Protein Alignment Cul2 and cul5a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_001314988.1
• Gene: cul5a / 327215
• ZFINID: ZDB-GENE-030131-5426
• Length: 780
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 806
• Identity: 207/806 - (25%)
• Similarity: 366/806 - (45%)
• Gaps: 98/806 - (12%)

  Fly     8 VEFVDVWPRLRCIAESVITLTKVERSVWNTSFSDVYTLCV---AQPEPMADRLYGETKHFLEQHV 69
            ::|.|.|..:|.|...::....|.:..|...||||:.:|:   ..|..:...|..:...|::|..
Zfish    13 LQFEDKWDLMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDQFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILDFIKQAQ 77

  Fly    70 QEMLAKKVLIEGECSHSNGGPDLLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKITDTESFY 134
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Zfish    78 ARVL----------SHQD-DTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPFCQLEITLMGKQ--------- 122

  Fly   135 GNLSSDAAEQMEIGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRHILEGIAADRASNGTLDHHRVQIINGVIHS 199
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Zfish   123 GSSKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFSNIKNRLQDSAMKLVHAERLGE-AFDS---QLVIGVRES 183

  Fly   200 FVEV----QDYKKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEVIRILEYESR 260
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Zfish   184 YVNLCSNPED-----KLQIYRDNFEKSYLDSTERFYRTQAPSYLQQNGVQNYMKYADAKLREEEK 243

  Fly   261 RAQKFLHV----SSLPKLRKECEEKFINDRLGFIYSECREMVSEERRQDLRNMYVVLKPIPDNLK 321
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Zfish   244 RALRYLETRRECNSVQALMECCVNALVTSFKETILAECPGMIKRNETDKLHLMFSLMDKVPNGIE 308

  Fly   322 SELITTFLDHIKSEGLQTVSALKGENIHI---AFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDK 383
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Zfish   309 -PMLKDLEEHIISAGLADMVA-AAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTARDK 371

  Fly   384 ACASVIN-------------------RRPTERQPCRSAEYVAKYCDTLLKKS----KTCEAEIDQ 425
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Zfish   372 AYKAVVNDATIFKLELPMKQKGVGLKTQPESKCP----ELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEDIEL 432

  Fly   426 KLTNNITIFKYIEDKDVYQKFYSRLLAKRLIHEQSQSMDAEEGMINRLKQ-ACGYEFTNKLHRMF 489
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Zfish   433 KLKEVLLVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMF 497

  Fly   490 TDISVSVDLNNKFNTHLKDSNVDL---GINLAIKVLQAGAWPLGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFE 551
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Zfish   498 QDIKVSEDLNQVFKEMHKHNKLALPADSVN--IKILNAGAWSRSSEKVF-VSLPTELEDLIPEVE 559

  Fly   552 DYYHKLFSGRKLTWLHHMCHGELKLSHLKKSYIVTMQTYQMAIILLF--ETCDSLSCREIQNTLQ 614
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Zfish   560 DFYKKNHSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPREKISFENLKLATE 624

  Fly   615 LNDETFQKHMQPIIESKLLN----------ASSENLAGETRIELNLDYT-------NKRTKFKIS 662
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Zfish   625 LPDAELRRTLWSLVAFPKLKRQVLLYEPQVSSPKDFTDSTLFFVNQEFSLIKNSKAQKRGKINLI 689

  Fly   663 SALQKETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNALIQEVLSLSKVSFTPNIAMIK 727
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Zfish   690 GRLQLTTERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKKITNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIK 754

  Fly   728 KCVESLIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753
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Zfish   755 EQIEWLIEHKYIKRDETDINTFIYMA 780

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	171/690 (25%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	24/61 (39%)
cul5a	NP_001314988.1	Cullin	19..672	CDD:459983	171/690 (25%)
		Cullin_Nedd8	711..772	CDD:463146	24/60 (40%)