Protein Alignment Cul2 and cul4b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_017951653.1
• Gene: cul4b / 100151714
• XenbaseID: XB-GENE-963628
• Length: 865
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 773
• Identity: 202/773 - (26%)
• Similarity: 380/773 - (49%)
• Gaps: 87/773 - (11%)

  Fly     4 KPKIVE-FVD-VWPRLRCIAESVITLTKVERSVWNTSFSDVYTLCVAQPEPMADRLYGETKHFLE 66
            |||:.| :.| .|.:|:...|::...|.::.:: ...:..|..||..:   ::..||.:.:...|
 Frog   157 KPKLPENYTDETWQKLKGAVEAIQNSTSIKYNL-EELYQAVENLCSYK---ISANLYKQLRQICE 217

  Fly    67 QHVQEMLAK-------KVLIEGECSHSNGGPDLLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKK 124
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 Frog   218 DHIKAQIHQFREDALDSVL-------------FLKKIDKCWQDHCRQMIMIRSIFLFLDRTYVLQ 269

  Fly   125 QKITDTESFYGNLSSDAAEQMEIGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRH-ILEGI--AADRASNGTLD 186
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 Frog   270 NSMLPS----------------IWDMGLELFRNHII---SDQKVQNKTIDGILLLIERERNGE-- 313

  Fly   187 HHRVQIINGVIHSFVEVQDYKKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYMQEV 251
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 Frog   314 ----AIDRSLLRSLLSM-----LSDLQIYQDSFEQRFLEETNRLYAAEGQRLMQEREVPEYLHHV 369

  Fly   252 IRILEYESRRAQKFLHVSSLPKLRKECEEKFINDRL-GFIYSECREMVSEERRQDLRNMYVVLKP 315
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 Frog   370 NKRLEEEADRVITYLDQSTQKPLIATVEKQLLGEHLTATLQKGLNHLLDENRIQDLSLLYQLFSR 434

  Fly   316 IPDNLKSELITTFLDHIKSEGLQTVSALKGENIHIAFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSA 380
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 Frog   435 VRGGVQ-VLLQHWIEYIKAFGSTIVINPEKDK---TMVQELLDFKDKVDHVIDVCFLKNEKFVNA 495

  Fly   381 LDKACASVINRRPTERQPCRSAEYVAKYCDTLLK--KSKTCEAEIDQKLTNNITIFKYIEDKDVY 443
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 Frog   496 MKEAFETFINKRPN-----KPAELIAKYVDSKLRTGNKEATDEELEKMLDKIMIIFRFIYGKDVF 555

  Fly   444 QKFYSRLLAKRLIHEQSQSMDAEEGMINRLKQACGYEFTNKLHRMFTDISVSVDLNNKFNTHLKD 508
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 Frog   556 EAFYKKDLAKRLLVGKSASVDAEKSMLSKLKHECGAAFTSKLEGMFKDMELSKDIMVHFKQYMQN 620

  Fly   509 SNVDLGINLAIKVLQAGAWPLGSTQVIPFAV--PQEFEKSIKMFEDYYHKLFSGRKLTWLHHM-- 569
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 Frog   621 QNVPGNIELTVNILTMGYWP----TYVPMEVHLPPEMVKLQEIFKTFYLGKHSGRKLQWQSTLGQ 681

  Fly   570 CHGELKLSHLKKSYIVTMQTYQMAIILLFETCDSLSCREIQNTLQLNDETFQKHMQPII--ESKL 632
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 Frog   682 CVLKAEFNEGKKELQVSL--FQTLVLLMFNEGDEFSLEEIRQATGIEDSELRRTLQSLACGRARV 744

  Fly   633 L--NASSENLAGETRIELNLDYTNKRTKFKISSALQKETPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRI 695
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 Frog   745 LVKSPKSKDVDDGDKFTFNDDFRHQLFRIRINQIQMKETVEEQASTTERVFQDRQYQIDAAIVRI 809

  Fly   696 MKARKVLKHNALIQEVLSLSKVSFTPNIAMIKKCVESLIDKQYIERTANSGDEYSYMA 753
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 Frog   810 MKMRKTLSHNLLVSEVYNQLKFPVKP--ADLKKRIESLIDRDYMERDKENPNQYNYVA 865

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	155/658 (24%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	31/61 (51%)
cul4b	XP_017951653.1	Cullin	169..766	CDD:459983	155/658 (24%)
		Cullin_Nedd8	794..859	CDD:214883	32/66 (48%)