Protein Alignment Ptr and ptr-18

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_496761.3
• Gene: ptr-18 / 174940
• WormBaseID: WBGene00004232
• Length: 895
• Species: Caenorhabditis elegans
• Alignment Length: 873
• Identity: 223/873 - (25%)
• Similarity: 402/873 - (46%)
• Gaps: 82/873 - (9%)

  Fly     8 VDKTLNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCMTGYQQLKYQIDPEYLFSPIAGEGKTERAIV 72
            :::..:..||.:|:.||.:|.:.:.|..:..||...|..:.|...:....||......:.|..:.
 Worm    15 IEQQTHDMFYWVGLKIADYPKWTLFITTIWALLMAGGVVRFKEVNNVRDHFSATNSPSRYEYRVA 79

  Fly    73 EQYFKVNYTHRFNVGRITRPGRFGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLDNIIQ-NATTTYDGDT 136
            .::|:          .:..|  |..|:.:......:::|.:...:..::::.:| ....::...:
 Worm    80 REFFQ----------ELGSP--FHVVVAMQAADGGSLLRPKYIDKALEIEDFLQYKLKGSFGNQS 132

  Fly   137 YTYKDNCARWENECFENDILN--LDALMDD--IEAGQLNLTFPFM--FNPVTWDA-HLFPVFFGG 194
            |:|.|.|.   .:|..:|.::  |....|.  .:...:.||:|.|  |....:.| ::|.|....
 Worm   133 YSYSDFCG---TQCETSDAVSIFLSMFRDQQIKKTAHVKLTYPSMDVFGHRVYLANNIFQVKINN 194

  Fly   195 -TKLTEDNYVISVPAIQLVYFVTADTKRQDAKGAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRT 258
             :.:.|::.::   ||........:|..:..|  |||:.......:.||....:    .|..|..
 Worm   195 RSSIIEESKLV---AINFHAIYNNETMYEIMK--EWEQKLFAYTLSTENDPLIR----VYVTSEG 250

  Fly   259 L-DHELEKNTKTVVPYFSSTFLLMGLFSIITCMMGDAVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMY 322
            | ..|:.:.....:|....|||::..|:|:|.:..|.|:||||...:|.:..|::..|:||...:
 Worm   251 LVSEEVRRTGILAMPLMGVTFLIILAFTILTTLKRDPVKSKPFEAFLGVICPILSLCASFGHLFW 315

  Fly   323 CGIEFIGINLAAPFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAERMGLMMSEAAVSITITSVTDFIS 387
            .|.|::.|....|||::.||:||.|:.:..|.||..|..|.:||...:::|..||:|||:|:.:|
 Worm   316 MGFEYLPIVTVVPFLILSIGVDDVFIFIHAWHRTPYKHSVRDRMAETLADAGPSISITSLTNLLS 380

  Fly   388 FLIGIISPFRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRE--RKNLHSIFGCRVQPMSVA 450
            |.|||.:|..::..||.:...||.:.:::.|.||:|.:.:||.||  |||.:..:.....|....
 Worm   381 FAIGIFTPTPAIYTFCVFISTAVIYDYIYQIFFFSAVLVLSGEREEQRKNAYLWWKDVPLPEEPT 445

  Fly   451 IKEKRNFLYKAIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGA 515
            .|:|:..:...::...:|                 |:.|.:.|    ||.|.:|.....:|.:..
 Worm   446 GKQKKETIVSRVLGKVLD-----------------FWVDFIMA----KWSKFLIGAIMITYWIFM 489

  Fly   516 CYGITQIKEGLERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQVENLTS 580
            ..|:.:|..||...||..:||..:.....:.:...:...::.|.:..|.|.|:|....::..:..
 Worm   490 ARGVMEIAVGLSSEKLFLDDSPLLPLVRLQTNVIFKEGGQVAVFVNNPGNMSEPDAVPEIMRILR 554

  Fly   581 TLEHTSYVTSRRYTESWLRSFLSFL-ERNNELLNVTVDDEQTFIDAVK----EHWLFPGNPFSLD 640
            ..|..:.......|..||..:|.:: |:.:..:.........|....:    .|::..||
 Worm   555 RFEVANNSVGAASTHMWLLPYLPYVGEQEHGSIEFKYRYLPEFFKLTEFRRWSHFVNLGN----- 614

  Fly   641 VRFNED---ETQIIASRFLI-----QAVNITDTNHEKEMVRDLRQICKD-SPLNASIFHPYFVFF 696
               ::|   |......:|:.     .||:.:|   ...::.:.|::..: ..||.:|:..:.::.
 Worm   615 ---HQDCLSEKPSCLQKFVFSTGFHDAVSWSD---RLALLENWREMASEYQHLNLTIYEDFSMYS 673

  Fly   697 DQFELVRPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWVAFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISM 761
            ||...:.||:...:....|.|::|..:|.|:.:..:....:|:||.|||.|.:...:::||.|||
 Worm   674 DQLLTIVPVTQSTVFCALICMIMILTLFTPSPVTIVTSTAAVLSINLGVFGCLVYMNIDLDPISM 738

  Fly   762 INLIMCIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTILGIVALLLAQSYI 826
            ..|:|.|||||||.|||.:.|......|.:||:|.||..:..|:.|..:||:|.|..|.|..:|:
 Worm   739 TTLLMAIGFSVDFVAHITWHYYKGDFHSKRARIRHALAGIAWPMFQAGTSTMLAITVLALVHAYM 803

  Fly   827 FLVFFKMVFLVIFFGAMHGLFLLPVLLS 854
            ..||.|:|.||||.|..|||.:||::.|
 Worm   804 VQVFVKVVVLVIFLGMFHGLVVLPIVFS 831

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	206/817 (25%)
ptr-18	NP_496761.3	Patched	72..834	CDD:308203	210/816 (26%)