Protein Alignment Cul2 and cul5b

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_610117.1
• Gene: Cul2 / 35420
• FlyBaseID: FBgn0032956
• Length: 753
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_073791420.1
• Gene: cul5b / 100006147
• ZFINID: ZDB-GENE-091113-45
• Length: 837
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 865
• Identity: 216/865 - (24%)
• Similarity: 375/865 - (43%)
• Gaps: 159/865 - (18%)

  Fly     8 VEFVDVWPRLRCIAESVITLTKVERSVWNTSFSDVYTLCV---AQPEPMADRLYGETKHFLEQHV 69
            ::|.|.|..:|.|...::....|.:..|...||||:.:|:   ..|..:...|..:...|::|..
Zfish    13 LQFEDKWDLMRPIVLKLLRQESVTKQQWFDLFSDVHAVCLWDDKGPAKIHQALKEDILDFIKQAQ 77

  Fly    70 QEMLAKKVLIEGECSHSNGGPDLLQRYYITWMEYSQGIKYLHQLYIYLNQQHIKKQKITDTESFY 134
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Zfish    78 ARVL----------SHQD-DTALLKAYIVEWRKFFTQCDILPKPF--------SKLEIT----LL 119

  Fly   135 GNLSSDAAEQME---IGELGLDIWRLYMIEYLSSELVRHILEGIAADRASNGTLDHHRVQIINGV 196
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Zfish   120 GNQGSNKKSNVEDSIVRKLMLDTWNESIFCNIKSRLQDSAMKLVHAERLGE-AFDS---QLVIGV 180

  Fly   197 IHSFVEV---QDYKKTGSLKLYQELFEGPMLEASGAYYTDEANKLLHRCSVSEYM---------- 248
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Zfish   181 RESYVNLCSNTDDK----LQIYRENFEKSYLDSTERFYKTQAPSYLQQNGVQNYMKYFSFLHRSY 241

  Fly   249 -------QEVI----------------RILEY---------ESRRAQKFLHV----SSLPKLRKE 277
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Zfish   242 TSQLHPRQRFLPDQFVTDLANQHYQDGKVLSHSKADGKLREEEKRALRYLETRRECNSVQALMEC 306

  Fly   278 CEEKFINDRLGFIYSECREMVSEERRQ---------------DLRNMYVVLKPIPDNLKSELITT 327
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Zfish   307 CVNALVTSFKETILTECPGMIKRNETESEYGRSSGTKGSASSELHLMFSLMDKVPSGIE-PMLKD 370

  Fly   328 FLDHIKSEGLQTVSALKGENIHI---AFVENMLKVHHKYQELIADVFENDSLFLSALDKACASVI 389
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Zfish   371 LEDHIMSAGLADMVA-SAETITTDSEKYVEQLLTLFNRFSKLVKEAFQDDPRFLTSRDKAYKAVV 434

  Fly   390 N-------------------RRPTERQPCRSAEYVAKYCDTLLKKS----KTCEAEIDQKLTNNI 431
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Zfish   435 NDATIFKLELPLKQKGVSLKTQPESKCP----ELLANYCDMLLRKTPLSKKLTSEEIEAKLKEVL 495

  Fly   432 TIFKYIEDKDVYQKFYSRLLAKRLIHEQSQSMDAEEGMINRLKQ-ACGYEFTNKLHRMFTDISVS 495
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Zfish   496 LVLKYVQNKDVFMRYHKAHLTRRLILDISADSEIEENMVEWLREVGMPADYVNKLARMFQDIKVS 560

  Fly   496 VDLNNKFNTHLKDSNVDL---GINLAIKVLQAGAWPLGSTQVIPFAVPQEFEKSIKMFEDYYHKL 557
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Zfish   561 EDLNQSFKEMHKHNKLALPADSVN--IKILNAGAWSRSSEKVF-VSLPTELEDLIPEVEDFYKKN 622

  Fly   558 FSGRKLTWLHHMCHGELKLSHLKKSYIVTMQTYQMAIILLF--ETCDSLSCREIQNTLQLNDE-- 618
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Zfish   623 HSGRKLHWHHLMSNGIITFKNEVGQYDLEVTTFQLAVLFAWNQRPRERISFENLKLATELPDAEL 687

  Fly   619 --------TFQKHMQPIIESKLLNASSENLAGETRIELNLDYT-------NKRTKFKISSALQKE 668
                    .|.|..:.::..:.:..|.::.|..|...:|.:::       .||.|..:...||..
Zfish   688 RRTLWSLVAFPKLKRQVLSYEPVVGSPKDFAEGTVFSINQEFSLIKNSKVQKRGKINLIGRLQLT 752

  Fly   669 TPQEVEHTINSVDEDRKLFLQAAIVRIMKARKVLKHNALIQEVLSLSKVSFTPNIAMIKKCVESL 733
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Zfish   753 TERMREEENEGIVQLRILRTQEAIIQIMKMRKRISNAQLQTELVEILKNMFLPQKKMIKEQIEWL 817

  Fly   734 IDKQYIERTANSGDEYSYMA 753
            |:.:||:|.....:.:.|||
Zfish   818 IEHKYIKRDETDINTFIYMA 837

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
Cul2	NP_610117.1	Cullin	14..652	CDD:459983	180/749 (24%)
		Cullin_Nedd8	683..745	CDD:463146	24/61 (39%)
cul5b	XP_073791420.1	None