Protein Alignment Cul2 and cul4a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_957321.2
• Gene: cul4a / 394002
• ZFINID: ZDB-GENE-040426-1357
• Length: 745
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 761
• Identity: 201/761 - (26%)
• Similarity: 374/761 - (49%)
• Gaps: 63/761 - (8%)

  Fly     4 KPKIVEFV--DVWPRLRCIAESVITLTKVERSVWNTSFSDVYTLCVAQPEPMADRLYGETKHFLE 66
            :||:.:..  |.|.:||....::...|.::.:: ...:..|..||..:..||   ||.:.:...|
Zfish    37 RPKLTDSYTEDTWLKLRDAVSAIQNSTSIQYNL-EELYQAVENLCSYKVSPM---LYKQLRQVCE 97

  Fly    67 QHVQEMLAKKVLIEGECSHSNGGPDLLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKITDTE 131
            :|||..      |......|......|:|....|.::.:....:..::::|::.::.:..:..:
Zfish    98 EHVQAQ------IHQFREESLDSLSFLKRMNRCWQDHCRQTIMIRSIFLFLDRTYVLQNSLLPS- 155

  Fly   132 SFYGNLSSDAAEQMEIGELGLDIWRLYMIE--YLSSELVRHILEGIAADRASNGTLDHHRVQIIN 194
                           |.:.||:::|.:::.  .:.|..|:.|||.:..:| |..|:|...::.:.
Zfish   156 ---------------IWDTGLELFRTHIVSDAAVQSRTVQGILEQVERER-SGETVDRSLLRSLL 204

  Fly   195 GVIHSFVEVQDYKKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEVIRILEYES 259
            |::            ..|::|::.||...|..:...|..|..:|:....|.||:..|.|.||.|:
Zfish   205 GML------------SDLQVYKDSFEQRFLSETTRLYAAEGQRLMQERDVPEYLHHVARRLEEEN 257

  Fly   260 RRAQKFLHVSSLPKLRKECEEKFINDRLGFIYSE-CREMVSEERRQDLRNMYVVLKPIPDNLKSE 323
            .|...:|..|:...|....|::.:.:.:..|..: .|.::.|.|..:|..:|.:...:...| :.
Zfish   258 DRVISYLDQSTQKPLIATVEKQLLGEHMTTILQKGLRTLLDENRVCELTLLYELFSKVKGGL-TA 321

  Fly   324 LITTFLDHIKSEGLQTVSALKGENIHIAFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDKACASV 388
            |:.::.::|||.|.:||.:.:.:.   ..|:.:|....:...:....|:.:..|::|:.:|..:.
Zfish   322 LLQSWREYIKSVGAETVCSPERDR---EMVQELLDFKDQMDSVTQSCFQRNESFINAMKEAFENF 383

  Fly   389 INRRPTERQPCRSAEYVAKYCDTLLK--KSKTCEAEIDQKLTNNITIFKYIEDKDVYQKFYSRLL 451
            ||:||.     :.||.:|||.|:.|:  ..:..|.|:::.|...:.||::|..|||::.||.:.|
Zfish   384 INQRPN-----KPAELIAKYVDSKLRAGNKEATEEELERILDKIMIIFRFIHGKDVFEAFYKKDL 443

  Fly   452 AKRLIHEQSQSMDAEEGMINRLKQACGYEFTNKLHRMFTDISVSVDLNNKFNTHLKDSNVDLGIN 516
            ||||:..:|.|:|||:.|:::||..||..||:||..||.|:.:|.|:..:|..::::......|.
Zfish   444 AKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMIQFKQYMQNQTEPSNIE 508

  Fly   517 LAIKVLQAGAWPLGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFEDYYHKLFSGRKLTWLHHMCHGELKLSHLKK 581
            |.:.:|..|.||  |...:...:|.|..|..::|:.:|....|||||.|...:.|..||....:.
Zfish   509 LTVNILTMGYWP--SYTPMDVHLPAEMVKLQEVFKLFYLGKHSGRKLQWQPTLGHAVLKTEFKEG 571

  Fly   582 SYIVTMQTYQMAIILLFETCDSLSCREIQNTLQLNDETFQKHMQPII--ESKLLNAS--SENLAG 642
            ...:.:..:|..::|:|...|..|..||:....:.:...::.:|.:.  ::::||.:  .:.:..
Zfish   572 KKELQVSLFQTLVLLMFNESDECSVEEIRVATGIEEGELKRTLQSLACGKARVLNKTPRGKEVED 636

  Fly   643 ETRIELNLDYTNKRTKFKISSALQKETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNAL 707
            ..|...|.|:.:|..:.||:....|||.:|...|...|.:||:..:.||:|||||.||.|.||.|
Zfish   637 GDRFHFNSDFRHKLFRIKINQIQMKETVEEQVSTTERVFQDRQYQIDAAVVRIMKMRKTLSHNLL 701

  Fly   708 IQEVLSLSKVSFTPNIAMIKKCVESLIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753
            :.|:.:..|....|  |.:||.:|||||:.|:||...:.::|.|:|
Zfish   702 VSELYNQLKFPVKP--ADLKKRIESLIDRDYMERDKENSNQYHYVA 745

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	156/646 (24%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	29/61 (48%)
cul4a	NP_957321.2	Cullin	49..646	CDD:459983	156/646 (24%)
		Cullin_Nedd8	677..737	CDD:463146	29/61 (48%)