Protein Alignment Ptr and Ptchd4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017452249.2
• Gene: Ptchd4 / 301271
• RGDID: 1563020
• Length: 904
• Species: Rattus norvegicus
• Alignment Length: 887
• Identity: 231/887 - (26%)
• Similarity: 419/887 - (47%)
• Gaps: 86/887 - (9%)

  Fly    14 KSFYH-LGICIAKHPGYFIIIPVLLTL-LCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYF 76
            :||.| ||:|:::||.:|:.:|.:||: ..::...:.:.:.|.|.|.:|.....|.||::....|
  Rat    28 QSFCHRLGLCVSRHPVFFLTVPAVLTITFGLSALNRFQTESDLERLVAPSHSLAKIERSLASSLF 92

  Fly    77 KVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDGDTYTYKD 141
            .::.:.......:..|||:||||:::..||..:::.|   .:.|....:......:.|..||:..
  Rat    93 PLDQSKSQLYSDLHTPGRYGRVILLSPPGDNILLQAE---GILQTHRAVMEMKVNHKGYNYTFSH 154

  Fly   142 NCA--RWENECFENDILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVTWDAHLFPVFFGGTKL------- 197
            .|.  ..:.:|..:||:   ::::|:....::       |..|....   |.:..|||
  Rat   155 LCVLRNQDKKCVLDDII---SVLEDLRQAAVS-------NKTTARVQ---VRYPNTKLKDGRNSF 206

  Fly   198 -------------TEDNYVISVPAIQLVYFV-TADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKH 248
                         ::|..|.|..|||:.|:: |..:..||..|.:||..|.:::...::..|  .
  Rat   207 IGHQLGGVVEVPNSKDQRVKSARAIQITYYLQTYGSATQDLIGEKWENEFCQLMRKLQDEHQ--D 269

  Fly   249 ISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIIT-----CMMGDAVRSKPFLGLMGNVS 308
            :.:...||.:|..:..|.:     ..:.:.:|:.|..|:|     ..|.|.:||||||||:|.::
  Rat   270 LQLYSLASFSLWRDFHKTS-----ILTRSKVLVSLVLILTTATLSSSMKDCLRSKPFLGLLGVLT 329

  Fly   309 AIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEA 373
            ..::...|.|:......::....|..||..:|.|....|.:|:||||||..:|..:|:....|:.
  Rat   330 VCISIATAAGIFFITDGKYNSTLLGIPFFAMGHGTKGVFELLSGWRRTKENLPFKDRVADAYSDV 394

  Fly   374 AVSITITSVTDFISFLIGIISPF---RSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKN 435
            .|:.|:||...||:|.:| .|||   .:|:|||.....::...:.:..:||.:|:..:|..|:..
  Rat   395 MVTYTMTSSLYFITFGMG-ASPFTNIEAVKIFCQNMCVSILLNYFYIFSFFGSCLVFAGQLEQNR 458

  Fly   436 LHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAIMAGGID--ANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNK 498
            .||||.|::.  |....:.:...::.:|:.|..  ::...||..:  |.:..|.::.....|.|.
  Rat   459 YHSIFCCKIP--SAEYLDGKPVWFQTVMSDGHQQTSHHETNPYQH--HFIQHFLREHYNEWITNI 519

  Fly   499 WCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGP 563
            :.|..:::.:..|...:..|..||.:|.....|...||.||.:...:..|:..:...:...:..|
  Rat   520 YVKPFVVILYLIYASFSFMGCLQISDGASIINLLASDSPSVSYAMVQQKYFSNYSPVIGFYVYEP 584

  Fly   564 LNYSDPLVQEQVENLTSTLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVKE 628
            |.|.:..|||.::.|.|...          ..||:..:..||:.:    |::.:::..||..::.
  Rat   585 LEYWNSSVQEDLQRLCSGFT----------AVSWVEQYYQFLKAS----NISANNKTDFISVLQS 635

  Fly   629 HWLFPGNP----FSLDVRFNE--DETQIIASRFLIQAVNITDTNHEK-EMVRDLRQICKDSPLNA 686
            .:|  ..|    |..|:.|:.  ||..|||||..:.|....|...|. |::..||.:.....:..
  Rat   636 SFL--KKPEFQHFRNDIIFSRAGDENNIIASRLYLVARTSRDKQKEVIEVLDKLRPLSLSKSIRF 698

  Fly   687 SIFHPYFVFFDQFELVRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMAL 751
            .:|:|.|||.|...|...|.:.....|.:::::::|..:.:.|.:.|:..||.||||||.|.|.|
  Rat   699 IVFNPSFVFTDHNSLSVTVPVLIAGFGVLLVLVLTFFLVIHPLGNFWLILSVTSIELGVLGLMTL 763

  Fly   752 WDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGI 816
            |:|::|.||::.||..:.|::|..|.:.||::.:.:.:....::.:|...|..|:|..:|.::|:
  Rat   764 WNVDMDCISILCLIYTLNFAIDHCAPLLYTFVLATEHTRTQCIKSSLQEHGTAILQNITSFLIGL 828

  Fly   817 VALLLAQSYIFLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP 858
            |.||...|.:....||.:.|......:|...:|||.|:.|.|
  Rat   829 VPLLFVPSNLTFTLFKCLLLTGGCTLLHCFVILPVFLTFFPP 870

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	212/831 (26%)
Ptchd4	XP_017452249.2	None