DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment eEF2 and eef2.2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_525105.2 Gene:eEF2 / 35422 FlyBaseID:FBgn0000559 Length:844 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_001015785.1 Gene:eef2.2 / 548502 XenbaseID:XB-GENE-5771153 Length:859 Species:Xenopus tropicalis


Alignment Length:866 Identity:681/866 - (78%)
Similarity:750/866 - (86%) Gaps:29/866 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVNFTVDEIRGLMDKKRNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVSKAGIIAGAKAGETRFTDTRKDEQE 65
            |||||||:||.:||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|:|||||||||||||||
 Frog     1 MVNFTVDQIRAIMDKKSNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQE 65

  Fly    66 RCITIKSTAISMYFEVEEKDLVFITHPDQREKECK---GFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTD 127
            |||||||||||:|:|:.|.||.||       |:||   |||||||||||||||||||||||||||
 Frog    66 RCITIKSTAISLYYELSENDLAFI-------KQCKEGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTD 123

  Fly   128 GALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPILFMNKMDRALLELQLDAEELYQTFQRIVENVNVI 192
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:.||||.||||||||||||
 Frog   124 GALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYLTFQRIVENVNVI 188

  Fly   193 IATYND-DGGPMGEVRVDPSKGSVGFGSGLHGWAFTLKQFSEMY-------SEKFKID------- 242
            |:||.: :.||||.:.:||..|:|||||||||||||||||:|||       .||.|::       
 Frog   189 ISTYGEGESGPMGNIMIDPVIGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFASKGEKTKLNPADRAKK 253

  Fly   243 VVKLMNRLWGENFFNAKTKKWQK-QKEADNK---RSFCMYILDPIYKVFDAIMNYKKEEIGTLLE 303
            |..:|.:|||:.:|:..|.|:.| ...|:.|   |:|...|||||:|:||||||:||||...|:|
 Frog   254 VEDMMKKLWGDKYFDPSTGKFSKTATNAEGKKLPRTFSQLILDPIFKIFDAIMNFKKEETAKLIE 318

  Fly   304 KIGVTLKHEDKDKDGKALLKTVMRTWLPAGEALLQMIAIHLPSPVVAQKYRMEMLYEGPHDDEAA 368
            |:.:.|..|||:|:||.|||.|||.|||||:||||||.|||||||.|||||.|:|||||.|||||
 Frog   319 KLDIKLDTEDKEKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAA 383

  Fly   369 IAVKSCDPDGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFAGKVATGQKCRIMGPNYTPGKKEDLYEKAI 433
            :.||||||.|||:||||||||||||||||||||||:|.|:||||.||||||||||||||||.|.|
 Frog   384 LGVKSCDPKGPLVMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGIVSTGQKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPI 448

  Fly   434 QRTILMMGRYVEAIEDVPSGNICGLVGVDQFLVKTGTITTFKDAHNMKVMKFSVSPVVRVAVEPK 498
            ||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||:.||||:|||||||||||||||.|
 Frog   449 QRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAK 513

  Fly   499 NPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLKKSDPVV 563
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
 Frog   514 NPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLKKSDPVV 578

  Fly   564 SYRETVSEESDQMCLSKSPNKHNRLLMKALPMPDGLPEDIDNGDVSAKDEFKARARYLSEKYDYD 628
            ||||||||||.|:||||||||||||.|||.|.||||.||||.||||::.|.|.|||||:|||::|
 Frog   579 SYRETVSEESSQLCLSKSPNKHNRLFMKARPFPDGLAEDIDKGDVSSRQELKQRARYLAEKYEWD 643

  Fly   629 VTEARKIWCFGPDGTGPNFILDCTKSVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGILADENLRGVRFNIYDV 693
            |.||||||||||||||||.::|.||.||||||||||||||||||:|||:|.:|||||.||:|:||
 Frog   644 VAEARKIWCFGPDGTGPNILVDVTKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGVLCEENLRGARFDIHDV 708

  Fly   694 TLHADAIHRGGGQIIPTTRRCLYAAAITAKPRLMEPVYLCEIQCPEVAVGGIYGVLNRRRGHVFE 758
            |||||||||||||||||.||.|||:|:||:||||||:||.||||||..||||||||||:||||||
 Frog   709 TLHADAIHRGGGQIIPTARRVLYASALTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFE 773

  Fly   759 ENQVVGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQVLPGDPSEPSSKPYAIVQD 823
            |:||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.:.:|:|..:|.:
 Frog   774 ESQVAGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDSTSRPSQVVGE 838

  Fly   824 TRKRKGLKEGLPDLSQYLDKL 844
            ||||||||||:|.|..:||||
 Frog   839 TRKRKGLKEGIPPLDNFLDKL 859

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
eEF2NP_525105.2 PTZ00416 1..844 CDD:240409 679/864 (79%)
eef2.2NP_001015785.1 PTZ00416 1..859 CDD:240409 679/864 (79%)

Return to query results.
Submit another query.