Protein Alignment Ptr and npc1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_005163715.1
• Gene: npc1 / 553330
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-3161
• Length: 1277
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 989
• Identity: 222/989 - (22%)
• Similarity: 407/989 - (41%)
• Gaps: 212/989 - (21%)

  Fly     9 DKTLNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVE 73
            :.:|...|...|....:.|...|:..::|..:|..|...::...:|..|:|..:...:.|:...:
Zfish   335 ENSLRLVFSRWGSLCVRQPLTIILSSLVLICICSAGLSYMRITTNPVELWSAPSSRARQEKNYFD 399

  Fly    74 QYFKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRV--IVITKDGDEN---------------MIRREVFQELRQL 121
            |:|                |.|.|.  ::||....|.               ::...:..::..|
Zfish   400 QHF----------------GPFFRTEQLIITTPWTEEGGFSTITGDIIPFSPILNLSLLHQVLDL 448

  Fly   122 DNIIQNATTTYDGDTYTYKDNC----ARWENECFENDILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVT 182
            ...|:|....|.|:..|.||.|    :.:.:.|....:||......::...:....| |::|  .
Zfish   449 QLEIENLIAEYKGENVTLKDICVSPLSPYNDNCTILSVLNYFQNSHEVLDHEFQDEF-FLYN--D 510

  Fly   183 WDAHLF-------------------------PVF----FGGTKLTEDNYVISVPAIQLVYFVT-- 216
            :..||.                         |||    .||   .||:...:..|:.:.:.||
Zfish   511 YHTHLLYCASSPTSLDDTSRLHDPCMGTFGGPVFPWLVLGG---YEDSAYNNATALVITFPVTNY 572

  Fly   217 -ADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLL 280
             .||::. .|...||:.|:|.:.|.||    .:::||:.:.|:::.|:::.:.:.|.....::::
Zfish   573 LNDTEKL-GKALAWEKEFIRFMKNYEN----PNLTVSFSSERSIEDEIDRESNSDVSTIVISYII 632

  Fly   281 MGLFSIITCMMGD-------AVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINL-AAPFL 337
            |  |..|:..:|.       .|.||..||:.|.:..:.:...:.|:..|.||....|.: ..|||
Zfish   633 M--FVYISVALGRINSCRTLLVDSKISLGIAGILIVLSSVACSLGIFSYIGIPLTLIVIEVIPFL 695

  Fly   338 MIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAE---RMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISPFRSV 399
            ::.:|:|:.|:::..::|.: :||..|   ::|.::.:.|.|:.::|.::.::|.:|.:|...:|
Zfish   696 VLAVGVDNIFIIVQTYQRDE-RMPEEELHQQIGRILGDVAPSMFLSSFSETVAFFLGALSTMPAV 759

  Fly   400 RIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMA 464
            |.|..::..|:...||..|:.|.:.:.:...|:..|...|..|        :|..
Zfish   760 RTFSLFAGLAIFIDFLLQISCFVSLLGLDIKRQEANRMDILCC--------VKLS---------- 806

  Fly   465 GGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEGLERR 529
                    |...:..:..|..|||...|..|...|.:.:::..|...|..:...:.:::.|||:.
Zfish   807 --------DGQEEKSEGWLFRFFKKIYAPFILKDWVRPLVVAVFVGMLSFSIAVVNKVEIGLEQT 863

  Fly   530 KLSREDSYSVEFFDREDDYYREFP--------------YRMQVIIAGPLN-YSDPLVQE-QVENL 578
            ....:|||.:.:|.....|....|              :..|..:.|.:. .:|.|||: ...:|
Zfish   864 LSMPDDSYVLNYFGNLSKYLHTGPPVYFVVEDGHDYKTFEGQNAVCGGVGCNNDSLVQQIYTASL 928

  Fly   579 TSTLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLE----------RNNELLNVTVDDE-----QTFIDAVKE 628
            .|.....|.|.|     |||..:..:::          ......|.:|.|:     :....:.|:
Zfish   929 MSNYTRISNVPS-----SWLDDYFDWVKPQSTCCRYYNSTGAFCNASVVDKSCVHCRPMTSSGKQ 988

  Fly   629 --------HWL---FPGNP-----------FSLDVRFNEDETQIIASRFLIQAV---NITDTNHE 668
                    |:|   ...||           :...|...::.|.:.|:.|:....   |.:|..:.
Zfish   989 RPNGTEFMHFLPMFLSDNPNIKCGKGGHAAYGTAVDLKDNNTDVGATYFMSYHTILKNSSDFINA 1053

  Fly   669 KEMVRDL----RQICKDSPLNASIFHPY---FVFFDQF-------ELVRPVSLQAMVIGAIIMMI 719
            .:|.|:|    .|.......:..:| ||   :||::|:       .|...|||.|:.|  :..::
Zfish  1054 MKMARELTDNITQTLSTHDKSYKVF-PYSVFYVFYEQYLTIVDDTALNLGVSLSAIFI--VTAVL 1115

  Fly   720 ISFVFIPNILCSLW----VAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICY 780
            :.|        .||    |.|::..|.:.:.|.|.||.::|:::|::||:|..|.||:|.:||..
Zfish  1116 LGF--------ELWSAVLVCFTIAMILINMFGVMWLWSISLNAVSLVNLVMSCGISVEFCSHIVR 1172

  Fly   781 TYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTIL-GIVALLLAQSYIFLVF-FKMVFLVIFFGAM 843
            .:..|.:.|...|..|||..:|..:..|.:.|.. ||:.|.|::|.||.:| |:|...::..||.
Zfish  1173 AFSISTRSSRVERAEEALAHMGSSVFSGITLTKFGGILILALSKSQIFQIFYFRMYLAIVLLGAA 1237

  Fly   844 HGLFLLPVLLSLFG 857
            |||..||||||..|
Zfish  1238 HGLIFLPVLLSYAG 1251

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	204/931 (22%)
npc1	XP_005163715.1	2A060601	28..1251	CDD:273337	221/987 (22%)