Protein Alignment Ptr and ptc

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_523661.2
• Gene: ptc / 35851
• FlyBaseID: FBgn0003892
• Length: 1286
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 1057
• Identity: 213/1057 - (20%)
• Similarity: 372/1057 - (35%)
• Gaps: 292/1057 - (27%)

  Fly   183 WDAHLFPVFFGGTKLTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTKRQD---------------AKGAE---- 228
            |...|   ..||.|.....::....|:|.|..:..:.:..|               .|.||
  Fly   323 WPEEL---IVGGAKRNRSGHLRKAQALQSVVQLMTEKEMYDQWQDNYKVHHLGWTQEKAAEVLNA 384

  Fly   229 WEETFLRVVGN--AENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMG-----LFSI 286
            |:..|.|.|..  .:.|....:..:..|:|..||..|.|     ..:.|:..:::|     |::.
  Fly   385 WQRNFSREVEQLLRKQSRIATNYDIYVFSSAALDDILAK-----FSHPSALSIVIGVAVTVLYAF 444

  Fly   287 ITCM-MGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINLAA----PFLMIGIGIDDT 346
            .|.: ..|.||.:..:|:.|.:....:|.|..||:...||.|   |.|:    |||.:|:|:|..
  Fly   445 CTLLRWRDPVRGQSSVGVAGVLLMCFSTAAGLGLSALLGIVF---NAASTQVVPFLALGLGVDHI 506

  Fly   347 FVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVC 411
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  Fly   507 FMLTAAYAESNRR----EQTKLILKKVGPSILFSACSTAGSFFAAAFIPVPALKVFCLQAAIVMC 567

  Fly   412 FTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGC---------RVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMAGGI 467
            ......:..|.|.:::...|.......||.|         :|.|..:.:...          .|.
  Fly   568 SNLAAALLVFPAMISLDLRRRTAGRADIFCCCFPVWKEQPKVAPPVLPLNNN----------NGR 622

  Fly   468 DANDP------------DNP-------IDNKDHMLMAFFKDKMA-----AVINNKWCKAIIILAF 508
            .|..|            .||       |....|.|.:|.....|     ..:...|.|.:.::.|
  Fly   623 GARHPKSCNNNRVPLPAQNPLLEQRADIPGSSHSLASFSLATFAFQHYTPFLMRSWVKFLTVMGF 687

  Fly   509 ASYLVGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFP-YRMQVIIAGPLNYSDPLVQ 572
            .:.|:.:.|..|::::||:...|..:||...:|.|.:.   |.|. |.|..:..|  |:..|..|
  Fly   688 LAALISSLYASTRLQDGLDIIDLVPKDSNEHKFLDAQT---RLFGFYSMYAVTQG--NFEYPTQQ 747

  Fly   573 EQVENLTSTLEHTSYVTSRRYTES--------WLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVKEH 629
            :.:.:.     |.|:|......::        ||..|..:|..    |....|:|.......||.
  Fly   748 QLLRDY-----HDSFVRVPHVIKNDNGGLPDFWLLLFSEWLGN----LQKIFDEEYRDGRLTKEC 803

  Fly   630 WLFPGNPFSLDVRFNEDETQIIASRFLIQAVNITDTNHEKEMVRDLRQICKDSPLNASIFHPY-- 692
            | ||          |.....|:|.:.::|..:: |...:||:|...|.:..|..:|...|:.|
  Fly   804 W-FP----------NASSDAILAYKLIVQTGHV-DNPVDKELVLTNRLVNSDGIINQRAFYNYLS 856

  Fly   693 ----------------------------------------------------------------- 692
                                                                             
  Fly   857 AWATNDVFAYGASQGKLYPEPRQYFHQPNEYDLKIPKSLPLVYAQMPFYLHGLTDTSQIKTLIGH 921

  Fly   693 ---------------------FVFFDQFELVRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVA- 735
                                 |:|::|:..:|  |..||::..:  ::.:.|.:..:|.|:|.|
  Fly   922 IRDLSVKYEGFGLPNYPSGIPFIFWEQYMTLR--SSLAMILACV--LLAALVLVSLLLLSVWAAV 982

  Fly   736 ---FSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREA 797
               .||::....:.|.|.|..:.|.:|..:.||:.:|..:.|...|...:|:|.....: ||:.:
  Fly   983 LVILSVLASLAQIFGAMTLLGIKLSAIPAVILILSVGMMLCFNVLISLGFMTSVGNRQR-RVQLS 1046

  Fly   798 LH-SLGLPIIQGSSSTILGIVALLLAQS---YIFLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858
            :. ||| |::.|..::  |:...:|:.|   ::...|..::.:|:..||.:.|.:.|:|||:.||
  Fly  1047 MQMSLG-PLVHGMLTS--GVAVFMLSTSPFEFVIRHFCWLLLVVLCVGACNSLLVFPILLSMVGP 1108

  Fly   859 GSCLTWTGKDDGSDAEVDDGLDDR-----QLEKPFSQSYYMQYPSIGINGPYGSKGFLGAPYKAY 918
            .:.|.        ..|..|.:...     :..|...:||.:|          ||:...|:..|::
  Fly  1109 EAELV--------PLEHPDRISTPSPLPVRSSKRSGKSYVVQ----------GSRSSRGSCQKSH 1155

  Fly   919 GVDEKDL---GLGTSGEDSSESSSSRSQHRQQAAATEEEVVVRESPTRRYDDGWRRSSYQNIYGQ 980
            ....|||   .|.|..|:.....||.|                   :.:..:.|   :||. ..|
  Fly  1156 HHHHKDLNDPSLTTITEEPQSWKSSNS-------------------SIQMPNDW---TYQP-REQ 1197

  Fly   981 GAAQFQAQPDLYGKQVSATEWRQRLDTHEQQQRQRQRRSP-----FENYRQDVEIDMQKARRNSH 1040
            ..|.:.|.|..|.|..:        ..|.|.|.......|     :....|.:.:..:.....:|
  Fly  1198 RPASYAAPPPAYHKAAA--------QQHHQHQGPPTTPPPPFPTAYPPELQSIVVQPEVTVETTH 1254

  Fly  1041 GD--VIDLHGTPNSSVE 1055
            .|  ...:..|.|..||
  Fly  1255 SDSNTTKVTATANIKVE 1271

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	166/830 (20%)
ptc	NP_523661.2	2A060602	17..1134	CDD:273338	176/877 (20%)