Protein Alignment Cul2 and Cul4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_610352.2
• Gene: Cul4 / 35780
• FlyBaseID: FBgn0033260
• Length: 821
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 754
• Identity: 209/754 - (27%)
• Similarity: 378/754 - (50%)
• Gaps: 77/754 - (10%)

  Fly    20 IAESVIT--LTKVERSVWNTSFSDVYTLCVAQPEPMADRLYGETKHFLEQHVQEMLAKKVLIEGE 82
            :.|:||.  |:|..:......:..|..:|   ...|..:||.:.|...||||:..:..|.|
  Fly   125 LEEAVIAIQLSKPIKYSLEELYQAVVNMC---SHKMDAQLYAKLKELTEQHVKRNIKLKEL---- 182

  Fly    83 CSHSNGGPD---LLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKITDTESFYGNLSSDAAEQ 144
               :.|..|   ||::....|:.:.|.:..:..:::|:::.::.:.....:
  Fly   183 ---TGGSMDKLILLEKINHWWLSFCQQMIMIRSIFLYMDRTYVLQNSTVHS-------------- 230

  Fly   145 MEIGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRHILEGIAA--DRASNG-TLDHHRVQIINGVIHSFVEVQDY 206
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  Fly   231 --IWDMGLDLFRIHFAQ--NSVVQKRTVDGLLTLIEKERQGSTVD-------RGLLKSLV----- 279

  Fly   207 KKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEVIRILEYESRRAQKFLHVSSL 271
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  Fly   280 RMLCDLQIYTSSFEEKFLDATNQLYKAESQRKMQELEVPEYLQHVNKRLAEENERLRHYLDSSTK 344

  Fly   272 PKLRKECEEKFINDRLGFIYSECREMVSEERR-QDLRNMYVVLKPIPDNLKSELITTFLDHIKSE 335
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  Fly   345 HPLIYNVEKELLAEHLTSILQKGLDSLLEDNRLSDLTLLYGLLSRV-KNGTSELCGNFNGFIKKK 408

  Fly   336 GLQTVSALKGENIHIAFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDKACASVINRRPTERQPCR 400
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  Fly   409 GRTIVIDPEKDK---SMVQDLLDFKDKMDVIVRTCFEHNEKFTNSLREAFEFFINQRAN-----K 465

  Fly   401 SAEYVAKYCDTLLKKSK--TCEAEIDQKLTNNITIFKYIEDKDVYQKFYSRLLAKRLIHEQSQSM 463
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  Fly   466 PAELIAKYVDMKLRSGNKGTTDEELEKTLDKIMVLFRFIHGKDVFEAFYKKDLAKRLLVGKSASV 530

  Fly   464 DAEEGMINRLKQACGYEFTNKLHRMFTDISVSVDLNNKFNTHLKDSNVDL-GINLAIKVLQAGAW 527
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  Fly   531 DSEKSMLSKLKQECGGGFTSKLEGMFKDMELSRDINIAFRGHALSNNRDVHNLDLCVSILTMGYW 595

  Fly   528 P-LGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFEDYYHKLFSGRKLTWLHHM--CHGELKLSHLKKSYIVTMQT 589
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  Fly   596 PTYAPTEV---TMPPQFINPQQIFNKFYLEKHSGRKLQWQPTLGNCMLRAQFDAGPKELLVSL-- 655

  Fly   590 YQMAIILLFETCDSLSCREIQNTLQLNDETFQKHMQPII--ESKLLNAS---SENLAGETRIELN 649
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  Fly   656 FQALVLLLFNDKPVLSYEEILAATLIEDGELRRTLQSLACGRARVITKTPKGREILDGD-QFDFN 719

  Fly   650 LDYTNKRTKFKISSALQKETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNALIQEVLSL 714
            .::|||..:.||:....|||.:|.:.|...|.:||:..:.||||||||.||.|.||.||.|:  .
  Fly   720 NEFTNKLFRIKINQIQMKETNEEQKATEERVFQDRQYQIDAAIVRIMKMRKTLSHNLLITEL--F 782

  Fly   715 SKVSFTPNIAMIKKCVESLIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753
            ::::|....|.:||.:|||||:.|:||..::.::|:|:|
  Fly   783 NQLTFPVKPADLKKRIESLIDRDYMERDKDNQNQYNYVA 821

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	165/651 (25%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	30/61 (49%)
Cul4	NP_610352.2	Cullin	124..722	CDD:459983	165/651 (25%)
		Cullin_Nedd8	753..813	CDD:463146	30/61 (49%)