DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Vps13 and vps13a

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001260781.1 Gene:Vps13 / 35693 FlyBaseID:FBgn0033194 Length:3321 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_031746767.1 Gene:vps13a / 100488998 XenbaseID:XB-GENE-989613 Length:3186 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:3432 Identity:1060/3432 - (30%)
Similarity:1747/3432 - (50%) Gaps:386/3432 - (11%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVFEAVVADVLNKVLGDYIENLDRNQLKIGIWGGDVVLQNLKIRENALDELDLPVQLIYGYLGKL 65
            ||||::|.||||:.||||:.|||.:|||:|||||.|.|:||:|:||||.:||:|.::..|::|||
 Frog     1 MVFESLVVDVLNRFLGDYVVNLDSSQLKLGIWGGAVALKNLEIKENALSQLDVPFKVKAGHIGKL 65

  Fly    66 VLKIPWKNLYSQPVIVNIEDLYVLVSPNNNVQYNAEKEAKYEMDLKKAALDALEAARKKELEMDQ 130
            .|||||||||:|||...::.:|:|:.|..:::|:||||.|..::.|:..|..:|.|::|..:.::
 Frog    66 DLKIPWKNLYTQPVEAVLDGVYLLIVPTASIKYDAEKEEKQSLEAKQRELQRIEEAKQKVADQEK 130

  Fly   131 PKADA--GFAEKLTAQIVNNLQVQITNVHLRYEDTTTTGS-PFSFGISLHELELYTTDCDWEKCY 192
            ||.:.  .|.|||..|::.||||:|:|:|:||||..|... |.|||:||..|.|.|:|.:|..|.
 Frog   131 PKEEKQDTFVEKLITQVIKNLQVKISNIHIRYEDDITNPKCPLSFGVSLQNLSLQTSDKNWNPCL 195

  Fly   193 MAQQASQVFKIANLSCLSAYLNCGGQLYANNKSDLSQQ-FKTNIACKETKP-NYNYVLGPISCNA 255
            ..:.|...:|:..|..|.||.|....::.:...|.:.: .|..||.:.|.| .|::|..|||..|
 Frog   196 HDESAKLFYKLVRLDNLFAYWNVKSDMFYHRSYDTALEILKYGIAARNTIPEGYDFVFRPISGRA 260

  Fly   256 KLKLNMNPELDDPPFEKPKIDLTLEMEKLNVGLTNTQFDNLMKLGDAMNRQQLGIPYRKYRPYNI 320
            ||::|...::|   |..|||||.:.::.:.:.....|:.::|:|.::::.....:||||:|| ::
 Frog   261 KLRMNPRSDVD---FSSPKIDLDVNLQDIAIDFNKPQYHSVMELLESIDLMSRNLPYRKFRP-DV 321

  Fly   321 PYKGHARDWWHFAITSILEEEVRKPRESWTWGHIKTHRERCNTYAQKYKEQCLSKKPSAVLTETC 385
            ....:|..||.:|||||||..::.....|:|..|:.||.:...|.:.|:.:..|||||..:....
 Frog   322 CVATNAPIWWKYAITSILEVNIKPRLHMWSWKRIRKHRLQVKKYKELYRMKITSKKPSEEVLSKT 386

  Fly   386 RLLETELDVFNLLLIRQRVNIEIAKQREAV--PEQK------SGWFSG-WGWGG--GAKKDDQTT 439
            ...|..||:||:.|.||:..:|..|....:  |..|      .|||.. |||.|  ..||:|..:
 Frog   387 EEYEKALDIFNITLARQQAEMEACKAGLKIYRPGSKDEDCNSKGWFGWMWGWSGETAEKKEDFKS 451

  Fly   440 SQKLVEKFEAAMTSEEKEKMYRAIGYQENAKPTDLPESYEAIRMNFKLIALEVGLYKDERNSSAA 504
            .     ..|..|:.|||.::|.||||.|.|....||::|||:|:..||:::.:.|.:|:..:.  
 Frog   452 G-----SLEGLMSPEEKVRLYAAIGYSETAVDPTLPKTYEAMRLCVKLLSMSIQLREDKGKTE-- 509

  Fly   505 TKDFHELPSLVLLNFSMA--TALITQRPAAEAISIIAGMREIKVTGLTRNDYTPLLVESK--ITD 565
                       |:||::.  :.::.|||.|:||...|.:...:|||..:....|.::.|:  |.:
 Frog   510 -----------LINFAITDLSTVLKQRPGAQAIKFEAQIGTFEVTGTPQEKSVPCVLSSRNLIEN 563

  Fly   566 EFNLLEVFFETNPLDKLCDQRVKVVARPLQITYDAPTILALINAFQTPGDVTLSKFEDAASTKIS 630
            ..:||.:.|||||||:..||:::|.::||:|.|||.||..|::.|:.|.||.|.:...|..||:.
 Frog   564 NISLLSLMFETNPLDERADQKLQVESQPLEIIYDAKTINNLVDFFRPPQDVHLEQLASATMTKLE 628

  Fly   631 NFKERSATGMQYMIDKKAVLDVDILLMPNILVVPHKGVYDAGNVSLLVVSMGQVHLSSQPRRESN 695
            .|::|::||:.|:|:.:.|||:.|.||.:.::||..|.|:..: :||::.:|.:.:.|:.|....
 Frog   629 EFRDRTSTGLLYVIETQKVLDLKINLMASYIIVPENGFYEQSS-NLLLLDLGSLKMVSKSRSHLP 692

  Fly   696 KLQHLFSAGEDKDEILKTVMENAYDRFTVAVDDVQMLVVRAGEPWQNALAEANSTEMHVLRPVSL 760
            :|:...|:.||       :|..|||.|.|.:..:|:|..:..|.|:.| .....:.:|:|.|:.|
 Frog   693 QLKIGQSSIED-------IMSRAYDSFDVQLSKMQLLYRKNNEDWKKA-RNLKRSSLHILEPMDL 749

  Fly   761 KVTAALCVVDNDPRLPNIKVDIDLPAILVNVSEDRIFLAIKVATSIPLPEQ-KEPASRLTQTNSR 824
            ||..:..:|..|.|:|..|:..:||.:.:.:|:.::...:::..|||.||. .||.....:...:
 Frog   750 KVEFSRAMVVTDARMPKCKLSGELPILSIQISDQKLKGVLELIDSIPKPESPPEPYPSPQKIAIQ 814

  Fly   825 SSMSISN----------------FINKE--------------VKKIGPSASGSSASKDPLLDEII 859
            .|.|:.|                .|..|              .|.....:||:.|..|.|..:.:
 Frog   815 KSTSVVNTPQLAPRRPAIVDLPSLIESESEEEFYDAPTSPVDEKPFFEVSSGAVARTDSLRKKKL 879

  Fly   860 QYTSLDVNFSLGEINFVLFQSSRKCETSPDVSIEFLTPDGDVLPSQLTENIQEPIEELPPTPPQQ 924
            :......|.:..::.|.:          |.|:|:..:...||                    .:.
 Frog   880 KRQETQKNMTEFQMRFEI----------PTVTIQLCSLSKDV--------------------EKT 914

  Fly   925 ILSIDIRRLEAHFVSKTYESVATVKLGDINLRQYDCQDSDMDVLDVIYTPKQENSSNYLFTVSCT 989
            :|.::|..|......:|::..|...|.:|:|:.....|.:...:.:|.|  .:|:::.|.|:...
 Frog   915 VLHLEIMGLGTELNVRTFDMSANAFLREISLKCPQYTDDEKRPVYIITT--LDNTTDDLLTLEYI 977

  Fly   990 IADKSSPEFSTKYNSTEQLVVANFEVLQIVLHQECLQRIMEVVNNFQRNLDLVLSSTRPRDRMGS 1054
            .||.:.|||.|.|.:.|||:..||..|.|.||.|.|...|.           .|:|..|:..   
 Frog   978 KADINGPEFKTTYKNVEQLIKVNFSSLDIHLHTEALLSTMS-----------FLTSLVPQSE--- 1028

  Fly  1055 IGGGDGIKRTLNVILEDTEEIMTTDQMKRRKKT--RRTHVVETVKVRVIANLDQVGLVLTGRKRP 1117
                   ::.::..::|:||    ::.:.:|||  :::...:.|.:.|.|.|..:.:.:.|:|..
 Frog  1029 -------RKEMDQPVQDSEE----EKREEQKKTTIKKSKYDDVVNLHVCAELSCLRVFIRGQKCR 1082

  Fly  1118 IAEMNVKKFVSSLIIKSSYTEVNIGLKDIQVLDLNPYTIHKNILSIVGKDAFNCQIVIY----NK 1178
            |:|::::...|.::|....|||...||:|.:||.:|....|..:.|.||:.|:.::|.|    ..
 Frog  1083 ISEISIEGLDSQVVITKKATEVLAKLKNIAILDCDPEANFKKAVCIKGKEFFSFKMVSYVGATEG 1147

  Fly  1179 EETQDYNSDDMKITVDIGCMKIIFLNWFVAGVMNFLNNFTAAQATISQAGAAAAESARQKAMDAY 1243
            :..:|.:..|..||:::||:::||:|.||:.::.|:|||.|.:..:::|...|||.|.....:..
 Frog  1148 DAYRDMSVVDSHITLNVGCIQVIFVNKFVSAILAFINNFQATKQALAEATVHAAEKAASGVKELA 1212

  Fly  1244 ETATRMKLNIRIKAPIIIVPIGSQDRNALLLDLGLLELTNN-TVEVAVAEEERLAVIDEIKLQIC 1307
            :.:.|:.|:|.:|||::|||..|:....|:.||||:.:.|. ::.:..:......|||.:.:.:.
 Frog  1213 QHSFRLALDIHVKAPVVIVPQSSKSSQVLVADLGLITVNNKFSIVIPKSHSNLPPVIDSMMINLS 1277

  Fly  1308 DVKISKIVLLDGNESTVDEVDAEVGFLSKFNMMNPMSCTLSITRNLSYTWYRDVPELNLSGRLKS 1372
            ::|:.:.|..:|:            ..|:..::.|::..::|.|||:..||.|||::.:.|.||.
 Frog  1278 ELKMYRTVYENGS------------LQSELQLLQPVNLDITIERNLAADWYHDVPDIKIIGHLKP 1330

  Fly  1373 IELTLFADDYALVMLVLNRNLNEGLEEFPPSEEAPQEAQVRPERRNSR-AGRLSRTVQV----SP 1432
            :.|.|..:|..|::..||.||.|..|.||  .|:..|..|..:..:|. ||....|..|    ||
 Frog  1331 MNLILGQEDLTLILQTLNENLGETSELFP--AESDDETLVSGDNSSSHSAGTTVVTAAVVETYSP 1393

  Fly  1433 IREKIHESIKFNFQFDGVVINLMEGE-------------GAGLARFGIYFLSVKGTKLDNGTLST 1484
            :  ||..::|.:||||.:.:||..|:             ...||.|.:..:|:......:||::.
 Frog  1394 V--KIKTTLKLDFQFDSLTLNLYSGKTFVLQGSVHERDSSLKLAEFKLGLISLAVKMSSDGTVNA 1456

  Fly  1485 SVVLCNIQMDDMRSNSKSQIRQYLSRKDWVQPKLDTDEIIDACYNERNFMVDVTAIIKEDDTFAE 1549
            :|.|.|..:||.|.:.:....:.|      :.|:.|         |:|.||||:.....:.|..:
 Frog  1457 AVKLTNCLLDDKRQSVQKATPRML------EMKVGT---------EKNVMVDVSYKQGREGTILD 1506

  Fly  1550 VRVRGFDLIVCIDFLLKLTTFLTLPPEENPRESVYIK--PAPVSETARDTKHSIRSSAILAAQEL 1612
            |.||...|...::|||.:........:::.:....||  .|||.|:|                  
 Frog  1507 VTVRDVYLCASMEFLLTVADIFLKASQQSSKAEKSIKQTSAPVKESA------------------ 1553

  Fly  1613 VPVESSSHEVPNRKMNLILHIDEPDIILVENLEDLNTSCIIFNAQVHLNYRSINDKQIVNGQIDA 1677
                 .:.:|...:||::  :..|:|:.|.:|...:...::...|..|..::..:.|.:...:..
 Frog  1554 -----PTQQVSKMEMNVV--VKNPEIVFVADLSRADAPALVVTTQCELCIKTSPEMQNMTAAVKD 1611

  Fly  1678 LKMYMCAFLPERREMTRHYILHPCVISLQGSTPEEEGMHISLKLSDIIINVSPATIELLNKAMLS 1742
            |.|..|.||.::|......||.||.:..|..........|.|.:..:::.|||.   ::|..:..
 Frog  1612 LHMKACPFLSDQRAGKITTILQPCDLFFQSIQSNSGPQMIELSIKSLMLKVSPV---IINTVITI 1673

  Fly  1743 VSSGTMTKCAIAEESRNYS-NLWHQHHFHSRTYWFTKVEQGVDALEAEQRSVSTDNEKQKTEKCV 1806
            .|:.:..|.|::|.:...| :||.:.:......||.:     ::.|:|.:...:.|.....|...
 Frog  1674 TSAISSNKEAVSEVTSPVSPDLWKKKNLKDLKMWFFE-----ESKESENKPEESSNMVLTGETLK 1733

  Fly  1807 IEIPSITLVIESGVGYYTKPLISLDTRITAVFNNWSRSLTAHGSLTLNMNYYNQALAEWEPIIEL 1871
            :.|.||.:.:|:|||:.|.|::...:..:....|||..:..:..|.|.::.:|:....|||::|.
 Frog  1734 MSIESIIVTLEAGVGHRTLPMLLAKSSFSGNVTNWSTLINLYCQLELEVHCFNEMFGVWEPLVEP 1798

  Fly  1872 NEVIGRNGVREYTPWELKFEMGMEKVQSELEDDAEQQ-------AMHMNIHSAETLEITLSKTCL 1929
            .||   :....:.||.|..:|..:..:...|.|.|::       ...::|.|.:.|.|||||..:
 Frog  1799 LEV---DKTDSFRPWNLGVKMKKKAREQICEPDGEEENYKIPEYITAISIFSKDHLNITLSKCGM 1860

  Fly  1930 GLLSELAEAFSQA---------IDQNGLTKPDIVAPYVLENDTGFDVNLNLRKGIFTLHEVHRGG 1985
            ..|..||.||:.|         |||         ||:|::|..|..|:::.......|:.     
 Frog  1861 ATLGNLANAFTDAASKKCDACKIDQ---------APFVVKNYLGLLVSVSPSDSFKPLNS----- 1911

  Fly  1986 TPVGANSTLLMVAQSEEVDPSVIKTCTISTGGRAYLQTKDLSTLSEEDSEDYTLYVTIGDINKEI 2050
               .|.|..:.:...|.:|...:::.:         ||...|.::...|:.:.:.:|..|.:...
 Frog  1912 ---AAGSKKIDLHDGECLDMDYVQSKS---------QTDQFSAMTSLSSKHFYIQLTPLDHSHTD 1964

  Fly  2051 ALPVSKSDTRFFNLMRSTSHEPWGIISEVKQEYGTTKVNIHGVVSVHNHFTTGLNIYRRNPAPTA 2115
            .:|::|.....:.:....|.....|:.:|....||..:.|...:.:.|||:..:.||.       
 Frog  1965 KIPLTKVGRSLYCVRHLVSGIERYIVCQVDSVEGTKCITIRSPLQIRNHFSIPIGIYE------- 2022

  Fly  2116 QCFEDIFVGRVRPGEVFHVPLHAIYAESKDLFF---SMRGYRRSVQGISWASNPSDLNYSHQLHC 2177
               |.:.:|...|.:.|::|| |.|...  |.|   ..:.|..| :|:|:.....:......:.|
 Frog  2023 ---EGVCLGTASPEDEFNIPL-ASYRSV--LCFKPVQEKKYEMS-EGVSFEDVIKNDGLLLNMKC 2080

  Fly  2178 -DPTNTFEPLIMNARRSKSEVY-FENTNKYTLLSAFYTIHLRPPLYLRNSLPINIQVSVAGCSVR 2240
             ..|:..:.|.:|....|..|. .::||:...|.  |.:||.|.:.|||.||..|:.|:.|..|.
 Frog  2081 QSATSKKDSLKLNIVPVKDIVMSSDHTNEGWHLP--YVVHLWPTVVLRNLLPYQIKFSLQGVDVD 2143

  Fly  2241 K---EDGLDAQSSQRFVDRGYRKEDFLDYGEKPVNSGDVLHLPTVRLASKGKESKSFLVVRLVQY 2302
            .   :||...|.....:|                                    .:.|.::|:.|
 Frog  2144 ATLVDDGCSTQIHNAALD------------------------------------NTKLKLQLLNY 2172

  Fly  2303 LEKDWSCATEIWDYTDDVITWTFSSYDSEMKVDMDLYVKTENRHGSLMLTLFSPFWMINKTGMML 2367
            .::.|:....|.....|:....|.......|.::|:.|......|..::.|.||:||:||||.||
 Frog  2173 TDQGWTAEYHIQSKQQDIHFINFRCVAELDKSELDIAVHVTYTTGQTIIALHSPYWMVNKTGRML 2237

  Fly  2368 TYKSETTSVEVLYHPPEYSGPILFTFRDKLFFDKKKASIRIDNGQWSEKIPLDVAGSVGEVICFA 2432
            .||::....:   ||.::..|:||:|:.|.|....|..:.|.:.:.|:...||..||.|.|.|.:
 Frog  2238 QYKADDIHRK---HPADHKKPLLFSFKPKNFLQNNKVQLMITDSELSDPFSLDTVGSHGAVKCKS 2299

  Fly  2433 NNQKYPVGVHNHLTQNSLTKQITFIPFYIVCNKCHFDIELQEQSRPADPWLHLEPNEMEPLWPRN 2497
            ....|.|||..:.:..:||:.:||.||::|.|:.::.:.:.|:.  ::..:.:...:..|.||.|
 Frog  2300 KKLDYQVGVTIYASSFNLTRIVTFTPFFMVANRSNYTLSVAEEG--SEKCITVSTEQCVPFWPEN 2362

  Fly  2498 DTKNNLVVRVDG-KITP--AFDFTEVICTLLKLEDSKYGGINVDVQTTEGGVYITFTDYKPADAP 2559
             :.|.|:|:|:| |..|  .:...:...|||.|.| ::|||.|||...:....|||:||....||
 Frog  2363 -SNNKLIVQVEGSKAAPKKIYFNKQDNSTLLYLGD-QFGGILVDVTLRDHSTVITFSDYHAGAAP 2425

  Fly  2560 GLLINHTGKQIVYHEKGTKNEH--ILNAKSTIMYAWDDPTGPKMLVFGTNKEETDLKR--DGIGE 2620
            .|:||....:.|...:.:.||.  .|.....::|||.|||..:.|.:...|.:.::.:  |.: |
 Frog  2426 FLIINDMKSETVTFFQSSVNEEKDCLPPGKAVLYAWKDPTSERKLTWICRKSQGEVSQTEDRV-E 2489

  Fly  2621 VIMQDGGKVLWVSFLDGLQRVLLFTENESIANRTESTASLQSITQSIDLRIHGIGLSVINNETGL 2685
            .:..:...|..||||:||||:||||||||:.|.|......:...|.|.:.:..||:|::||.|..
 Frog  2490 YLRLEDTSVYLVSFLEGLQRILLFTENESVFNVTFDNQKAELAEQEIIISLSNIGISLVNNYTKQ 2554

  Fly  2686 DILYLGVTSSGIIWESKKVTKNRFKELTINENALLEIEYQKYLVHKSVNDVQTYKLDNKFPI--- 2747
            ::.|:|:|:|.::||:||  |:|:|.|:|.:...||..:::| ...|..|.:...||....:   
 Frog  2555 EVSYIGITNSDVVWETKK--KSRWKPLSIKQTEKLEQAFKEY-TESSPTDTKIVALDTNCQVCLT 2616

  Fly  2748 -DFDLMILKKTVERNLRRSFYPAIWLSRKSSPFQSQLHVKINRIQVDNQFLDPIFPVVLAPIPPP 2811
             ||..|...:.....:||||.||:.|...:|..|:.:.:::.|||:.||....|||.|..|:.||
 Frog  2617 PDFSGMKFIQPTTDPIRRSFLPALKLEYSASAHQTSIRLQVYRIQIQNQNPAAIFPFVFYPVKPP 2681

  Fly  2812 KSVASTTSLKPFIECSMVQRIMPNSTVRQFKYARILIQEFLFKVDLNFLTAIAEMFAK--EVSDE 2874
            |||...:..||..:.|:|.|...:|.:.:.||.::||||...::||.||.|:|::|::  :|..:
 Frog  2682 KSVTLDSEPKPLTDVSIVMRTAGHSEISRIKYFKVLIQEMDLRIDLGFLYALADLFSQSGDVPKD 2746

  Fly  2875 AAAKQFRQDVESIELPLSAFFEEHSLEEQKSFYDNLHLGPLKIHVSFSMAGS---------DTKA 2930
            .|.:.|::||||.:..|||.....:  ...|.|:..|:.|:|:|:|||::..         |.:.
 Frog  2747 QAIELFKKDVESFQTELSAVSSTDT--SSISVYEYFHISPIKLHLSFSLSTGGDDGNKEQRDKEL 2809

  Fly  2931 LP-GFLGSLVQGVGVTLTDVNDVVFRLAFFEREYQFFSQKQLINEITSHYTGQALKQLYVLVLGL 2994
            :| ..|..|::.:|.|||||.||||:||:||.:.||::.::|..|:..||:.||:||:|||||||
 Frog  2810 IPVQSLNLLLKSIGATLTDVQDVVFKLAYFELQNQFYTTQELQWEVIRHYSKQAIKQMYVLVLGL 2874

  Fly  2995 DVLGNPYGLVVGLKKGVEDLFYEPFQGAIQGPGEFAEGLVLGVKSLFGHTVGGAAGAVSKITGAM 3059
            ||||||:|....|.:|||..||||:|||||||.||.||:.||||:|.|..|||.|||.|:|||||
 Frog  2875 DVLGNPFGFFRDLSEGVEAFFYEPYQGAIQGPEEFVEGMALGVKALVGGAVGGLAGAASRITGAM 2939

  Fly  3060 GKGLAALTFDEDYQKKRRQGIQNKPKNFHEGLARSSKGLVMGFVDGVTGVVTKPVTGARDNGVEG 3124
            .||:||:|.||:||:|||:.:..:|....||:.|..||||.|||.|:||:||||:.||:..|..|
 Frog  2940 AKGVAAITMDEEYQQKRREAMNKQPSGIREGITRGGKGLVSGFVSGITGIVTKPIKGAQKEGAAG 3004

  Fly  3125 FFKGLGKGAIGLVARPTAGVVDFASGSFEAVKRAADASEDVKRMRPPRFQHYDFVLRPYCLMEAT 3189
            ||||:|||.:|.|.|||.|::|.||.:|:.:|:|.|:|:||:.:|||||.|.|.|:|||.:.|..
 Frog  3005 FFKGVGKGLVGAVTRPTGGIIDMASSTFQGIKKATDSSDDVESLRPPRFIHEDGVIRPYRMREGA 3069

  Fly  3190 GNKIMKETDKGKFATTDNFIHCEEIIQKSEYLVVTNYRVMYVQRNEMFGVWTSLWSYLWNEISSV 3254
            |::::::.:.|:||....|.|.  ::..|:.|:|....|::|.|. .||..|..|.|.::|.:..
 Frog  3070 GSQMLQKIENGRFAKCKYFAHA--MVNSSDLLMVMKSGVLFVTRG-TFGQLTCEWQYSFDEFTKE 3131

  Fly  3255 AATARGVQFTVKTDGKKVLGLFSSKE--------SPR--KLVLVADERKRDA 3296
            .....|.:..::.. ::|..:|.:||        :|.  |.:|...|..|||
 Frog  3132 PFIVSGRRLRIEAK-ERVKSVFHAKEFGKIINFRTPEEAKWILCKLEEVRDA 3182

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Vps13NP_001260781.1 Chorein_N 4..113 CDD:315323 59/108 (55%)
VPS13 140..370 CDD:318996 82/232 (35%)
VPS13_mid_rpt 574..807 CDD:318998 78/232 (34%)
SHR-BD 2349..2600 CDD:310922 86/255 (34%)
VPS13 <2701..3232 CDD:330393 237/546 (43%)
VPS13_C 2904..3074 CDD:318997 96/179 (54%)
vps13aXP_031746767.1 MRS6 4..>2076 CDD:227376 640/2266 (28%)
SHR-BD 2220..2468 CDD:399561 86/254 (34%)
MRS6 <2642..3110 CDD:227376 214/471 (45%)
VPS13_C 2777..2954 CDD:407143 95/176 (54%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 212 1.000 Domainoid score I2722
eggNOG 00.000 Not matched by this tool.
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 1 1.000 - - H22068
Inparanoid 1 1.050 1542 1.000 Inparanoid score I93
OMA 1 1.010 - - QHG54975
OrthoDB 1 1.010 - - D4159at2759
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001282
OrthoInspector 1 1.000 - - otm48531
Panther 00.000 Not matched by this tool.
Phylome 1 0.910 - -
RoundUp 1 1.030 - avgDist Average_Evolutionary_Distance R1642
SonicParanoid 1 1.000 - - X990
SwiftOrtho 00.000 Not matched by this tool.
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
1111.010

Return to query results.
Submit another query.