Protein Alignment clumsy and GluRIID

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036373.1
• Gene: clumsy / 35394
• FlyBaseID: FBgn0026255
• Length: 1002
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: NP_651982.1
• Gene: GluRIID / 44483
• FlyBaseID: FBgn0028422
• Length: 902
• Species: Drosophila melanogaster
• Alignment Length: 947
• Identity: 325/947 - (34%)
• Similarity: 510/947 - (53%)
• Gaps: 92/947 - (9%)

  Fly     8 HFLLIALPVLADIDR--SQFMVGSIFTSDK----------DESEIAFRTAVDRANILERNVELVP 60
            ||..|:|.:|: :.|  :||..|:.:.:..          |::....|...:.|..:..|...||
  Fly     2 HFCWISLIILS-LSRVQAQFYGGNAYEASSGQSIRLGLITDDATDRIRQTFEHAISVVNNELGVP 65

  Fly    61 I------VVYANTDDSFIMEKMVCNLISQGVIAIFGPSTGSSSDIIASICDTLDIPHIVYDWIPN 119
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  Fly    66 LVGETEQVAYGNSVQAF---AQLCRLMQSGVGAVFGPAARHTASHLLNACDSKDIP-FIYPHLSW 126

  Fly   120 ESIPDREHSTMTLNVHPDNLLLSQGLAEIVQSFAWRSFTVVYETDKELQQLQDILQVGEPISNPT 184
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  Fly   127 GSNPD------GFNLHPSPEDIANALYDIVNQFEWSRFIFCYESAEYLKIL-DHLMTRYGIKGP- 183

  Fly   185 TVK----QLGPGDDHRPFLKEIKLSTDNCLILHCAPDNLLKILQQANELKMLGEYQSVFIPLLDT 245
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  Fly   184 VIKVMRYDLNLNGNYKSVLRRIRKSEDSRIVVVGSTTGVAELLRQAQQVGIMNEDYTYIIGNLNL 248

  Fly   246 HSIDFGELSGVEANITTVRLMDPSDFHVKNVVHDWEEREKREGRYFKVDPNRVKSQMILLNDAVW 310
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  Fly   249 HTFDLEEYKYSEANITGIRMFSPDQEEVRDLMEKLHQ-ELGESEPVNSGSTFITMEMALTYDAVR 312

  Fly   311 LFSKGLTELGIFEELTAPDLEC--RRKKPWPFGKRIIEFIKAR--SEETSTGRIDFNENGQRSFF 371
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  Fly   313 VIAETTKHLPYQPQM----LNCSERHDNVQPDGSTFRNYMRSLEIKEKTITGRIYF-EGNVRKGF 372

  Fly   372 TLRFMELNSDGFLDLATWDPVNGLDV----------LNDDEESEKRVGQKLSNKTFIVSSRLGA- 425
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  Fly   373 TFDVIELQTSGLVKVGTWE--EGKDFEFQRPPQAVNFNDIDDG------SLVNKTFIVLISVATK 429

  Fly   426 PFLTLREPQEGEILTGNSRYEGYSIDLINEIAKMLNFKFEFRMSPDG--KYGALNKVTQTWDGIV 488
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  Fly   430 PYASLVE--SIDTLIGNNQFQGYGVDLIKELADKLGFNFTFR---DGGNDYGSFNKTTNSTSGML 489

  Fly   489 RQLIDGNADLGICDLTMTSSRRQAVDFTPPFMTLGISILFSKPPTPPTDLFSFLSPFSLDVWIYM 553
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  Fly   490 KEIVEGRADLAITDLTITSEREEVIDFSIPFMNLGIAILYVKPQKAPPALFSFMDPFSSEVWLYL 554

  Fly   554 GSAYLFISLLLFALARMAPDDWENPHPC-KEPEEVENIWSIMNTTWLSIGSLMGQGCDILPKAAS 617
            |.|||.:||..|.:.|::|.:|:||:|| :||||:||.::|.|:.|.:.|:|:.||.:|.|||.|
  Fly   555 GIAYLGVSLCFFIIGRLSPIEWDNPYPCIEEPEELENQFTINNSLWFTTGALLQQGSEIAPKALS 619

  Fly   618 TRLVTGMWWFFALMMLNSYTANLAAFLTNSRQANSINSAEDLA-AQSKIKYGAMAGGSTMGFFRD 681
            ||.::.:||||.|:|::|||||||||||.....:.|||.:||| .:..::|||...|||..||..
  Fly   620 TRTISAIWWFFTLIMVSSYTANLAAFLTIENPTSPINSVKDLADNKDDVQYGAKRTGSTRNFFST 684

  Fly   682 SNFSTYQKMWTAMESASPSVFTKTNDEGVERVQKGKNLYAFLMESTTLEYNVERKCDLVQIGGWL 746
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  Fly   685 SEEPIYIKM-NEYLNAHPEMLMENNQQGVDKVKSGTK-YAFLMESTSIEFNTVRECNLTKVGDPL 747

  Fly   747 DYKSYGIAMPFNSPYRKQISAAVLKLGELGQLAELKRKWWKEMHGGGNCE-KSDEDGGDTPELGL 810
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  Fly   748 DEKGYGIAMVKNWPYRDKFNKALLELQEQGVLARLKNKWWNEV-GAGVCSAKSDDDG--PSELGV 809

  Fly   811 ENVGGVFLVLGLGLLSAMVLGCTEFLWNVKSVAIEEKISLKEAFKSEALFAARIWITTKPVHTSS 875
            :|:.|:::||.:|.:.::::....:.:.|...|...::...:|...|.....|.....:|:
  Fly   810 DNLSGIYVVLVIGSIISIIISILCWCYFVYKKAKNYEVPFCDALAEEFRIVIRFSENERPL---- 870

  Fly   876 ESGSSNSSSSSSSRSKHSFKSQGLSMKSLKSSGYQDV 912
                 .|:.|..|||::|  ||  |::|||:...:::
  Fly   871 -----KSAQSIYSRSRNS--SQ--SIESLKTDSEENM 898

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
clumsy	NP_001036373.1	PBP1_iGluR_Kainate	27..397	CDD:380605	98/393 (25%)
		PBP2_iGluR_Kainate	414..787	CDD:270432	179/377 (47%)
GluRIID	NP_651982.1	PBP1_iGluR_Kainate	35..400	CDD:380605	98/384 (26%)
		PBP2_iGluR_Kainate	417..788	CDD:270432	179/377 (47%)
		Lig_chan	547..819	CDD:459656	132/276 (48%)