Protein Alignment Ptr and Npc1l1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_997125.2
• Gene: Npc1l1 / 237636
• MGIID: 2685089
• Length: 1333
• Species: Mus musculus
• Alignment Length: 1061
• Identity: 226/1061 - (21%)
• Similarity: 421/1061 - (39%)
• Gaps: 248/1061 - (23%)

  Fly    12 LNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYF 76
            |.:.|...|..:|..|...:.:..::.:....|...::...||..|:|....:.:.|:|..:::|
Mouse   337 LGRFFESWGTRVASWPLTVLALSFIVVIALSVGLTFIELTTDPVELWSAPKSQARKEKAFHDEHF 401

  Fly    77 KVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKD-----------GDEN---MIRREVFQELRQLDNIIQ- 126
            ...:             |..::.|..|:           |.:|   ::..::.|||.:|...::
Mouse   402 GPFF-------------RTNQIFVTAKNRSSYKYDSLLLGPKNFSGILSLDLLQELLELQERLRH 453

  Fly   127 -------------------------NATTTYDGDTYTYKDNCARWENECFENDILNLDALMDDIE 166
                                     |.:.|         |.|.....:.|:|:...|....:...
Mouse   454 LQVWSHEAQRNISLQDICYAPLKPHNTSLT---------DCCVNSLLQYFQNNHTLLLLTANQTL 509

  Fly   167 AGQLNLT-----FPFMFN-PVT--------------WDAHLFPVF----FGGTKLTEDNYVISVP 207
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Mouse   510 NGQTSLVDWKDHFLYCANAPLTYKDGTALALSCIADYGAPVFPFLAVGGYQGTDYSE------AE 568

  Fly   208 AIQLVYFVT---ADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKT 269
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Mouse   569 ALIITFSINNYPADDPRM-AHAKLWEEAFLKEMQSFQRSTADK-FQIAFSAERSLEDEINRTTIQ 631

  Fly   270 VVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGD-------AVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGI-E 326
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Mouse   632 DLPVFAISYLIVFLY--ISLALGSYSRWSRVAVDSKATLGLGGVAVVLGAVVAAMGFYSYLGVPS 694

  Fly   327 FIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAER---MGLMMSEAAVSITITSVTDFISF 388
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Mouse   695 SLVIIQVVPFLVLAVGADNIFIFVLEYQRL-PRMPGEQREAHIGRTLGSVAPSMLLCSLSEAICF 758

  Fly   389 LIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKE 453
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Mouse   759 FLGALTSMPAVRTFALTSGLAIIFDFLLQMTAFVALLSLDSKRQEAS---------RPDVVCCFS 814

  Fly   454 KRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYG 518
            .||.                .|...|:.:|:.||:......:.:::.:.:::|.|........|.
Mouse   815 SRNL----------------PPPKQKEGLLLCFFRKIYTPFLLHRFIRPVVLLLFLVLFGANLYL 863

  Fly   519 ITQIKEGLERRKLSREDSYSVE---------------FFDREDDYYREFPYRMQVII--AGPLNY 566
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Mouse   864 MCNISVGLDQDLALPKDSYLIDYFLFLNRYLEVGPPVYFDTTSGYNFSTEAGMNAICSSAGCESF 928

  Fly   567 SDPLVQEQVENLTSTLEHTSYVTSRRY----TESWLRSFLSFLERNNELLNVTV----DDE---- 619
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Mouse   929 S----------LTQKIQYASEFPNQSYVAIAASSWVDDFIDWLTPSSSCCRIYTRGPHKDEFCPS 983

  Fly   620 -QTFIDAVKE----------------H----WLFPGNP-----------FSLDVRFNEDETQIIA 652
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Mouse   984 TDTSFNCLKNCMNRTLGPVRPTTEQFHKYLPWFLNDTPNIRCPKGGLAAYRTSVNLSSD-GQIIA 1047

  Fly   653 SRFLIQAVNITDTNHEKEMVR-----------DLRQICKDSPLNASIFHPYF---VFFDQFELVR 703
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Mouse  1048 SQFMAYHKPLRNSQDFTEALRASRLLAANITAELRKVPGTDP-NFEVF-PYTISNVFYQQYLTVL 1110

  Fly   704 PVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIP-NILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMC 767
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Mouse  1111 PEGIFTLALCFVPTFVVCYLLLGLDIRSGILNLLSIIMILVDTIGLMAVWGISYNAVSLINLVTA 1175

  Fly   768 IGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSST-ILGIVALLLAQSYIF-LVF 830
            :|.||:|.:||..::..|.|.:...|.::|...:|..:..|.:.| ..||:.|..||:.:. :.|
Mouse  1176 VGMSVEFVSHITRSFAVSTKPTRLERAKDATIFMGSAVFAGVAMTNFPGILILGFAQAQLIQIFF 1240

  Fly   831 FKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGPGSCLTWTGKDDGSDAEVDDGLDDR------QLEKPFS 889
            |::..|:...|.:|||..|||:||..||          |.:.|.|   |:::      .:.:|..
Mouse  1241 FRLNLLITLLGLLHGLVFLPVVLSYLGP----------DVNQALV---LEEKLATEAAMVSEPSC 1292

  Fly   890 QSYYMQYPSIGINGPYGSKGF 910
            ..|  .:|:......|.:.||
Mouse  1293 PQY--PFPADANTSDYVNYGF 1311

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	200/947 (21%)
Npc1l1	NP_997125.2	2A060601	32..1267	CDD:273337	214/1000 (21%)