DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhx15 and AT2G47250

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610269.1 Gene:Dhx15 / 35654 FlyBaseID:FBgn0033160 Length:729 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_182247.1 Gene:AT2G47250 / 819338 AraportID:AT2G47250 Length:729 Species:Arabidopsis thaliana


Alignment Length:735 Identity:507/735 - (68%)
Similarity:607/735 - (82%) Gaps:31/735 - (4%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     3 KRRIEVGETYGSKAKKDPEASSSSA-------AAAAGTVAQILGGFVPNKQPPTMNPLTNTPYSQ 60
            ||::.:.:     ..:||..||.:.       |||||..:.::            |......|||
plant     6 KRKVSLFD-----VMEDPSLSSKNTKSNGLGLAAAAGGGSNLI------------NKWNGKAYSQ 53

  Fly    61 RYQNLYKKRIALPVFEYQADFMRLLSLHQCIVLVGETGSGKTTQIPQWCVDFAVS----KGRKG- 120
            ||..:.:||..|||:..:.||:..|:.:|.::|||||||||||||||:.:|..|:    ||||. 
plant    54 RYFEILEKRRDLPVWLQKDDFLNTLNSNQTLILVGETGSGKTTQIPQFVLDAVVADNSDKGRKWL 118

  Fly   121 VSCTQPRRVAAMSVAQRVSEEMDVKLGEEVGYSIRFEDCSTAKTLLKYMTDGMLLREAMSDPMLD 185
            |.||||||||||||::||::||||.:|||||||||||||::::|:|||:||||||||||:||:|:
plant   119 VGCTQPRRVAAMSVSRRVADEMDVSIGEEVGYSIRFEDCTSSRTMLKYLTDGMLLREAMADPLLE 183

  Fly   186 QYQVILLDEAHERTLATDILMGVLKEVIRQRSDLKLVVMSATLDAGKFQQYFDNAPLMKVPGRTH 250
            :|:||:||||||||||||:|.|:||||:|.|.|||||||||||:|.|||:||..|||||||||.|
plant   184 RYKVIILDEAHERTLATDVLFGLLKEVLRNRPDLKLVVMSATLEAEKFQEYFSGAPLMKVPGRLH 248

  Fly   251 PVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEIEGDILMFLTGQEEIEEACKRIKREIDNLGSEIGE 315
            |||||||.||||||||||||||:||||||. .||||:||||:||||:||::|.:|:.|||.::|.
plant   249 PVEIFYTQEPERDYLEAAIRTVVQIHMCEP-PGDILVFLTGEEEIEDACRKINKEVSNLGDQVGP 312

  Fly   316 LKCIPLYSTLPPNLQQRIFEPAPPP-NANGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKV 379
            :|.:||||||||.:||:||:|||.| ...|..|||:|||||||||||||||:|:|||||||||||
plant   313 VKVVPLYSTLPPAMQQKIFDPAPVPLTEGGPAGRKIVVSTNIAETSLTIDGIVYVIDPGFAKQKV 377

  Fly   380 YNPRIRVESLLVSPISKASAQQRSGRAGRTRPGKCFRLYTEKAFKNEMQDNTYPEILRSNLGTVV 444
            ||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||:|.|::|..||||||||||...|
plant   378 YNPRIRVESLLVSPISKASAHQRSGRAGRTRPGKCFRLYTEKSFNNDLQPQTYPEILRSNLANTV 442

  Fly   445 LQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALDDDGNLTDLGAVMSEFPLDPQLAKMLI 509
            |.||||||||||||||||||||||||||||:||||.||||:||||..|.:|||||||||::||||
plant   443 LTLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALEVLNYLGALDDEGNLTKTGEIMSEFPLDPQMSKMLI 507

  Fly   510 ASCQHNCSNEILSITAMLSVPQCFVRPNEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQSSEDP 574
            .|.:.||||||||::||||||.|||||.||:|||||||.||.|||||||||||||||:||::|||
plant   508 VSPEFNCSNEILSVSAMLSVPNCFVRPREAQKAADEAKARFGHIDGDHLTLLNVYHAYKQNNEDP 572

  Fly   575 NWCYENFINFRSLKSADNVRQQLARIMDRFNLRRTSTEFTSKDYYVNIRKALVQGFFMQVAHLER 639
            |||:|||:|.|::||||||||||.|||.||||:..||:|.|:|||||||||::.|:|||||||||
plant   573 NWCFENFVNNRAMKSADNVRQQLVRIMSRFNLKMCSTDFNSRDYYVNIRKAMLAGYFMQVAHLER 637

  Fly   640 TGYYLTIKDNQNVQLHPSTCLDHKPDWVIYNEFVLTTKNYIRTVTDVKPEWLCCLAPQYYDLNNF 704
            ||:|||:||||.|.||||.||||||:||||||:||||:|:||||||::.|||..:|..||||:||
plant   638 TGHYLTVKDNQVVHLHPSNCLDHKPEWVIYNEYVLTTRNFIRTVTDIRGEWLVDVAQHYYDLSNF 702

  Fly   705 PQCEAKRQLELLQQRLETKQ 724
            |.|||||.||.|.::.|.::
plant   703 PNCEAKRALEKLYKKREREK 722

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhx15NP_610269.1 HrpA 71..>691 CDD:441249 469/625 (75%)
AT2G47250NP_182247.1 HrpA 64..>695 CDD:441249 472/631 (75%)

Return to query results.
Submit another query.