DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment eEF2 and eef2b

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_525105.2 Gene:eEF2 / 35422 FlyBaseID:FBgn0000559 Length:844 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_956752.2 Gene:eef2b / 326929 ZFINID:ZDB-GENE-030131-5128 Length:858 Species:Danio rerio


Alignment Length:867 Identity:684/867 - (78%)
Similarity:746/867 - (86%) Gaps:32/867 - (3%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVNFTVDEIRGLMDKKRNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVSKAGIIAGAKAGETRFTDTRKDEQE 65
            |||||||:||.:||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|:|||||||||||||||
Zfish     1 MVNFTVDQIRAIMDKKSNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVSKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQE 65

  Fly    66 RCITIKSTAISMYFEVEEKDLVFITHPDQREKECK---GFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTD 127
            |||||||||||||:|:.|.||.||       |:||   |||||||||||||||||||||||||||
Zfish    66 RCITIKSTAISMYYELTENDLAFI-------KQCKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTD 123

  Fly   128 GALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPILFMNKMDRALLELQLDAEELYQTFQRIVENVNVI 192
            ||||||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:.|||||||||||||||||
Zfish   124 GALVVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVI 188

  Fly   193 IATY-NDDGGPMGEVRVDPSKGSVGFGSGLHGWAFTLKQFSEMYSEKF---------------KI 241
            |:|| .|:|||||.:.:||..|:|||||||||||||||||:|||..||               |:
Zfish   189 ISTYGEDEGGPMGNIMIDPVIGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFASKGEAQLSPADRCKKV 253

  Fly   242 DVVKLMNRLWGENFFNAKTKKWQKQKEA-DNK---RSFCMYILDPIYKVFDAIMNYKKEEIGTLL 302
            :  .:|.:|||:.:|:....|:.|.... |.|   |:|...|||||:||||||||:||||...|:
Zfish   254 E--DMMKKLWGDRYFDPAGGKFTKTANGPDGKKYPRTFAQLILDPIFKVFDAIMNFKKEETAKLI 316

  Fly   303 EKIGVTLKHEDKDKDGKALLKTVMRTWLPAGEALLQMIAIHLPSPVVAQKYRMEMLYEGPHDDEA 367
            ||:.:.|..|||||:||.|||.|||.||||||||||||.|||||||.|||||.|:|||||.||||
Zfish   317 EKLDIKLDTEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGEALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPGDDEA 381

  Fly   368 AIAVKSCDPDGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFAGKVATGQKCRIMGPNYTPGKKEDLYEKA 432
            |:.:|:|||.|||||||||||||:||||||||||||:|.|:||.|.||||||||||||||||.|.
Zfish   382 AMGIKNCDPKGPLMMYISKMVPTTDKGRFYAFGRVFSGVVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKP 446

  Fly   433 IQRTILMMGRYVEAIEDVPSGNICGLVGVDQFLVKTGTITTFKDAHNMKVMKFSVSPVVRVAVEP 497
            |||||||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||..||||:|||||||||||||||.
Zfish   447 IQRTILMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFDQAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEA 511

  Fly   498 KNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLKKSDPV 562
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Zfish   512 KNPADLPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLKKSDPV 576

  Fly   563 VSYRETVSEESDQMCLSKSPNKHNRLLMKALPMPDGLPEDIDNGDVSAKDEFKARARYLSEKYDY 627
            ||||||||.|||||||||||||||||.|||.|.||||.||||.||||::.|.|.|||||::||::
Zfish   577 VSYRETVSAESDQMCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGDVSSRQELKTRARYLADKYEW 641

  Fly   628 DVTEARKIWCFGPDGTGPNFILDCTKSVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGILADENLRGVRFNIYD 692
            :||||||||||||||||||.::|.||.||||||||||||||||||:|||.|.:||:|.|||:|:|
Zfish   642 EVTEARKIWCFGPDGTGPNMLVDVTKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRAVRFDIHD 706

  Fly   693 VTLHADAIHRGGGQIIPTTRRCLYAAAITAKPRLMEPVYLCEIQCPEVAVGGIYGVLNRRRGHVF 757
            ||||.|||||||||||||.||.|||..:||:||||||:||.||||||..||||||||||:|||||
Zfish   707 VTLHTDAIHRGGGQIIPTARRVLYACQLTAEPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVF 771

  Fly   758 EENQVVGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQVLPGDPSEPSSKPYAIVQ 822
            ||:||:|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.:.:|||..||.
Zfish   772 EESQVMGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPKDAASKPCQIVA 836

  Fly   823 DTRKRKGLKEGLPDLSQYLDKL 844
            |||||||||||:|.|..:||||
Zfish   837 DTRKRKGLKEGIPALDNFLDKL 858

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
eEF2NP_525105.2 PTZ00416 1..844 CDD:240409 682/865 (79%)
eef2bNP_956752.2 PTZ00416 1..858 CDD:240409 682/865 (79%)

Return to query results.
Submit another query.