DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment CG9270 and rdog

DIOPT Version :10

Sequence 1:NP_995741.2 Gene:CG9270 / 35366 FlyBaseID:FBgn0032908 Length:1292 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:NP_651678.1 Gene:rdog / 43450 FlyBaseID:FBgn0039644 Length:1374 Species:Drosophila melanogaster


Alignment Length:1371 Identity:560/1371 - (40%)
Similarity:824/1371 - (60%) Gaps:118/1371 - (8%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly     9 NPRESAGIFSTLMFCFALPILFKGRKKTLEPTDLYNALKEHKAETLGDKFFATWQSEVRSCGDSP 73
            ||...|..||...|.:...:..:|.:..|...:||...|...:|.:.:||...|:.|::      
  Fly    13 NPFTKANFFSQWSFWWMRDLFKRGLQGPLTDEELYQHRKTLDSERVTNKFAELWEDELK------ 71

  Fly    74 KKEPSIIRVILKVFGWQLFLSGIVVGVLELGTRATLPLILGALIAEFTRNGNG-DGLWAQIYGLT 137
            :..||::|:||:.:|......|:...:.|...::.:||.||.|:..|..|... ....|.:|.:.
  Fly    72 RSNPSVVRMILRAYGKIFVPMGLAFSISETICKSLMPLFLGGLVGYFATNQTDISENTAYLYAMG 136

  Fly   138 LILSILFSVLMFHPLMMGLMHLAMKMRVAVSTAIYRKALRLSRTALGDTTTGQVVNLISNDLGRF 202
            :::.:|..|:.|||.:..:..:..|:|:|:|..||||.|::|:::..|...|:.:|::|||||||
  Fly   137 IVICMLVPVITFHPFIFYIFQVGTKLRLALSGLIYRKVLQVSKSSSNDGLRGRAINILSNDLGRF 201

  Fly   203 DRALIHFHFLWLGPLELLISSYFLYQQIGVASLYGIVILLLFLPIQTFLSRLTSRLRHQTALRTD 267
            |.||...|..|.||:|.::..:.:|::||::::.|:..:|.|:|:|.:.::..:..|..||.|||
  Fly   202 DVALCFLHDTWKGPMESILIGFLMYREIGISAVIGVSFMLSFIPLQAWAAKKAAYYRQMTAERTD 266

  Fly   268 QRVRMMNEIISGIQVIKMYTWEKPFGRLIERLRRSEMSSIRKVNYIRGTLLSFEITLSRIAIFVS 332
            .||::|||||.||||||||.|||.|.|:|..:|..|:.:||...||... |.....:|.:::|::
  Fly   267 MRVKLMNEIIQGIQVIKMYAWEKSFARVIAEVRLKEVKAIRGTAYIHAA-LGCTSMISPLSVFLA 330

  Fly   333 LLGFVLMGGELTAERAFSVTAFYNILRRTVCKFFPSGMSQFAEMMVTLRRIKGFMM--------- 388
            |..:|.:|..|||::.::|::::|:|..::..|:|..::..||.:|:.:|.|.|::         
  Fly   331 LCSYVYLGDPLTAQKVYTVSSYFNMLNDSMVTFWPMSITFIAEALVSAKRCKDFLLDGDKAEVPI 395

  Fly   389 ----------------------RSETEALYLKGGQT--NKLFEGEP-----LVKLQSFQARW--N 422
                                  ..|.....|..||.  |:|.:.:|     .|.|::..|.|  :
  Fly   396 NLEANQQTGKNKRKISKKDKQKNVELNGSLLSNGQVHHNRLRDYDPEATKKCVVLKNVSASWDTS 460

  Fly   423 HDHVEPVLENINISLSPPQLVAVIGPVGSGKSSLIQAILGELPGESGKLKVQGDISYASQEPWLF 487
            ..|....:|:.:..:....|.||:||||:||||.:..:|||:..:.|:..|.|.|||||||.|:|
  Fly   461 DGHANCAIEDFSTDIKDQTLAAVVGPVGAGKSSFLNVLLGEVGIDKGEAMVHGKISYASQESWVF 525

  Fly   488 NASVRDNILFGLPMDKHRYRNVIRNCALERDFELL-HGDRTFVGERGASLSGGQRARISLARAVY 551
            ..::||||:|....::.||:.|::.|.||||.||| .||.|.|||||.||||||:||:|||||||
  Fly   526 EGTIRDNIVFVEDYNERRYKKVVKVCGLERDMELLPRGDLTVVGERGVSLSGGQKARVSLARAVY 590

  Fly   552 RQADTYLLDDPLSAVDTHVGRHLFEECMRGFLRDKLVILVTHQLQFLEHADLIVIMDKGKISAVG 616
            |:||.|||||||||||||||:|:|:.|:|.||.:|:.||||||:|:|...:.:::|..|||.|.|
  Fly   591 RKADIYLLDDPLSAVDTHVGKHIFDRCIRDFLSNKIRILVTHQVQYLFDVEHLLLMGSGKIMAQG 655

  Fly   617 TYEEMLKSGQDFGKLLATEAQEMGDSNQEQVNAEGDSRNDKSTYSRQSSRVSRVSVTSVDSSTES 681
            :|:|:.:|.| |..|..|:..|.|.          |:.:..|..||..|.      .|::.....
  Fly   656 SYQELQRSRQ-FQFLEQTQHDESGI----------DTHSVSSYLSRSDSE------KSMEHQHNQ 703

  Fly   682 IL---DNERQPAQESRSQGKIGLGIYGKYFSA-GSGWLMVILVAFF-CLGTQILASGGDYFLSYW 741
            :|   ::.....||.::.|.|.:.:|..|..| .|.:|:.|:::.| |  .:|:.:|.|||||.|
  Fly   704 LLRPDEHVEDVNQEQQTVGSIKMHVYASYIKALDSTFLLGIVISLFVC--ARIMLTGVDYFLSRW 766

  Fly   742 V---------------KNNDSS--------SSTDIYIF--------SGINAALVIF--------- 766
            |               ...|::        ::||.||.        :||...||:|         
  Fly   767 VIWEEQIAVNRTTTLLNETDTTIANDTLPINATDPYIAPLLASDIQAGIRQELVLFYATILGATL 831

  Fly   767 --ALLRTLLFFSMAMHSSTQLHNTMFQGVSRTALYFFHANPSGRILNRFAMDLGQVDEILPAVML 829
              .|:||..||.|.:..|..||:.:|:|::|.::|||:.|.||||||||:.|:..||..||..:|
  Fly   832 IVYLIRTFGFFKMCLRISLHLHDRLFRGITRASMYFFNTNSSGRILNRFSKDIRTVDTDLPHTLL 896

  Fly   830 DCIQIFLTISGIIGVLCITNPWYLINTITMFLAFHFLRTFYLSTSRDLKRLEAIARSPMYSHFSA 894
            ||:...:.:||::.::.|.|.|.||....:.:....:|..|::|||.:||||:|:|||::|..:.
  Fly   897 DCLAFIIDVSGVVIIVAIANYWLLIPAAIIGVILGMIRYLYVNTSRSVKRLESISRSPVFSLTNQ 961

  Fly   895 TLNGLSTIRAMEAQDLLTKEYDNYQDIHSSGYYTFLSTNRAFGYYLDLFCVAYVISVTLMSYFNP 959
            |..||:||||::||..|.:|:..||:.::|.::.|||..|||..:.|:.|:.|:.:||.......
  Fly   962 TFQGLTTIRALQAQSALEQEFHEYQNTNTSAWFLFLSCTRAFALWSDVLCIVYMTAVTFSFLLLK 1026

  Fly   960 PVDNPGQIGLVITQAMSMTGTVQWGMRQSAELENSMTSVERVLEYRHLEAEGEFESPDDKKPPMN 1024
            ...:.|.:||.|..:.:|||..||||||:|||||.||||||||||....:|...|:|:..||...
  Fly  1027 DEFDSGDVGLAILHSTTMTGMCQWGMRQTAELENQMTSVERVLEYTEQPSEALLETPEKFKPKSE 1091

  Fly  1025 WPQEGLISAEQLSLRYNPDPKADRVLKSLNFIIMPREKIGIVGRTGAGKSSLINALFRLSYNEGS 1089
            ||.:|.|......|||:  ||...|||.|||.|.|||||||||||||||||:|.::|||:.|||.
  Fly  1092 WPSKGRIEFINFKLRYS--PKEAPVLKDLNFTIEPREKIGIVGRTGAGKSSIIQSIFRLACNEGM 1154

  Fly  1090 LVIDNTDILGIGLHDLRSKISIIPQEPVLFSGTLRCNLDPFEQYADEKLWEALEEVHLKDEVSEL 1154
            :.||:.||..||||||||::|||||:|||||||||.||||.::.:||::|:||.:|.|:..||.|
  Fly  1155 IRIDDVDIEHIGLHDLRSQVSIIPQDPVLFSGTLRYNLDPMDERSDEEMWKALGDVELRSYVSTL 1219

  Fly  1155 PNGLESVVAEGGSNYSVGQRQLVCLARAILRENRILVMDEATANVDPQTDALIQSTIRRKFRDCT 1219
            ..||...:.:||||:||||||||||||||||.|:||:||||||||||:||.|||.|||.||..||
  Fly  1220 IGGLNCRMYDGGSNFSVGQRQLVCLARAILRHNKILIMDEATANVDPETDKLIQQTIRSKFAHCT 1284

  Fly  1220 VLTIAHRLNTIIDSDRVMVLDAGTLVEFGSPFELLTQSWSKVFYGMVLQTGRSSFEHLLKLALEA 1284
            ||||||||:|::|||||:|:|||.:.|.|.|:||| |........:|..||.::...|.:.|.::
  Fly  1285 VLTIAHRLHTVMDSDRVLVMDAGEVRELGHPYELL-QRTGGYLRQLVDNTGAATSFALQQAAEQS 1348

  Fly  1285 HERRLL 1290
            :.:::|
  Fly  1349 YSKQIL 1354

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
CG9270NP_995741.2 PLN03130 10..1289 CDD:215595 558/1367 (41%)
rdogNP_651678.1 MRP_assoc_pro 14..1323 CDD:188098 553/1337 (41%)

Return to query results.
Submit another query.