Protein Alignment Ptr and Ptchd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001342199.1
• Gene: Ptchd4 / 627626
• MGIID: 1920485
• Length: 904
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 887
• Identity: 231/887 - (26%)
• Similarity: 420/887 - (47%)
• Gaps: 86/887 - (9%)

  Fly    14 KSFYH-LGICIAKHPGYFIIIPVLLTL-LCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYF 76
            :||.| ||:|:::||.:|:.:|.:||: ..::...:.:.:.|.|.|.:|.....|.||::....|
Mouse    28 QSFCHRLGLCVSRHPVFFLTVPAVLTITFGLSALNRFQTEGDLERLVAPSHSLAKIERSLASSLF 92

  Fly    77 KVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDGDTYTYKD 141
            .::.:.......:..|||:||||:::..||..:::.|   .:.|....:......:.|..||:..
Mouse    93 PLDQSKSQLYSDLHTPGRYGRVILLSSPGDNILLQAE---GILQTHRAVMEMKVNHKGYNYTFSH 154

  Fly   142 NCA--RWENECFENDILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVTWDAHLFPVFFGGTKL------- 197
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Mouse   155 LCVLRNQDKKCVLDDII---SVLEDLRQAAVS-------NKTTARVQ---VRYPNTKLKDGRNSF 206

  Fly   198 -------------TEDNYVISVPAIQLVYFV-TADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKH 248
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Mouse   207 IGHQLGGVVEVPNSKDQRVKSARAIQITYYLQTYGSATQDLIGEKWENEFCKLMRKLQEEHQ--D 269

  Fly   249 ISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIIT-----CMMGDAVRSKPFLGLMGNVS 308
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Mouse   270 LQLYSLASFSLWRDFHKTS-----ILTRSKVLVSLVLILTTATLSSSMKDCLRSKPFLGLLGVLT 329

  Fly   309 AIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEA 373
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Mouse   330 VCISIATAAGIFFITDGKYNSTLLGIPFFAMGHGTKGVFELLSGWRRTKENLPFKDRVADAYSDV 394

  Fly   374 AVSITITSVTDFISFLIGIISPF---RSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKN 435
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Mouse   395 MVTYTMTSSLYFITFGMG-ASPFTNIEAVKIFCQNMCVSILLNYFYIFSFFGSCLVFAGQLEQNR 458

  Fly   436 LHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMAGGID--ANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNK 498
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Mouse   459 YHSIFCCKIP--SAEYLDRKPVWFQTVMSDGHQQTSHHETNPYQH--HFIQHFLREHYNEWITNI 519

  Fly   499 WCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGP 563
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Mouse   520 YVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQISDGASIINLLASDSPSVSYAMVQQKYFSNYSPVIGFYVYEP 584

  Fly   564 LNYSDPLVQEQVENLTSTLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVKE 628
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Mouse   585 LEYWNSSVQEDLQRLCSGFT----------AVSWVEQYYQFLKTS----NISANNKTDFISVLQS 635

  Fly   629 HWLFPGNP----FSLDVRFNE--DETQIIASRFLIQAVNITDTNHEK-EMVRDLRQICKDSPLNA 686
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Mouse   636 SFL--KKPEFQHFRNDIIFSRAGDENNIIASRLYLVARTSRDKQKEVIEVLDKLRPLSLSKSIRF 698

  Fly   687 SIFHPYFVFFDQFELVRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMAL 751
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Mouse   699 IVFNPSFVFTDHYSLSVTVPVLIAGFGVLLVLILTFFLVIHPLGNFWLILSVTSIELGVLGLMTL 763

  Fly   752 WDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGI 816
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Mouse   764 WNVDMDCISILCLIYTLNFAIDHCAPLLYTFVLATEHTRTQCIKSSLQEHGTAILQNITSFLIGL 828

  Fly   817 VALLLAQSYIFLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858
            :.||...|.:....||.:.|......:|...:|||.|:.|.|
Mouse   829 LPLLFVPSNLTFTLFKCLLLTGGCTLLHCFVILPVFLTFFPP 870

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	212/831 (26%)
Ptchd4	NP_001342199.1	Patched	84..870	CDD:308203	213/829 (26%)