Protein Alignment Ptr and ncr-1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_508771.1
• Gene: ncr-1 / 180719
• WormBaseID: WBGene00003561
• Length: 1383
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1036
• Identity: 199/1036 - (19%)
• Similarity: 396/1036 - (38%)
• Gaps: 227/1036 - (21%)

  Fly    19 LGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQYFKVNYTHR 83
            :|:...::|.....|...:.:.|:.|....|...:...::|......:.|    |..|..|:
 Worm   345 IGMMAGRNPKSHFFIGCAVLIFCLPGMIYHKESTNVVDMWSSPRSRARQE----EMVFNANF--- 402

  Fly    84 FNVGRITRPGRFGRVIVIT-KDGDEN------MIRREVFQELRQLDNIIQN-ATTTYDGDTYTYK 140
                  .||.|:.:::::: :|...:      :..:::|:||..:.|.|:| :|...||.|.|..
 Worm   403 ------GRPQRYQQIMLLSHRDFQSSGKLYGPVFHKDIFEELFDILNAIKNISTQDSDGRTITLD 461

  Fly   141 DNCARWEN---EC--------FENDILNLD-------ALMDDIEAGQLNLTFPFMFNPVT---WD 184
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 Worm   462 DVCYRPMGPGYDCLIMSPTNYFQGNKEHLDMKSNKEETVSEDDDA------FDYFSSEATTDEWM 520

  Fly   185 AHLFPVF-----------------FGGTKLTEDNYVI--------SVPAIQLVYFVTADTKRQDA 224
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 Worm   521 NHMAACIDQPMSQKTKSGLSCMGTYGGP--SAPNMVFGKNSTNHQAANSIMMTILVTQRTEPEIQ 583

  Fly   225 KGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTK----TVVPYFSSTFLLMGLFS 285
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 Worm   584 KAELWEKEFLKFC--KEYREKSPKVIFSFMAERSITDEIENDAKDEIVTVV------IALAFLIG 640

  Fly   286 IITCMMGD-----------AVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGIEFIGINLAAPFLMI 339
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 Worm   641 YVTFSLGRYFVCENQLWSILVHSRICLGMLSVIINLLSSFCSWGIFSMFGIHPVKNALVVQFFVV 705

  Fly   340 G-IGIDDTFVMLAGWRRTKAKMP------VAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISPFR 397
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 Worm   706 TLLGVCRTFMVVKYYAQQRVSMPYMSPDQCPEIVGMVMAGTMPAMFSSSLGCAFSFFIGGFTDLP 770

  Fly   398 SVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYKAI 462
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 Worm   771 AIRTFCLYAGLAVLIDVVLHCTIFLALFVWDTQRELNGKPEFF------FPYQIKD----LLGAY 825

  Fly   463 MAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEGLE 527
            :.|...|.|.         .:..||..::|..:.::..:.|..:.|.:..:......::|..|.:
 Worm   826 LIGRQRATDT---------FMTQFFHFQVAPFLMHRMTRIITGIIFIASFITTVILSSKISVGFD 881

  Fly   528 RRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQV------------ENLTS 580
            :.....|.||....|...|.::...| .:...:.|.|::..|.||.:.            ..:..
 Worm   882 QSMAFTEKSYISTHFRYLDKFFDVGP-PVFFTVDGELDWHRPDVQNKFCTFPGCSDTSFGNIMNY 945

  Fly   581 TLEHT--SYVTSRRYTESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFI-------------------- 623
            .:.||  :|::...|  :|:.::|.::.|.:....|.|.|..||.
 Worm   946 AVGHTEQTYLSGEMY--NWIDNYLEWISRKSPCCKVYVHDPNTFCSTNRNKSALDDKACRTCMDF 1008

  Fly   624 -------------------------------DAVKEHWLFPGNPFSLDVRFNEDETQIIASRFLI 657
                                           |......:|.|.....|........:|.||:|:.
 Worm  1009 DYVANSYPKSSIMYHRPSIEVFYRHLRHFLEDTPNSECVFGGRASFKDAISFTSRGRIQASQFMT 1073

  Fly   658 --QAVNITDTNHEKEMVRDLRQICK------DSPLNASIFHPYFVFFDQFELVRPV---SLQAMV 711
              :.::|::::...:.:...|.:.:      |...:...:...|.|::|:..:.|:   .|...|
 Worm  1074 FHKKLSISNSSDFIKAMDTARMVSRRLERSIDDTAHVFAYSKIFPFYEQYSTIMPILTTQLFITV 1138

  Fly   712 IGAI-IMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSVDFT 775
            :|.. |:.:...:.:....|::   ...:|....:..:|.::::.::::|..||:|..|..::|:
 Worm  1139 VGVFGIICVTLGIDVKGAACAV---ICQVSNYFHIVAFMYIFNIPVNALSATNLVMSSGILIEFS 1200

  Fly   776 AHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIVALLLAQSYIFLV---FFKMVFLV 837
            .::...|..|.::..|.|....:.|:|..|:.|...|:.| ..:.|:.:::.::   |||:..:.
 Worm  1201 VNVLKGYACSLRQRAKDRAESTVGSIGPIILSGPVVTMAG-STMFLSGAHLQIITVYFFKLFLIT 1264

  Fly   838 IFFGAMHGLFLLPVLLSLFGP---GSCLTWTG-KDDGSDA------------EVDDGLDDR 882
            |...|:|.|.:||:||:..|.   ||..|.|. .|:..||            .|::|:.:|
 Worm  1265 IVSSAVHALIILPILLAFGGSRGHGSSETSTNDNDEQHDACVLSPTAESHISNVEEGILNR 1325

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	176/947 (19%)
ncr-1	NP_508771.1	2A060601	22..1284	CDD:273337	188/993 (19%)