Protein Alignment clumsy and gria4

DIOPT Version :10

• Sequence 1: NP_001036373.1
• Gene: clumsy / 35394
• FlyBaseID: FBgn0026255
• Length: 1002
• Species: Drosophila melanogaster
• Sequence 2: XP_031751480.1
• Gene: gria4 / 100125052
• XenbaseID: XB-GENE-5838893
• Length: 902
• Species: Xenopus tropicalis
• Alignment Length: 908
• Identity: 313/908 - (34%)
• Similarity: 473/908 - (52%)
• Gaps: 67/908 - (7%)

  Fly     4 LFLTHFLLIALPVLADIDRSQFMVGSIFTSDKDESEIAFRTAV----DRANILERNVELVPIVVY 64
            ||.:.|..:|:....    |...:|.:|..:.|:...|||.|:    ...|..|....|||.|..
 Frog    10 LFFSGFWGLAMGAFP----SSVQIGGLFIRNTDQEYTAFRLAIFLHNTSPNESEALFNLVPHVDN 70

  Fly    65 ANTDDSFIMEKMVCNLISQGVIAIFGPSTGSSSDIIASICDTLDIPHIVYDWIPNESIPDREHST 129
            ..|.:||.:....|:..|:||.||||.....|...:.|.|..|.|..|      ..|.|....|.
 Frog    71 IETSNSFAVTNAFCSQYSRGVFAIFGLYDKRSVHTLTSFCSALHISLI------TPSFPTEGESQ 129

  Fly   130 MTLNVHPDNLLLSQGLAEIVQSFAWRSFTVVYETDKELQQLQDIL----QVGEPISNPTTVKQLG 190
            ..|.:.|.   |...|..::..:.|..:..:|:||:....||.|:    |.|..:| ...|:...
 Frog   130 FVLQLRPS---LRGALLSLLDHYGWNHYVFLYDTDRGYSILQAIMEKAGQNGWQVS-AICVENFN 190

  Fly   191 PGDDHRPFLKEIKLSTDNCLILHCAPDNLLKILQQANEL-KMLGEYQSVFIPLLDTHSIDFGELS 254
            .. .:|..|:::....:|..::.|..:.|..||:|...: |.:..|..: |..|....|......
 Frog   191 DA-SYRRLLEDLDRRQENKFVIDCEVERLQNILEQIVSVGKHVKGYHYI-IANLGFKDISLDRFM 253

  Fly   255 GVEANITTVRLMDPSDFHVKNVVHDWEEREKREGRYFKVDPNRVKSQMILLNDAVWLFSKGL--- 316
            ...||:|..:|:|.:...|..::..|:..::||   :....:..|....|..|.|.:.::..
 Frog   254 HGGANVTGFQLVDFNTPIVTELMQRWKTLDQRE---YPGSESPPKYTSALTYDGVLVMAEAFRIL 315

  Fly   317 --TELGIFEELTAPDLECRRKKPWPFGKRIIEFIKARSEETSTGRIDFNENGQRSFFTLRFMELN 379
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 Frog   316 RRQKIDLSRRGNAGDCLANPAAPWGQGIDMERTLKQVRIQGLTGNIQFDHYGRRVNYTMDVLELK 380

  Fly   380 SDGFLDLATWDPVNGLDVLNDDEESEKRVGQKLSNKTFIVSSRLGAPFLTLREPQEGEILTGNSR 444
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 Frog   381 SNGLRKIGYWNDMDKL-VLLQHEPAFKNDSSGIENRTVIVTTILEAPYVMYK--KNHELLEGNDK 442

  Fly   445 YEGYSIDLINEIAKMLNFKFEFRMSPDGKYGALNKVTQTWDGIVRQLIDGNADLGICDLTMTSSR 509
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 Frog   443 FEGYCVDLAYEIAKHIGIKYKIAIVPDGKYGARDSETKIWNGMVGELVYGKAEIAVAPLTITLVR 507

  Fly   510 RQAVDFTPPFMTLGISILFSKPPTPPTDLFSFLSPFSLDVWIYMGSAYLFISLLLFALARMAPDD 574
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 Frog   508 EEVIDFSKPFMSLGISIMIKKPQKSKPGVFSFLDPLAYEIWMCIVFAYIGVSVVLFLVSRFSPYE 572

  Fly   575 W--ENPHPCKE--PEEVENIWSIMNTTWLSIGSLMGQGCDILPKAASTRLVTGMWWFFALMMLNS 635
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 Frog   573 WHTEEPEDGKEGPSDQPPNEFGIFNSLWFSLGAFMQQGCDISPRSLSGRIVGGVWWFFTLIIISS 637

  Fly   636 YTANLAAFLTNSRQANSINSAEDLAAQSKIKYGAMAGGSTMGFFRDSNFSTYQKMWTAMESASPS 700
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 Frog   638 YTANLAAFLTVERMVSPIESAEDLAKQTEIAYGTLDAGSTKEFFKRSKIAVYEKMWTYMKSAEPS 702

  Fly   701 VFTKTNDEGVERVQKGKNLYAFLMESTTLEYNVERK-CDLVQIGGWLDYKSYGIAMPFNSPYRKQ 764
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 Frog   703 VFTKTTAEGVARVRKSKGKFAFLLESTMNEYIEQRKPCDTMKVGGNLDSKGYGVATPKHSQLRNA 767

  Fly   765 ISAAVLKLGELGQLAELKRKWWKEMHGGGNCEKSDEDGGD-TPELGLENVGGVFLVL--GLGLLS 826
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 Frog   768 VNLAVLKLNEQGLLDKLKNKWW---YDKGECGSGGGDSKDKTSALSLSNVAGVFYILVGGLGL-- 827

  Fly   827 AMVLGCTEFLWNVKSVAIEEKISLKEAFKSEALFAARIWIT--------------TKPVHTSS 875
            ||::...||.:..::.|...|::..||.:::    ||:.||              .|.|||.:
 Frog   828 AMLVALIEFCYKSRAEAKRMKLTFSEAIRNK----ARLSITGSIGENGRVLTPDCPKAVHTGT 886

Known Domains

Gene	Sequence	Domain	Region	External ID	Identity
clumsy	NP_001036373.1	PBP1_iGluR_Kainate	27..397	CDD:380605	93/383 (24%)
		PBP2_iGluR_Kainate	414..787	CDD:270432	177/377 (47%)
gria4	XP_031751480.1	PBP1_iGluR_AMPA_GluR4	28..400	CDD:380611	95/387 (25%)
		PBP2_iGluR_AMPA_GluR4	414..795	CDD:270445	179/385 (46%)