DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment eEF2 and Eef2

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_525105.2 Gene:eEF2 / 35422 FlyBaseID:FBgn0000559 Length:844 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_058941.1 Gene:Eef2 / 29565 RGDID:61979 Length:858 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:862 Identity:677/862 - (78%)
Similarity:747/862 - (86%) Gaps:22/862 - (2%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     1 MVNFTVDEIRGLMDKKRNIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVSKAGIIAGAKAGETRFTDTRKDEQE 65
            |||||||:||.:||||.|||||||||||||||||||||||.||||||.|:|||||||||||||||
  Rat     1 MVNFTVDQIRAIMDKKANIRNMSVIAHVDHGKSTLTDSLVCKAGIIASARAGETRFTDTRKDEQE 65

  Fly    66 RCITIKSTAISMYFEVEEKDLVFITHPDQREKECKGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGAL 130
            |||||||||||:::|:.|.||.||    ::.|:..||||||||||||||||||||||||||||||
  Rat    66 RCITIKSTAISLFYELSENDLNFI----KQSKDGSGFLINLIDSPGHVDFSSEVTAALRVTDGAL 126

  Fly   131 VVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPILFMNKMDRALLELQLDAEELYQTFQRIVENVNVIIAT 195
            |||||||||||||||||||||||||||:|.|||||||||||||:.||||||||||||||||||:|
  Rat   127 VVVDCVSGVCVQTETVLRQAIAERIKPVLMMNKMDRALLELQLEPEELYQTFQRIVENVNVIIST 191

  Fly   196 YND-DGGPMGEVRVDPSKGSVGFGSGLHGWAFTLKQFSEMYSEKFKI-------------DVVKL 246
            |.: :.||||.:.:||..|:|||||||||||||||||:|||..||..             .|..:
  Rat   192 YGEGESGPMGNIMIDPVLGTVGFGSGLHGWAFTLKQFAEMYVAKFAAKGEGQLGAAERAKKVEDM 256

  Fly   247 MNRLWGENFFNAKTKKWQKQKEA-DNK---RSFCMYILDPIYKVFDAIMNYKKEEIGTLLEKIGV 307
            |.:|||:.:|:....|:.|...: |.|   |:||..|||||:||||||||::|||...|:||:.:
  Rat   257 MKKLWGDRYFDPANGKFSKSANSPDGKKLPRTFCQLILDPIFKVFDAIMNFRKEETAKLIEKLDI 321

  Fly   308 TLKHEDKDKDGKALLKTVMRTWLPAGEALLQMIAIHLPSPVVAQKYRMEMLYEGPHDDEAAIAVK 372
            .|..|||||:||.|||.|||.|||||:||||||.|||||||.|||||.|:|||||.|||||:.:|
  Rat   322 KLDSEDKDKEGKPLLKAVMRRWLPAGDALLQMITIHLPSPVTAQKYRCELLYEGPPDDEAAMGIK 386

  Fly   373 SCDPDGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFAGKVATGQKCRIMGPNYTPGKKEDLYEKAIQRTI 437
            ||||.||||||||||||||||||||||||||:|.|:||.|.||||||||||||||||.|.|||||
  Rat   387 SCDPKGPLMMYISKMVPTSDKGRFYAFGRVFSGVVSTGLKVRIMGPNYTPGKKEDLYLKPIQRTI 451

  Fly   438 LMMGRYVEAIEDVPSGNICGLVGVDQFLVKTGTITTFKDAHNMKVMKFSVSPVVRVAVEPKNPAD 502
            ||||||||.|||||.|||.||||||||||||||||||:.||||:|||||||||||||||.|||||
  Rat   452 LMMGRYVEPIEDVPCGNIVGLVGVDQFLVKTGTITTFEHAHNMRVMKFSVSPVVRVAVEAKNPAD 516

  Fly   503 LPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPLKKSDPVVSYRE 567
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||||||||
  Rat   517 LPKLVEGLKRLAKSDPMVQCIIEESGEHIIAGAGELHLEICLKDLEEDHACIPIKKSDPVVSYRE 581

  Fly   568 TVSEESDQMCLSKSPNKHNRLLMKALPMPDGLPEDIDNGDVSAKDEFKARARYLSEKYDYDVTEA 632
            ||||||:.:||||||||||||.|||.|.||||.||||.|:|||:.|.|||||||:|||::||.||
  Rat   582 TVSEESNVLCLSKSPNKHNRLYMKARPFPDGLAEDIDKGEVSARQELKARARYLAEKYEWDVAEA 646

  Fly   633 RKIWCFGPDGTGPNFILDCTKSVQYLNEIKDSVVAGFQWASKEGILADENLRGVRFNIYDVTLHA 697
            ||||||||||||||.:.|.||.||||||||||||||||||:|||.|.:||:|||||:::||||||
  Rat   647 RKIWCFGPDGTGPNILTDITKGVQYLNEIKDSVVAGFQWATKEGALCEENMRGVRFDVHDVTLHA 711

  Fly   698 DAIHRGGGQIIPTTRRCLYAAAITAKPRLMEPVYLCEIQCPEVAVGGIYGVLNRRRGHVFEENQV 762
            |||||||||||||.||||||:.:||:||||||:||.||||||..||||||||||:|||||||:||
  Rat   712 DAIHRGGGQIIPTARRCLYASVLTAQPRLMEPIYLVEIQCPEQVVGGIYGVLNRKRGHVFEESQV 776

  Fly   763 VGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQVLPGDPSEPSSKPYAIVQDTRKR 827
            .|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||:|||||.:.||:|..:|.:||||
  Rat   777 AGTPMFVVKAYLPVNESFGFTADLRSNTGGQAFPQCVFDHWQILPGDPFDNSSRPSQVVAETRKR 841

  Fly   828 KGLKEGLPDLSQYLDKL 844
            ||||||:|.|..:||||
  Rat   842 KGLKEGIPALDNFLDKL 858

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
eEF2NP_525105.2 PTZ00416 1..844 CDD:240409 675/860 (78%)
Eef2NP_058941.1 PTZ00416 1..858 CDD:240409 675/860 (78%)

Return to query results.
Submit another query.