Protein Alignment Ptr and Npc1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_609357.2
• Gene: Npc1a / 34358
• FlyBaseID: FBgn0024320
• Length: 1287
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 987
• Identity: 228/987 - (23%)
• Similarity: 406/987 - (41%)
• Gaps: 204/987 - (20%)

  Fly    12 LNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYF 76
            |...|...|...|.:||..:|....|.::...|...::...||..|::....:.:.||...:..|
  Fly   338 LETFFTKWGTYFASNPGLTLIAGASLVVILGYGINFIEITTDPVKLWASPNSKSRLEREFFDTKF 402

  Fly    77 KVNY---------------THRFNVGRITRPGRFGRVI---VITKDGDENMIRREVFQELRQLDN 123
            ...|               .|..:.|    |..||.|.   .:||..|.....:|:.....||.:
  Fly   403 SPFYRLEQIIIKAVNLPQIVHNTSNG----PYTFGPVFDREFLTKVLDLQEGIKEINANGTQLKD 463

  Fly   124 IIQNATTTYDGDTYT------------YKDNCARWENECFEN--DILNLDALMDDIEAGQLNLTF 174
            |.. |..:.||....            :.|:..|.::...:|  ::..||||.|.|....|.|.
  Fly   464 ICY-APLSDDGSEIDVSQCVVQSIWGYFGDDRERLDDHDEDNGFNVTYLDALYDCISNPYLCLA- 526

  Fly   175 PFMFNPVTWDAHLFPVFFGGTKLTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTKRQDAKGA-EWEETFLRVVG 238
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  Fly   527 PY-GGPVDPAIALGGFLPPGDQLTGSTKFELANAIILTFLVKNHHNKTDLENALTWEKKFVEFMT 590

  Fly   239 NAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGDA-------VR 296
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  Fly   591 NYTKNNMSQYMDIAFTSERSIEDELNRESQSDVLTILVSYLIM--FMYIAISLGHVKEFKRVFID 653

  Fly   297 SKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCG-------IEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWR 354
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  Fly   654 SKITLGIGGVIIVLASVVSSVGVFGYIGLPATLIIVEVI------PFLVLAVGVDNIFILVQTHQ 712

  Fly   355 RTKAK--MPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWH 417
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  Fly   713 RDQRKPNETLEQQVGRILGKVGPSMLLTSLSESFCFFLGGLSDMPAVRAFALYAGVALIIDFLLQ 777

  Fly   418 ITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHM 482
            ||.|.:...:...|..:|...|  |      ..||.|:                ||: |.:.:.:
  Fly   778 ITCFVSLFTLDTKRREENRMDI--C------CFIKGKK----------------PDS-ITSNEGL 817

  Fly   483 LMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYGIT---QIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDR 544
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  Fly   818 LYKFFSSVYVPFLMKKIVRASVMVIFFAWL---CFSIAIAPRIDIGLDQELAMPQDSFVLHYFQS 879

  Fly   545 EDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQE-----QVENLTSTLEHTSYVTSR--------RYTES 596
            .::.....| .:..::.|.|.|::...|.     |..|..|.|... |:.||        |...|
  Fly   880 LNENLNIGP-PVYFVLKGDLAYTNSSDQNLVCAGQYCNDDSVLTQI-YLASRHSNQTYIARPASS 942

  Fly   597 WLRSFL-------------------------SFLERN---NELLNVTVDDEQTFIDAVKEHWLFP 633
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  Fly   943 WIDDYFDWAAAASSCCKYRKDSGDFCPHQDTSCLRCNITKNSLLR---PEEKEFVKYL------- 997

  Fly   634 GNPFSLDVRFNEDET----------------------QIIASRFLIQ------------------ 658
              ||.|  :.|.|:|                      .|.||.|:..
  Fly   998 --PFFL--KDNPDDTCAKAGHAAYGGAVRYSNSHERLNIEASYFMAYHTILKSSADYFLALESAR 1058

  Fly   659 --AVNITDTNHEKEMVRDLRQICKDSPLNASIFHPY---FVFFDQFELVRPVSLQAMVIGAIIMM 718
              :.|||.....:.|...:...   |.|...:| ||   :||::|:..:...:||:|.|..:.:.
  Fly  1059 KISANITQMLQGRLMSNGVPMA---SALTVEVF-PYSVFYVFYEQYLTMWSDTLQSMGISVLSIF 1119

  Fly   719 IISFVFIP-NILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTY 782
            :::||.:. ::..:|.|..::..|.:.:.|.|..|:::|:::|::||:|.:|.||:|.:|:.:::
  Fly  1120 VVTFVLMGFDVHSALVVVITITMIVVNLGGLMYYWNISLNAVSLVNLVMAVGISVEFCSHLVHSF 1184

  Fly   783 MSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSST-ILGIVALLLAQSYIFLVF-FKMVFLVIFFGAMHG 845
            .:||..|...|..::|..:|..|..|.:.| ..||:.|..|:|.||.|| |:|...::..||.||
  Fly  1185 ATSKSVSQIDRAADSLSKMGSSIFSGITLTKFAGILVLAFAKSQIFQVFYFRMYLGIVVIGAAHG 1249

  Fly   846 LFLLPVLLSLFG 857
            |..||||||..|
  Fly  1250 LIFLPVLLSYIG 1261

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	209/932 (22%)
Npc1a	NP_609357.2	2A060601	33..1261	CDD:273337	227/985 (23%)