DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhx15 and ddx-15

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610269.1 Gene:Dhx15 / 35654 FlyBaseID:FBgn0033160 Length:729 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_741147.1 Gene:ddx-15 / 175771 WormBaseID:WBGene00018967 Length:739 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:734 Identity:515/734 - (70%)
Similarity:614/734 - (83%) Gaps:18/734 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     2 SKRRIEVGETYGSKAKKDPEASSSSAA------AAAGTVAQILGGFVPNKQPPTMNPLTNTPYSQ 60
            |:.|:::..:.....::.|...|.|.:      ::.....||  |.|.|.: ..:||..|.|:|.
 Worm     3 SRHRLDLDGSGRGDRRRSPNRRSRSRSRSPHRRSSPDRKRQI--GAVGNMK-IQINPYNNQPFSN 64

  Fly    61 RYQNLYKKRIALPVFEYQADFMRLLSLHQCIVLVGETGSGKTTQIPQWCVDFAVSKGRKG----- 120
            ||..:::||..|||:||:..||.||..:|||.||||||||||||||||.|:| :.:.::|     
 Worm    65 RYWAIWEKRSQLPVWEYKEKFMELLRNNQCITLVGETGSGKTTQIPQWAVEF-MKQQQQGQPPGQ 128

  Fly   121 ---VSCTQPRRVAAMSVAQRVSEEMDVKLGEEVGYSIRFEDCSTAKTLLKYMTDGMLLREAMSDP 182
               |:|||||||||||||.||:|||||.||:|||||||||||.:.:|:|||.||||||||||:.|
 Worm   129 ARLVACTQPRRVAAMSVATRVAEEMDVVLGQEVGYSIRFEDCISERTVLKYCTDGMLLREAMNSP 193

  Fly   183 MLDQYQVILLDEAHERTLATDILMGVLKEVIRQRSDLKLVVMSATLDAGKFQQYFDNAPLMKVPG 247
            :||:|:|::||||||||||||||||::||::|.|:|:|:|:|||||||||||:||::.||:.|||
 Worm   194 LLDKYKVLILDEAHERTLATDILMGLIKEIVRNRADIKVVIMSATLDAGKFQRYFEDCPLLSVPG 258

  Fly   248 RTHPVEIFYTPEPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEIEGDILMFLTGQEEIEEACKRIKREIDNLGSE 312
            ||.|||||:||..|:|||||||||||||||.||:|||||:|||||||||||||||.|||..||::
 Worm   259 RTFPVEIFFTPNAEKDYLEAAIRTVIQIHMVEEVEGDILLFLTGQEEIEEACKRIDREIQALGAD 323

  Fly   313 IGELKCIPLYSTLPPNLQQRIFEPAPPPNANGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQ 377
            .|.|.||||||||||..||||||||||...||||.||.|:||||||||||||||||||||||:||
 Worm   324 AGALSCIPLYSTLPPAAQQRIFEPAPPNRPNGAISRKCVISTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFSKQ 388

  Fly   378 KVYNPRIRVESLLVSPISKASAQQRSGRAGRTRPGKCFRLYTEKAFKNEMQDNTYPEILRSNLGT 442
            ||||||||||||||.|||||||.||:||||||:||||||||||.|:.:||||.|||||||||||:
 Worm   389 KVYNPRIRVESLLVCPISKASAMQRAGRAGRTKPGKCFRLYTETAYGSEMQDQTYPEILRSNLGS 453

  Fly   443 VVLQLKKLGIDDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALDDDGNLTDLGAVMSEFPLDPQLAKM 507
            |||||||||.:||||||||||||||||||||||||||.|::|||.||:||::|:|||||||||||
 Worm   454 VVLQLKKLGTEDLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLQAINDDGELTELGSLMAEFPLDPQLAKM 518

  Fly   508 LIASCQHNCSNEILSITAMLSVPQCFVRPNEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQSSE 572
            ||.|.:.||||||||||||||||||:|||||.:..|||||.|||||||||||||||||:|||:.|
 Worm   519 LITSTELNCSNEILSITAMLSVPQCWVRPNEMRTEADEAKARFAHIDGDHLTLLNVYHSFKQNQE 583

  Fly   573 DPNWCYENFINFRSLKSADNVRQQLARIMDRFNLRRTSTEFTSKDYYVNIRKALVQGFFMQVAHL 637
            ||.|||:||||:|::|:||.||.||:|:||::||||.||:|.|:|||:|||||||.|||||||||
 Worm   584 DPQWCYDNFINYRTMKTADTVRTQLSRVMDKYNLRRVSTDFKSRDYYLNIRKALVAGFFMQVAHL 648

  Fly   638 ERTGYYLTIKDNQNVQLHPSTCLDHKPDWVIYNEFVLTTKNYIRTVTDVKPEWLCCLAPQYYDLN 702
            ||:|:|:|:||||.|.|||||.|||||:|.:||||||||||:|||||||:||||..:|||||||:
 Worm   649 ERSGHYVTVKDNQLVNLHPSTVLDHKPEWALYNEFVLTTKNFIRTVTDVRPEWLLQIAPQYYDLD 713

  Fly   703 NFPQCEAKRQLELLQQRLE 721
            |||..:.||:|..:.|.|:
 Worm   714 NFPDGDTKRKLTTVMQTLQ 732

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhx15NP_610269.1 HrpA 71..>691 CDD:441249 479/627 (76%)
ddx-15NP_741147.1 HrpA 74..>707 CDD:441249 481/633 (76%)

Return to query results.
Submit another query.