Protein Alignment Ptr and ncr-2

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_498813.1
• Gene: ncr-2 / 176165
• WormBaseID: WBGene00003562
• Length: 1274
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 1026
• Identity: 197/1026 - (19%)
• Similarity: 397/1026 - (38%)
• Gaps: 255/1026 - (24%)

  Fly    20 GIC------IAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTG---YQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIVEQY 75
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 Worm   319 GLCARYANAVIKHPLIFVSLGLIVAAACCSGNFKFHSLTHSVD-----QVSAADGETRRN----- 373

  Fly    76 FKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQNATTTYDG-----D 135
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 Worm   374 -EKKFIHSFGPNH-----RIEQIFINLPPTTKSMFNMPLFEEMFQLVGNIQNLTACYGNSSVKLD 432

  Fly   136 TYTYK-----DNCA----------RWENECFEN------DILNLDALMDDIEAGQLNLTFPFMFN 179
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 Worm   433 DICYKPIGKNHGCAIMSPTNYFQNKWTN--FENAGPPTID----DEIFDDQHWEHLKYC---IRN 488

  Fly   180 PVT------------WDAHLFPVF-FGGTKLTEDNYVISVPAIQLVY-----FVTADTKRQDAKG 226
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 Worm   489 PLTVSTYSEMSCFGEFSGPIDPILVFGGSN-------ESIKGAEMYYTARTIMITVLIRGPEDQA 546

  Fly   227 AEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKT--VVPYFSSTFLLMGLFSII-- 287
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 Worm   547 IAWETAFLNMMSRYE----MKHANFTFMTETSVAEEIHTAVETDKIVSVIACAAVLIWVITMLGI 607

  Fly   288 -----TCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGI---EFIGIN------LAAPFLM 338
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 Worm   608 NHWPESSILSALVHHK----LLISISAVMISV----ISVWCSIGMFSLFGVHATDNAIVVLFFVI 664

  Fly   339 IGIGIDDTFVML--------------AGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFISFL 389
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 Worm   665 TCLGINRIFVIIRTFQANGHCYGLPNISYREMNHRI-----SNVMRRSIPIVLTNSLICSTCLFL 724

  Fly   390 IGIISPFRS-----VRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACM-AISGYRERKNLHSIFGCRVQP-M 447
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 Worm   725 AGGVLPYVSVSMPAVEVFARHAGLAI----LMDTAFYLLVMLPLFQYDARREMSG--KCEIWPWY 783

  Fly   448 SVAIKEKRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYL 512
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 Worm   784 ELSNESKINLCMEA-----VDGN-LRSPVD--------WFKLAIAPLLLKKICRIWIATFFFVSL 834

  Fly   513 VGACYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQVEN 577
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 Worm   835 IIACYCTLCLEFGFNQVMAFSETSYLTKHFQNMNENLNIGP-PLWFVVEGDVKWHDPKMQNKFCT 898

  Fly   578 LTSTLEHT--SYVTSRRYTES------------WLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVK- 627
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 Worm   899 LAGCDDNSMGNKIRSLAYAENYKGNYLHGDVNIWLDSYLQFMHPRGSCCKM---DGKQFCDPSNA 960

  Fly   628 -------------------------EHWLFPGNPFSLDV----------RFNEDETQIIASRF-- 655
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 Worm   961 THCSSCSSSSVASLTTTEYEFYRNLHHFL--ETPPSIQCAHGGMALAKPAINLTRNGKIQSAYFS 1023

  Fly   656 -LIQAVNITDT-------NHEKEMVRDLRQICKDSPLNASIFHPYFVFFDQFELVRPVSLQAMVI 712
             ..:.:|::|:       ...|.:..|:.:..:...:...::..:|.:::|: |....::..:|
 Worm  1024 TFFKKLNLSDSIQLYDAWRFAKYLADDIERELEIPGVKVYVYSTFFPYYEQY-LTLSTTVYTLV- 1086

  Fly   713 GAIIMMIISFVFIP-----NILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIMCIGFSV 772
              ::::.::||.|.     |:..||...|.::|..|.:..:|.|..:.::.:|:||:.|.:|.:|
 Worm  1087 --VLVLFVAFVTISLFLRVNLAGSLVTVFVLLSSYLHLMEWMYLLGITVNVVSVINMAMSLGIAV 1149

  Fly   773 DFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIV--------ALLLAQSYIFLV 829
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 Worm  1150 EFFGQMLHGFYNSKKPKREERAFAALVSNG-------STTLSGIFPAIMITAGCLSFADSRVLIT 1207

  Fly   830 FF--KMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLSLFGPGSCLTWTGKDDGSD-AEVDD 877
            :|  ::|.:.:.. |:||:..:|.||::||.......:.:::.:| ||:.|
 Worm  1208 YFCNQLVGIGLVC-AVHGVVYMPTLLAIFGSDFYQNVSSEEESTDEAELQD 1257

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	177/949 (19%)
ncr-2	NP_498813.1	2A060601	85..1236	CDD:273337	191/1003 (19%)