DRSC/TRiP Functional Genomics Resources

powered by:
logo

back to: DIOPT - Ortholog Prediction Tool / DIOPT for Diseases and Traits


Protein Alignment sick and Nav2

DIOPT Version :9

Sequence 1:NP_001260606.1 Gene:sick / 35277 FlyBaseID:FBgn0263873 Length:2707 Species:Drosophila melanogaster
Sequence 2:XP_038947453.1 Gene:Nav2 / 171563 RGDID:619778 Length:2465 Species:Rattus norvegicus


Alignment Length:2696 Identity:787/2696 - (29%)
Similarity:1135/2696 - (42%) Gaps:768/2696 - (28%)


- Green bases have known domain annotations that are detailed below.


  Fly   480 PVPSRHVQYKIRKPRPLSTHSDADSGFLSPCSPEEMRANPAILVLQQCDSVQGYMEIYTDWANYY 544
            |:.|:.:|....:..||...|..::||                     |:     :|||||||:|
  Rat    57 PLKSQGLQEPTGEGLPLRKSSSLENGF---------------------DT-----QIYTDWANHY 95

  Fly   545 LERAKSKRKVTDLSADCRDGLLLAEVIEAVTSFKVPDLVKKPKNQQQMFDNVNSCLHVLRSQSVG 609
            |.::..||.:.||..|..||:|||::|:.|.:.|:.|:...|||:.||.:|:::||:.|.::.: 
  Rat    96 LAKSGHKRLIKDLQQDVTDGVLLAQIIQVVANDKIEDINGCPKNRSQMIENIDACLNFLAAKGI- 159

  Fly   610 GLENITTNDICAGRLKAVLALFFALSRFKQQAKQTKSIGVGCGGGVGGSSSTLTGSGS-VLGI-- 671
            ..:.::..:|..|.|||:|.|||:|||:|||.:|.:......      |||.|..:|| |.|.  
  Rat   160 NTQGLSAEEIRNGNLKAILGLFFSLSRYKQQQQQQQPEKQHL------SSSPLPPAGSQVAGAPS 218

  Fly   672 ----GI---GGLRTP--------GSSLNQDKNQQEQQQQQQQQQTPQQLAQSLENGNEMVNRQIA 721
                ||   .||.||        .:|..|.|.|.|.|.....:.:.|........|.:.::|...
  Rat   219 QCQSGILQQQGLATPQAPCQPLQPASHQQAKTQAEMQSSASAKDSCQSKIIRFTLGQKKISRLPG 283

  Fly   722 P--------AYAKVNGGTAIPLPATVMVQRRCPP----DKVRPLPPTPNHTP------------- 761
            |        :.||..||      :|....||...    ||.:|:|..|...|             
  Rat   284 PTARVAAAGSEAKTRGG------STAANNRRSQSFNNYDKSKPVPSPPQPAPPSNHEKEPLASSA 342

  Fly   762 -SIPGLGKSGSDFNTSRPNSP----------------PTSNHTIQSLKSGNNN--SLRPPSIKSG 807
             |.||:.::......|.|:.|                |..:.::....|..::  |::|...::.
  Rat   343 SSHPGMSENVPASLESSPSIPVNCSSSAIPQPSMTSKPWRSKSLSVKHSATSSMLSVKPAGPEAP 407

  Fly   808 IPSPSSPQTAP-QKHSMLDKLKLFNKEKQQNAVNAASVASKTQIQSKRTSSSSGFSSARSERSDS 871
            .|:|.:.:.|| .:.|||:||||||              ||...::...|:|...|..|.|...|
  Rat   408 RPTPEAMKPAPNNQKSMLEKLKLFN--------------SKGGSKAGEGSASRDTSCERLEILPS 458

  Fly   872 SLSLNDGHGSQLKPPSISVSSQKPQPKTK---QSKLLAAQQKKEQANKATKLDK------KEKSP 927
            .....:...:...||:...:|..|:...|   |.....|...|:.:.|..:.:|      |||..
  Rat   459 FEESEELEVANRAPPTAGPASSSPKIALKGIAQRTFSRALTNKKSSPKGNEKEKEKQQREKEKET 523

  Fly   928 ARSLNKEESGNESRSSTMGRTGKSSLVRAVGGVEKNTPKTSSK-SSLHSKSDSKSSLKAPQLLQS 991
            .:.|.|..|..:  ...:....|..|   .|.|....||.||| :|...|....||.|  :...:
  Rat   524 GKDLTKRVSVTD--RPDLKEEPKEEL---SGVVVTEMPKKSSKIASFIPKGGKLSSTK--KEATA 581

  Fly   992 PSSGGLPKPIAAIKGTSKLPSLGGGAGHLPAAESQQNQQLLKRETSDISSNISQPPPAEPPI-ST 1055
            ||..|:|||     |...:|.....| .:|..|.:       |....:||.:   ||.:|.: |.
  Rat   582 PSHSGIPKP-----GMKNMPGKSPSA-PIPPKEGE-------RSRGKLSSGL---PPQKPQLDSR 630

  Fly  1056 HAHIHQNQTPPPPYYANSQPTSHISSHGFLSEPSTPQHS------SGIYG----------SSRLP 1104
            |               :|..:|..||.|.....:|..||      ||..|          |.:||
  Rat   631 H---------------SSSSSSLASSEGKGPGGTTLNHSISSQTVSGSIGTTQTTGSNTVSVQLP 680

  Fly  1105 PPKSALSAPRKLEYNAGPHILSS--------------------PTHHQRQGLPRPLVNSAPNTPT 1149
            .|:...|.|...  ...|.:..|                    |:|:.:.|.| .|.......|.
  Rat   681 QPQQQYSHPNTA--TVAPFLYRSQTDTEGNVTAESSSAGVSMEPSHYTKSGQP-ALEELTAEDPE 742

  Fly  1150 ASPNKFHTIPSKIVGTIYESKEE---------------------------------QLLPAPPPA 1181
            |  .:..|:  |.:..:.::.||                                 .|...|.|.
  Rat   743 A--RRLRTV--KNIADLRQNLEETMSSLRGTQVTHSTLETTFDTNVTTEISGRSILSLTGRPTPL 803

  Fly  1182 S---GGSSILPMRPLLR---------GYNSHVTLPTR-------GARGGHHPHQSYL-------- 1219
            |   |.||     |.|:         ||      |.|       .|..|.:.:.:.|        
  Rat   804 SWRLGQSS-----PRLQAGDAPSMGNGY------PPRANASRFISAEAGRYVYSAPLRRQLASRG 857

  Fly  1220 -DFCESDIGQ----------------GYCSDGDALRVGSSPGGSRFHDIDNGYLSEGSSGLNGPS 1267
             ..|..|:..                ||.||||.|     ....|..||.:||:::|..||.  :
  Rat   858 SSICHVDVSDKVGDEVDLEGISMDAPGYMSDGDVL-----SKNIRTDDITSGYMTDGGLGLY--T 915

  Fly  1268 SSAGGISPGKHFLSMMRARTQLPTT------------------IEERIRNSRGSLDSIGTAANGS 1314
            .....:..|   ::::|...|..|:                  |.:.|.|.  |.|.|.|:::.|
  Rat   916 RRLNRLPDG---MAVVRETLQRNTSLGLGDADSWDDSSSVSSGISDTIDNL--STDDINTSSSIS 975

  Fly  1315 SAASQASSSGGS------TTTHAQNNNNN---------NNNNSGGGAKMDGSPHHRPGS---RNG 1361
            |.|:..:||..:      ...|:|...|:         ::..|..|.||:      |||   ||.
  Rat   976 SYANTPASSRRNLDVQTDAEKHSQVERNSLWSGDDIKRSDGGSDSGVKME------PGSKWRRNP 1034

  Fly  1362 RDNWSKMPEPLNGQK-----------------------------------------------VEK 1379
            .|...:..:.::|:|                                               .||
  Rat  1035 SDMSDESDKSVSGKKNPVLSQTGSWRRGMTAEVGITMPRTKPSAQTGTLKTSGTGKTDDAKVSEK 1099

  Fly  1380 ---SDKSSPSRRSMGGGG--SGSSSKQGSPSSSSRTKGVPPSFGYVKRANGSIASTAEQQNIAMM 1439
               |.|:|..:||....|  ||..||:..||||........|||: |:.:||.|..|       |
  Rat  1100 GRLSPKASQVKRSPSDAGRSSGDESKKTLPSSSRTPTANANSFGF-KKQSGSAAGLA-------M 1156

  Fly  1440 MAAGGAGANGLPCGRTAHVSAVPRT------ASGRKVAGGTQTLPN-DMNKLP----PNTQHRSF 1493
            :.|.||...    .|:|.:..:|::      ::|||.:  ....|| |...|.    .|.|:||.
  Rat  1157 ITASGATVT----SRSATLGKIPKSSALVGRSTGRKTS--MDGAPNQDDGYLSLSSRTNLQYRSL 1215

  Fly  1494 -------SLTGPTATQLSQSIRERLATGSHSLPKP----------GSDLHVFQHRISNRGGTRHD 1541
                   |..|......:.||...:::.|..||.|          ||.|....::.....|...|
  Rat  1216 PRPSKSNSRNGAGNRCSTSSIDSNMSSKSAGLPVPKLREPSKTSLGSSLPGLVNQTDKEKGISSD 1280

  Fly  1542 ----GSLSDTQTYAEVKPEYSSYAMWL----KHSNTAG---SRLSDGESVEQLQIGS-------- 1587
                .|.:..:.....:|..:|....|    |:::.|.   .||..|:..:|:.|.:        
  Rat  1281 NESVASCNSVKVNPATQPVSNSTQATLQPGTKYTDVASPTLRRLFGGKPTKQVPIATAETMKSAV 1345

  Fly  1588 ------PALTRHGHKMIHNRSGGPGQMAGQMSG--------NESPYVQSP---RMNRSNS----- 1630
                  ..:|:.|:  :.:.||.....:|..|.        |:||...||   ....|||     
  Rat  1346 VISNPHATMTQQGN--LESPSGSGVLSSGSSSPLYSKNVDLNQSPLASSPSSAHSGPSNSLTWGT 1408

  Fly  1631 -------------------------------------------IRSTKSEKMYPSMMSRAGEVEI 1652
                                                       :.|||.:.:.|.:.:.:.:..:
  Rat  1409 SSSAVSKDGLGFQSVSSLHTSCESIDISLGSGGGLSHNSSPGPVASTKEDSLMPFVRTSSVKTTL 1473

  Fly  1653 ----------EPYYC------------------LP-VGTNGVLTAQMAAAMAA----QSQAAQGN 1684
                      .|.:|                  || .|.....|:|:......    :|.:|.|.
  Rat  1474 SESPLSSPAASPKFCRSTLPRKQDSDPHLDRNTLPKKGLRYTPTSQLRTQEDTKEWFRSHSAGGL 1538

  Fly  1685 PGVGVNVGGVAWSQPTSPTPLTRGPFNTAAGASVLSP----------THGTTSAAGLVGPGGGAG 1739
            .....|....:.|..|||:. ||..|:..|..:.::.          ||..::|.|...|   ..
  Rat  1539 QETATNSPFSSGSSVTSPSG-TRFNFSQLASPTAVTQMSLSNPTMLRTHSLSNADGQYDP---YT 1599

  Fly  1740 GGAMVGHRLTYPKKN-------------DEVHGSAASLLSGGSSLYGNAEERQAHEIRRLKRELQ 1791
            ........::..:|:             :|||||:.||:|..||:|...||:...|||:|:|||.
  Rat  1600 DSRFRNSSMSLDEKSRTMSRSGSFRDGFEEVHGSSLSLVSSTSSIYSTPEEKCQSEIRKLRRELD 1664

  Fly  1792 DARDQVLSLSSQLSTNAHVVTAFEQSLSNMTNRLHQLTATAERKDGELTDMRQTIELLRKQSIQA 1856
            .::::|.:|::||:.|||:|.||||||.|||.||..||.|||:||.||.::|:|||||:||:..|
  Rat  1665 ASQEKVSALTTQLTANAHLVAAFEQSLGNMTIRLQSLTMTAEQKDSELNELRKTIELLKKQNAAA 1729

  Fly  1857 GLTTAHMQSMGVQTQGQGQVQGQALGQALGQPGSDQKPPNSGSQRAINANNGSMPLGMQRQHSTD 1921
                            |..:.|     .:..|..:.|  .:||.:|.:       |.::||||:|
  Rat  1730 ----------------QAAING-----VINTPELNCK--GNGSAQATD-------LRIRRQHSSD 1764

  Fly  1922 SMCSLNSISSGCSAA---QDKNKANKKKGW---LRSSFTKAFSRNAKISKTSRHVGHHHHHNHSQ 1980
            |:.|:||.:|..|..   :..:|..|:|.|   |||||.:||.:.......|.|.......:.|.
  Rat  1765 SVSSINSATSHSSVGSNIESDSKKKKRKNWVNELRSSFKQAFGKKKSPKSASSHSDIEEMTDSSL 1829

  Fly  1981 QELASGKLPLHNGHGEPLGLASLATQPAPPLPNSKQSSPAKTVTLIDNAKPIDAIDQEDQHVVED 2045
            .  :|.||| |||          :|...|.|.|:..:|      ||.     :.:|.|.:.|:: 
  Rat  1830 P--SSPKLP-HNG----------STGSTPLLRNAHSNS------LIS-----ECMDSEAETVMQ- 1869

  Fly  2046 LKKQLREKDLVLTDIRLEALSSASQLESLKEMMNKMRAEMMSLKHNNERLQKLVTTRSLAGSEAS 2110
            |:.:||:|::.||||||||||||.||:.|:|.||:|::|:..||..|:||:          ||: 
  Rat  1870 LRNELRDKEMKLTDIRLEALSSAHQLDQLREAMNRMQSEIEKLKAENDRLK----------SES- 1923

  Fly  2111 LGQAISPNGSVAGSSEVSRRYSLADSNSRPPMELPARLSEELELEEDCLPPAPAPEQPPPPAPNG 2175
                 ..:|.....|:||               :.|...:.|.|.:..|                
  Rat  1924 -----QGSGCSRAPSQVS---------------ISASPRQSLGLSQHSL---------------- 1952

  Fly  2176 VSVAPLSPSTHVDLTPPPPALEAAPMASPVHMASATEELADVCDGKKIAIACYLGQPEAFAKYCE 2240
                .|:.||.:|:                 :...|.|    |..:|        :.....|...
  Rat  1953 ----NLTESTSLDM-----------------LLDDTGE----CSARK--------EGGRHVKIVV 1984

  Fly  2241 ELQELDGFYANGHEADSQSQSERKSNYTSASCNEFVIACTYISGKTTWQNLDYVVRKTFKDYVAR 2305
            ..||.    ....|....|...|.|....:..:.|:|.|..:||||.|..||.|||:.||:|:..
  Rat  1985 SFQEA----MKWKEVSRISLPARLSFPQDSRPHLFLIGCIGVSGKTKWDVLDGVVRRLFKEYIIH 2045

  Fly  2306 IDPGTNLGLNTDSITSYHLGEAKRGPEMGFPELLPCGYIVGSVRTLYICLQG-----VGSLAFDS 2365
            :||.:.||||:||:..|.:||.||......||||||||:||...|:.:.::|     :.||.|:|
  Rat  2046 VDPVSQLGLNSDSVLGYSIGEIKRSNTSETPELLPCGYLVGENTTILVTVKGLTENSLDSLVFES 2110

  Fly  2366 LIPRSIVHRYISLLTEHRRLILCGPSGTGKSYLARRLAEFLVARSARGNPSEAIATFNVDHKSSK 2430
            |||:.|:.||:||||||||:||.|||||||:|||.||:|::|.|..|......||||||||||||
  Rat  2111 LIPKPILQRYVSLLTEHRRIILSGPSGTGKTYLANRLSEYVVLREGRELTDGVIATFNVDHKSSK 2175

  Fly  2431 DLRQYLGHIAEQAAIANGVSELPSVIILDNLHHASALGDVFSCLLSAGPANKLPCIIGTMSQATC 2495
            :|||||.::|:|....|...::|.|||||||||.|:||::|:.||:. ..:|.|.|||||:|||.
  Rat  2176 ELRQYLSNLADQCNSENNAVDMPLVIILDNLHHVSSLGEIFNGLLNC-KYHKCPYIIGTMNQATS 2239

  Fly  2496 NTTNLQLHHNFRWVLTANHMEPVKGFLGRFLRRRLFQLELQTQHPQPELAAVLAWLPSVWQHINR 2560
            :|.||||||||||||.|||.|||||||||||||:|.:.|:..:....||..::.|:|.||.|:||
  Rat  2240 STPNLQLHHNFRWVLCANHTEPVKGFLGRFLRRKLMETEISGRVRNAELVKIINWIPKVWHHLNR 2304

  Fly  2561 FLEVHSSSDVTIGPRLFLACPMDLKDSQVWFTDIWNYHLSPYLVEAVREGVQLYGRRGGAWNDPS 2625
            |||.||||||||||||||:||:|:..|:|||||:|||.:.|||:||||||:|||||| ..|.||:
  Rat  2305 FLEAHSSSDVTIGPRLFLSCPIDVDGSRVWFTDLWNYSIIPYLLEAVREGLQLYGRR-APWEDPA 2368

  Fly  2626 AFIRNSYPWPYGPD--SVPPLRQINAEDVGLEGVAL--------------TNGDQQDPLLNMLMR 2674
            .::.::|||...|.  ..|||.|:..||||.:|.:|              |.|   |||:|||||
  Rat  2369 KWVMDTYPWAASPQQHEWPPLLQLRPEDVGFDGYSLPREGSTSKQVPPSDTEG---DPLMNMLMR 2430

  Fly  2675 LQEAANYSEAQDQESDCAS-------LDSNV 2698
            ||||||||..|..:||..|       |||::
  Rat  2431 LQEAANYSSPQSYDSDSNSNSHHDDILDSSL 2461

Known Domains:


Indicated by green bases in alignment.

GeneSequenceDomainRegion External IDIdentity
sickNP_001260606.1 CH 535..637 CDD:214479 43/101 (43%)
AAA 2382..2531 CDD:214640 96/148 (65%)
AAA_22 2385..2476 CDD:290137 53/90 (59%)
Nav2XP_038947453.1 CH_NAV2 74..188 CDD:409134 48/140 (34%)
Herpes_BLLF1 <331..720 CDD:282904 99/442 (22%)
PTZ00449 <456..>626 CDD:185628 47/192 (24%)
PHA03307 1014..>1266 CDD:223039 65/271 (24%)
Mplasa_alph_rch <1650..>1922 CDD:275316 124/336 (37%)
AAA_22 2124..>2217 CDD:379165 57/92 (62%)


Information from Original Tools:


Tool Simple Score Weighted Score Original Tool Information
BLAST Result Score Score Type Cluster ID
Compara 00.000 Not matched by this tool.
Domainoid 1 1.000 393 1.000 Domainoid score I743
eggNOG 1 0.900 - - E1_2CMAI
Hieranoid 1 1.000 - -
Homologene 00.000 Not matched by this tool.
Inparanoid 1 1.050 851 1.000 Inparanoid score I412
OMA 00.000 Not matched by this tool.
OrthoDB 00.000 Not matched by this tool.
OrthoFinder 1 1.000 - - FOG0001074
OrthoInspector 1 1.000 - - otm45279
orthoMCL 1 0.900 - - OOG6_103597
Panther 1 1.100 - - O PTHR12784
Phylome 00.000 Not matched by this tool.
SonicParanoid 1 1.000 - - X908
SwiftOrtho 1 1.000 - -
TreeFam 00.000 Not matched by this tool.
109.950

Return to query results.
Submit another query.