Protein Alignment clumsy and grid1a

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036373.1
• Gene: clumsy / 35394
• FlyBaseID: FBgn0026255
• Length: 1002
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_021323097.2
• Gene: grid1a / 793756
• ZFINID: ZDB-GENE-120411-28
• Length: 1044
• Species: Danio rerio
• Alignment Length: 984
• Identity: 254/984 - (25%)
• Similarity: 425/984 - (43%)
• Gaps: 185/984 - (18%)

  Fly    27 VGSIFTSDKDESEIAFRTAVDRANI------LERNVELVPIVVYANTDDSFIMEKMVCNLISQGV 85
            :|:||..:....:..|:.|:...::      .||....:.::   ..::.|...:..|.|::||:
Zfish    26 IGAIFEQNAIRDDEVFQLAISDLSLNDDILQSERITHSIKLI---EPNNPFQAVQEACELMNQGI 87

  Fly    86 IAIFGPSTGSSSDIIASICDTLDIPHIVY----DWIP------NESIPDREHSTMTLNVHPDNLL 140
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Zfish    88 LALVSSTGCAAANALQSLTDAMHIPHLFIQRNGDGTPRAECQLNPS-PDGER--YTLAARPP-VR 148

  Fly   141 LSQGLAEIVQSFAWRSFTVVYETDKELQQLQDILQVGEPISNPTTVKQLGPGDDH--RPF----- 198
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Zfish   149 LNDVMITLVSELRWHKFIVFYDSEYDVRGLRGFLDQASRMGLDVSLQQV---DRNVTKVFSTLFS 210

  Fly   199 ---LKEIKLSTDNC--LILHCAPDNLLKILQQANELKMLGEYQSVFIPLLDTHSIDFGELSGVEA 258
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Zfish   211 TMRMEELNRYRDTLRRAILLLSPRTAQVFIHQAVETNLASK---------DSHWVYANE------ 260

  Fly   259 NITTVRLMDPSDFHVKNVVHD--------------WEEREKREGRYFKVDPNRVKSQMILLNDAV 309
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Zfish   261 --------EVSDTEIMELVHSALGRMTVIRQIFPLWRDTNIRCMR----NNHRISS---LLCDPQ 310

  Fly   310 --WLFSKGLTELGIFEEL-----------------TAPDLECRRK--KPWPFGKRIIEFIKARSE 353
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Zfish   311 EGYLQSLEVSSLYLYDSVLMLANAFYRKLEDRKWHSMASLNCMRKSTKPWNGGWSMLDTIQKGRI 375

  Fly   354 ETSTGRIDFNENGQRSFFTLRFMELN-SDGF----LDLATWDPVNGLDVLNDDEESEKRVGQKLS 413
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Zfish   376 SGLTGLMDFRSNGANSHVQFEILGTSYSETFGKDVKRLATWDSDRGL----NGSLRENRADHGMQ 436

  Fly   414 NKTFIVSSRLGAPFLTLREPQEGEILTGNSRYEGYSIDLINEIAKMLNFKFEFRMSPDGKYGALN 478
            ..|..|.:.|..||:.:.|    .||....||:|:|||:::.:||:|.||:|.....|.|||: .
Zfish   437 GITLKVVTLLEEPFVMVAE----NILGQPKRYKGFSIDVLDALAKILGFKYEMYQVADAKYGS-P 496

  Fly   479 KVTQTWDGIVRQLIDGNADLGICDLTMTSSRRQAVDFTPPFMTLGISILFSKPPTPPTDLFSFLS 543
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Zfish   497 QANGSWNGMIGELIGKRADVAISAITITPERENVVDFSKRYLDYSVGILMTK-TEERLNIFSLLA 560

  Fly   544 PFSLDVWIYMGSAYLFISLLLFALARMAPDDWENPHPCKEPEEVENIWSIMNTTWLSIGSLMGQG 608
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Zfish   561 PFDLAVWACIAAAIPVVGVMVFLLRRVQSVRSQNPPGPHQPASVTT--SFQSAIWIVYGAFVQQG 623

  Fly   609 CDILPKAASTRLVTGMWWFFALMMLNSYTANLAAFLTNSRQANSINSAEDLAAQSKIKYGAMAGG 673
            .:....:.:.|:..|.||.|.|::.:||||||||:||.||..|:|.:.:||:.||:|.||.:...
Zfish   624 GESFMSSMALRIAMGSWWLFTLIVCSSYTANLAAYLTVSRMDNAIRTFQDLSKQSEINYGTVRES 688

  Fly   674 STMGFFRDSNF------STYQKMWTAMES--------ASPSVFTKTNDEGVERVQKGKNLYAFLM 724
            :...:||....      ||:.::|..:..        .||:       ||:.:|:  ::.||||.
Zfish   689 AVFEYFRVKGTNPLEQDSTFAELWRTINKNQGQDNSVTSPA-------EGIRKVK--RDPYAFLW 744

  Fly   725 ESTTLEYN--VERKCDLVQIGGWLDYKSYGIAMPFNSPYRKQISAAVLKLGELGQLAELKRKWWK 787
            :...|||.  .:..|.||..|..:..|.||:|:...||||...|..:|.|.|.|.|..||:|||.
Zfish   745 DMAVLEYAALTDDDCTLVVTGNGMSSKGYGLALQHGSPYRDLFSQKILDLQEKGDLDILKQKWWP 809

  Fly   788 EMHGGGNC--EKSDEDGGDTPELGLENVGGVFLVLGLGLLSAMVLGCTEFLWN------------ 838
            ..   |.|  :|..|...:...|.|.:..|||.:|..|||.|.::...|..||
Zfish   810 RK---GRCDLDKHAEPQTEGRALRLHSFAGVFCILAAGLLLACLVAALESWWNGPRCQRAQPKED 871

  Fly   839 VKSVAIEEKISLKEAFKSEALFAA----------RIWITTKPVHTS--SESGSSN---------- 881
            .|..|: |..|...|:...|..|.          |.|..|:..:|.  .|||:.:
Zfish   872 TKGCAL-EMASGSLAYNEIAPAAGCARDVWPERERDWEDTQAFYTGQRGESGAGSPPFEWADGGR 935

  Fly   882 SSSSSSSRS 890
            |.:.:::||
Zfish   936 SGTQAAARS 944

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
clumsy	NP_001036373.1	PBP1_iGluR_Kainate	27..397	CDD:380605	90/437 (21%)
		PBP2_iGluR_Kainate	414..787	CDD:270432	127/388 (33%)
grid1a	XP_021323097.2	None