DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment Gp210 and npp-12

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_610184.2 Gene:Gp210 / 35512 FlyBaseID:FBgn0266580 Length:1876 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_491855.1 Gene:npp-12 / 172348 WormBaseID:WBGene00003798 Length:1847 Species:Caenorhabditis elegans


Alignment Length:2064 Identity:459/2064 - (22%)
Similarity:822/2064 - (39%) Gaps:444/2064 - (21%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     4 ILCMILLILVRNHASEAARLNHPRVLLPIFEDKAINFTLEVDEP--NCYKWSSSRQDLISVMPIY 66
            |:...||:|.....:.:.|||.||||||......::|.|||..|  .|:.|.|:|.|::||..|.
 Worm     2 IILRSLLVLALVQITISYRLNVPRVLLPYHPTVPVSFVLEVTHPTGGCFTWRSTRPDIVSVKRIE 66

  Fly    67 KGFSECAYQAVV-------TVRTHDRRRNTAIVFAEEVQTGETLRSDVIVDVIASLNVRTATRQL 124
            ...:.|:.:|.:       ||.:.:.   :|::|||:..:|.||...|.||.||::::.|.|:.|
 Worm    67 TNEAGCSDKAEIRSVAKPGTVGSSEL---SAVIFAEDKGSGTTLSCGVTVDEIATISIETTTKVL 128

  Fly   125 YLEEAPAMFELHAFDEQGNEFFTLEGIEFDWEILEPGSKRPTAMRYLTFTDSPYHTVPPTIEKFE 189
            :::.|||...:.||:..|:.|.||..|..:||:....|.:...:|.:.|..|.|. .|..|.|.|
 Worm   129 FVDAAPARMTVDAFNADGDRFSTLSEIALEWELASTSSNKAKPLRIVPFEQSTYE-APSEIVKLE 192

  Fly   190 ADGKKGHMILLEGINTGTAKVTIAMPQAEYKHVRPVEVYISVLANIIIEPSEVTIMAGDSV-SFR 253
            .:.|||::||:||:.||||.:|.....|..:.|....|.::|:||:::.||:...:...|| .|:
 Worm   193 KNRKKGYLILIEGVGTGTATLTTKFSDAYLQKVAAHNVELAVVANLLLVPSQDVYLPVHSVLPFQ 257

  Fly   254 ILQLKMDRLHVID--NNQYYLEVEDSSIAYL--RGNSATGAALGRTQVFLRDRNMADSDEVQ--- 311
            :|.:|.....:::  |..|.|:::...:|.|  :.:|.....:|.|.|.|    ::...:|:   
 Worm   258 VLIVKQRGTEIVNMPNPSYELQIDGGDVASLDKKSSSVRALTIGNTAVHL----LSSHVDVRAKA 318

  Fly   312 --KGPSALLTVAYPNRLSISLLPHL---NWVTVQGEHHAIALDLFAADGQKITMGTKYSINSEVD 371
              :.||.::.|....    |:..|:   ||:...|:.:.|.::|....|..:.:......::.:|
 Worm   319 GLRPPSTVIHVVDAE----SVQWHVSGDNWMLETGKQYTINVELLDEHGNVMFVADNSRFDTHID 379

  Fly   372 ESFFAIVDRTRNG----------SRLFGQAKKEGITQVYGS----YKDLSVQAELQIFEELQLAP 422
            |.|..:..::.||          |:...:.|...|....|:    ...:..:..:.|.:.:::.|
 Worm   380 EQFLHVDFKSENGTWFLVTPLKPSKTTLRTKFVAIIDAKGNRIAQSGKIGGEQRVTIVDPVRIVP 444

  Fly   423 TKVVLPYDPNSLKPLKLQFHASGGDNNYAWFSGNPQVIQIDTQGQATTEIRDVKSAYVNQEVLKD 487
            ..:.||:  .|.|..::...|:||...:.|.|.:..|..:|..                      
 Worm   445 PVIYLPF--VSEKRSQIDLTATGGSGLFEWTSEDGHVATVDLL---------------------- 485

  Fly   488 GGKLTAH----TTVKVALSKNQKISRVAHIYFLPPERLQITRSNFETALKDFVHVHVGVYARINN 548
            .|::||:    |.||....:|.::..:|.::.|....:....:..||.:.|.:.:::......::
 Worm   486 TGRMTANSLGSTKVKATDKRNDQLRDIASVHILEVSGIGFGETVRETFVGDTLTLNIKATGLTSD 550

  Fly   549 S-EVPYTSCDNL--HFQLDFSQPILQLEGNEGAEAAHE--ACHVLRLRATAVGTTSL-------- 600
            . .|..:.|.|:  |.|:           .:.|...||  |...|.:..|..||.:.        
 Worm   551 GLLVEMSDCRNIRAHVQI-----------TDNALLRHESSADSSLPMMGTGCGTITFKGLSSGDA 604

  Fly   601 RVSYMYMDKVLYDIIDLYVFEPLVVLNPIENEVVLPVGSSRNIIYANGPQRSFTVAAEIIQSTAF 665
            |||..|:....  .||:.|:|.|.:   .|....:.:||:..:..:.||:......|...::...
 Worm   605 RVSISYLGHKA--SIDVAVYEKLSI---SEESSSIALGSTHPLTVSGGPRPWILDPANFYKTQET 664

  Fly   666 DEKILKVSKLEFDTQNLITAFTVLCRELGETQFTYRVH---NSLPTSSFAL-YQSEVTTKVHCVR 726
            .:..|:|:   |:.:.::.       :.|.::.|..|.   .:|.:|:..| ..||:|..:.|.:
 Worm   665 KQSQLQVT---FENEKVLF-------KCGSSEVTEAVRLRIGNLKSSTLPLPIHSEITVSICCAK 719

  Fly   727 PRFLKLYARHNLRDSCPLEKRTSLLFLKDPENKIEIEIE---VHDSNNRRLMNISSLGLDWEFSA 788
            |..|:::.:......|||...:.|:     ...:|:.:.   |.:.....|.:|:.|...|..| 
 Worm   720 PTRLEIFDKKQRPSKCPLNVHSMLI-----NTNVELVLRGSGVCNGAATPLASINGLSPKWTTS- 778

  Fly   789 GEERYQKNIIPHRQISELEFN-HGVTLPSRDLLVLTLSEVATNFRIKGTVSQYNDKLLAQHGIHA 852
                         ....|..| ||:...            ||:.:.:|.|:     :.||.|..:
 Worm   779 -------------DSGLLTVNRHGIEAD------------ATSGKKEGQVT-----IQAQAGSLS 813

  Fly   853 ERPPFGIKNPQTGLIYTP---LIENEIRLHAVNSTLLPKDYMSIFLASGYSERIPIAQGSGYLQL 914
            .:....:|.   ||...|   ::.||    ||:.        ..|..:|         |||:..:
 Worm   814 TKYEITVKK---GLNVEPARLVLWNE----AVSK--------GTFTITG---------GSGHFHV 854

  Fly   915 ELSEAGIVQVEYNENTRILVLTPLRLGHVRLELTDRCLMNEPSHLSISVVGIGAIEVVSMDRLER 979
            :........|......|.|.:||...|.|.|.::|.||:.:.:..|:.:..|.::.:.:...:|.
 Worm   855 DNLPTSDSPVAIALRARSLTVTPKNNGQVNLRISDACLVGQHADASVRIADIHSLAIDAPQFVEI 919

  Fly   980 TTRIEAIVRLFDTNDNLLLVDQSKLS----AYDLSEVVADQSILSVRLGEQENVGPGEIRYTITG 1040
            ...:|.         .:|..|::..|    ...|::...|.|...|.|.:.:.     :|||:..
 Worm   920 GQEVEV---------EILAQDETGASFEKEHRPLADAQLDASNNHVILTKVDG-----LRYTLRA 970

  Fly  1041 NQVGETKILFQSGKGIYKV-ASDPLNIQVFAPIRLFPRDSTLVVGSSIQVYFHGGPHPNTNMIIS 1104
            |.:|...:...|.....:| :|.|..:|:|:||.|.|:..||:..|..|:...|||.|...:..|
 Worm   971 NSIGTVSLSASSKSSSGRVLSSRPHTVQIFSPIFLQPKRLTLIPDSKFQLEVVGGPQPTPPLDFS 1035

  Fly  1105 VEKEQVATIS-STVVTAHKLGTTKIVGKCLLKNPVTGKDEVVSQDSVEVHVVALKGVQIRTPLVR 1168
            :....:|:|. :.::|:.:||.|.|.|      .|...|..|:.|:|.:.|.:|.|:.:.....:
 Worm  1036 LNNSMIASIEPNALITSSELGYTAITG------TVRVGDGHVTLDTVVLRVASLGGIILSASSRK 1094

  Fly  1169 IHSGAVMPATLWGL----SDLSPMIL-GTLQNTKISWKVSQPQVVEIFNVFTTAGIEYQSGDLI- 1227
            :.:|..:...|.|:    .|..|... |.:...|::|.||.|.|     :|||..:   .||:: 
 Worm  1095 VETGGRVNLRLRGVIAGAEDEEPFAFGGAIYPFKVTWSVSDPSV-----LFTTHPL---GGDVVE 1151

  Fly  1228 ------SVRVRALNPGKATITASVTLAD----------GTILPPATVDLQVFKTLELVTPNAIKM 1276
                  ::...|:..|..|:.|.|.|.:          .|.....|:.::  ..|.||.|. :.:
 Worm  1152 PTDNQFAIWFNAIRGGSVTVKAVVELNEKARKHFTGRTSTFTAETTITVE--DGLSLVQPE-MDI 1213

  Fly  1277 DSILAAPRSILQLKSNMDNVVYKLDDRSNGIVSVTPDGLVHTKDSLGRDLI----IATTADQSLP 1337
            :::..||.|.|::.:......:.:....:..:.::.||.:.|....|...|    :.:..::::.
 Worm  1214 NTVRVAPNSQLKMVTAWSQASFSVPSDFSSRIVISADGHLITNGKEGSAAITVRNVNSPDNETVL 1278

  Fly  1338 IGIEVKNVQYILVTLMPILKLRE------LEHKIPRGMNFVFKVSLHDNLGNEL--SHNIEDFNG 1394
            |.:.|..|..:  .:.|.::|:.      |.| :|.|......|...|..|..|  :.|..:|..
 Worm  1279 IPVTVSRVASL--DVHPTIELKSAFENSPLIH-LPVGAQIQLNVVPRDARGRRLAAASNSINFRP 1340

  Fly  1395 LRYELGNKDDVDVQIDNNLTFALNLMRETNNVIGISLKDSTGVKHSMDFIKLSVVESDNLFPT-- 1457
            .|::|   .|: |..::|.|..:.|....:.|:.|....:|   |...||:||.  |:::.|.  
 Worm  1341 HRFDL---TDI-VATNSNQTLTITLKTAGDTVLRIGDASNT---HIATFIRLSA--SESILPRAA 1396

  Fly  1458 ---KTIFSVGDIICFDSPLTL--SSTW--RSSNE-QIVYINKHTGIAQVL--------------- 1499
               .....|.|:||..|.:..  .|.|  :||:| :|.:::::.|:||:.               
 Worm  1397 HKYANDLVVSDVICLQSNIFTVDGSRWSSQSSSEGRISWLDENLGVAQLTKAGNTFIRLHADKQT 1461

  Fly  1500 -----------SHRLKPGEKIEITNGDETKRGGFLKYDLEVRESDTILFVKSVDTFSGPEYRGQL 1553
                       |.|...|:|.|..:.||..                 :||..|           :
 Worm  1462 IHSKISVVLPSSLRFPDGQKPEFVSNDEHS-----------------VFVIPV-----------I 1498

  Fly  1554 VIRNHLQSEKYSNLIAQNVSKCARELGSVPVNFFTCRLA----AKDALGRNLLKMYKVDALFEPS 1614
            ...|:....|.|::..:..:...|...::... |.|::|    :|.....|.|   .|.|:|.|.
 Worm  1499 AATNNTSGSKVSSIYGECTADQIRSFDAIGAP-FECQVAFTRRSKIISAVNWL---TVSAVFSPV 1559

  Fly  1615 IGQYSCRLQLLTGFIELLSIVKTHDVYL-ELEA-VVAKGVSDKMSLKLVPGIKVFPESVRVTD-- 1675
            .| |.|.::.....:...|||...::.. :.:| :.||.:||              .:|:|.|  
 Worm  1560 FG-YGCEIRRFDSSVSTSSIVVPEELLKDQFDARITAKWISD--------------GTVQVNDAT 1609

  Fly  1676 ----------LKPHEIHISGLD--KALLKVQVKPSDSKYFAVDFIEHGHGLS-----------KY 1717
                      ::..|:..|.::  :|.|.:.....|||:..|...| |..:|           ..
 Worm  1610 IDVPFHFAFIVEEKELVFSNMNQIEAALSIWAPTYDSKHIVVSGCE-GDIVSVEKTSRSSDKHSA 1673

  Fly  1718 RLELFDDLPLD-----------ENFYILVVSPDTKQSIEVPIIGNTMLAPKCTDRRYGGPLVYRI 1771
            :..:|.::.|:           :...|.|.:..|.|.|.||:  ...|..:...:      ||..
 Worm  1674 KANVFYNIRLNIKSAALFTEHAKKCQISVENTLTGQVIRVPV--TVQLLDETAKQ------VYNA 1730

  Fly  1772 LENLGFV---------------------LTTTVIVIISIWVYMSCFQTQGVTQVNFEAFKKGKSR 1815
            ||:.|.|                     |...:|::|.|:|.|:.|...|       :|......
 Worm  1731 LESRGVVDVLLILAHKYSHAIPTLLWTCLVGIIILVIGIYVKMNVFDKTG-------SFGDNTLN 1788

  Fly  1816 TELMQQSGRSSQDDTFGDSFNVRNFSPDRRRPPSNALSESYIYGHPRLN 1864
            ....|.|..||...|     ||....|..|..|        |.|.|:::
 Worm  1789 NTTHQTSMASSLSST-----NVSLREPVFRSTP--------IAGSPQVS 1824

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
Gp210NP_610184.2 None
npp-12NP_491855.1 Big_2 438..513 CDD:396788 19/98 (19%)

Return to query results.
Submit another query.