Protein Alignment Ptr and npc1l1

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610209.2
• Gene: Ptr / 35546
• FlyBaseID: FBgn0262867
• Length: 1169
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073767089.1
• Gene: npc1l1 / 100616532
• ZFINID: ZDB-GENE-110510-5
• Length: 1392
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 1005
• Identity: 229/1005 - (22%)
• Similarity: 413/1005 - (41%)
• Gaps: 207/1005 - (20%)

  Fly     5 ISCVDKT-------LNKSFYHLGICIAKHPGYFIIIPVLLTLLCM--TGYQQLKYQIDPEYLFSP 60
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Zfish   345 VSCSDKASLATQEFLGSLFQSWGTLMARYP--YIVLPVCLVIVLVFAVGIKDIELTTDPVQLWSA 407

  Fly    61 IAGEGKTERAIVEQYFKVNYTHRFNVGRITRPGR---FGRVIVITKDGDENMIRREVFQELRQLD 122
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Zfish   408 PESRAMREKAFHDAHFDPFY--RTNQLILTAPGRPSHFYDSLLFGKQNFSGIISKDLIIELLKLQ 470

  Fly   123 NIIQNATTTYD--GDTYTYKDNCARWEN-------EC--------FENDILNLDALMDDIEAGQL 170
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Zfish   471 QSIQAIEFWSDELNSTASLKDVCYAPLNPGNPSLTDCAVNSLPQYFQNSIDNLNAKVNMTELGVT 535

  Fly   171 N-----------LTFPFMFNPVT---------WDAHLFP-VFFGGTKLTEDNYVISVPAIQLVYF 214
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Zfish   536 KEVDWRDHFIYCVNSPLSFKDITALGMSCMSDYGGPVFPFLAVGG----YDNEQYTTAEALILTF 596

  Fly   215 VTADTKRQDAK---GAEWEETFLRVVGNAENSGQFKHISVSYFASRTLDHELEKNTKTVVPYFSS 276
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Zfish   597 SLNNYARTDVKFKVVEEWENRFLKIVQEYQKNST-TNFTFAYMAERSLEDEINRTTAEDIPIFMI 660

  Fly   277 TFLLMGLFSIITCMMGD-------AVRSKPFLGLMGNVSAIMATLAAFGLAMYCGI-EFIGINLA 333
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Zfish   661 SYAV--IFLYIAVALGEYSSCKRILVDSKFLVGLGGILVVGCSVIASMGFYAWIGVASSLVILQV 723

  Fly   334 APFLMIGIGIDDTFVMLAGWRRTKAKMPVAER---MGLMMSEAAVSITITSVTDFISFLIGIISP 395
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Zfish   724 VPFLVLAVGADNIFIFVLEYQR-DLRRPGEQREEQIGRVLGNVAPSMLLCSLSESVCFFLGALST 787

  Fly   396 FRSVRIFCTYSVFAVCFTFLWHITFFAACMAISGYRERKNLHSIFGCRVQPMSVAIKEKRNFLYK 460
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Zfish   788 MPAVKSFALYAALAVLMDFVLQMTAFVALLSLDARRQDSNRCEIACCVT---------------- 836

  Fly   461 AIMAGGIDANDPDNPIDNKDHMLMAFFKDKMAAVINNKWCKAIIILAFASYLVGACYGITQIKEG 525
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Zfish   837 ------VDTPRPQKP---NEGILLPLMRKYYAPFLLNSFSRVVVMVLFLVMFFSSVFLMFHVKVG 892

  Fly   526 LERRKLSREDSYSVEFFDREDDYYREFPYRMQVIIAGPLNYSDPLVQEQVENLTSTL--EHTSYV 588
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Zfish   893 LNQELAMPTDSYMLDYFAYLFKYF-EVGVPTYFITTKGFNFNS---EEGINAVCSSVGCDQFSMT 953

  Fly   589 TSRRY-TESWLRSFLSFLERNNELLNVTVDDEQTFIDAVKEHWLFPG------------------ 634
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Zfish   954 QKIRYATEYPERSYLAIPASS------WVDD---YID-----WLNPGSRCCRLYTFGPNKDEFCP 1004

  Fly   635 ---------------------------NPFSLDVRFN--------------------EDET-QII 651
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Zfish  1005 ANETGVCLKKCMGKPENGVLRPDVSEFNRFLPDFLSNRPDLQCPKGGLGAYDKAVIRDNETGEII 1069

  Fly   652 ASRFL---IQAVNITDTNHEKEMVRDL--------RQICKDSPLNASIFHPY---FVFFDQFELV 702
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Zfish  1070 ATRFMAYHTPLVNSQEYTGALQKARELAHNITMAMRKLNDTSP-DFEVF-PYTVTYVYYEQYLNI 1132

  Fly   703 RPVSLQAMVIGAIIMMIISFVFIPNILCSLWV-AFSVISIELGVAGYMALWDVNLDSISMINLIM 766
            ....|..:.:..:...::..:.:...|.|.:: ..:::.|.:...|.|.||.::.:::|:|||:.
Zfish  1133 VNEGLFNIAVCLLPTFVVCCILLGMDLRSGFLNLLTIVMITVDTVGVMTLWGIDFNAVSLINLVT 1197

  Fly   767 CIGFSVDFTAHICYTYMSSKKRSPKARVREALHSLGLPIIQGSSSTIL-GIVALLLAQSYIFLVF 830
            .:|.||:|.:|...::..|.:.:...|.:||..::|..:..|.:.|.| |||.|..|::.:..:|
Zfish  1198 AVGISVEFVSHTTRSFALSVRPTKVERAKEATANMGSAVFAGVAMTNLPGIVVLAFAKAQLIQIF 1262

  Fly   831 FKMVFLVI-FFGAMHGLFLLPVLLSLFGPG 859
            |..:.||| ..|..|||..||||||.||||
Zfish  1263 FFRLNLVITLLGMAHGLIFLPVLLSYFGPG 1292

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Ptr	NP_610209.2	Patched	53..845	CDD:308203	202/932 (22%)
npc1l1	XP_073767089.1	None