DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Dhx15 and Dhx15

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610269.1 Gene:Dhx15 / 35654 FlyBaseID:FBgn0033160 Length:729 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_031865.2 Gene:Dhx15 / 13204 MGIID:1099786 Length:795 Species:Mus musculus


Alignment Length:794 Identity:568/794 - (71%)
Similarity:649/794 - (81%) Gaps:67/794 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MSKR-RIEVGETYGSKAK--------------------------------KDPEASSSSAAAAAG 32
            |||| |:::||.|.|..|                                ::.|........|:.
Mouse     1 MSKRHRLDLGEDYPSGKKRAGTDGKDRERDRDREDRSKDRDRERDRGDREREREKEKEKELRAST 65

  Fly    33 TVAQILGGFVPNKQ--------------------------------PPTMNPLTNTPYSQRYQNL 65
            ....|..|..|.|.                                |..:||.||.|::.||.::
Mouse    66 NAMLISAGLPPLKASHSAHSTHSAHSTHSTHSAHSTHTGHTGHTSLPQCINPFTNLPHTPRYYDI 130

  Fly    66 YKKRIALPVFEYQADFMRLLSLHQCIVLVGETGSGKTTQIPQWCVDF--AVSKGRKGVSCTQPRR 128
            .|||:.|||:||:..|..:|..||..|||||||||||||||||||::  ::...::||:||||||
Mouse   131 LKKRLQLPVWEYKDRFTDILVRHQSFVLVGETGSGKTTQIPQWCVEYMRSLPGPKRGVACTQPRR 195

  Fly   129 VAAMSVAQRVSEEMDVKLGEEVGYSIRFEDCSTAKTLLKYMTDGMLLREAMSDPMLDQYQVILLD 193
            ||||||||||::||||.||:||||||||||||:|||:||||||||||||||:||:|::|.||:||
Mouse   196 VAAMSVAQRVADEMDVMLGQEVGYSIRFEDCSSAKTILKYMTDGMLLREAMNDPLLERYGVIILD 260

  Fly   194 EAHERTLATDILMGVLKEVIRQRSDLKLVVMSATLDAGKFQQYFDNAPLMKVPGRTHPVEIFYTP 258
            |||||||||||||||||||:|||||||::||||||||||||.||||.||:.:|||||||||||||
Mouse   261 EAHERTLATDILMGVLKEVVRQRSDLKVIVMSATLDAGKFQIYFDNCPLLTIPGRTHPVEIFYTP 325

  Fly   259 EPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEIEGDILMFLTGQEEIEEACKRIKREIDNLGSEIGELKCIPLYS 323
            ||||||||||||||||||||||.|||:|:||||||||:|||||||||:|:||.|:|::|.|||||
Mouse   326 EPERDYLEAAIRTVIQIHMCEEEEGDLLLFLTGQEEIDEACKRIKREVDDLGPEVGDIKIIPLYS 390

  Fly   324 TLPPNLQQRIFEPAPPPNANGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVES 388
            ||||..|||||||.||...||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Mouse   391 TLPPQQQQRIFEPPPPKKQNGAIGRKVVVSTNIAETSLTIDGVVFVIDPGFAKQKVYNPRIRVES 455

  Fly   389 LLVSPISKASAQQRSGRAGRTRPGKCFRLYTEKAFKNEMQDNTYPEILRSNLGTVVLQLKKLGID 453
            |||:.|||||||||:|||||||||||||||||||:|.||||||||||||||||:|||||||||||
Mouse   456 LLVTAISKASAQQRAGRAGRTRPGKCFRLYTEKAYKTEMQDNTYPEILRSNLGSVVLQLKKLGID 520

  Fly   454 DLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALDDDGNLTDLGAVMSEFPLDPQLAKMLIASCQHNCSN 518
            |||||||||||||||||||||||||||||:|||:||:||::|:|||||||||||:||||.:||||
Mouse   521 DLVHFDFMDPPAPETLMRALELLNYLAALNDDGDLTELGSMMAEFPLDPQLAKMVIASCDYNCSN 585

  Fly   519 EILSITAMLSVPQCFVRPNEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQSSEDPNWCYENFIN 583
            |:||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||:.|...|||:||||
Mouse   586 EVLSITAMLSVPQCFVRPTEAKKAADEAKMRFAHIDGDHLTLLNVYHAFKQNHESVQWCYDNFIN 650

  Fly   584 FRSLKSADNVRQQLARIMDRFNLRRTSTEFTSKDYYVNIRKALVQGFFMQVAHLERTGYYLTIKD 648
            :|||.|||||||||:||||||||.|.||:|||:|||:|||||||.|:|||||||||||:|||:||
Mouse   651 YRSLMSADNVRQQLSRIMDRFNLPRRSTDFTSRDYYINIRKALVTGYFMQVAHLERTGHYLTVKD 715

  Fly   649 NQNVQLHPSTCLDHKPDWVIYNEFVLTTKNYIRTVTDVKPEWLCCLAPQYYDLNNFPQCEAKRQL 713
            ||.|||||||.|||||:||:||||||||||||||.||:|||||..:||||||::|||||||||||
Mouse   716 NQVVQLHPSTVLDHKPEWVLYNEFVLTTKNYIRTCTDIKPEWLVKIAPQYYDMSNFPQCEAKRQL 780

  Fly   714 ELLQQRLETKQYQK 727
            :.:..:|::|:|.:
Mouse   781 DRIIAKLQSKEYSQ 794

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Dhx15NP_610269.1 HrpA 71..>691 CDD:441249 519/621 (84%)
Dhx15NP_031865.2 Disordered. /evidence=ECO:0000256|SAM:MobiDB-lite 1..111 54/174 (31%)
HrpA 136..>763 CDD:441249 498/592 (84%)
DEAH box 260..263 2/2 (100%)

Return to query results.
Submit another query.