSIDLRIHGIGLSVINNETGLDILYLGVTSSGIIWESKKVTKNRFKELTINENALLEI 2722
            ...:.....:.|.:..:|:|::||.|..::.|:|:|||.::||:|...|:|:|.:::.....||.
  Rat  2508 EKAELAELEVVLALQDVGISLVNNYTKQEVAYIGITSSDVVWETKPKKKSRWKPMSVKHTEKLEK 2572

  Fly  2723 EYQKYLVHKSVNDVQTYKLDNKFPI-----DFDLMILKKTVERNLRRSFYPAIWLSRKSSPFQSQ 2782
            |:::|.....:.| :..:|||..|:     ..|:.||:..|.. :||::.||:.:...:|..||.
  Rat  2573 EFREYTESSPLED-KVVELDNSIPVLLTPSGNDMKILEPHVIA-VRRNYLPALKVEYNTSAHQSS 2635

  Fly  2783 LHVKINRIQVDNQFLDPIFPVVLAPIPPPKSVASTTSLKPFIECSMVQRIMPNSTVRQFKYARIL 2847
            ..::|.|||:.||....|||.|..||.||:||...::.|||.:.|:|.|...:|.:.:.||.::|
  Rat  2636 FRIQIYRIQIQNQIHGAIFPFVFYPIKPPRSVTMDSAPKPFTDVSIVMRSAGHSQISRIKYFKVL 2700

  Fly  2848 IQEFLFKVDLNFLTAIAEMFAK-EVSDEAAAKQFRQDVESIELPLSAFFEEHSL--EEQKSFYDN 2909
            |||...::||.|:.|:|::..| ||:::...:.|.:|||:.|..    ||..|.  :.|.:.::.
  Rat  2701 IQEMDLRLDLGFVYALADLVPKTEVTEKTEVEYFHRDVEAFEQE----FEVVSSVDQSQVNLFEY 2761

  Fly  2910 LHLGPLKIHVSFSMA-----GSDTKALPGF-----LGSLVQGVGVTLTDVNDVVFRLAFFEREYQ 2964
            .|:.|:|:|:|.|::     ..||:...|.     |..|::.:|.|||||.||||:||||:..||
  Rat  2762 FHISPIKLHLSVSLSSGRDEAKDTEQHGGLIPVHSLNLLLKSIGATLTDVQDVVFKLAFFQLNYQ 2826

  Fly  2965 FFSQKQLINEITSHYTGQALKQLYVLVLGLDVLGNPYGLVVGLKKGVEDLFYEPFQGAIQGPGEF 3029
            |.:..:|.:|:..||:.||:||:|||:|||||||||:||:....:|||..||||:|||||||.||
  Rat  2827 FHTTSELQSEVIRHYSKQAIKQMYVLILGLDVLGNPFGLIREFSEGVEAFFYEPYQGAIQGPEEF 2891

  Fly  3030 AEGLVLGVKSLFGHTVGGAAGAVSKITGAMGKGLAALTFDEDYQKKRRQGIQNKPKNFHEGLARS 3094
            .||:.||:|:|.|..|||.|||.||||.||.||:||:|.|||||:|||:.:..:|....||:.|.
  Rat  2892 VEGMALGLKALVGGAVGGLAGAASKITSAMAKGVAAMTMDEDYQQKRREAMNKQPAGLREGITRG 2956

  Fly  3095 SKGLVMGFVDGVTGVVTKPVTGARDNGVEGFFKGLGKGAIGLVARPTAGVVDFASGSFEAVKRAA 3159
            .||||.|||.|:||:||||:.||:..|..|||||:|||.:|.|||||.|::|.||.:|:.:|||.
  Rat  2957 GKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAGFFKGVGKGLVGAVARPTGGIIDMASSTFQGIKRAT 3021

  Fly  3160 DASEDVKRMRPPRFQHYDFVLRPYCLMEATGNKIMKETDKGKFATTDNFIHCEEIIQKSEYLVVT 3224
            :.|| |:.:|||||.:.|.|:|||.|.:.|||::::..:.|:||....|.|.  ::.|::..::|
  Rat  3022 ETSE-VESLRPPRFFNEDGVIRPYRLRDGTGNQMLQVMENGRFAKYKYFTHV--MVNKTDMFMIT 3083

  Fly  3225 NYRVMYVQRNEMFGVWTSLWSYLWNEISSVAATARGVQFTVKTDGKKVLGLFSSKESPRKLVLVA 3289
            ...|::|.:. .||..|..|.|.::|.:.......|.:..::.. ::|..:|.:||..:.:....
  Rat  3084 RCGVLFVTKG-TFGQLTCEWQYTFDEFTKEPFIVHGRRLRIEAK-ERVKSVFHAKEFGKIINFKT 3146

  Fly  3290 DERKRDALVDIIESQRSDPNP 3310
            .|..|..|..:.|::  :|:|
  Rat  3147 PEDARWILTKLEEAR--EPSP 3165

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Vps13NP_001260781.1 Chorein_N 4..113 CDD:315323 60/108 (56%)
VPS13 140..370 CDD:318996 89/232 (38%)
VPS13_mid_rpt 574..807 CDD:318998 70/232 (30%)
SHR-BD 2349..2600 CDD:310922 84/255 (33%)
VPS13 <2701..3232 CDD:330393 236/548 (43%)
VPS13_C 2904..3074 CDD:318997 94/179 (53%)
Vps13aNP_001094445.2 MRS6 4..>2005 CDD:227376 612/2210 (28%)
Chorein_N 4..113 CDD:289396 60/108 (56%)
VPS13 142..371 CDD:293513 89/232 (38%)
VPS13_mid_rpt 568..791 CDD:293515 69/231 (30%)
VPS13_mid_rpt 1152..>1236 CDD:293515 29/91 (32%)
SHR-BD 2202..2445 CDD:284143 81/249 (33%)
VPS13_C 2759..2936 CDD:293514 94/176 (53%)
ATG_C 2939..3018 CDD:286423 41/78 (53%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 213 1.000 Domainoid score I2665
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H22068
Inparanoid 00.000 Not matched by this tool.
OMA 1 1.010 - - QHG54975
OrthoDB 1 1.010 - - D4159at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001282
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45459
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_101020
Panther 1 1.100 - - O PTHR16166
Phylome 1 0.910 - -
SonicParanoid 1 1.000 - - X990
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1110.930

Return to query results.
Submit another query.